FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2379, 1159 aa 1>>>pF1KE2379 1159 - 1159 aa - 1159 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0487+/-0.000923; mu= 7.2428+/- 0.056 mean_var=237.2462+/-47.310, 0's: 0 Z-trim(113.8): 31 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.083267 statistics sampled from 14376 (14406) to 14376 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.443), width: 16 Scan time: 5.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5910.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 (1159) 7844 956.1 0 CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 ( 819) 5337 654.8 2.3e-187 CCDS2219.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 (1196) 3836 474.7 5.9e-133 CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 994) 3076 383.3 1.6e-105 CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 958) 3031 377.9 6.4e-104 CCDS2220.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 ( 732) 2954 368.5 3.2e-101 CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs108|chr3 (1107) 1627 209.3 4.2e-53 CCDS11639.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 905) 1498 193.7 1.7e-48 CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17 (1017) 1442 187.0 1.9e-46 CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 962) 1118 148.1 9.7e-35 CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 988) 1086 144.2 1.4e-33 CCDS8786.1 KCNH3 gene_id:23416|Hs108|chr12 (1083) 986 132.3 6.3e-30 CCDS1496.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 989) 943 127.1 2.1e-28 CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 611) 900 121.7 5.3e-27 CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 ( 889) 670 94.2 1.5e-18 CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 676) 570 82.1 4.9e-15 CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 694) 570 82.1 5e-15 CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 ( 890) 526 76.9 2.3e-13 CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 ( 774) 480 71.3 9.7e-12 >>CCDS5910.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 (1159 aa) initn: 7844 init1: 7844 opt: 7844 Z-score: 5102.8 bits: 956.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7844; 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CCDS22 VAMMFIINFEYVTDNENAATP-----ERVNPILPIKTVNRKFFGFKFPGLRVLTYRKQSL 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 RSGGAGGAGAPGAVVVDVDLTPAAPSSESLALDEVTAMDNHVAGLGPAEERRALVGPG-- . : .::.: . :..:.:. . . .. . . :.. .::. :. CCDS22 PQED------PDVVVID----SSKHSDDSVAMKHFKSPTKESCSPSEADDTKALIQPSKC 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 SPPRSAPGQLP--SPRAH--SLNPDASGSSCSLARTRSRESCASVRRASSADDIEAMRAG :: . : : ::. . : :: :: .:...::::: :.:::::. :::.. : CCDS22 SPLVNISGPLDHSSPKRQWDRLYPDMLQSSSQLSHSRSRESLCSIRRASSVHDIEGF--G 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE2 VLPPP---PRHAST-------GAMHPLRSGLLNSTSDSDLVRYRTISKIPQITLNFVDLK : : :::: : .. ..:.::.:::::.: .: ::.::::.:::: ..: CCDS22 VHPKNIFRDRHASEDNGRNVKGPFNHIKSSLLGSTSDSNLNKYSTINKIPQLTLNFSEVK 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 GDPFLASP-TSDREIIAPKIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHY . .:: .::. :::::.:.::::::::::::::::::::::::::.:::...::::: CCDS22 TEKKNSSPPSSDKTIIAPKVKDRTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQTPRINKFTILHY 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMF :::::::::::::::::::.::::::::::.. :: ::::.:.:: :::::::::: CCDS22 SPFKAVWDWLILLLVIYTAIFTPYSAAFLLNDREE-QKRRECGYSCSPLNVVDLIVDIMF 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 IVDILINFRTTYVNANEEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSEE---L :.:::::::::::: :::::: :..::.::::::::::::::::::::::::::.: : CCDS22 IIDILINFRTTYVNQNEEVVSDPAKIAIHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSDETTTL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 IGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMD ::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::::::::::.:.:.. CCDS22 IGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLMLLMCIFALIAHWLACIWYAIGNVERPYLT 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 SRIGWLHNLGDQIGKPYNSS-GLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKI ..:::: .::.:::: ::.: . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS22 DKIGWLDSLGQQIGKRYNDSDSSSGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKI 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 FSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEE ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::: CCDS22 FSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHMQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEE 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 YFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGATKGCLRALAMKFK ::::::.:::::::: ::::::::::::::::::..:::.:: ::::.:::::::::::: CCDS22 YFQHAWTYTNGIDMNMVLKGFPECLQADICLHLNQTLLQNCKAFRGASKGCLRALAMKFK 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 TTHAPPGDTLVHAGDLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFGEPLNLYARPGKSN :::::::::::: ::.::::::.::::::::. :.::::::::::::: ..:::.::::: CCDS22 TTHAPPGDTLVHCGDVLTALYFLSRGSIEILKDDIVVAILGKNDIFGEMVHLYAKPGKSN 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 GDVRALTYCDLHKIHRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSLEITFNLRDTNMIPG---SPGSTE .:::::::::::::.:.:::::::::::::::: ..::.::::: . : . .. CCDS22 ADVRALTYCDLHKIQREDLLEVLDMYPEFSDHFLTNLELTFNLRHESAKADLLRSQSMND 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 LEGGFSRQRKRKLSFRRRTDKD--TEQPGEVSALGPGRAGAGPSSRGRPGGPWGESPSSG :: . :.:::::. . .:. :..: : :: ::. . . :. : . CCDS22 SEGDNCKLRRRKLSFESEGEKENSTNDP-EDSA---DTIRHYQSSKRH----FEEKKSRS 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 PSSPESSEDEGPGRSSSPLRLVPFSSPRPPGEPPG-GEPLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSG : : .:: ..:: ::. . :: :. : :.. : :: . CCDS22 SSFISSIDDE-----QKPL----FSGIVDSS--PGIGKASGLDFEETV----PTSGRMHI 940 950 960 970 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 VSNIFSFWGDSRGRQYQELPRCPAP---TPSLLNIPL----SSPGRRPRGDVESRLDALQ . : . :.... : : .:: :. . . :.::.::: :: CCDS22 DKRSHSCKDITDMRSWERENAHPQPEDSSPSALQRAAWGISETESDLTYGEVEQRLDLLQ 980 990 1000 1010 1020 1030 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 RQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQMTLVPPAYSAVTTPGPGPTSTSPLLPVS-PLPTLTL .::::::.....:. :.:::::.: :.:::::: ::. . :. .: : .. CCDS22 EQLNRLESQMTTDIQTILQLLQKQTTVVPPAYSMVTAGSEYQRPIIQLMRTSQPEASIKT 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 D-SLSQVSQFMACEELPPGAPELPQEGPTRRLSLPGQLGALTSQPLHRHGSDPGS : :.: :: : :. CCDS22 DRSFSPSSQ---CPEFLDLEKSKLKSKESLSSGVHLNTASEDNLTSLLKQDSDLSLELHL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 (994 aa) initn: 2976 init1: 1583 opt: 3076 Z-score: 2008.1 bits: 383.3 E(32554): 1.6e-105 Smith-Waterman score: 3645; 55.8% identity (67.1% similar) in 1215 aa overlap (1-1158:1-987) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MPVRRGHVAPQNTFLDTIIRKFEGQSRKFIIANARVENCAVIYCNDGFCELCGYSRAEVM :::::::::::::.:::::::::::::::.::::..::::.:::::::::: ::::.::: CCDS11 MPVRRGHVAPQNTYLDTIIRKFEGQSRKFLIANAQMENCAIIYCNDGFCELFGYSRVEVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 QRPCTCDFLHGPRTQRRAAAQIAQALLGAEERKVEIAFYRKDGSCFLCLVDVVPVKNEDG :.::::::: :: : :....::::::::: ::.: .::::.: : ::::::::::::: CCDS11 QQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNEDG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 AVIMFILNFEVVMEKDMVGSPAHDTNHRGPPTSWLAPGRAKTFRLKLPALLALTARESSV :::::::::: :.. :. .. :. . :: ..: CCDS11 AVIMFILNFE-----DLAQLLAKCSS------------RSLSQRLLSQSFL--------- 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 RSGGAGGAGAPGAVVVDVDLTPAAPSSESLALDEVTAMDNHVAGLGPAEERRALVGPGSP :. :. : :: :: ::: CCDS11 --GSEGSHGRPG---------------------------------GP--------GPG-- 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 PRSAPGQLPSPRAHSLNPDASGSSCSLARTRSRESCASVRRASSADDIEAMRAGVLPPPP CCDS11 ------------------------------------------------------------ 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 RHASTGAMHPLRSGLLNSTSDSDLVRYRTISKIPQITLNFVDLKGDPFLASPTSDREIIA :: : .:::::.:::.:::::... . .: :.. :::: CCDS11 ----TG------RG-----------KYRTISQIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIA 170 180 190 200 370 380 390 400 410 pF1KE2 P-KIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVI : :. :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVI 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 YTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTTYVNAN ::::::::::::::.. .:. .. :.:.:.::.::::::::::.:::.:::::::::.: CCDS11 YTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGA-CSYTCSPLTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTN 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 EEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSEE---LIGLLKTARLLRLVRVA .:::::: :::::::::::::::::::::::::: .::.: ::::::::::::::::: CCDS11 DEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFRTGSDETTTLIGLLKTARLLRLVRVA 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 RKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDSRIGWLHNLGDQIGKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:... .:::: .:: :.:: CCDS11 RKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKIGWLDSLGVQLGKR 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 YNSSG-LGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASI ::.: .:::..::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS11 YNGSDPASGPSVQDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASI 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 FGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNA :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 FGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNA 510 520 530 