FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2399, 2285 aa
1>>>pF1KE2399 2285 - 2285 aa - 2285 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61265892 residues in 86068 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.3306+/-0.000519; mu= -22.1949+/- 0.032
mean_var=921.9958+/-190.738, 0's: 0 Z-trim(124.4): 331 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.042239
statistics sampled from 45668 (46091) to 45668 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.536), width: 16
Scan time: 25.470
The best scores are: opt bits E(86068)
NP_006006 (OMIM: 603024,614607) AT-rich interactiv (2285) 15878 985.3 0
NP_624361 (OMIM: 603024,614607) AT-rich interactiv (2068) 9644 605.3 2.4e-171
XP_011534286 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2359) 4004 261.7 7.6e-68
XP_016866592 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2326) 3983 260.4 1.8e-67
XP_016866593 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2316) 3913 256.2 3.5e-66
XP_016866594 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2306) 3834 251.3 9.9e-65
NP_001333742 (OMIM: 135900,614556,614562) AT-rich (2289) 3826 250.9 1.4e-64
NP_059989 (OMIM: 135900,614556,614562) AT-rich int (2236) 3795 249.0 5e-64
XP_016866595 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2263) 3780 248.0 9.5e-64
NP_065783 (OMIM: 135900,614556,614562) AT-rich int (2249) 3736 245.4 6.1e-63
XP_016866596 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (2256) 3700 243.2 2.8e-62
XP_016866598 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (1539) 3483 229.8 2.1e-58
XP_011534290 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (1336) 3427 226.3 2e-57
XP_016866597 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTE (1551) 1885 132.4 4.2e-29
XP_011526344 (OMIM: 120216) PREDICTED: collagen al (1744) 535 50.2 0.00027
NP_056534 (OMIM: 120216) collagen alpha-3(V) chain (1745) 535 50.2 0.00027
XP_016868640 (OMIM: 610026) PREDICTED: collagen al (1552) 517 49.0 0.00053
XP_011515187 (OMIM: 610026) PREDICTED: collagen al (1588) 517 49.0 0.00054
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078) 521 49.4 0.00055
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 521 49.4 0.00055
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 521 49.4 0.00055
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 521 49.4 0.00055
NP_000080 (OMIM: 120160,130060,166210,166220,16671 (1366) 514 48.8 0.00055
XP_005246339 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1505) 504 48.2 0.0009
XP_011539024 (OMIM: 120326) PREDICTED: collagen al (1589) 501 48.1 0.0011
NP_001229468 (OMIM: 605299) nuclear receptor coact (1070) 490 47.2 0.0013
XP_016883240 (OMIM: 605299) PREDICTED: nuclear rec (1070) 490 47.2 0.0013
NP_000081 (OMIM: 120180,130020,130050) collagen al (1466) 487 47.2 0.0018
NP_001837 (OMIM: 120090,614483,614519) collagen al (1712) 483 47.0 0.0024
XP_016858788 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1518) 477 46.6 0.0028
XP_011508864 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1608) 477 46.6 0.0029
XP_011508863 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1608) 477 46.6 0.0029
XP_016858787 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1608) 477 46.6 0.0029
XP_011508862 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1612) 477 46.6 0.0029
XP_011508861 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1612) 477 46.6 0.0029
XP_016858785 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1659) 477 46.6 0.003
NP_000083 (OMIM: 120131,203780) collagen alpha-4(I (1690) 477 46.6 0.003
XP_005246338 (OMIM: 120131,203780) PREDICTED: coll (1690) 477 46.6 0.003
XP_016855827 (OMIM: 120326) PREDICTED: collagen al (1593) 474 46.4 0.0033
XP_011539028 (OMIM: 120326) PREDICTED: collagen al (1402) 466 45.9 0.0042
XP_016883233 (OMIM: 605299) PREDICTED: nuclear rec (2051) 471 46.4 0.0045
XP_011527029 (OMIM: 605299) PREDICTED: nuclear rec (2056) 471 46.4 0.0045
XP_006723818 (OMIM: 605299) PREDICTED: nuclear rec (1975) 470 46.3 0.0045
XP_011539025 (OMIM: 120326) PREDICTED: collagen al (1573) 466 45.9 0.0046
NP_006239 (OMIM: 168810) basic salivary proline-ri ( 416) 444 44.0 0.0047
NP_001305169 (OMIM: 605299) nuclear receptor coact (2063) 470 46.3 0.0047
NP_054790 (OMIM: 605299) nuclear receptor coactiva (2063) 470 46.3 0.0047
XP_011527023 (OMIM: 605299) PREDICTED: nuclear rec (2068) 470 46.3 0.0047
XP_005270538 (OMIM: 120326) PREDICTED: collagen al (1588) 465 45.9 0.0048
XP_016882520 (OMIM: 616633) PREDICTED: proline-ric (1424) 461 45.6 0.0053
>>NP_006006 (OMIM: 603024,614607) AT-rich interactive do (2285 aa)
