Result of FASTA (omim) for
pF1KE2347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2347, 738 aa
1>>>pF1KE2347 738 - 738 aa - 738 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3793+/-0.000422; mu= 17.9685+/- 0.026
mean_var=169.2066+/-35.795, 0's: 0 Z-trim(117.4): 300 B-trim: 1876 in 2/50
Lambda= 0.098597
statistics sampled from 29085 (29421) to 29085 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 13.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036221 (OMIM: 605454) ATP-binding cassette sub- ( 738) 4827 699.5 1.3e-200
XP_011542437 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding ( 559) 3525 514.1 5.9e-145
XP_011542438 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding ( 442) 2738 402.1 2.6e-111
NP_009119 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette sub- ( 718) 1445 218.4 8.1e-56
NP_001269220 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 735) 1445 218.4 8.2e-56
NP_001269222 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 630) 1428 215.9 4e-55
XP_011536397 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 766) 1380 209.2 5.1e-53
XP_011536398 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 766) 1380 209.2 5.1e-53
NP_062571 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub- ( 766) 1380 209.2 5.1e-53
XP_016874592 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 766) 1380 209.2 5.1e-53
NP_001269221 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 693) 1302 198.0 1.1e-49
XP_005253615 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 548) 1290 196.2 3e-49
XP_011536400 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 548) 1290 196.2 3e-49
NP_001229943 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette s ( 681) 1195 182.8 4e-45
NP_982269 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub- ( 683) 1191 182.2 5.9e-45
NP_061338 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1232) 1176 180.4 3.8e-44
XP_011514615 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1232) 1176 180.4 3.8e-44
XP_011514614 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1247) 1176 180.4 3.8e-44
XP_011514613 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1251) 1176 180.4 3.8e-44
XP_011514612 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1259) 1176 180.4 3.8e-44
NP_000434 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1279) 1176 180.5 3.8e-44
NP_061337 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1286) 1176 180.5 3.9e-44
XP_011514611 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1287) 1176 180.5 3.9e-44
XP_016867812 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1294) 1176 180.5 3.9e-44
XP_011514610 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1294) 1176 180.5 3.9e-44
NP_000918 (OMIM: 120080,171050,612244) multidrug r (1280) 1175 180.3 4.2e-44
XP_011510382 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 936) 1152 176.9 3.4e-43
NP_001276972 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide ( 686) 1147 176.0 4.5e-43
NP_000535 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide tr ( 703) 1147 176.0 4.6e-43
NP_000584 (OMIM: 170260,604571) antigen peptide tr ( 808) 1147 176.1 5e-43
NP_001157413 (OMIM: 611785) ATP-binding cassette s (1257) 1093 168.6 1.4e-40
XP_011510383 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 763) 1069 165.0 1.1e-39
XP_016860656 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 916) 1069 165.1 1.2e-39
XP_016860655 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1098) 1069 165.1 1.3e-39
NP_003733 (OMIM: 601847,603201,605479) bile salt e (1321) 1069 165.2 1.5e-39
XP_006712880 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1335) 1069 165.3 1.5e-39
XP_011510379 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1355) 1069 165.3 1.5e-39
XP_011510380 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1355) 1069 165.3 1.5e-39
NP_001278951 (OMIM: 170260,604571) antigen peptide ( 547) 1062 163.8 1.7e-39
NP_061313 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide tr ( 653) 1050 162.2 6.3e-39
XP_011514617 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1074) 1047 162.0 1.2e-38
XP_016860654 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1314) 857 135.1 1.8e-30
NP_062570 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub- ( 723) 840 132.4 6.6e-30
NP_005680 (OMIM: 111600,605452,609153,614497,61540 ( 842) 818 129.3 6.3e-29
NP_001258627 (OMIM: 300135,301310) ATP-binding cas ( 726) 801 126.8 3.1e-28
NP_001258625 (OMIM: 300135,301310) ATP-binding cas ( 752) 801 126.8 3.1e-28
NP_004290 (OMIM: 300135,301310) ATP-binding casset ( 753) 801 126.8 3.1e-28
NP_001258626 (OMIM: 300135,301310) ATP-binding cas ( 712) 765 121.7 1.1e-26
NP_001258628 (OMIM: 300135,301310) ATP-binding cas ( 713) 765 121.7 1.1e-26
XP_016878731 (OMIM: 158343) PREDICTED: multidrug r (1434) 645 105.0 2.3e-21
>>NP_036221 (OMIM: 605454) ATP-binding cassette sub-fami (738 aa)
initn: 4827 init1: 4827 opt: 4827 Z-score: 3722.9 bits: 699.5 E(85289): 1.3e-200
