Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2398
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2398, 338 aa
1>>>pF1KE2398 338 - 338 aa - 338 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6346+/-0.000936; mu= 14.2195+/- 0.057
mean_var=62.4430+/-13.087, 0's: 0 Z-trim(104.5): 77 B-trim: 443 in 1/50
Lambda= 0.162305
statistics sampled from 7844 (7922) to 7844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47828.1 SLC25A37 gene_id:51312|Hs108|chr8 ( 338) 2231 531.1 5.1e-151
CCDS41559.1 SLC25A28 gene_id:81894|Hs108|chr10 ( 364) 1499 359.7 2.1e-99
CCDS45937.1 SLC25A41 gene_id:284427|Hs108|chr19 ( 370) 377 96.9 2.7e-20
CCDS45700.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 359) 359 92.7 4.8e-19
CCDS3114.1 SLC25A36 gene_id:55186|Hs108|chr3 ( 310) 349 90.4 2.1e-18
CCDS82138.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 336) 348 90.1 2.7e-18
CCDS11482.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 351) 348 90.2 2.8e-18
CCDS46927.1 SLC25A36 gene_id:55186|Hs108|chr3 ( 311) 346 89.7 3.5e-18
CCDS55913.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 298) 312 81.7 8.3e-16
CCDS9663.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 299) 312 81.7 8.4e-16
CCDS5610.1 SLC25A40 gene_id:55972|Hs108|chr7 ( 338) 309 81.0 1.5e-15
CCDS13758.1 SLC25A1 gene_id:6576|Hs108|chr22 ( 311) 278 73.7 2.2e-13
CCDS11720.1 SLC25A19 gene_id:60386|Hs108|chr17 ( 320) 267 71.2 1.3e-12
CCDS41671.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 246) 250 67.2 1.6e-11
CCDS60850.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 264) 250 67.2 1.7e-11
CCDS41670.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 288) 250 67.2 1.9e-11
CCDS9065.1 SLC25A3 gene_id:5250|Hs108|chr12 ( 361) 242 65.3 8.5e-11
>>CCDS47828.1 SLC25A37 gene_id:51312|Hs108|chr8 (338 aa)
initn: 2231 init1: 2231 opt: 2231 Z-score: 2824.8 bits: 531.1 E(32554): 5.1e-151
Smith-Waterman score: 2231; 100.0% identity (100.0% similar) in 338 aa overlap (1-338:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MELRSGSVGSQAVARRMDGDSRDGGGGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MELRSGSVGSQAVARRMDGDSRDGGGGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SVMYPVDSVKTRMQSLSPDPKAQYTSIYGALKKIMRTEGFWRPLRGVNVMIMGAGPAHAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVMYPVDSVKTRMQSLSPDPKAQYTSIYGALKKIMRTEGFWRPLRGVNVMIMGAGPAHAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFACYENMKRTLNDVFHHQGNSHLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRLQMYNSQHRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YFACYENMKRTLNDVFHHQGNSHLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRLQMYNSQHRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AISCIRTVWRTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHRTYNPQSHIIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AISCIRTVWRTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHRTYNPQSHIIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GGLAGALAAAATTPLDVCKTLLNTQENVALSLANISGRLSGMANAFRTVYQLNGLAGYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GGLAGALAAAATTPLDVCKTLLNTQENVALSLANISGRLSGMANAFRTVYQLNGLAGYFK
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE2 GIQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GIQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
310 320 330
>>CCDS41559.1 SLC25A28 gene_id:81894|Hs108|chr10 (364 aa)
initn: 1580 init1: 1191 opt: 1499 Z-score: 1897.9 bits: 359.7 E(32554): 2.1e-99
Smith-Waterman score: 1503; 66.5% identity (87.8% similar) in 328 aa overlap (19-336:36-362)
10 20 30
pF1KE2 MELRSGSVGSQAVARRMDGDSRDGGGG----------KDATGSEDYEN
: .: .::: .: .. :::
CCDS41 RGAGGVAGGPAAGPGRSPGESALLDGWLQRGVGRGAGGGEAGACRPPVRQDPDSGPDYEA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LPTSASVSTHMTAGAMAGILEHSVMYPVDSVKTRMQSLSPDPKAQYTSIYGALKKIMRTE
::..:.:.:::.:::.:::::: ::::.: ::::::::.::: :.: .. :: .:.:::
CCDS41 LPAGATVTTHMVAGAVAGILEHCVMYPIDCVKTRMQSLQPDPAARYRNVLEALWRIIRTE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 GFWRPLRGVNVMIMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHQGNSHLANGIAGSMATLLHD
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CCDS41 GLWRPMRGLNVTATGAGPAHALYFACYEKLKKTLSDVIHPGGNSHIANGAAGCVATLLHD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 AVMNPAEVVKQRLQMYNSQHRSAISCIRTVWRTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFIT
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CCDS41 AAMNPAEVVKQRMQMYNSPYHRVTDCVRAVWQNEGAGAFYRSYTTQLTMNVPFQAIHFMT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 YEFLQEQVNPHRTYNPQSHIISGGLAGALAAAATTPLDVCKTLLNTQENVALSLANISGR
::::::. ::.: :::.::..::. :::.:::::::::::::::::::..::. ..:.:.