initn: 15878 init1: 15878 opt: 15878 Z-score: 5249.7 bits: 985.3 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 15878; 100.0% identity (100.0% similar) in 2285 aa overlap (1-2285:1-2285)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEMKAAAGQESEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEMKAAAGQESEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PAVGPPQPLGKELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPALNNNLTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PAVGPPQPLGKELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPALNNNLTEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PGGGGGGSSDGVGAPPHSAAAALPPPAYGFGQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PGGGGGGSSDGVGAPPHSAAAALPPPAYGFGQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LAALQSGGGGGLEPYAGPQQNSHDHGFPNHQYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LAALQSGGGGGLEPYAGPQQNSHDHGFPNHQYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGAAAAAGSKPPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPSAAGGGTPQPTATPTLNQLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SGAAAAAGSKPPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPSAAGGGTPQPTATPTLNQLLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAASGGAQQRSHHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAASGGAQQRSHHA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNPYSQQQGPPSGPQQGHGYPGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNPYSQQQGPPSGPQQGHGYPGQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQIPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQIPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQ
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490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QQPPYSQQPPSQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QQPPYSQQPPSQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQST
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550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TQQHPQSQPPYSQPQAQSPYQQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TQQHPQSQPPYSQPQAQSPYQQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 QELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLPDLSGSIDDLPMGTEGALSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLPDLSGSIDDLPMGTEGALSPG
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pF1KE2 VSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPVGSPASVAQSRSGPLSPAAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPVGSPASVAQSRSGPLSPAAVP
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730 740 750 760 770 780
pF1KE2 GNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDRGYMQRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDRGYMQRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IHTGMGSYQQNSMGSYGPQGGQYGPQGGYPRQPNYNALPNANYPSAGMAGGINPMGAGGQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MHGQPGIPPYGTLPPGRMSHASMGNRPYGPNMANMPPQVGSGMCPPPGGMNRKTQETAVA
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910 920 930 940 950 960
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAASPEMMGLGDVKLTPATKMNNKADGTPKTESKSKKSSSSTTTNEKITKLYELGGEPER
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NP_006 KMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLDLYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NVGTSSSAASSLKKQYIQCLYAFECKIERGEDPPPDIFAAADSKKSQPKIQPPSPAGSGS
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NP_006 MQGPQTPQSTSSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDAFNDGSDSTFQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKRHEGEMYSVPYSTGQGQPQQQQLPPAQPQPASQQQAAQPSPQQDVYNQYGNAYPATAT
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NP_006 AATERRPAGGPQNQFPFQFGRDRVSAPPGTNAQQNMPPQMMGGPIQASAEVAQQGTMWQG
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NP_006 RNDMTYNYANRQSTGSAPQGPAYHGVNRTDEMLHTDQRANHEGSWPSHGTRQPPYGPSAP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VPPMTRPPPSNYQPPPSMQNHIPQVSSPAPLPRPMENRTSPSKSPFLHSGMKMQKAGPPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PASHIAPAPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQPVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LAESTWALDTINILLYDDNSIMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPG
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NP_006 QRTLLDPGRFSKVSSPAPMEGGEEEEELLGPKLEEEEEEEVVENDEEIAFSGKDKPASEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDCSDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGDTTEHIQTHFE
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NP_006 SKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KE2 TLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKR
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 CVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQ
2050 2060 2070 2080 2090 2100
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pF1KE2 DPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYSTMVRFLSDRKN
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NP_006 DPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYSTMVRFLSDRKN
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NP_006 PVCREMAVVLLANLAQGDSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLEDSLAATQFQQSQASLLHMQN
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NP_006 PPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDENHSEFTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLF
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pF1KE2 LIGQS
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NP_006 LIGQS
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NP_624 MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEMKAAAGQESEG
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NP_624 PAVGPPQPLGKELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPALNNNLTEP
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NP_624 SPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAASGGAQQRSHHA
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NP_624 PMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNPYSQQQGPPSGPQQGHGYPGQ
