Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2368
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2368, 2015 aa
1>>>pF1KE2368 2015 - 2015 aa - 2015 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6558+/-0.00105; mu= 9.8746+/- 0.063
mean_var=176.2983+/-36.149, 0's: 0 Z-trim(109.8): 105 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.096594
statistics sampled from 11075 (11179) to 11075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16
Scan time: 6.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015) 13431 1885.5 0
CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 13419 1883.8 0
CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 13379 1878.2 0
CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1983) 10512 1478.7 0
CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1998) 9423 1326.9 0
CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962) 7134 1007.9 0
CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 6098 863.6 0
CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 6092 862.7 0
CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3 (1956) 5999 849.8 0
CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 5999 849.8 0
CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 5805 822.7 0
CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 5798 821.8 0
CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (2000) 5367 761.7 6.7e-219
CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009) 4727 672.5 4.7e-192
CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836) 4284 610.8 1.7e-173
CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951) 4209 600.3 2.5e-170
CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 4172 595.2 9e-169
CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977) 4101 585.3 8.5e-166
CCDS53794.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1939) 3140 451.3 1.7e-125
CCDS33737.1 SCN11A gene_id:11280|Hs108|chr3 (1791) 2838 409.2 7.5e-113
CCDS46442.1 SCN7A gene_id:6332|Hs108|chr2 (1682) 2759 398.2 1.5e-109
CCDS44801.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1171 177.0 7.5e-43
CCDS44795.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1166 176.3 1.2e-42
CCDS44796.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2144) 1151 174.2 5.2e-42
CCDS59166.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1912) 1128 171.0 4.3e-41
CCDS59167.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1966) 1128 171.0 4.4e-41
CCDS35253.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1977) 1128 171.0 4.4e-41
CCDS53735.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1040 158.7 2.4e-37
CCDS44798.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1036 158.2 3.4e-37
CCDS44791.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1031 157.5 5.6e-37
CCDS53734.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1031 157.5 5.6e-37
CCDS53733.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1031 157.5 5.6e-37
CCDS44799.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1027 156.9 8.3e-37
CCDS44793.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1022 156.2 1.3e-36
CCDS44800.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1018 155.7 2e-36
CCDS44787.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1018 155.7 2e-36
CCDS53736.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1018 155.7 2e-36
CCDS44794.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1013 155.0 3.2e-36
CCDS44789.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2158) 958 147.3 6.5e-34
CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2237) 925 142.7 1.6e-32
CCDS59522.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2339) 925 142.7 1.7e-32
CCDS1407.1 CACNA1S gene_id:779|Hs108|chr1 (1873) 792 124.1 5.3e-27
CCDS44790.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2166) 784 123.0 1.3e-26
CCDS44792.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2179) 762 120.0 1.1e-25
CCDS44788.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2186) 729 115.4 2.6e-24
CCDS58576.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2227) 704 111.9 3e-23
CCDS58573.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2232) 672 107.4 6.6e-22
CCDS9498.1 NALCN gene_id:259232|Hs108|chr13 (1738) 620 100.1 8.2e-20
CCDS45376.1 CACNA1H gene_id:8912|Hs108|chr16 (2347) 601 97.6 6.6e-19
CCDS46710.1 CACNA1I gene_id:8911|Hs108|chr22 (2223) 535 88.4 3.7e-16
>>CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015 aa)
initn: 13431 init1: 13431 opt: 13431 Z-score: 10116.7 bits: 1885.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13431; 100.0% identity (100.0% similar) in 2015 aa overlap (1-2015:1-2015)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALNGTNGSVEADGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALNGTNGSVEADGLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 ETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNNLQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEKVP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQESQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQESQP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 VSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGST
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 ADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 VEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 GFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 SQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KE2 YNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 GSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KE2 KINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPTL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 FRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 VKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGD
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 CGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKF
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 DPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRV
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 LGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSL
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 KHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010
pF1KE2 RATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
1990 2000 2010
>>CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016 aa)
initn: 7182 init1: 7182 opt: 13419 Z-score: 10107.7 bits: 1883.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13419; 100.0% identity (100.0% similar) in 2016 aa overlap (1-2015:1-2016)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
10 20 30 40 50 60
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CCDS46 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
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CCDS46 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
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CCDS46 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTIV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS46 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQQESQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRS
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CCDS46 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
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CCDS46 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQQESQ
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CCDS46 PVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGS
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CCDS46 TADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYH
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CCDS46 IVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVA
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CCDS46 YGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KE2 LGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINIL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE2 AKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE2 LFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE2 YVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRG
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE2 DCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEK
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE2 FDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKR
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE2 VLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE2 LKHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSV
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1980 1990 2000 2010
pF1KE2 TRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
1990 2000 2010
>>CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1983 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
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pF1KE2 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTIV
:::::::::::::::::::::::::..: . :::.:::::::::::::::::: ::::::
CCDS54 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALNGTNGSVEADGLV
250 260 270 280 290 300
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pF1KE2 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
370 380 390 400 410 420
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pF1KE2 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
