FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2392, 517 aa 1>>>pF1KE2392 517 - 517 aa - 517 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9465+/-0.000369; mu= 20.1349+/- 0.023 mean_var=67.3357+/-13.540, 0's: 0 Z-trim(113.2): 163 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.156297 statistics sampled from 22211 (22380) to 22211 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16 Scan time: 10.170 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholi ( 517) 3498 798.0 0 NP_000742 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61632 ( 517) 1547 358.1 3.6e-98 NP_000071 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) acet ( 493) 1407 326.5 1.1e-88 XP_016879604 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) P ( 481) 1385 321.6 3.4e-87 NP_001243586 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 502) 1333 309.8 1.2e-83 NP_000738 (OMIM: 100710,616313,616314) acetylcholi ( 501) 1290 300.2 9.8e-81 NP_001298125 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 416) 1172 273.5 8.6e-73 XP_011508826 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 390) 807 191.2 4.9e-48 XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 669 160.1 1.3e-38 XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 669 160.1 1.3e-38 XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 669 160.1 1.3e-38 NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 669 160.1 1.4e-38 XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 666 159.4 2.1e-38 NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 664 159.0 2.8e-38 NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 662 158.5 4.1e-38 XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 648 155.4 3.7e-37 XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 648 155.4 3.7e-37 XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 622 149.5 2e-35 XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 622 149.5 2e-35 NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 594 143.3 2e-33 XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 572 138.3 5.6e-32 XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 572 138.3 5.6e-32 NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 572 138.3 5.6e-32 NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 563 136.2 2.2e-31 NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 563 136.2 2.2e-31 NP_001298124 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,61 ( 323) 558 135.0 3.4e-31 NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 558 135.1 4.4e-31 NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 558 135.1 4.7e-31 NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 557 134.8 5.1e-31 XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 538 130.3 6.2e-30 XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 538 130.4 6.2e-30 NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 538 130.6 1e-29 NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 525 127.6 8e-29 NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 521 126.7 1.5e-28 XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 521 126.7 1.5e-28 XP_016855669 (OMIM: 118507,605375) PREDICTED: neur ( 332) 517 125.7 2.1e-28 XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 516 125.6 3e-28 XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 516 125.6 3e-28 NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 516 125.6 3.2e-28 NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 507 123.6 1.3e-27 XP_011519494 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 316) 502 122.3 2.1e-27 XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 497 121.2 5.3e-27 NP_998786 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 516) 498 121.6 5.7e-27 NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 497 121.3 6.6e-27 NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 492 120.2 1.5e-26 NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 489 119.5 2.3e-26 XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 479 117.3 1.2e-25 XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 468 114.8 5.5e-25 XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 462 113.3 1.1e-24 XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 462 113.3 1.1e-24 >>NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholine r (517 aa) initn: 3498 init1: 3498 opt: 3498 Z-score: 4261.1 bits: 798.