540 550 560 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 VLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDL :::::::::::::::::.:.::::: : :: ::::::::.::::::::::::::: ::. CCDS11 VLKGFPECLQADICLHLHRALLQHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDV 570 580 590 600 610 620 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 LTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHR :..::::::::::::: ::::::::::::::::..:.:.::::..:::::::::::::.: CCDS11 LSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQR 630 640 650 660 670 680 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 DDLLEVLDMYPEFSDHFWSSLEITFNLRDT----NMIP-GSPGSTELEGGFSRQRKRKLS :::::::::: :.. :::.::.::::::. . : .::: . .: : :: CCDS11 ADLLEVLDMYPAFAESFWSKLEVTFNLRDAAGGLHSSPRQAPGSQDHQGFF-------LS 690 700 710 720 730 740 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 FRRRTDKDTEQPGEVSALGPGRAGAGPSSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESSEDEGPGRSS :... .: : ::: . ::.: : ::: .. CCDS11 -----DNQSGSPHE---LGP------------------QFPSKGYSL------LGPGSQN 750 760 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 SPLRLVPFSSPRPPGEPPGGEPLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSGVSNIFSFWGDSRGRQYQ : ..: ::.: :. ::: .:. ..: . : CCDS11 SMG-----AGPCAPGHP--------------DAAPPLS-----ISDASGLWPE----LLQ 770 780 790 800 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 ELPRCPAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVESRLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQ :.: : .:. : .: : . :::. :: :.::::.:.:.:.. .:::::. CCDS11 EMP--PRHSPQS---PQEDPDCWPL-KLGSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLSRILQLLQKP 810 820 830 840 850 1080 1090 pF1KE2 M-----------------TLVPPAYSAVTTPGP----G--PTSTSP----LLPVSP---- : .::: : : .:.::: : : . .: : :: CCDS11 MPQGHASYILEAPASNDLALVPIA-SETTSPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRN 860 870 880 890 900 910 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 ----LPTLTL---DSLSQVSQFMACEEL-PPGA-PELPQE------GPTRRLSLPGQLGA .: :.. .:. :. : : :: : : : : :: ::: .::. CCDS11 SSPRMPHLAVATDKTLAPSSEQEQPEGLWPPLASPLHPLEVQGLICGPCFS-SLPEHLGS 920 930 940 950 960 970 1150 pF1KE2 LTSQ-PLHRHGSDPGS . .: ..::::::: CCDS11 VPKQLDFQRHGSDPGFAGSWGH 980 990 >>CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 (958 aa) initn: 3384 init1: 1583 opt: 3031 Z-score: 1979.1 bits: 377.9 E(32554): 6.4e-104 Smith-Waterman score: 3532; 54.8% identity (65.5% similar) in 1210 aa overlap (1-1158:1-951) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MPVRRGHVAPQNTFLDTIIRKFEGQSRKFIIANARVENCAVIYCNDGFCELCGYSRAEVM :::::::::::::.:::::::::::::::.::::..::::.:::::::::: ::::.::: CCDS62 MPVRRGHVAPQNTYLDTIIRKFEGQSRKFLIANAQMENCAIIYCNDGFCELFGYSRVEVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 QRPCTCDFLHGPRTQRRAAAQIAQALLGAEERKVEIAFYRKDGSCFLCLVDVVPVKNEDG :.::::::: :: : :....::::::::: ::.: .::::.: : ::::::::::::: CCDS62 QQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNEDG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 AVIMFILNFEVVMEKDMVGSPAHDTNHRGPPTSWLAPGRAKTFRLKLPALLALTARESSV :::::::::: :.. :. .. :. . :: ..: CCDS62 AVIMFILNFE-----DLAQLLAKCSS------------RSLSQRLLSQSFL--------- 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 RSGGAGGAGAPGAVVVDVDLTPAAPSSESLALDEVTAMDNHVAGLGPAEERRALVGPGSP :. :. : :: :: ::: CCDS62 --GSEGSHGRPG---------------------------------GP--------GPG-- 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 PRSAPGQLPSPRAHSLNPDASGSSCSLARTRSRESCASVRRASSADDIEAMRAGVLPPPP CCDS62 ------------------------------------------------------------ 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 RHASTGAMHPLRSGLLNSTSDSDLVRYRTISKIPQITLNFVDLKGDPFLASPTSDREIIA :: : .:::::.:::.:::::... . .: :.. :::: CCDS62 ----TG------RG-----------KYRTISQIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIA 170 180 190 200 370 380 390 400 410 pF1KE2 P-KIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVI : :. :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 PHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVI 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 YTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTTYVNAN ::::::::::::::.. .:. .. :.:.:.::.::::::::::.:::.:::::::::.: CCDS62 YTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGA-CSYTCSPLTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTN 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 EEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSEE---LIGLLKTARLLRLVRVA .:::::: :::::::::::::::::::::::::: .::.: ::::::::::::::::: CCDS62 DEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFRTGSDETTTLIGLLKTARLLRLVRVA 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 RKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDSRIGWLHNLGDQIGKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:... .:::: .:: :.:: CCDS62 RKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKIGWLDSLGVQLGKR 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 YNSSG-LGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASI ::.: .:::..::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS62 YNGSDPASGPSVQDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASI 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 FGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNA :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 FGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNA 510 520 530 540 550 560 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 VLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDL :::::::::::::::::.:.::::: : :: ::::::::.::::::::::::::: ::. CCDS62 VLKGFPECLQADICLHLHRALLQHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDV 570 580 590 600 610 620 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 LTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHR :..::::::::::::: ::::::::::::::::..:.:.::::..:::::::::::::.: CCDS62 LSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQR 630 640 650 660 670 680 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 DDLLEVLDMYPEFSDHFWSSLEITFNLRDTNMIPGSPGSTELEGGFSRQRKRKLSFRRRT :::::::::: :.. :::.::.::::::. ::. CCDS62 ADLLEVLDMYPAFAESFWSKLEVTFNLRDAA------------GGLHS------------ 690 700 710 720 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 DKDTEQPGEVSALGPGRAGAGPSSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESSEDEGPGRSSSPLRL : : :: :.. .: CCDS62 ----------------------SPRQAPG---------------SQDHQG---------- 730 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 VPFSSPRPPGEPPGGEPLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSGVSNIFSFWGDSRGRQYQELPRC : .. : . ::. ::: .:. ..: . ::.: CCDS62 --F--------------FLSDNQ--SDAAPPLS-----ISDASGLWPE----LLQEMP-- 740 750 760 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 PAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVESRLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQM---- : .:. : .: : . :::. :: :.::::.:.:.:.. .:::::. : CCDS62 PRHSPQS---PQEDPDCWPL-KLGSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLSRILQLLQKPMPQGH 770 780 790 800 810 820 1080 1090 1100 pF1KE2 -------------TLVPPAYSAVTTPGP----G--PTSTSP----LLPVSP--------L .::: : : .:.::: : : . .: : :: . CCDS62 ASYILEAPASNDLALVPIA-SETTSPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNSSPRM 830 840 850 860 870 880 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 PTLTL---DSLSQVSQFMACEEL-PPGA-PELPQE------GPTRRLSLPGQLGALTSQ- : :.. .:. :. : : :: : : : : :: ::: .::.. .: CCDS62 PHLAVATDKTLAPSSEQEQPEGLWPPLASPLHPLEVQGLICGPCFS-SLPEHLGSVPKQL 890 900 910 920 930 940 1150 pF1KE2 PLHRHGSDPGS ..::::::: CCDS62 DFQRHGSDPGFAGSWGH 950 >>CCDS2220.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 (732 aa) initn: 3042 init1: 729 opt: 2954 Z-score: 1930.7 bits: 368.5 E(32554): 3.2e-101 Smith-Waterman score: 3113; 67.3% identity (83.4% similar) in 730 aa overlap (1-716:1-712) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MPVRRGHVAPQNTFLDTIIRKFEGQSRKFIIANARVENCAVIYCNDGFCELCGYSRAEVM ::::::::::::::: :::::::::..:::::::::.:::.:::::::::. :.:: .:: CCDS22 MPVRRGHVAPQNTFLGTIIRKFEGQNKKFIIANARVQNCAIIYCNDGFCEMTGFSRPDVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 QRPCTCDFLHGPRTQRRAAAQIAQALLGAEERKVEIAFYRKDGSCFLCLVDVVPVKNEDG :.::::::::::.:.:. :::::::::.::::::...:.:.:: :.: . ..::::..: CCDS22 QKPCTCDFLHGPETKRHDIAQIAQALLGSEERKVEVTYYHKNGSTFICNTHIIPVKNQEG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 AVIMFILNFEVVMEKDMVGSPAHDTNHRGPPTSWLAPGRAKTFRLKLPALLALTARESSV ...:::.::: : ... ...: .: : . : : .:.:.: .:: :..:. CCDS22 VAMMFIINFEYVTDNENAATP-----ERVNPILPIKTVNRKFFGFKFPGLRVLTYRKQSL 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 RSGGAGGAGAPGAVVVDVDLTPAAPSSESLALDEVTAMDNHVAGLGPAEERRALVGPG-- . : .::.: . :..:.:. . . .. . . :.. .::. :. CCDS22 PQED------PDVVVID----SSKHSDDSVAMKHFKSPTKESCSPSEADDTKALIQPSKC 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 SPPRSAPGQLP--SPRAH--SLNPDASGSSCSLARTRSRESCASVRRASSADDIEAMRAG :: . : : ::. . : :: :: .:...::::: :.:::::. :::.. : CCDS22 SPLVNISGPLDHSSPKRQWDRLYPDMLQSSSQLSHSRSRESLCSIRRASSVHDIEGF--G 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 VLPPP---PRHASTGAMHPLRSGLLNSTSDSDLVRYRTISKIPQITLNFVDLKGDPFLAS : : :::: : .. ..:.::.:::::.: .: ::.::::.:::: ..: . .: CCDS22 VHPKNIFRDRHASEGPFNHIKSSLLGSTSDSNLNKYSTINKIPQLTLNFSEVKTEKKNSS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 P-TSDREIIAPKIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVW : .::. :::::.:.::::::::::::::::::::::::::.:::...:::::::::::: CCDS22 PPSSDKTIIAPKVKDRTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQTPRINKFTILHYSPFKAVW 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 DWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILIN ::::::::::::.::::::::::.. :: ::::.:.:: :::::::::::.::::: CCDS22 DWLILLLVIYTAIFTPYSAAFLLNDREE-QKRRECGYSCSPLNVVDLIVDIMFIIDILIN 