Result of FASTA (omim) for
pF1KE2389
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2389, 691 aa
1>>>pF1KE2389 691 - 691 aa - 691 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9703+/-0.000567; mu= 22.1011+/- 0.035
mean_var=73.9040+/-14.921, 0's: 0 Z-trim(106.1): 99 B-trim: 680 in 1/48
Lambda= 0.149190
statistics sampled from 14114 (14213) to 14114 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.167), width: 16
Scan time: 10.660
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006437 (OMIM: 237450,604843) solute carrier org ( 691) 4561 992.2 0
NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier org ( 702) 3735 814.4 0
NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic an ( 712) 2124 467.7 6.8e-131
XP_005253451 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 712) 2124 467.7 6.8e-131
XP_011519006 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 711) 2112 465.1 4e-130
NP_001139418 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 730) 2043 450.3 1.2e-125
XP_011519005 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 729) 2031 447.7 7.3e-125
XP_016874975 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 1755 388.2 4.8e-107
XP_016874976 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 1755 388.2 4.8e-107
XP_016874974 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1674 370.8 8.7e-102
XP_016874973 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1674 370.8 8.7e-102
XP_005253453 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1674 370.8 8.7e-102
NP_001139416 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 612) 1674 370.8 8.7e-102
XP_011519011 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1674 370.8 8.7e-102
XP_016874977 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 1570 348.4 4.5e-95
XP_011519013 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 1570 348.4 4.5e-95
XP_016874979 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 1555 345.1 4.1e-94
XP_016874978 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 1555 345.1 4.1e-94
XP_005253534 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 650) 1458 324.3 9e-88
XP_011519122 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 668) 1458 324.3 9.1e-88
XP_011519120 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1458 324.3 9.2e-88
NP_602307 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 1458 324.3 9.2e-88
XP_011519121 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1458 324.3 9.2e-88
XP_005253531 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1458 324.3 9.2e-88
NP_066580 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 1458 324.3 9.2e-88
NP_001139417 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 663) 1430 318.3 5.9e-86
XP_016875339 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 578) 1389 309.4 2.4e-83
XP_016875338 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 598) 1389 309.4 2.5e-83
XP_005254946 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 697) 1376 306.7 1.9e-82
NP_037404 (OMIM: 612435) solute carrier organic an ( 710) 1366 304.6 8.7e-82
NP_001138516 (OMIM: 612435) solute carrier organic ( 692) 1365 304.3 1e-81
XP_011519758 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 652) 1325 295.7 3.7e-79
XP_005254948 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 595) 1128 253.3 2e-66
XP_011519123 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 362) 930 210.5 9.4e-54
NP_001139480 (OMIM: 613543) solute carrier organic ( 687) 933 211.3 9.7e-54
XP_016869372 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 687) 933 211.3 9.7e-54
NP_112220 (OMIM: 613543) solute carrier organic an ( 848) 933 211.4 1.1e-53
XP_011541674 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 586) 744 170.6 1.5e-41
XP_011541672 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 636) 744 170.6 1.6e-41
NP_851322 (OMIM: 609013) solute carrier organic an ( 724) 744 170.7 1.8e-41
NP_001138683 (OMIM: 604988) solute carrier organic ( 687) 665 153.7 2.2e-36
NP_009187 (OMIM: 604988) solute carrier organic an ( 709) 665 153.7 2.3e-36
XP_016872646 (OMIM: 604988) PREDICTED: solute carr ( 711) 665 153.7 2.3e-36
NP_005621 (OMIM: 601460,614441) solute carrier org ( 643) 650 150.4 2e-35
XP_016862565 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 597) 638 147.8 1.1e-34
XP_016862564 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 653) 638 147.8 1.2e-34
XP_016869373 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 554) 617 143.2 2.5e-33
XP_016869374 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 544) 593 138.1 8.7e-32
XP_011541455 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 445) 591 137.6 1e-31
XP_011541452 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 476) 591 137.6 1.1e-31
>>NP_006437 (OMIM: 237450,604843) solute carrier organic (691 aa)
initn: 4561 init1: 4561 opt: 4561 Z-score: 5306.0 bits: 992.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4561; 100.0% identity (100.0% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YRYSKETNINSSENSTSTLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YRYSKETNINSSENSTSTLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TNDEKDQTANLTNQGKNITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TNDEKDQTANLTNQGKNITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGIT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 YISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASE
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 NGSVMDEANLESLNKNKHFVPSAGADSETHC
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NGSVMDEANLESLNKNKHFVPSAGADSETHC
670 680 690
>>NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier organic (702 aa)
initn: 3768 init1: 3620 opt: 3735 Z-score: 4345.0 bits: 814.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3735; 79.8% identity (93.6% similar) in 692 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFE
:::.::::::::. ::.:::: :::.::::::::.:.:::.::.:::: :: .:::::.