CCDS41 YEFLQEHFNPQRRYNPSSHVLSGACAGAVAAAATTPLDVCKTLLNTQESLALN-SHITGH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LSGMANAFRTVYQLNGLAGYFKGIQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
..:::.:::::::..:...::.:.:::::::.:::::.:::::::::..:::: : ::
CCDS41 ITGMASAFRTVYQVGGVTAYFRGVQARVIYQIPSTAIAWSVYEFFKYLITKRQEEWRAGK
310 320 330 340 350 360
>>CCDS45937.1 SLC25A41 gene_id:284427|Hs108|chr19 (370 aa)
initn: 270 init1: 106 opt: 377 Z-score: 477.9 bits: 96.9 E(32554): 2.7e-20
Smith-Waterman score: 377; 27.7% identity (60.0% similar) in 285 aa overlap (49-327:96-368)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 GDSRDGGGGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEHSVMYPVDSVKTRMQSLSP
. .::::: . .. :.: .:. :: :
CCDS45 PSQQVLDTGEQLMVPVEVLEVDNKEALWKFLLSGAMAGAVSRTGTAPLDRAKVYMQVYS-
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 DPKAQYTSIYGALKKIMRTEGFWRPLRGVNVMIMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHH
:...:.. :.:..... :: :: .. .. .: .:. :. .:. : . .
CCDS45 -SKTNFTNLLGGLQSMVQEGGFRSLWRGNGINVLKIAPEYAIKFSVFEQCKNYFCGI---
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 QGNSHLANGI-AGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRLQMYNS-QHRSAISCIRTVWRTEGLGA
::. . . . :::.:. . ....:: ::.: :: . . :... ..: : . . :: :
CCDS45 QGSPPFQERLLAGSLAVAISQTLINPMEVLKTRLTLRRTGQYKGLLDCARQILQREGTRA
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 FYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQE-QVNPHRTYNPQSHIISGG---LAGALAAAAT
.::.: .. ::. . .::.:: :. : .. : ..: . :. . . :.
CCDS45 LYRGYLPNMLGIIPYACTDLAVYEMLQCFWVKSGRDMGDPSGLVSLSSVTLSTTCGQMAS
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 TPLDVCKTLLNTQENVALSLANISGRLSGMANAFRTVYQLNGLAGYFKGIQARVIYQMPS
:: . .: ...:..: : .. : :. : . : .: : ..:. .. .:.