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 pF1KE2 FRTTYVNANEEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSEE---LIGLLKTA ::::::: :::::: :..::.::::::::::::::::::::::::::.: :::::::: CCDS22 FRTTYVNQNEEVVSDPAKIAIHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSDETTTLIGLLKTA 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 RLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDSRIGWLH :::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::::::::::.:.:.. ..:::: CCDS22 RLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLMLLMCIFALIAHWLACIWYAIGNVERPYLTDKIGWLD 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 NLGDQIGKPYNSS-GLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVML .::.:::: ::.: . .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS22 SLGQQIGKRYNDSDSSSGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVML 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 IGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWS :::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::. 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CCDS26 GDVVLFLASF-----KDIT-----DTK--------------------------------- 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRSGGAGGAGAPGAVVVDVDLTPAAPSSESLALDEVTAMDNHVAGLGPAEERRALVGPGS : .:: :. :.: . CCDS26 ------------------VKITP-----EDKKEDKVKG---------------------- 140 150 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PPRSAPGQLPSPRAHSLNPDASGSSCSLARTRSRESCASVRRASSADDIEAMRAGVLPPP :: :: :. . :: ::: .:: CCDS26 --RS--------RA--------GTHFDSARRRSR--------------------AVL--- 160 170 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 PRHASTGAMHPLRSGLLNSTSDSDLVRYRTISKIPQITLN-FVDLKGDPFLASPTSDREI : : : : . : .:. .:. : ::: .:. CCDS26 -YHIS---------GHL---------QRREKNKL-KINNNVFVD--------KPA----- 180 190 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 IAPKIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLV .::::.. . .. .::.: ::: ::::::: . CCDS26 --------------------------FPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLAT 200 210 220 230 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 IYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTTYVNA .:.:: .::.. :. .. .: .: :. :.:.::.::..:::::::. CCDS26 FYVAVTVPYNVCFIGNDDLSTTRST---------TVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSK 240 250 260 270 280 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 NEEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLI-FGSGSEELIGLLKTARLLRLVRVAR . .:. . : .:: ::.::..::.::::: :. :. ::::.:::::.:. . CCDS26 SGQVIFEARSICIHYVTTWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQ 290 300 310 320 330 340 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 KLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPH---MDSRIGWLHNLGDQIG ::::::.... :: ::: :::.:::.:::::.::.::. . ..::::.:: .. CCDS26 KLDRYSQHSTIVLTLLMSMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLE 350 360 370 380 390 400 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 KPY-NSSGLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYA .:: ... ::::::.. :..:::::.:::::::::::: ::..:::::::.::::.::.: CCDS26 SPYYGNNTLGGPSIRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHA 410 420 430 440 450 460 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 SIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDM .::::.:::::.:: . :::. ...::: :..:. :.::. :::: .:: .:::: CCDS26 LVFGNVTAIIQRMYSRWSLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDS 470 480 490 500 510 520 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 NAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAG : .:: ::. :..:: .:::. .:: . :. :..::::.:....::. ::. :.. : CCDS26 NELLKDFPDELRSDITMHLNKEILQ-LSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQG 530 540 550 560 570 580 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 DLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKI : : :.::. ::.:.:. ..:.:::::.:..: :.. . :.:.::.:::::::. : CCDS26 DALQAIYFVCSGSMEVLKDSMVLAILGKGDLIGANLSIKDQVIKTNADVKALTYCDLQCI 590 600 610 620 630 640 840 850 860 870 880 pF1KE2 HRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSLE--ITFNLRD---TNMIP----GSPGSTELEGGFSRQ :.::::.:::.. .: ... .:.:::. ...: : : : . CCDS26 ILKGLFEVLDLYPEYAHKFVEDIQHDLTYNLREGHESDVISRLSNKSMVSQSEPKGNGNI 650 660 670 680 690 700 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 RKRKLSFRRRTDKDTEQPGE---VSALGPGRAGAGPSSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESS :: :. . :.. :. :: . .:.: : :::.. : ... : : . . CCDS26 NKRLPSIVE--DEEEEEEGEEEEAVSLSPI-CTRGSSSRNKKVG--SNKAYLGLSLKQLA 710 720 730 740 750 950 960 970 980 990 pF1KE2 EDEGPGRSSSPLRLVPFSSPRPPGE--PPGGEPLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSGVSNIFS : .: :.:. .::. : ::. . : : . . .: . : . CCDS26 SGTVPFHS--PIRVSRSNSPKTKQEIDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPRIVD 760 770 780 790 800 810 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 FWGDSRGRQYQELPRCPAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVES-------RLDALQRQLNRL : : . .: . . . : :: : :: : . . ..:.:.: CCDS26 --GIEDGNSSEESQTFDFGSERIRSEPRISP---PLGDPEIGAAVLFIKAEETKQQINKL 820 830 840 850 860 870 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 ETRLSADMATVLQLLQRQMTLVPPAYSAVTTPGPGPTSTSPLLPVSPLPTL-TLDSLSQV ...... : :: ..: : : .: :. : .: :. .:.. .. CCDS26 NSEVTTLTQEVSQL-GKDMRNVIQLLENVLSPQQ-PSRFCSLHSTSVCPSRESLQTRTSW 880 890 900 910 920 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 SQFMACEELPPGAPELPQEGPTRRLSLPGQLGALTSQPLHRHGSDPGS : . : .: :. : CCDS26 SAHQPCLHLQTGGAAYTQAQLCSSNITSDIWSVDPSSVGSSPQRTGAHEQNPADSELYHS 930 940 950 960 970 980 >>CCDS11639.