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NP_624 VSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPVGSPASVAQSRSGPLSPAAVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 KMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLDLYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 KMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLDLYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 NVGTSSSAASSLKKQYIQCLYAFECKIERGEDPPPDIFAAADSKKSQPKIQPPSPAGSGS
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pF1KE2 MQGPQTPQSTSSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDAFNDGSDSTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 MQGPQTPQSTSSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDAFNDGSDSTFQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 SRAAGPGLGNVAMGPRQHYPYGGPYDRVRTEPGIGPEGNMSTGAPQPNLMPSNPDSGMYS
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pF1KE2 PSRYPPQQQQQQQQRHDSYGNQFSTQGTPSGSPFPSQQTTMYQQQQQNYKRPMDGTYGPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 PSRYPPQQQQQQQQRHDSYGNQFSTQGTPSGSPFPSQQTTMYQQQQQ-------------
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pF1KE2 AKRHEGEMYSVPYSTGQGQPQQQQLPPAQPQPASQQQAAQPSPQQDVYNQYGNAYPATAT
NP_624 ------------------------------------------------------------
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NP_624 ------------------------------------------------------------
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pF1KE2 RNDMTYNYANRQSTGSAPQGPAYHGVNRTDEMLHTDQRANHEGSWPSHGTRQPPYGPSAP
NP_624 ------------------------------------------------------------
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 PASHIAPAPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQPVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGL
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pF1KE2 LAESTWALDTINILLYDDNSIMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 LAESTWALDTINILLYDDNSIMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPG
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pF1KE2 QRTLLDPGRFSKVSSPAPMEGGEEEEELLGPKLEEEEEEEVVENDEEIAFSGKDKPASEN
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pF1KE2 SEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDCSDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGDTTEHIQTHFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 SEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDCSDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGDTTEHIQTHFE
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pF1KE2 SKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 SKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSS
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pF1KE2 TLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 TLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKR
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pF1KE2 CVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 CVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQG
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pF1KE2 VSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 VSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQ
1830 1840 1850 1860 1870 1880
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pF1KE2 DPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYSTMVRFLSDRKN
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NP_624 DPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYSTMVRFLSDRKN
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pF1KE2 PVCREMAVVLLANLAQGDSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLEDSLAATQFQQSQASLLHMQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 PVCREMAVVLLANLAQGDSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLEDSLAATQFQQSQASLLHMQN
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pF1KE2 PPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDENHSEFTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_624 PPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDENHSEFTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLF
2010 2020 2030 2040 2050 2060
pF1KE2 LIGQS
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NP_624 LIGQS
>>XP_011534286 (OMIM: 135900,614556,614562) PREDICTED: A (2359 aa)
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pF1KE2 GQESEGPAVGPPQPLG-KELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPAL
: . :: . :: : :. :.... : . : : : . . :. .:.:
XP_011 GAPQPGPDMEQPQHGGAKDSAAGGQADPPGPPLLSKPGDEDDAPPKMGEPAGGRYEHPGL
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pF1KE2 NN-NLTEPP---GGGGGGSSDGVGAPPHSAAAALPPPAYGFGQPYGRSPSAVAAAAAAVF
. . .:: ::::: . ..: . . :: : : : :: :. :
XP_011 GALGTQQPPVAVPGGGGGPA---AVPEFNNYYGSAAPASG-G-PGGR--------AGPCF
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pF1KE2 HQQHGGQQSPGLAALQSGGGG--GLEPYAGPQQNSHDHGFPNHQYNSYYPNRS---AYPP
.:::::::::.. ..:.... : : ::::. :.:: : : .::. : :
XP_011 -DQHGGQQSPGMGMMHSASAAAAGAPGSMDPLQNSHE-GYPNSQCN-HYPGYSRPGAGGG
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230 240 250 260
pF1KE2 PAPAYALSSPRGGTPGSGAAAAAGSKPPPSSSASASSSS--------------------S
. . . .. :: :.:.:.:.:. ..:.:.... :
XP_011 GGGGGGGGGGSGGGGGGGGAGAGGAGAGAVAAAAAAAAAAAGGGGGGGYGGSSAGYGVLS
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270 280 290 300
pF1KE2 SFAQQRFGAM---GGGGP---------SAAGG-----GTPQ-PT-ATPTLNQLLTSPSSA
: :: : : :::: ::::: : : :. :::::::::::::
XP_011 SPRQQGGGMMMGPGGGGAASLSKAAAGSAAGGFQRFAGQNQHPSGATPTLNQLLTSPSPM
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310 320 330 340
pF1KE2 -RGYQG-YPGGDYSGG---------PQDGGAGKGPADMASQCWGA-------AAAAAAAA
:.: : :: .::. ::. .:. : : ..: .. .: :::.