Smith-Waterman score: 4827; 100.0% identity (100.0% similar) in 738 aa overlap (1-738:1-738)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRGPPAWPLRLLEPPSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGLRPARLWGAGPALLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MRGPPAWPLRLLEPPSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGLRPARLWGAGPALLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GVGAARRWRSGCRGGGPGASRGVLGLARLLGLWARGPGSCRCGAFAGPGAPRLPRARFPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GVGAARRWRSGCRGGGPGASRGVLGLARLLGLWARGPGSCRCGAFAGPGAPRLPRARFPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GPAAAAWAGDEAWRRGPAAPPGDKGRLRPAAAGLPEARKLLGLAYPERRRLAAAVGFLTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GPAAAAWAGDEAWRRGPAAPPGDKGRLRPAAAGLPEARKLLGLAYPERRRLAAAVGFLTM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSDNLTRLCLGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 SSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSDNLTRLCLGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 QRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 SVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 VRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 MGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 VILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKIGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKIGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 EEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 TSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLS
670 680 690 700 710 720
730
pF1KE2 KPNGIYRKLMNKQSFISA
::::::::::::::::::
NP_036 KPNGIYRKLMNKQSFISA
730
>>XP_011542437 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding cas (559 aa)
initn: 3525 init1: 3525 opt: 3525 Z-score: 2723.3 bits: 514.1 E(85289): 5.9e-145
Smith-Waterman score: 3525; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (180-738:1-559)
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 AAAGLPEARKLLGLAYPERRRLAAAVGFLTMSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSD
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSD
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 NLTRLCLGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLTRLCLGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTG
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 ELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIA
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 VIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLAR
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 KEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLS
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 SFYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SFYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPI
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 FQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSK
340 350 360 370 380 390
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 IGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGE
400 410 420 430 440 450
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 KGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIA
460 470 480 490 500 510
690 700 710 720 730
pF1KE2 HRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
520 530 540 550
>>XP_011542438 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding cas (442 aa)
initn: 2738 init1: 2738 opt: 2738 Z-score: 2119.5 bits: 402.1 E(85289): 2.6e-111
Smith-Waterman score: 2738; 98.6% identity (99.8% similar) in 438 aa overlap (301-738:5-442)
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAV
:.. ...:::::::::::::::::::::::
XP_011 MPFVSTSCKLQFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAV
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 IYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARK
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 EAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSS
100 110 120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 FYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIF
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 QDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKI
220 230 240 250 260 270
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 GTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEK
280 290 300 310 320 330
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 GVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAH
340 350 360 370 380 390
700 710 720 730
pF1KE2 RLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
400 410 420 430 440
>>NP_009119 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette sub-fami (718 aa)
initn: 1377 init1: 796 opt: 1445 Z-score: 1123.1 bits: 218.4 E(85289): 8.1e-56
Smith-Waterman score: 1447; 37.7% identity (68.9% similar) in 716 aa overlap (45-735:13-695)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 PSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGLRPARLWGAGPALLWGVGAARRWRSGCRG
: :.:: : : . . .: :. .: :
NP_009 MLVHLFRVGIRGGPFPGRLL---PPLRFQTFSAVRYSDGYR-
10 20 30
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.: . ..:.: . :::. : . : ::: .:.: :.:
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140 150 160 170
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. . : :::... : ..: ::. . .:. :..::
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. ....... :..::....:. .. : :. .. .::. ..: :. . :
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:. : :.:.. .: .::::.:::...::: ..::.:..::..:. . : .:.
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:::. .:.. . . ..: :. ... ..: . .....: ::::.. :...:.:
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.:.: .:::::::::. :. : :.:..... : : ..: : : : .... : .:
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:..:. :: :... ..: :.: :::. . : :...:: .......::.::.:..: .