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3498; 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48.0% identity (74.5% similar) in 521 aa overlap (5-512:2-509) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MHGGQGPLL---LLLLLAVCLGAQGRNQEERLLADLMQN--YDPNLRPAERDSDVVNVSL .::.: :: :::: :. : :.::::. :.:. :. .:::. . . :.:.: NP_000 MEGPVLTLGLLAALAVC-GSWGLNEEERLIRHLFQEKGYNKELRPVAHKEESVDVAL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 KLTLTNLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLE :::.:::::.: ::.:::::::: : : ::.:. ... .. :::.: ::: :.:::: NP_000 ALTLSNLISLKEVEETLTTNVWIEHGWTDNRLKWNAEEFGNISVLRLPPDMVWLPEIVLE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NNVDGVFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYST :: :: :... ::::: : .::::::::::.: ::::::::::::::: :.: :.. NP_000 NNNDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFRSSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NEIDLQLSQEDGQT----IEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAPAQEAGHQKV .:: :.:.:. .. .:::.::::.::::::: : ::::.. .:: :: . ..: . NP_000 KEITLSLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEGFTENGEWEIVHRPARVNVDPRAPLDSPSRQDI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VFYLLIQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLV .:::.:.::::::.:::..:::::: .. :. .::: .: .: .:::.:::::.:::.:. NP_000 TFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFYLPADSG-EKTSVAISVLLAQSVFLLLI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 AKKVPETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLL .:..: ::.:.:::.:.: : .:.. ..:: :.:::. .:.: :: ...::.:.::. : NP_000 SKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTMVVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFLETL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 PQLLRMHVRPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQ-QWQRQGLVA :.::.: :: . . : ...: :. :. .:: : ::.:.:. : .:.:: : NP_000 PELLHMS-RPAEDGPSPGALVR-RSSSLGY-ISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHGL-A 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 AALEKLEKGP---ELGLSQFCGSLKQAAPAIQACVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFL : .. : : . ... . :: :: :.. :.:. ..:..... .. : NP_000 RRLTTARRPPASSEQAQQELFNELK---PA----VDGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNR 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 VGRVLDRVCFLAMLSLFICGTAGIFLMAHYNRVPALPFPGDPRPYLPSPD :.:..::.:.... ... ::: :::.. ::. : :::::: : NP_000 VARTVDRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPPQPFPGDPYSYNVQDKRFI 470 480 490 500 510 >>NP_000071 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) acetylch (493 aa) initn: 1608 init1: 695 opt: 1407 Z-score: 1713.2 bits: 326.5 E(85289): 1.1e-88 Smith-Waterman score: 1601; 50.7% identity (74.5% similar) in 509 aa overlap (5-511:3-493) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MHGGQGPLLLLLLLAVCLGAQGRNQEERLLADLMQNYDPNLRPAERDSDVVNVSLKLTLT ..:: .::::.. . :.:.: :: :..::::. ::... :.:..:::.::: NP_000 MARAPLGVLLLLGLLGRGVGKNEELRLYHHLFNNYDPGSRPVREPEDTVTISLKVTLT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLENNVDG :::::::.::.:::.::: ..: :::: .. :. :. .::::: .:: :.::::::.:: NP_000 NLISLNEKEETLTTSVWIGIDWQDYRLNYSKDDFGGIETLRVPSELVWLPEIVLENNIDG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYSTNEIDL : :: :::: : . ::::::.::.:.. :::::::::::::::.::::...:... NP_000 QFGVAYDANVLVYEGGSVTWLPPAIYRSVCAVEVTYFPFDWQNCSLIFRSQTYNAEEVEF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 QLS-QEDGQTIEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAPAQEAGHQKVVFYLLIQR .. ..::.::. : :: ::.::::::::. :. . .. .. :. :.. :.:.: NP_000 TFAVDNDGKTINKIDIDTEAYTENGEWAIDFCPGVIRRHHGGATDGPGETDVIYSLIIRR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 KPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLVAKKVPETS ::::::::::.::::::....: .::::.::::::::.:::::::::::::.:.:.:::: NP_000 KPLFYVINIIVPCVLISGLVLLAYFLPAQAGGQKCTVSINVLLAQTVFLFLIAQKIPETS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLLPQLLRMHV .:::....: :..::. :::.: :.::::: :.: ::.:. .:.:.:.:::.:: NP_000 LSVPLLGRFLIFVMVVATLIVMNCVIVLNVSQRTPTTHAMSPRLRHVLLELLPRLLGSPP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 RPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQ-QWQRQGLVAAALEKLEK : :: :.. . .:: . .::. : :::::.:. : .::: .:: NP_000 PPEAPRAASPPRR----ASSVGLLLRAEELILKKPRSELVFEGQRHRQGTWTAA------ 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 GPELGLSQFCGSLKQAAPAIQACVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFLVGRVLDRVCFL :: :: ::: .. ::.: :..: . ..: . .: .: .:: .:: NP_000 --------FCQSLGAAAPEVRCCVDAVNFVAESTRDQEATGEEVSDWVRMGNALDNICFW 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 pF1KE2 AMLSLFICGTAGIFLMAHYNRVPALPFPGDPRPYLPSPD : : :: :.. ::: :..:::: ::. .: NP_000 AALVLFSVGSSLIFLGAYFNRVPDLPYAPCIQP 470 480 490 >>XP_016879604 (OMIM: 100725,605809,608931,616324) PREDI (481 aa) initn: 1586 init1: 673 opt: 1385 Z-score: 1686.5 bits: 321.6 E(85289): 3.4e-87 Smith-Waterman score: 1579; 51.2% identity (74.6% similar) in 492 aa overlap (22-511:8-481) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MHGGQGPLLLLLLLAVCLGAQGRNQEERLLADLMQNYDPNLRPAERDSDVVNVSLKLTLT :.:.: :: :..::::. ::... :.:..:::.::: XP_016 MQRGRGVGKNEELRLYHHLFNNYDPGSRPVREPEDTVTISLKVTLT 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLENNVDG :::::::.::.:::.::: ..: :::: .. :. :. .::::: .:: :.::::::.:: XP_016 NLISLNEKEETLTTSVWIGIDWQDYRLNYSKDDFGGIETLRVPSELVWLPEIVLENNIDG 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYSTNEIDL : :: :::: : . ::::::.::.:.. :::::::::::::::.::::...:... XP_016 QFGVAYDANVLVYEGGSVTWLPPAIYRSVCAVEVTYFPFDWQNCSLIFRSQTYNAEEVEF 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE2 QLS-QEDGQTIEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAPAQEAGHQKVVFYLLIQR .. ..::.::. : :: ::.::::::::. :. . .. .. :. :.. :.:.: XP_016 TFAVDNDGKTINKIDIDTEAYTENGEWAIDFCPGVIRRHHGGATDGPGETDVIYSLIIRR 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 KPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLVAKKVPETS ::::::::::.::::::....: .::::.::::::::.:::::::::::::.:.:.:::: XP_016 KPLFYVINIIVPCVLISGLVLLAYFLPAQAGGQKCTVSINVLLAQTVFLFLIAQKIPETS 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLLPQLLRMHV .:::....: :..::. :::.: :.::::: :.: ::.:. .:.:.:.:::.:: XP_016 LSVPLLGRFLIFVMVVATLIVMNCVIVLNVSQRTPTTHAMSPRLRHVLLELLPRLLGSPP 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 RPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQ-QWQRQGLVAAALEKLEK : :: :.. . .:: . .::. : :::::.:. : .::: .:: XP_016 PPEAPRAASPPRR----ASSVGLLLRAEELILKKPRSELVFEGQRHRQGTWTAA------ 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 GPELGLSQFCGSLKQAAPAIQACVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFLVGRVLDRVCFL :: :: ::: .. ::.: :..: . ..: . .: .: .:: .:: XP_016 --------FCQSLGAAAPEVRCCVDAVNFVAESTRDQEATGEEVSDWVRMGNALDNICFW 400 410 420 430 440 480 490 500 510 pF1KE2 AMLSLFICGTAGIFLMAHYNRVPALPFPGDPRPYLPSPD : : :: :.. ::: :..:::: ::. .: XP_016 AALVLFSVGSSLIFLGAYFNRVPDLPYAPCIQP 450 460 470 480 >>NP_001243586 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323 (502 aa) initn: 978 init1: 476 opt: 1333 Z-score: 1622.9 bits: 309.8 E(85289): 1.2e-83 Smith-Waterman score: 1442; 45.9% identity (72.2% similar) in 521 aa overlap (5-512:2-494) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MHGGQGPLL---LLLLLAVCLGAQGRNQEERLLADLMQN--YDPNLRPAERDSDVVNVSL .::.: :: :::: :. : :.::::. :.:. :. .:::. . . :.:.: NP_001 MEGPVLTLGLLAALAVC-GSWGLNEEERLIRHLFQEKGYNKELRPVAHKEESVDVAL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 KLTLTNLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLE :::.:::::. : : ::.:. ... .. :::.: ::: :.:::: NP_001 ALTLSNLISLG---------------WTDNRLKWNAEEFGNISVLRLPPDMVWLPEIVLE 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NNVDGVFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYST :: :: :... ::::: : .::::::::::.: ::::::::::::::: :.: :.. NP_001 NNNDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFRSSCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTA 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NEIDLQLSQEDGQT----IEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAPAQEAGHQKV .:: :.:.:. .. .:::.::::.::::::: : ::::.. .:: :: . ..: . NP_001 KEITLSLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEGFTENGEWEIVHRPARVNVDPRAPLDSPSRQDI 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VFYLLIQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLV .:::.:.::::::.:::..:::::: .. :. .::: .: .: .:::.:::::.:::.:. NP_001 TFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFYLPADSG-EKTSVAISVLLAQSVFLLLI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 AKKVPETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLL .:..: ::.:.:::.:.: : .:.. ..:: :.:::. .:.: :: ...::.:.::. : NP_001 SKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTMVVVICVIVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFLETL 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 PQLLRMHVRPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQ-QWQRQGLVA :.::.: :: . . : ...: :. :. .:: : ::.:.:. : .:.:: : NP_001 PELLHMS-RPAEDGPSPGALVR-RSSSLGY-ISKAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHGL-A 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 pF1KE2 AALEKLEKGP---ELGLSQFCGSLKQAAPAIQACVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFL : .. : : . ... . :: :: :.. :.:. ..:..... .. : NP_001 RRLTTARRPPASSEQAQQELFNELK---PA----VDGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNR 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 pF1KE2 VGRVLDRVCFLAMLSLFICGTAGIFLMAHYNRVPALPFPGDPRPYLPSPD :.:..::.:.... ... ::: :::.. ::. : :::::: : NP_001 VARTVDRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQPPPQPFPGDPYSYNVQDKRFI 450 460 470 480 490 500 >>NP_000738 (OMIM: 100710,616313,616314) acetylcholine r (501 aa) initn: 1046 init1: 607 opt: 1290 Z-score: 1570.5 bits: 300.2 E(85289): 9.8e-81 Smith-Waterman score: 1290; 42.5% identity (69.6% similar) in 510 aa overlap (6-506:4-501) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MHGGQGPLLLLL-LLAVCL--GAQGRNQEERLLADLMQNYDPNLRPAERDSDVVNVSLKL : ::.:: :.. : :..: . : :: :...:: ..:::.. .: : ::. : NP_000 MTPGALLMLLGALGAPLAPGVRGSEAEGRLREKLFSGYDSSVRPAREVGDRVRVSVGL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 TLTNLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLENN :..::::::..: ..:.:.....: :::: ::: ...:. ::. . :: ::.:: :: NP_000 ILAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRITAESVWLPDVVLLNN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VDGVFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYSTNE :: :.::: .:.:: :: . : ::.:.::.:::.:::::::::::...:.: .:...: NP_000 NDGNFDVALDISVVVSSDGSVRWQPPGIYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 IDLQLSQ-EDGQTIEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAP--AQEAGHQKVVFY ..:: . ::: . : : .: :::.: : :.:.... :. : ..:. .:.:.:: NP_000 VSLQTGLGPDGQGHQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGDPRGGREGQRQEVIFY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LLIQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLVAKK :.:.::::::..:.::::.::. .::.. .:: :: .: ..: .::. ::::.:.: : NP_000 LIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDAG-EKMGLSIFALLTLTVFLLLLADK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 VPETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLLPQL ::::: .::.: ::: : .:.. . :. .:::::. ::::::.: ::..:.. :: NP_000 VPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVVVLNLHHRSPHTHQMPLWVRQIFIHKLPLY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 LRMHVRPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQQWQR--QGLVAAA ::.. :: .. . .. .:::. : .: . : :..:: . .: : : NP_000 LRLK-RPKPERDLMPEPPHCSSPGSGWGRGT-DEYFIRKPPSDFLFPKPNRFQPELSAPD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 LEKLEKGPELGLSQFCGSLKQAAPAIQACVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFLVGRVL :... ::. ... . : .. : . . :: ..: : .:.: .:. :. NP_000 LRRFIDGPNRAVALL--------PELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVV 420 430 440 450 460 480 490 500 510 pF1KE2 DRVCFLAMLSLFIC-GTAGIFLMAHYNRVPALPFPGDPRPYLPSPD ::. :: . .: :: ::: : :. : ::: NP_000 DRL-FLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHLPPPDPFP 470 480 490 500 >>NP_001298125 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323 (416 aa) initn: 790 init1: 360 opt: 1172 Z-score: 1427.8 bits: 273.5 E(85289): 8.6e-73 Smith-Waterman score: 1172; 46.5% identity (74.4% similar) in 402 aa overlap (119-512:19-408) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 WDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLENNVDGVFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRS :: :... ::::: : .:::::::::: NP_001 MLKNLETSVSCASPRTCNDGSFQISYSCNVLVYHYGFVYWLPPAIFRS 10 20 30 40 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 ACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYSTNEIDLQLSQEDGQT----IEWIFIDPEAFTENG .: ::::::::::::::: :.: :...:: :.:.:. .. .:::.::::.::::: NP_001 SCPISVTYFPFDWQNCSLKFSSLKYTAKEITLSLKQDAKENRTYPVEWIIIDPEGFTENG 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 EWAIQHRPAKMLLDPAAPAQEAGHQKVVFYLLIQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHF :: : ::::.. .:: :: . ..: ..:::.:.::::::.:::..:::::: .. :. . NP_001 EWEIVHRPARVNVDPRAPLDSPSRQDITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFY 110 120 130 140 150 160 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 LPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLVAKKVPETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAV ::: .: .: .:::.:::::.:::.:..:..: ::.:.:::.:.: : .:.. ..:: : NP_001 LPADSG-EKTSVAISVLLAQSVFLLLISKRLPATSMAIPLIGKFLLFGMVLVTMVVVICV 170 180 190 200 210 220 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 VVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLLPQLLRMHVRPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSIT .:::. .:.: :: ...::.:.::. ::.::.: :: . . : ...: :. :. NP_001 IVLNIHFRTPSTHVLSEGVKKLFLETLPELLHMS-RPAEDGPSPGALVR-RSSSLGY-IS 230 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 TGEEVALCLPRSELLFQ-QWQRQGLVAAALEKLEKGP---ELGLSQFCGSLKQAAPAIQA .:: : ::.:.:. : .:.:: : : .. : : . ... . :: :: NP_001 KAEEYFLLKSRSDLMFEKQSERHGL-ARRLTTARRPPASSEQAQQELFNELK---PA--- 290 300 310 320 330 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 CVEACNLIACARHQQSHFDNGNEEWFLVGRVLDRVCFLAMLSLFICGTAGIFLMAHYNRV :.. :.:. ..:..... .. : :.:..::.:.... ... ::: :::.. ::. NP_001 -VDGANFIVNHMRDQNNYNEEKDSWNRVARTVDRLCLFVVTPVMVVGTAWIFLQGVYNQP 340 350 360 370 380 390 510 pF1KE2 PALPFPGDPRPYLPSPD : :::::: : NP_001 PPQPFPGDPYSYNVQDKRFI 400 410 >>XP_011508826 (OMIM: 100720,253290,616321,616322,616323 (390 aa) initn: 451 init1: 322 opt: 807 Z-score: 983.4 bits: 191.2 E(85289): 4.9e-48 Smith-Waterman score: 807; 42.7% identity (73.1% similar) in 316 aa overlap (201-512:79-382) 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 QTYSTNEIDLQLSQEDGQTIEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAPAQEAGHQK .::::: : ::::.. .:: :: . ..: XP_011 CTGCHLPSSAPPAPSLSPISPSTGRTAPSSSENGEWEIVHRPARVNVDPRAPLDSPSRQD 50 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VVFYLLIQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFL ..:::.:.::::::.:::..:::::: .. :. .::: .: .: .:::.:::::.:::.: XP_011 ITFYLIIRRKPLFYIINILVPCVLISFMVNLVFYLPADSG-EKTSVAISVLLAQSVFLLL 110 120 130 140 150 160 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 VAKKVPETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRL ..:..: ::.:.:::.:.: : .:.. ..:: :.:::. .:.: :: ...::.:.::. 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XP_016 MRRAPSLVLFFLVALCGRGNCRVANAEEKLMDDLLNKTRYNNLIRPATSSSQLISIKLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LTLTNLISLNEREEALTTNVWIEMQWCDYRLRWDPRDYEGLWVLRVPSTMVWRPDIVLEN :.:..:::.::::. .:::::....: :::: :. :::. .::.:. .: ::::: : XP_016 LSLAQLISVNEREQIMTTNVWLKQEWTDYRLTWNSSRYEGVNILRIPAKRIWLPDIVLYN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NVDGVFEVALYCNVLVSPDGCIYWLPPAIFRSACSISVTYFPFDWQNCSLIFQSQTYSTN :.::..::..: :..: .: . ::::::..:::.: : ::::: :::.: :.: ::. . XP_016 NADGTYEVSVYTNLIVRSNGSVLWLPPAIYKSACKIEVKYFPFDQQNCTLKFRSWTYDHT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 EIDLQLSQEDGQTIEWIFIDPEAFTENGEWAIQHRPAKMLLDPAAPAQEAGHQKVVFYLL :::. : .. .: :: .::: : :.. ..: :. . :.. .. XP_016 EIDMVLMTPTAS------MDD--FTPSGEWDIVALPGRRTVNPQDPS----YVDVTYDFI 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 IQRKPLFYVINIIAPCVLISSVAILIHFLPAKAGGQKCTVAINVLLAQTVFLFLVAKKVP :.::::::.::.: :::: . .:::. .::. : .: :. :.:::: : ::.:..: :: XP_016 IKRKPLFYTINLIIPCVLTTLLAILVFYLPSDCG-EKMTLCISVLLALTFFLLLISKIVP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ETSQAVPLISKYLTFLLVVTILIVVNAVVVLNVSLRSPHTHSMARGVRKVFLRLLPQLLR :: ::::.::: : .:.. . .:..: :::: ::: ::.:: :.. ::. :: .: XP_016 PTSLDVPLIGKYLMFTMVLVTFSIVTSVCVLNVHHRSPSTHTMAPWVKRCFLHKLPTFLF 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 MHVRPLAPAAVQDTQSRLQNGSSGWSITTGEEVALCLPRSELLFQQWQRQGLVAAALEKL :. :: XP_016 MK-RPGPDSSPARAFPPSKSCVTKPEATATSTSPSNFYGNSMYFVNPASAASKSPAGSTP 350 360 370 380 390 400 517 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 09:24:27 2016 done: Sun Nov 6 09:24:29 2016 Total Scan time: 10.170 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]