XP_011 MRSYGGSYP--EYSSPSAPPPPPSQPQSQAAAAGAAAGGQQAAAGMGLGKDMGAQYAAAS
430 440 450 460 470 480
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 AASGGAQQRSHHAPMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYG-GTNPYSQQQG
: ..:::::: : ::::. : : : .:::: : ::: :: :.::.::
XP_011 PAWAAAQQRSHPA-MSPGTPG----PTMGRSQ-GSPMDPMVMKRPQLYGMGSNPHSQ---
490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PPSGPQQGHGYPGQPYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQIPPYGQQGPSGYGQQG
:::. ::: :: :::::. .:::. .::.:..: : :: :: .
XP_011 ----PQQSSPYPGGSYGPPGPQRYPIGIQGRTPGAMAGMQY----P---QQQDSGDATWK
540 550 560 570 580
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 QTPYYNQQSPHPQQQQPPYSQQPPSQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPP
.: . : : :.:: : .: :: : :: ::::: :::
XP_011 ETFWL-----MP----PQYGQQGVS-------GYCQQGQ---------QPYYSQQP-QPP
590 600 610 620
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 HQQSPAPYPSQQSTTQQHPQSQPPYSQPQAQSPYQQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQ
: : ::: : :.:
XP_011 H------LP------------------PQA-----QYLPSQ-------------------
630
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 SQQTAYSQQRFPPPQELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLP------
::::. : :..::...:.. : : .. .: ..::.:: : ::::::
XP_011 ------SQQRYQPQQDMSQEGYGTR--SQPPLAPGKPNHEDLNLIQQERPSSLPVEVLAS
640 650 660 670 680
650 660 670 680 690
pF1KE2 --------DLSGSIDDLPMGTEGALSPGVSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGI
:::::::::: :::..:: .::.:: .::::.::::::::::::.:::: .:
XP_011 EDAAFGLKDLSGSIDDLPTGTEATLSSAVSASGSTSSQGDQSNPAQSPFSPHASPHLSSI
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 RG-PSPSPVGSPASVAQSRSGPLSPAAVPGNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDRG
: :::::::::.. ::::::.:::..::.::::.::..::.: ::...:: . :.::
XP_011 PGGPSPSPVGSPVGSNQSRSGPISPASIPGSQMPPQPPGSQSESSSHPALSQSPMPQERG
750 760 770 780 790 800
760 770 780 790 800
pF1KE2 YM---QRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQIHTGMGSYQQ-NSMGSYGPQGGQYGPQG
.: :::::: ::. : : ..::. :::.:.:..:.:: :: :.:::: .::::::
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870 880 890 900 910
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. ::..: : : : :: :: .:::.::.:.: :..:::: :.:::
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2240 2250 2260 2270 2280
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XP_016 RVDENRSEFLLHEGRLLDISISAVLNSLVASVICDVLFQIGQL
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:::::: :::..:: .::.:: .::::.::::::::::::.:::: .: : :::::::::
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.. ::::::.:::..::.::::.::..::.: ::...:: . :.::.: ::::::
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::. : : ..::. :::.:.:..:.:: :: :.:::: .::::::.: : : :...:
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.:.: . : . ::. :..::::: : :..: ::: :.: :::. ::..: :
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: : :: :: .:::.::.:.: :..:::: :.: ..:.:::.:.:... ::.
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: .::......: :.: :::.: :::::::: :: .:. :.:::: :::::::.:.:
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::.::: .:::..:: ::..: : :... . ...:..:: ::..:::. :::
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: ::..:::::..: .. .::: :.:.:. ..:.:...: : .
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