FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2399, 2285 aa 1>>>pF1KE2399 2285 - 2285 aa - 2285 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 61265892 residues in 86068 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.3306+/-0.000519; mu= -22.1949+/- 0.032 mean_var=921.9958+/-190.738, 0's: 0 Z-trim(124.4): 331 B-trim: 0 in 0/59 Lambda= 0.042239 statistics sampled from 45668 (46091) to 45668 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.536), width: 16 Scan time: 25.470 The best scores are: opt bits E(86068) NP_006006 (OMIM: 603024,614607) AT-rich interactiv (2285) 15878 985.3 0 NP_624361 (OMIM: 603024,614607) AT-rich interactiv (2068) 9644 605.3 2.4e-171 XP_011534286 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2359) 4004 261.7 7.6e-68 XP_016866592 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2326) 3983 260.4 1.8e-67 XP_016866593 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2316) 3913 256.2 3.5e-66 XP_016866594 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