Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2369
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2369, 580 aa
1>>>pF1KE2369 580 - 580 aa - 580 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0949+/-0.0011; mu= 8.3314+/- 0.066
mean_var=229.7681+/-48.804, 0's: 0 Z-trim(110.2): 32 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.084611
statistics sampled from 11386 (11412) to 11386 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16
Scan time: 3.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 579) 3735 469.3 5.7e-132
CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 731) 2561 326.1 9.3e-89
CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19 ( 543) 2348 300.0 5.1e-81
CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 426) 2199 281.7 1.3e-75
CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 ( 231) 1472 192.7 4.4e-49
CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 ( 746) 1386 182.7 1.4e-45
CCDS12630.1 KCNN4 gene_id:3783|Hs108|chr19 ( 427) 1131 151.3 2.3e-36
>>CCDS4114.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 (579 aa)
initn: 3443 init1: 3443 opt: 3735 Z-score: 2482.7 bits: 469.3 E(32554): 5.7e-132
Smith-Waterman score: 3735; 99.8% identity (99.8% similar) in 580 aa overlap (1-580:1-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSEAQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS41 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSEAQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAA-V
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTL
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDF
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580
pF1KE2 IEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
540 550 560 570
>>CCDS30880.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (731 aa)
initn: 2689 init1: 2525 opt: 2561 Z-score: 1707.0 bits: 326.1 E(32554): 9.3e-89
Smith-Waterman score: 2685; 73.6% identity (86.6% similar) in 580 aa overlap (1-580:175-728)
10 20 30
pF1KE2 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSE
::::.:.::::.::: :::::::: : ..:
CCDS30 ATSGPGGGSRHRQASPLVHRRDSNPFTEIAMSSCKYSGGVMKPLSRLSASRRNLIEAETE
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 AQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAAVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGS
.:::: ::: . ::::.:. : :.... :. .. .
CCDS30 GQPLQ----------LFSPS------------NPPEIVISSREDNHAHQTLLHHPNATHN
210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 TGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVM
.: . .:.. :..:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HQHAG----TTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVM
250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAM
::::::::: :.: :..::::::::::::::::::::.::.::.:::..:::::::::::
CCDS30 VIETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAM
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 TYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLI
:::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: . ::::::::::::::::::
CCDS30 TYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEADVDIILSIPMFLRLYLI
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTV
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALV
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS30 RVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALV
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 VAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVR
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.:::::::::
CCDS30 VAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWLIYKHTKLLKKIDHAKVR
540 550 560 570 580 590
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 KHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVT
:::::::::::::::::::::::.:::::::::.: ::.:::.:..::.::::.::.: .
CCDS30 KHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYDLITELNDRSEDLEKQIGS
600 610 620 630 640 650
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 LETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSS
::.::: : .:...:: ::..:.::::.... : .:. :. .. .. :. ::
CCDS30 LESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSVAVGTTHTPISDSPIGVSS
660 670 680 690 700 710
580
pF1KE2 TAPPTSSESS
:. :: ::
CCDS30 TSFPTPYTSSSSC
720 730
>>CCDS67611.1 KCNN1 gene_id:3780|Hs108|chr19 (543 aa)
initn: 2082 init1: 2031 opt: 2348 Z-score: 1568.1 bits: 300.0 E(32554): 5.1e-81
Smith-Waterman score: 2362; 70.1% identity (85.0% similar) in 539 aa overlap (1-534:1-508)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSSCRYNGGVMRPL-SNLSASRRNLHEMDSEA-QPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAA
:.: :::.: ::: :. .: :. : :: .: ::: : : ..: . :
CCDS67 MNSHSYNGSVGRPLGSGPGALGRD--PPDPEAGHPPQPPHSPG------LQVVVAKSEPA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 AVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNI
: ..:. ..:. ..... . . . .: . .. : .:.