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.: .:.. : . .....:.. :.:: :.:: :: ...::.:..: :...:::: ::
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.::.:: ::: :.:::..:.. :::.:.: :.: :::... : .::::.::. .: :::
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.: . :. ::. .:. ::: :: .::.:.::::::.:. ::::::::.::::::.
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:.: .:.:::::::::::.: .::::::: :::::::::::::...:. ..:. .:..
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: : :::::.: .:.: .:. .:..
NP_009 WEAGTHEELLKK-GGLYAELIRRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
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: :.:: : : . . .: : ::.:
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. : ..: . . . :. . : .: : :: :: .:.: :.:
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. . : :::... : ..: ::. . .:. :..:
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.::..:. :: :... ..: :.: :::. . : :...:: .......::.::.:..:
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. .: .:.. : . .....:.. :.:: :.:: :: ...::.:..: :...::::
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::.::.:: ::: :.:::..:.. :::.:.: :.: :::... : .::::.::. .: ::
NP_001 SGGGKTTVASLLERFYDPTAGVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMEN
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: .: . :. ::. .:. ::: :: .::.:.::::::.:. ::::::::.:::::
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:.:.: .:.:::::::::::.: .::::::: :::::::::::::...:. ..:. .:
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pF1KE2 KITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
.. : : :::::.: .:.: .:. .:..
NP_001 RVWEAGTHEELLKK-GGLYAELIRRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
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....:. .. : :. .. .::. ..: :. . ::. : :.:.. .:
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.::::.:::...::: ..::.:..::..:. . : .:.:::. .:.. . . .
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.: :. ... ..: . .....: ::::.. :...:.: .:.: .:::::::::.
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pF1KE2 AEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDA
:. ::: :: .::.:.::::::.:. ::::::::.::::::.:.: .:.::::::::::
NP_001 AREANAHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARALIKQPTVLILDEATSALDA
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pF1KE2 ENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLSKPNGIY
:.: .::::::: :::::::::::::...:. ..:. .:.. : : :::::.: .:.:
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.:. .:..
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XP_011 PEQASGATLQKLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQF
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:::.::.::.:::.... :..:.. :: .... . .:: .: .:. .. : .
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... :::.: ..:.: .:..::.:.. ::: :. ..:::.:..: : : : :...:..
XP_011 MVSNIYGKYYKRLSKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYK
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: :::: : . ..::. .. .:.:: :: :. :..:: :.: .:..: : .: .
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...: :: ::.:.::. ...:...:.: . ..: : ..: ..:.:: :.: .::.
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. ..:. :.:. :.:::::::::::::. ...: .: .: . :::. : . .:
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. :. :::::.::. ::..::.:: :. : : . ..:. ::: .:: .. .:..:
XP_011 HRVISLVSQEPVLFARSITDNISYGL--PT-VPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTE
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pF1KE2 VGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVL
.::::. ::::::::.:.::::..:: .:.:::::::::::.:::.:.:. .. .:::
XP_011 TGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVL
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pF1KE2 VIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
.:::::::...:....:::.:.... : :..::.. .:.: ::...:
XP_011 IIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQQGTHQQLLAQ-GGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAG
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XP_011 HNEPVANGSHKA
760
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Smith-Waterman score: 1381; 39.4% identity (71.3% similar) in 617 aa overlap (119-733:142-741)
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pF1KE2 LLGLWARGPGSCRCGAFAGPGAPRLPRARFPGGPAAAAWAGDEAWRRGPAAPPGDKGRLR
:: : :. :: . ::. ::
XP_011 RDPWFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEA-----EGFPGS-GRPP
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pF1KE2 PAAAGLPEARKLLGLAYPERRRLAAAVGFLTMSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVD-Y
: :. .:::. . :. :.:: :: .... :.. :. :: : . ..: .
XP_011 PEQASGATLQKLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQF
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: .. .:: .... : : :: .. :. :::. :: :.. ::..:::..
XP_011 STAVVIVCLLAIGSSFAAG-----IRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDEN
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pF1KE2 RTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVS
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XP_016 HNEPVANGSHKA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]