FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2413, 1977 aa 1>>>pF1KE2413 1977 - 1977 aa - 1977 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9905+/-0.000468; mu= 8.1009+/- 0.029 mean_var=234.8337+/-48.160, 0's: 0 Z-trim(117.2): 302 B-trim: 1583 in 1/55 Lambda= 0.083694 statistics sampled from 28606 (28930) to 28606 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16 Scan time: 18.760 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005174 (OMIM: 300071,300110,300476,300600) volt (1977) 13218 1611.1 0 NP_001243719 (OMIM: 300071,300110,300476,300600) v (1912) 12616 1538.4 0 XP_011542285 (OMIM: 300071,300110,300476,300600) P (1905) 12540 1529.2 0 NP_001243718 (OMIM: 300071,300110,300476,300600) v (1966) 10269 1255.0 0 XP_016862633 (OMIM: 114206,614896,615474) PREDICTE (2218) 6488 798.5 0 XP_016862632 (OMIM: 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RAQGEQEYQNCELDKNQRQCVEYALKAQPLRRYIPKNPHQYRVWATVNSAAFEYLMFLLI 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE2 LLNTVALAMQHYEQTAPFNYAMDILNMVFTGLFTIEMVLKIIAFKPKHYFTDAWNTFDAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LLNTVALAMQHYEQTAPFNYAMDILNMVFTGLFTIEMVLKIIAFKPKHYFTDAWNTFDAL 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 IVVGSIVDIAVTEVNNGGHLGESSEDSSRISITFFRLFRVMRLVKLLSKGEGIRTLLWTF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IVVGSIVDIAVTEVNNGGHLGESSEDSSRISITFFRLFRVMRLVKLLSKGEGIRTLLWTF 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE2 IKSFQALPYVALLIAMIFFIYAVIGMQMFGKVALQDGTQINRNNNFQTFPQAVLLLFRCA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IKSFQALPYVALLIAMIFFIYAVIGMQMFGKVALQDGTQINRNNNFQTFPQAVLLLFRCA 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE2 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