CCDS67 RPSPGSPR---GQPQDQDDDE--------------------DDEEDEAGRQRASGKPSNV
60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLS
:..:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.: : ::::.:::::::::
CCDS67 GHRLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVTETELSWGVYTKESLYSFALKCLISLS
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTW
: :::::...::::::::::::::::::::::: ::.:.: ::. ::::::.::.: :::
CCDS67 TAILLGLVVLYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTCERVFLISLELAVCAIHPVPGHYRFTW
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFN
::::::.::::.. ::::..:::::::::::..::::::::.:::::::::::::::.::
CCDS67 TARLAFTYAPSVAEADVDVLLSIPMFLRLYLLGRVMLLHSKIFTDASSRSIGALNKITFN
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFL
::::::::::::::::::::::: :::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::
CCDS67 TRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISSWIIAAWTVRVCERYHDKQEVTSNFLGAMWLISITFL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTK
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RVKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQ---LRSVKMEQRKLND
::::::::::::::::::.:.:::: :.:.:::::::::::::: :::::.:: ::::
CCDS67 RVKNAAANVLRETWLIYKHTRLVKKPDQARVRKHQRKFLQAIHQAQKLRSVKIEQGKLND
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 QANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQ
:::::.::::::..:::..:.:. . :..: :..:::..:..: .:..::::::.:.::
CCDS67 QANTLTDLAKTQTVMYDLVSELHAQHEELEARLATLESRLDALGASLQALPGLIAQAIRP
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KE2 QQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
CCDS67 PPPPLPPRPGPGPQDQAARSSPCRWTPVAPSDCG
510 520 530 540
>>CCDS1072.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (426 aa)
initn: 2199 init1: 2199 opt: 2199 Z-score: 1471.1 bits: 281.7 E(32554): 1.3e-75
Smith-Waterman score: 2199; 81.1% identity (92.8% similar) in 418 aa overlap (163-580:6-423)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 KRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAR
: :..::::::::::::::::::::.::.:
CCDS10 MERPIKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTR
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 EIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTT
:.:::..::::::::::::::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: .
CCDS10 EVQLFVIDNGADDWRIAMTYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAE
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 ADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPG
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 TVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCG
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS10 TVLLVFSISLWIIAAWTVRVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCG
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 KGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS10 KGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETW
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 LIYKNTKLVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYD
::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.: ::.:::
CCDS10 LIYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLSDQANTLVDLSKMQNVMYD
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 MISDLNERSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHV
.:..::.::::.::.: .::.::: : .:...:: ::..:.::::.... : .:. :
CCDS10 LITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLSAIIEARGVSV
340 350 360 370 380 390
560 570 580
pF1KE2 TYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
. .. .. :. :::. :: ::
CCDS10 AVGTTHTPISDSPIGVSSTSFPTPYTSSSSC
400 410 420
>>CCDS43352.1 KCNN2 gene_id:3781|Hs108|chr5 (231 aa)
initn: 1472 init1: 1472 opt: 1472 Z-score: 994.7 bits: 192.7 E(32554): 4.4e-49
Smith-Waterman score: 1472; 100.0% identity (100.0% similar) in 231 aa overlap (350-580:1-231)
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 ISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLT
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 GIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTK
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 LVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNE
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 RSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSEDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKHVTYNAERS
160 170 180 190 200 210
560 570 580
pF1KE2 RSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
:::::::::::::::::::::
CCDS43 RSSSRRRRSSSTAPPTSSESS
220 230
>>CCDS72928.1 KCNN3 gene_id:3782|Hs108|chr1 (746 aa)
initn: 2668 init1: 1332 opt: 1386 Z-score: 931.7 bits: 182.7 E(32554): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 2637; 71.6% identity (84.2% similar) in 595 aa overlap (1-580:175-743)
10 20 30
pF1KE2 MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSE
::::.:.::::.::: :::::::: : ..:
CCDS72 ATSGPGGGSRHRQASPLVHRRDSNPFTEIAMSSCKYSGGVMKPLSRLSASRRNLIEAETE
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 AQPLQPPASVGGGGGASSPSAAAAAAAAAVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGS
.:::: ::: . ::::.:. : :.... :. .. .
CCDS72 GQPLQ----------LFSPS------------NPPEIVISSREDNHAHQTLLHHPNATHN
210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 TGGGGGGGGSGHGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVM
.: . .:.. :..:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HQHAG----TTASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVM
250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAM
::::::::: :.: :..::::::::::::::::::::.::.::.:::..:::::::::::
CCDS72 VIETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAM
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 TYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLI
:::::..: ::.::::::::::.: : :::::::::.:: . ::::::::::::::::::
CCDS72 TYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWTARLAFSYTPSRAEADVDIILSIPMFLRLYLI
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTV
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370
pF1KE2 RACER---------------YHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGV
:.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS72 RVCESPESPAQPSGSSLPAWYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGV
480 490 500 510 520 530
380 390 400 410 420 430
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. .. :. :::. :: ::
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