NP_062 MDQHQHLNKTAESASSEKKKTRRCNGFKMFLAALSFSYIAKALGGIIMKISITQIERRFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGY
:::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::..:: :..::.::::::::
NP_062 ISSSLAGLIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLMGTGSILTSLPHFFMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YRYSKETNINSSENSTSTLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNML
:::::::.:: ::::::.:::::::: ::.: .::::: : :.:::::.:::::::::::
NP_062 YRYSKETHINPSENSTSSLSTCLINQTLSFNGTSPEIVEKDCVKESGSHMWIYVFMGNML
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190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYV
::::::::::::.::::::::::::::::: ::::.::::.:::.:::::.:::::::::
NP_062 RGIGETPIVPLGISYIDDFAKEGHSSLYLGSLNAIGMIGPVIGFALGSLFAKMYVDIGYV
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 DLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLE
::::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::..::::::::: :::::::.
NP_062 DLSTIRITPKDSRWVGAWWLGFLVSGLFSIISSIPFFFLPKNPNKPQKERKISLSLHVLK
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310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TNDEKDQTANLTNQGKNITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVF
:::...:::::::::::.::::::::::.::::::::::.:.:::::::::.::.:::::
NP_062 TNDDRNQTANLTNQGKNVTKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVF
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pF1KE2 KYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLS
::.:::::: .:.::.:::.:::: :.::::::.:::::::. ::::::: .:...:.
NP_062 KYMEQQYGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFIIKKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGIT
: :::: ..::.:::::::.:::::: :.:: :::::::::.::::::::::::::::::
NP_062 FQLLYFPLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGIT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 YISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAI
:.:::::::::::: :: :::::::.::::::::::::::::::::..:::::...:::
NP_062 YLSPCLAGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNYSAHLGECPRDNTCTRKFFIYVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCI
::.: .::: :::. ..: :::::::::.::.::.:::::.::::::::::::::: ::.
NP_062 QVINSLFSATGGTTFILLTVKIVQPELKALAMGFQSMVIRTLGGILAPIYFGALIDKTCM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASE
:::::.::..:.:: :::. :.::::::: :: .:::::..:.:::::.: :: .::.
NP_062 KWSTNSCGAQGACRIYNSVFFGRVYLGLSIALRFPALVLYIVFIFAMKKKFQGKDTKASD
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 NG-SVMDEANLESLNKNKHFVPSAGADSETHC
: .:::::::: ::...:::::::.::.: :
NP_062 NERKVMDEANLEFLNNGEHFVPSAGTDSKT-CNLDMQDNAAAN
670 680 690 700
>>NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic anion (712 aa)
initn: 2088 init1: 1072 opt: 2124 Z-score: 2471.0 bits: 467.7 E(85289): 6.8e-131
Smith-Waterman score: 2124; 45.4% identity (76.1% similar) in 687 aa overlap (15-690:30-711)
10 20 30 40
pF1KE2 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGA
:: ..: :. ::.:: :::. ..::.:.
NP_059 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCCGELKVFLCALSFVYFAKALAE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 IIMKSSIIHIERRFEISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMG
.::.: .:::::.: ::::: :::::::::::::.::::::.::::::.:: :: :::
NP_059 GYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIMG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 IGGVLTALPHFFMGYYRYSKETNINSSENSTSTLSTCLI---NQI-LSLNRASPEIVGKG
.: .: :.:.::: :.: . . : ::: ..: ::. .:. .:. . : ...
NP_059 VGTLLIAMPQFFMEQYKYER---YSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNE
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 CLKESGSYMWIYVFMGNMLRGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPI
: ...: ::::::.::.::::::::: :::..:.::::.: ....:.: ....:.::::
NP_059 CEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IGFTLGSLFSKMYVDIGYVDLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQ
.:: :::: .:.:::::.:.:. : ::: : .:::::::..:..:..:.....::..::.
NP_059 FGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE2 T-PNKPQKERKASLSLHVLETNDEKDQTANLTNQGKN--ITKNVTGFFQSFKSILTNPLY
. : . ..: . : : . : :.: : ::.: : . . :. :.:... ::.:
NP_059 SLPRSQSREDSNSSSEKSKFIID--DHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 VMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVFKYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIK
... . .: .: .: :: ::.:::::: ::.::...:.:.:: : :.: :: ..:
NP_059 FLYLCTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 KFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLSFYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSY
::.... : ::. ..:.. ..: : . :::..:::::..:.:..::. :. . .:
NP_059 KFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSD
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 CNSDCNCDESQWEPVCGNNGITYISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYS
::: :.:.:..:::.::.:::::.: :::::..:. . : :.::::.:. ... .. : :
NP_059 CNSRCKCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSS
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XP_011 VGTLLIAMPQFFMEQYKYER---YSPSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNE
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XP_011 FGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPK
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pF1KE2 T-PNKPQKERKASLSLHVLETNDEKDQTANLTNQGKN--ITKNVTGFFQSFKSILTNPLY
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XP_011 SLPRSQSREDSNSSSEKSKFIID--DHTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVY
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pF1KE2 CNSDCNCDESQWEPVCGNNGITYISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYS
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XP_011 CNSRCKCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSS
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pF1KE2 AHLGECPRDDACTRKFYFFVAIQVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMV
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XP_011 GIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLA
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]