CCDS45 YPLTLVRTRMQAQDTVEGSNPTMRGVLQ------RILAQ-QGWLGLYRGMTPTLLKVLPA
310 320 330 340 350
320 330
pF1KE2 TAISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
.::. ::: .: :
CCDS45 GGISYVVYEAMKKTLGI
360 370
>>CCDS45700.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 (359 aa)
initn: 348 init1: 142 opt: 359 Z-score: 455.4 bits: 92.7 E(32554): 4.8e-19
Smith-Waterman score: 359; 28.9% identity (56.8% similar) in 308 aa overlap (33-329:58-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LRSGSVGSQAVARRMDGDSRDGGGGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEHSV
: .: .::.: . :: :.::
CCDS45 FMTPLDVVKVRLQSQRPSMASELMPSSRLWSLSYTKLPSSLQ-STGKCLLYCNGVLEPLY
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110
pF1KE2 MYPVDSVKTRMQSLSPDPKAQYTSIYGALKKIMRTEG---FWRPLRGVNVMIMGAGPAHA
. : . : . :: ...:. . :. ::.: :: .: : .. :: . :: :
CCDS45 LCPNGA---RCATWFQDP-TRFTGTMDAFVKIVRHEGTRTLWSGLPATLVMTV---PATA
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 MYFACYENMKRTLNDVFHHQGNSHLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRLQMYNSQHR
.::. :...: : . .. : .::..: : .:..: :... .:: . ..:
CCDS45 IYFTAYDQLKAFLCG--RALTSDLYAPMVAGALARLGTVTVISPLELMRTKLQAQHVSYR
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 SAISCIRTVWRTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHRTYNPQS---
.:.::. : ... .. ..::.......::... .: : . :
CCDS45 ELGACVRTAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLNGFRPKDQTSVGM
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 HIISGGLAGALAAAATTPLDVCKTLLNTQENVALSLANISGRLSGMANA-----FRTVYQ
...::..:..::. : :.:: : ::..:::. : . :.. . .: .
CCDS45 SFVAGGISGTVAAVLTLPFDVVK----TQRQVALG-AMEAVRVNPLHVDSTWLLLRRIRA
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330
pF1KE2 LNGLAGYFKGIQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
.: : : :. :.: :: :: :.::: : :. .
CCDS45 ESGTKGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQRLNQDRLLGG
320 330 340 350
>>CCDS3114.1 SLC25A36 gene_id:55186|Hs108|chr3 (310 aa)
initn: 323 init1: 128 opt: 349 Z-score: 443.8 bits: 90.4 E(32554): 2.1e-18
Smith-Waterman score: 384; 28.5% identity (60.7% similar) in 305 aa overlap (48-327:9-308)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 DGDSRDGGGGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEHSVMYPVDSVKTRMQSLS
:. ::. .: . . :.. ::::.:: :
CCDS31 MSQRDTLVHLFAGGCGGTVGAILTCPLEVVKTRLQSSS
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE2 PD---PKAQYTSIYGA-------------LKKIMRTEGFWRPLRGVNVMIMGAGPAHAMY
..: ... :: :: :.. :: .::.. ..:..:..:.:
CCDS31 VTLYISEVQLNTMAGASVNRVVSPGPLHCLKVILEKEGPRSLFRGLGPNLVGVAPSRAIY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KE2 FACYENMKRTLNDVFHHQGNSHLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRLQM--YNSQHR
:: : : :. ::::: . .: .. :...:: . .. :: ..: :::. : .:
CCDS31 FAAYSNCKEKLNDVF--DPDSTQVHMISAAMAGFTAITATNPIWLIKTRLQLDARNRGER
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 --SAISCIRTVWRTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHRTY----N
.:. :.: :..:.:: .:::..... . .: :::. :: ..... ..: :
CCDS31 RMGAFECVRKVYQTDGLKGFYRGMSASYA-GISETVIHFVIYESIKQKLLEYKTASTMEN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PQSHII-SGGLAGALAAAATTPLDVCKTLLNTQENVALSLANISGRLSGMANAFRTVYQL
. . .. ..: . ::::. .: : . . : : . . . .. ... . :
CCDS31 DEESVKEASDFVGMMLAAATSK--TCATTIAYPHVVRTRLREEGTKYRSFFQTLSLLVQE
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE2 NGLAGYFKGIQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
.: .. ..:. .... :.:.::: ..::. :.:
CCDS31 EGYGSLYRGLTTHLVRQIPNTAIMMATYELVVYLLNG
280 290 300 310
>>CCDS82138.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 (336 aa)
initn: 348 init1: 142 opt: 348 Z-score: 441.9 bits: 90.1 E(32554): 2.7e-18
Smith-Waterman score: 348; 28.8% identity (57.5% similar) in 285 aa overlap (56-329:57-327)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 GGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEHSVMYPVDSVKTRMQSLSPDPKAQYT
:.:: . : . : . :: ...:
CCDS82 LFMTPLDVVKVRLQSQRPSMASGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGA---RCATWFQDP-TRFT
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 SIYGALKKIMRTEG---FWRPLRGVNVMIMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHQGNS
. . :. ::.: :: .: : .. :: . :: :.::. :...: : . ..