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pF1KE2 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGV
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pF1KE2 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
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pF1KE2 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
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pF1KE2 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
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pF1KE2 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNNLQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEKVP
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KE2 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQESQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQESQP
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pF1KE2 VSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGST
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 ADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE2 VEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 GFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE2 SQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KE2 YNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KE2 GSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 KINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPTL
:::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS54 KINLLFVAIFTG--------------------------------TVLSDIIQKYFFSPTL
1570 1580
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pF1KE2 FRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAY
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 VKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGD
1650 1660 1670 1680 1690 1700
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pF1KE2 CGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKF
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 DPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRV
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 LGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSL
1830 1840 1850 1860 1870 1880
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 KHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVT
1890 1900 1910 1920 1930 1940
1990 2000 2010
pF1KE2 RATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
1950 1960 1970 1980
>>CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1998 aa)
initn: 10960 init1: 7142 opt: 9423 Z-score: 7098.2 bits: 1326.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13208; 98.7% identity (98.9% similar) in 2016 aa overlap (1-2015:1-1998)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
130 140 150 160 170 180
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pF1KE2 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTIV
:::::::::::::::::::::::::..: . :::.:::::::::::::::::: ::::::
CCDS46 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 GALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALNGTNGSVEADGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALNGTNGSVEADGLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 ADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
610 620 630 640 650 660
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pF1KE2 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
670 680 690 700 710 720
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pF1KE2 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
730 740 750 760 770 780
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pF1KE2 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
790 800 810 820 830 840
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pF1KE2 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 ETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNNLQ
910 920 930 940 950 960
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pF1KE2 LALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEKVP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQ-ESQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS46 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQQESQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 PVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE2 TADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE2 IVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 YGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KE2 RVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE2 KSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS46 KSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQV------------------YEEQPQW
1390 1400 1410 1420
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pF1KE2 EYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKK
1430 1440 1450 1460 1470 1480
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pF1KE2 LGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINIL
1490 1500 1510 1520 1530 1540
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pF1KE2 AKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPT
1550 1560 1570 1580 1590 1600
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pF1KE2 LFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFA
1610 1620 1630 1640 1650 1660
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pF1KE2 YVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRG
1670 1680 1690 1700 1710 1720
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pF1KE2 DCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEK
1730 1740 1750 1760 1770 1780
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pF1KE2 FDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKR
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE2 VLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRS
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE2 LKHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSV
1910 1920 1930 1940 1950 1960
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pF1KE2 TRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
1970 1980 1990
>>CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962 aa)
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pF1KE2 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQA
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pF1KE2 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPI
70 80 90 100 110 120
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pF1KE2 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARG
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pF1KE2 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTIV
:::::::::::::::::::::::::..: . :::.:::::::::::::::::: ::::::
CCDS54 FCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 GALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALNGTNGSVEADGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALNGTNGSVEADGLV
250 260 270 280 290 300
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pF1KE2 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAW
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRK
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSE
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 ADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
670 680 690 700 710 720
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pF1KE2 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 ETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNNLQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEKVP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQESQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQ----
1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 VSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGST
:::::::::::
CCDS54 -------------------------------------------------TPEDSCSEGST
1080
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pF1KE2 ADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 VEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAY
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 GFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 SQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE2 YNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 GSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 KINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPTL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 FRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAY
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 VKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 CGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKF
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 DPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRV
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 LGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 KHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1990 2000 2010
pF1KE2 RATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
1930 1940 1950 1960
>>CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005 aa)
initn: 6845 init1: 3074 opt: 6098 Z-score: 4594.0 bits: 863.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8101; 63.0% identity (80.9% similar) in 2057 aa overlap (5-1999:6-1995)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQ
:.: : .::: ::::::::::.:.::..:. .. :. .:..:.:. ::.
CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRP---KQERKDEDDENGPKPNSDLE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
:.:.:: .::. : :... :::::::.: ..::::::::::.: ::::: :::.:.::.:
CCDS33 AGKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
::. :.:::::::::::::::::::::::.. .:: ::: ::::::.:::::::.:::::
CCDS33 IRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTI
::::. :::::::::::::.:: .::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS33 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
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.:....: ... . : :. : .. . .: .:.:::::::::: ::::: :.:::
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.::..::::::.:.::::.:::::::: :: ::: :::.::: :::::.::::::::::.
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..:. . .: : :. .:: .::.:.:.:: : :.::: :::::
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::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: .::: : :.. .. ..:::
CCDS33 VVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINYTTGEM-FDVSVVNNY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE2 SQCESLNLTGEL-YWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQW
:.:..: ... : .::::::::: :::.:::::::::::::::::::::. : ::..
CCDS33 SECKALIESNQTARWKNVKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKY
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE2 EYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKK
: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS33 EDNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KE2 LGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINIL
::::::::::::: ::.::..::.::::.::..::.::::::::::::::::: : :::
CCDS33 LGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEMTNIL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE2 AKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPT
:::.:...:::::..:: .::.:::: .::::::::::::::: :...:.::: :::
CCDS33 YWINLVFIVLFTGECVLKLISLRYYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVSPT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE2 LFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFA
:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::
CCDS33 LFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE2 YVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGS-R
::: :.::::::::.::.:::.:::::::::::::::.::::.::: ::: . ..: .
CCDS33 YVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKDHPGSSVK
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE2 GDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWE
::::.:.:::.::..:::::::.:::::::.::::::::::::.::::::::.::::.::
CCDS33 GDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWE
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE2 KFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTK
::::.::::::.. ::::::::. :: :::::...:: :::::::::::::.::::::::
CCDS33 KFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTK
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE2 RVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQR
::::::::::::.:::::.:::.::::.:::::::::.::.:::::..::::.::.::..
CCDS33 RVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQ
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE2 SLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA-PEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYD
..:..: ..... :. : :. : .: . ..:: . : ... ::. :::::
CCDS33 KVKKVSSIYKKDKGK---ECDGTPIKEDTLIDKLNENST----PEKTDMTPSTTSPPSYD
1930 1940 1950 1960 1970
1980 1990 2000 2010
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CCDS33 SVTKPEKEKFE---KDKSEKEDKGKDIRESKK
1980 1990 2000
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CCDS33 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL
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pF1KE2 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
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CCDS33 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
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::::. ::.::::::::::::: .::. .:: ..:.::::::::::::.::: :::.:
CCDS33 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI
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:::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.: :.: :: : .
CCDS33 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH---
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:. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
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::::: : : :::.::::.:::.::.:.:. :.::.: : . :::. :. ::: .
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. :.: :. : ... :.:: . : :. :.:. : : :.:.::.: :: ::
CCDS33 KPRVSEGSTE--DNKSPRSDPYN-QRRMSFLGLASG------KRRASHGSVFHFRSPGRD
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.. .:: . :. :::. ::: : ..: : : . : . :. :
CCDS33 ISLPEGVTDD-GVFPGDHESHRGSLL----LGGGAGQQGPLPRSPLP-------QPSNPD
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CCDS33 SRH-------GEDEHQPPPTSELAPGAVD------VSAFDAGQKKTFLS----AEYLDEP
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:::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...: . .: :
CCDS33 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
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pF1KE2 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY
::..::::.:::.::.:::.::..:. :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
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CCDS33 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
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CCDS33 VPQVPAEG-VDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKL
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CCDS33 TDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKA
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CCDS33 RCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKG
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CCDS33 WMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKL
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CCDS33 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICL
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CCDS33 NMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVV
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:::.. ..: :.. . .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS33 LSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALF
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::::::::::::::::::..: .:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS
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::::::::::::.::::::.:::::::::::.::::::::::::.::::::.:::::.::
CCDS33 PILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIMVNMYIAVILENFNVA
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pF1KE2 TEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINM
:::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::. ::.:
CCDS33 TEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQM
1730 1740 1750 1760 1770 1780
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pF1KE2 DLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRR
:::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.::::
CCDS33 DLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRW
1790 1800 1810 1820 1830 1840
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pF1KE2 KHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSEN
:.:..:: :::.:.: ..:.::. .. .: ::.: :. ::..:.. .::
CCDS33 KQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANEN
1850 1860 1870 1880 1890 1900
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pF1KE2 FSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESI
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CCDS33 C---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
