FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2408, 2168 aa 1>>>pF1KE2408 2168 - 2168 aa - 2168 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.1321+/-0.00138; mu= -9.8428+/- 0.083 mean_var=486.3429+/-98.346, 0's: 0 Z-trim(112.9): 63 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.058157 statistics sampled from 13509 (13556) to 13509 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16 Scan time: 9.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2209.2 BAZ2B gene_id:29994|Hs108|chr2 (2168) 14213 1209.1 0 CCDS74594.1 BAZ2B gene_id:29994|Hs108|chr2 (2132) 8992 771.1 0 CCDS73483.1 BAZ2A gene_id:11176|Hs108|chr12 (1903) 904 92.4 2e-17 CCDS44924.1 BAZ2A gene_id:11176|Hs108|chr12 (1905) 904 92.4 2e-17 >>CCDS2209.2 BAZ2B gene_id:29994|Hs108|chr2 (2168 aa) initn: 14213 init1: 14213 opt: 14213 Z-score: 6460.4 bits: 1209.1 E(32554): 0 Smith-Waterman 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CCDS74 NLSTVSSAFPMVSHPVFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFP--EWWRTTD 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 AHTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGSNTSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 AHTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGSNTSS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 VIGINTSVLSTTASSSMGQTKSTSSGGGNRKCNQEQSKNQPLDARVDKIKDKKPRKKAME :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 VIGINTSVLSTTASSSMGQTKSTSSGGGNRKCNQEQSKNQPLDARVDKIKDKKPRKKAME 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 SSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSIEESEDDDSDSESEAQHKSNNQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 SSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSIEESEDDDSDSESEAQHKSNNQ 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 VLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLASESQTHSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 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