CCDS82 GTMDAFVKIVRHEGTRTLWSGLPATLVMTV---PATAIYFTAYDQLKAFLCG--RALTSD
90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 HLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRLQMYNSQHRSAISCIRTVWRTEGLGAFYRSYT
: .::..: : .:..: :... .:: . ..: .:.::. : ... ..
CCDS82 LYAPMVAGALARLGTVTVISPLELMRTKLQAQHVSYRELGACVRTAVAQGGWRSLWLGWG
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250
pF1KE2 TQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHRTYNPQS---HIISGGLAGALAAAATTPLDVCK
..::.......::... .: : . : ...::..:..::. : :.:: :
CCDS82 PTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLNGFRPKDQTSVGMSFVAGGISGTVAAVLTLPFDVVK
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 TLLNTQENVALSLANISGRLSGMANA-----FRTVYQLNGLAGYFKGIQARVIYQMPSTA
: :..:::. : . :.. . .: . .: : : :. :.: :: :
CCDS82 T----QRQVALG-AMEAVRVNPLHVDSTWLLLRRIRAESGTKGLFAGFLPRIIKAAPSCA
260 270 280 290 300 310
320 330
pF1KE2 ISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
: :.::: : :. .
CCDS82 IMISTYEFGKSFFQRLNQDRLLGG
320 330
>>CCDS11482.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 (351 aa)
initn: 348 init1: 142 opt: 348 Z-score: 441.6 bits: 90.2 E(32554): 2.8e-18
Smith-Waterman score: 348; 28.8% identity (57.5% similar) in 285 aa overlap (56-329:72-342)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 GGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEHSVMYPVDSVKTRMQSLSPDPKAQYT
:.:: . : . : . :: ...:
CCDS11 QRPSMASELMPSSRLWSLSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGA---RCATWFQDP-TRFT
50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 SIYGALKKIMRTEG---FWRPLRGVNVMIMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHQGNS
. . :. ::.: :: .: : .. :: . :: :.::. :...: : . ..
CCDS11 GTMDAFVKIVRHEGTRTLWSGLPATLVMTV---PATAIYFTAYDQLKAFLCG--RALTSD
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 HLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRLQMYNSQHRSAISCIRTVWRTEGLGAFYRSYT
: .::..: : .:..: :... .:: . ..: .:.::. : ... ..
CCDS11 LYAPMVAGALARLGTVTVISPLELMRTKLQAQHVSYRELGACVRTAVAQGGWRSLWLGWG
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250
pF1KE2 TQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHRTYNPQS---HIISGGLAGALAAAATTPLDVCK
..::.......::... .: : . : ...::..:..::. : :.:: :
CCDS11 PTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLNGFRPKDQTSVGMSFVAGGISGTVAAVLTLPFDVVK
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 TLLNTQENVALSLANISGRLSGMANA-----FRTVYQLNGLAGYFKGIQARVIYQMPSTA
: :..:::. : . :.. . .: . .: : : :. :.: :: :
CCDS11 T----QRQVALG-AMEAVRVNPLHVDSTWLLLRRIRAESGTKGLFAGFLPRIIKAAPSCA
280 290 300 310 320
320 330
pF1KE2 ISWSVYEFFKYFLTKRQLENRAPY
: :.::: : :. .
CCDS11 IMISTYEFGKSFFQRLNQDRLLGG
330 340 350
>>CCDS46927.1 SLC25A36 gene_id:55186|Hs108|chr3 (311 aa)
initn: 361 init1: 128 opt: 346 Z-score: 440.0 bits: 89.7 E(32554): 3.5e-18
Smith-Waterman score: 381; 28.8% identity (60.8% similar) in 306 aa overlap (48-327:9-309)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 DGDSRDGGGGKDATGSEDYENLPTSASVSTHMTAGAMAGILEHSVMYPVDSVKTRMQSLS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]