1910 1920 1930 1940 1950
pF1KE2 V
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLDLQ
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CCDS33 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKD----DDENGPKPNSDLE
10 20 30 40 50
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pF1KE2 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
:.:.:: .::. : :...::::::::.: ..::::::::::.:::::::.:::.:.::.:
CCDS33 AGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
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CCDS33 LRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIAR
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTI
::::. :::::::::::::.:: .::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS33 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCV---------------RNF
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CCDS33 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 TA-LNGT--NGSV-EADGLVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYR
:. ::: : .: : : :.: :..: . . . .: :.:::::::::: :::::
CCDS33 TVNYNGTLINETVFEFD---WKS---YIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYM
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 CLKAGENPDHGYTSFDSFAWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLG
:.:::.::..::::::.:.::::.:::::::: :: ::: :::.::: :::::.::::::
CCDS33 CVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLG
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410 420 430 440 450
pF1KE2 SFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSR--
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CCDS33 SFYLINLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATASEHS
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE2 -----------SSLEMSPLAPVNSHERRSKRRKRMS---SGTEECGEDRLPKSDSEDGPR
:: : : :. ...:::..:.:: . :: :: ::.. ::.:::. :
CCDS33 REPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEKDEDEFQKSESEDSIR
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540
pF1KE2 AM--------NHLSLTRGLS---------RTSM-KPR-SSRGSIFTFRRR--DLGSEADF
:.:. . : : :. .:: .:: :.:.:: : :.::: ::
CCDS33 RKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVGSENDF
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ADDENSTAGESESHHTSLLVPW--PLRRTSAQGQPSPGTSAPG-HALHGKKNSTVDCNGV
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CCDS33 ADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNSNLSQTSRSSRMLAVFPANGKMHSTVDCNGV
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPGARQ
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CCDS33 VSLVG-GPSVPTSPVGQLL-------PEGTTTETEMR--KRRSSSFHVSMDFLEDPSQRQ
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pF1KE2 RALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTD
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CCDS33 RAMSIASILTNTVEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVMDPFVD
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pF1KE2 LTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQG
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CCDS33 LAITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEG
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CCDS33 WNIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALG
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pF1KE2 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSEL--RDSDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGE
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CCDS33 NLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGE
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pF1KE2 WIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDREMNN
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CCDS33 WIETMWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDNEMNN
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pF1KE2 LQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPPPETEK
::.:. :...:. .::: ..: . .. .: : : . : .: .
CCDS33 LQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEF---IQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNHTAE
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1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 VPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQES
. . .: : :: .. : . :: . .. .. : .
CCDS33 IGKDLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYII--------------DESDYMSFINNPSLTVT
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pF1KE2 QPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEG
:.. : .: . . :::.. :. .. .: :::
CCDS33 VPIAVG-----ESDFENLNTEDFSSESDLEESKEKLNES---------------SSSSEG
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pF1KE2 STADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCY
::.:. .: :: ... .:: :::::::.: :: ... .. :: :: ::.::.
CCDS33 STVDIGAPVE--EQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLRRTCF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE2 HIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWV
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CCDS33 RIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KE2 AYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEG
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CCDS33 AYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEG
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CCDS33 MRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDR-FDIEDVN
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pF1KE2 NKSQCESLNLTGEL-YWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQP
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CCDS33 NHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQP
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pF1KE2 QWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAM
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CCDS33 KYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAM
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pF1KE2 KKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKIN
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CCDS33 KKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEYVTT
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pF1KE2 ILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFS
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CCDS33 ILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVS
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pF1KE2 PTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMAN
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CCDS33 PTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSN
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pF1KE2 FAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGS
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CCDS33 FAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNPGSS
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pF1KE2 -RGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEI
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CCDS33 VKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEV
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pF1KE2 WEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAF
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CCDS33 WEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAF
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pF1KE2 TKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLL
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CCDS33 TKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHLL
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1980 1990
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:34:21 2016 done: Sun Nov 6 09:34:22 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]