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 (905 aa) initn: 3103 init1: 1477 opt: 1498 Z-score: 984.2 bits: 193.7 E(32554): 1.7e-48 Smith-Waterman score: 3170; 51.9% identity (61.6% similar) in 1209 aa overlap (1-1158:1-898) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MPVRRGHVAPQNTFLDTIIRKFEGQSRKFIIANARVENCAVIYCNDGFCELCGYSRAEVM :::::::::::::.:::::::::::::::.::::..::::.:::::::::: ::::.::: CCDS11 MPVRRGHVAPQNTYLDTIIRKFEGQSRKFLIANAQMENCAIIYCNDGFCELFGYSRVEVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 QRPCTCDFLHGPRTQRRAAAQIAQALLGAEERKVEIAFYRKDGSCFLCLVDVVPVKNEDG :.::::::: :: : :....::::::::: ::.: .::::.: : ::::::::::::: CCDS11 QQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNEDG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 AVIMFILNFEVVMEKDMVGSPAHDTNHRGPPTSWLAPGRAKTFRLKLPALLALTARESSV :::::::::: :.. :. .. :. . :: ..: CCDS11 AVIMFILNFE-----DLAQLLAKCSS------------RSLSQRLLSQSFL--------- 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 RSGGAGGAGAPGAVVVDVDLTPAAPSSESLALDEVTAMDNHVAGLGPAEERRALVGPGSP :. :. : :: :: ::: CCDS11 --GSEGSHGRPG---------------------------------GP--------GPG-- 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 PRSAPGQLPSPRAHSLNPDASGSSCSLARTRSRESCASVRRASSADDIEAMRAGVLPPPP CCDS11 ------------------------------------------------------------ 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 RHASTGAMHPLRSGLLNSTSDSDLVRYRTISKIPQITLNFVDLKGDPFLASPTSDREIIA :: : .:::::.:::.:::::... . .: :.. :::: CCDS11 ----TG------RG-----------KYRTISQIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIA 170 180 190 200 370 380 390 400 410 pF1KE2 P-KIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVI : :. :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVI 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 YTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTTYVNAN ::::::::::::::.. .:. .. :.:.:.::.::::::::::.:::.:::::::::.: CCDS11 YTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGA-CSYTCSPLTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTN 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 EEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSEE---LIGLLKTARLLRLVRVA .:::::: :::::::::::::::::::::::::: .::.: ::::::::::::::::: CCDS11 DEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFRTGSDETTTLIGLLKTARLLRLVRVA 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 RKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDSRIGWLHNLGDQIGKP ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 RKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACI----------------------------- 390 400 410 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 YNSSGLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASIF ::::::::::::::::::.::::::::::::::::: CCDS11 -----------------------CSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIF 420 430 440 450 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 GNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAV ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 GNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAV 460 470 480 490 500 510 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 LKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDLL ::::::::::::::::.:.::::: : :: ::::::::.::::::::::::::: ::.: CCDS11 LKGFPECLQADICLHLHRALLQHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVL 520 530 540 550 560 570 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 TALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHRD ..::::::::::::: ::::::::::::::::..:.:.::::..:::::::::::::.: CCDS11 STLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRA 580 590 600 610 620 630 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 DLLEVLDMYPEFSDHFWSSLEITFNLRDTNMIPGSPGSTELEGGFSRQRKRKLSFRRRTD :::::::::: :.. :::.::.::::::. ::. CCDS11 DLLEVLDMYPAFAESFWSKLEVTFNLRDAA------------GGLHS------------- 640 650 660 670 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 KDTEQPGEVSALGPGRAGAGPSSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESSEDEGPGRSSSPLRLV : : :: :.. .: CCDS11 ---------------------SPRQAPG---------------SQDHQG----------- 680 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 PFSSPRPPGEPPGGEPLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSGVSNIFSFWGDSRGRQYQELPRCP : .. : . ::. ::: .:. ..: . ::.: : CCDS11 -F--------------FLSDNQ--SDAAPPLS-----ISDASGLWPE----LLQEMP--P 690 700 710 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 APTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVESRLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQM----- .: . : .: : . :::. :: :.::::.:.:.:.. .:::::. : CCDS11 RHSP---QSPQEDPDCWPL-KLGSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLSRILQLLQKPMPQGHA 720 730 740 750 760 770 1080 1090 1100 pF1KE2 ------------TLVPPAYSAVTTPGP----G--PTSTSP----LLPVSP--------LP .::: : : .:.::: : : . .: : :: .: CCDS11 SYILEAPASNDLALVPIA-SETTSPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNSSPRMP 780 790 800 810 820 830 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 TLTL---DSLSQVSQFMACEEL-PPGA-PELPQE------GPTRRLSLPGQLGALTSQ-P :.. .:. :. : : :: : : : : :: ::: .::.. .: CCDS11 HLAVATDKTLAPSSEQEQPEGLWPPLASPLHPLEVQGLICGPCFS-SLPEHLGSVPKQLD 840 850 860 870 880 1150 pF1KE2 LHRHGSDPGS ..::::::: CCDS11 FQRHGSDPGFAGSWGH 890 900 >>CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17 (1017 aa) initn: 1839 init1: 649 opt: 1442 Z-score: 947.2 bits: 187.0 E(32554): 1.9e-46 Smith-Waterman score: 1883; 35.5% identity (55.9% similar) in 1185 aa overlap (1-1147:1-967) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MPVRRGHVAPQNTFLDTIIRKFEGQSRKFIIANAR-VENCAVIYCNDGFCELCGYSRAEV ::: .: .:::::::::: .:.: .:..:::. ... ..::.:::::: ::.:.:: CCDS11 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGRTEV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 MQRPCTCDFLHGPRTQRRAAAQIAQALLGAEERKVEIAFYRKDGSCFLCLVDVVPVKNED ::. :.: ::.::.:.. : .. .:: : .:...:: ::::::: : ::.:..:.::: CCDS11 MQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIKNEM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 GAVIMFILNFEVVMEKDMVGSPAHDTNHRGPPTSWLAPGRAKTFRLKLPALLALTARESS : :..:...:. . .. :::. :: CCDS11 GEVVLFLFSFKDITQS---GSPGL-----GP----------------------------- 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRSGGAGGAGAPGAVVVDVDLTPAAPSSESLALDEVTAMDNHVAGLGPAEERRALVGPGS .:: : . :: .:: :: : CCDS11 --QGGRGDS-------------------------------NHENSLG----RR---GATW 150 160 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PPRSAPGQLPSPRAHSLNPDASGSSCSLARTRSRESCASVRRASSADDIEAMRAGVLPPP ::: : ::: :: CCDS11 KFRSA------------------------RRRSRT--------------------VL--- 170 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 PRHASTGAMHPLRSGLLNSTSDSDLVRYRTISKIPQITLNFVDLKGDPFLASPTSDREII : :: : : : .: . .. ... CCDS11 --HRLTG--HFGRRG-----------------------------QG-----GMKANNNVF 180 190 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 APKIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVI :: . .::::. . : .:::: ::.:: :::: .. CCDS11 EPKPS--------------------VPEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATF 200 210 220 230 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 YTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTTYVNAN :.:: .::.. : .. : : . : :. :...::.::..:::::::. . CCDS11 YVAVTVPYNVCF---SGDDDTPITS-----RHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQS 240 250 260 270 280 290 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 EEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-IFGSGSEELIGLLKTARLLRLVRVARK .:.: : :..::. ::.::..::.::::: ::. :. ::::.:::::.:. .: CCDS11 GQVISAPRSIGLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQK 300 310 320 330 340 350 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 LDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDS---RIGWLHNLGDQIGK :.:::. .:.:: ::: .:::.:::.:::::.:: :. : :::::.:: .. CCDS11 LERYSQCSAVVLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELGKRLEV 360 370 380 390 400 410 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 PYNSSGLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASI :: ....:::: .. :..:::::.::::::::::: ::..:::::::.::::.::.: . CCDS11 PYVNGSVGGPSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGALMHAVV 420 430 440 450 460 470 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 FGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNA ::::.:::::.:: . ::..: ...::: :..: ::.::. :::: .:. ..::: : CCDS11 FGNVTAIIQRMYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWAVNSGIDANE 480 490 500 510 520 530 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 VLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGA-TKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGD .:. ::. :.::: .:::: .:: :. :: ..::::::....::. ::. :.. :: CCDS11 LLRDFPDELRADIAMHLNREILQ--LPLFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPGEYLLRRGD 540 550 560 570 580 780 790 800 810 820 pF1KE2 LLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFG----EPLN---LYARPG---KSNGDVRA : : :.. ::.:.:: ..:.:::::.:..: :: . : : :. :...::.: CCDS11 ALQAHYYVCSGSLEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVLKTSADVKA 590 600 610 620 630 640 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 LTYCDLHKIHRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSL--EITFNLRDTNMIPGSPGSTELEGGFS :::: :... : ::: .:::.. : ..: ..:::::. :: : :.: CCDS11 LTYCGLQQLSSRGLAEVLRLYPEYGAAFRAGLPRDLTFNLRQ-----GSDTS-----GLS 650 660 670 680 690 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 R-QRKRKLSFRRRTDKDTEQPGEVSALGPGRAGAGPSSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESS : .:. .:: : . . . . .. ...:: :.. :: : :. .:. :..: CCDS11 RFSRSPRLSQPRSESLGSSSDKTLPSITEAESGAEPGGGPRPRRPL-LLPNLSPARPRGS 700 710 720 730 740 750 950 960 970 980 pF1KE2 E-----DEGPGRS---SSPLRLVPFSSPRPPGE----PPGGEPLMEDCEKSSDTCNPLSG .: : : ::: : : :: :. : : : : . : : CCDS11 LVSLLGEELPPFSALVSSP-SLSPSLSPALAGQGHSASPHGPPRCSAAWKPPQLLIPPLG 760 770 780 790 800 810 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 AFSG-------VSNIFSFWGDSRGRQYQELPRCPAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVESRL .:. :..: . . ... ... : : : : : :: .. :. CCDS11 TFGPPDLSPRIVDGIEDSGSTAEAPSFRFSRRPELPRPRSQAPPT---GTRPSPELASEA 820 830 840 850 860 870 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 DALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQMTLVPPAYSAVTTPGPGPTSTSPLLPVSPLPT . ..... ::. ..: : :: .:.. . .: : :: . : : : : CCDS11 EEVKEKVCRLNQEISRLNQEVSQL-SRELRHIMGLLQARLGP-PGHPAGSAWTPDPPCPQ 880 890 900 910 920 930 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 LTLDSLSQVSQFMACEELPPGAPELPQEGPTRRLSLPGQLGALTSQPLHRHGSDPGS : :: : :: : : :. .. :...:.. . CCDS11 LRPPCLSP------CASRPP--PSL-QDTTLAEVHCPASVGTMETGTALLDLRPSILPPY 940 950 960 970 980 CCDS11 PSEPDPLGPSPVPEASPPTPSLLRHSFQSRSDTFH 990 1000 1010 >>CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 (962 aa) initn: 1934 init1: 905 opt: 1118 Z-score: 737.1 bits: 148.1 E(32554): 9.7e-35 Smith-Waterman score: 1579; 46.8% identity (76.0% similar) in 530 aa overlap (353-863:159-675) 330 340 350 360 370 pF1KE2 DLVRYRTISKIPQITLNFVDLKGDPFLASPTSDREII---APKIK--ERTHNVTEKVTQV ::.: .. ::... : .:. . ....: CCDS31 TFSDITAFKQPIEDDSCKGWGKFARLTRALTSSRGVLQQLAPSVQKGENVHKHS-RLAEV 130 140 150 160 170 180 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 LSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETE :.::.:.::.:: .::. :::: ::..:::.::.:..:::...::...: .:. CCDS31 LQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILHYCVFKTTWDWIILILTFYTAILVPYNVSF---KTR 190 200 210 220 230 240 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 EGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTTYVNANEEVVSHPGRIAVHYFKGW .. : ::: :::..:.:::..::.::.:. ::.: : : ..:.: : CCDS31 QNNVA---------WLVVDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPAGEVISDPKLIRMNYLKTW 250 260 270 280 290 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 FLIDMVAAIPFDLL-IFGS---GSEELIGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLL :.::... .:.:.. : . : :.. ::..::::: :::::::.: ::::::: :: CCDS31 FVIDLLSCLPYDVINAFENVDEGISSLFSSLKVVRLLRLGRVARKLDHYIEYGAAVLVLL 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 600 pF1KE2 MCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDSRI----GWLHNLGDQIGKPY--NSSGLG---- .:.:.: :::.:::::.::..: :.. .::..:. .:: :: :.:: : CCDS31 VCVFGLAAHWMACIWYSIGDYEIFDEDTKTIRNNSWLYQLAMDIGTPYQFNGSGSGKWEG 360 370 380 390 400 410 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 GPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAII ::: .. :...::::..:::::::::..:.:. ::::.. .:.::::.::.:::::..:. CCDS31 GPSKNSVYISSLYFTMTSLTSVGFGNIAPSTDIEKIFAVAIMMIGSLLYATIFGNVTTIF 420 430 440 450 460 470 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 QRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPEC :..:..: ::: .. ::.:....:.:. : .:. .:. .::.. ::: . ::. :. CCDS31 QQMYANTNRYHEMLNSVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSRGIDTEKVLQICPKD 480 490 500 510 520 530 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 LQADICLHLNRSLLQHCKPFRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDLLTALYFIS ..::::.::::..... :: :. ::::::::.:.:.: ::: . :::. . .: :. CCDS31 MRADICVHLNRKVFKEHPAFRLASDGCLRALAMEFQTVHCAPGDLIYHAGESVDSLCFVV 540 550 560 570 580 590 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 RGSIEILRGDVVVAILGKNDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHRDDLLEVLD ::.:... : :::::::.:.::. . : ..: ..:::::::::: :.:: : .::. CCDS31 SGSLEVIQDDEVVAILGKGDVFGDVFWKEATLAQSCANVRALTYCDLHVIKRDALQKVLE 600 610 620 630 640 650 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 MYPEFSDHFWSSLEITFNLRDTNMIPGSPGSTELEGGFSRQRKRKLSFRRRTDKDTEQPG .: :: : .: .:.::: CCDS31 FYTAFSHSFSRNLILTYNLRKRIVFRKISDVKREEEERMKRKNEAPLILPPDHPVRRLFQ 660 670 680 690 700 710 1159 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 16:14:19 2016 done: Sun Nov 6 16:14:20 2016 Total Scan time: 5.700 Total Display time: 0.510 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]