Result of FASTA (ccds) for pF1KE2416
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2416, 639 aa
  1>>>pF1KE2416 639 - 639 aa - 639 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0029+/-0.000876; mu= 17.4624+/- 0.053
 mean_var=94.4882+/-18.765, 0's: 0 Z-trim(109.4): 11  B-trim: 48 in 1/49
 Lambda= 0.131943
 statistics sampled from 10854 (10859) to 10854 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.334), width:  16
 Scan time:  3.930

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4418.1 SLC34A1 gene_id:6569|Hs108|chr5         ( 639) 4193 808.5       0
CCDS54953.1 SLC34A1 gene_id:6569|Hs108|chr5        ( 340) 2020 394.7 1.1e-109
CCDS7038.1 SLC34A3 gene_id:142680|Hs108|chr9       ( 599) 1889 369.9 5.5e-102
CCDS54750.1 SLC34A2 gene_id:10568|Hs108|chr4       ( 689) 1257 249.6   1e-65
CCDS3435.1 SLC34A2 gene_id:10568|Hs108|chr4        ( 690) 1257 249.6   1e-65


>>CCDS4418.1 SLC34A1 gene_id:6569|Hs108|chr5              (639 aa)
 initn: 4193 init1: 4193 opt: 4193  Z-score: 4314.3  bits: 808.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4193; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MLSYGERLGSPAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MLSYGERLGSPAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 TCPCGEVLERHEPLPAKLALEEEQKPESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TCPCGEVLERHEPLPAKLALEEEQKPESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LSSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 VSSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VSSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 LIQIWCHPDSLQAPTSMSRAEANSSQTLGNATMEKCNHIFVDTGLPDLAVGLILLAGSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LIQIWCHPDSLQAPTSMSRAEANSSQTLGNATMEKCNHIFVDTGLPDLAVGLILLAGSLV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFVVQSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFVVQSSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VFTSAITPLIGLGVISIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPREKLSSAFQIALCHFFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VFTSAITPLIGLGVISIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPREKLSSAFQIALCHFFF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 NISGILLWYPVPCTRLPIRMAKALGKRTAKYRWFAVLYLLVCFLLLPSLVFGISMAGWQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NISGILLWYPVPCTRLPIRMAKALGKRTAKYRWFAVLYLLVCFLLLPSLVFGISMAGWQV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 MVGVGTPFGALLAFVVLINVLQSRSPGHLPKWLQTWDFLPRWMHSLKPLDHLITRATLCC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVGVGTPFGALLAFVVLINVLQSRSPGHLPKWLQTWDFLPRWMHSLKPLDHLITRATLCC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630         
pF1KE2 ARPEPRSPPLPPRVFLEELPPATPSPRLALPAHHNATRL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ARPEPRSPPLPPRVFLEELPPATPSPRLALPAHHNATRL
              610       620       630         

>>CCDS54953.1 SLC34A1 gene_id:6569|Hs108|chr5             (340 aa)
 initn: 2016 init1: 2016 opt: 2020  Z-score: 2082.7  bits: 394.7 E(32554): 1.1e-109
Smith-Waterman score: 2020; 92.6% identity (96.5% similar) in 339 aa overlap (1-336:1-339)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MLSYGERLGSPAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLSYGERLGSPAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 TCPCGEVLERHEPLPAKLALEEEQKPESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TCPCGEVLERHEPLPAKLALEEEQKPESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LSSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 VSSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VSSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TGYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHS
              250       260       270       280       290       300

              310          320       330       340       350       
pF1KE2 LIQIWCHPDSLQAPTS---MSRAEANSSQTLGNATMEKCNHIFVDTGLPDLAVGLILLAG
       ::::::::::::       ... .  ..:.. .... .:                     
CCDS54 LIQIWCHPDSLQQNLEGREITHFDLRKKQAMEDSSVPHCP                    
              310       320       330       340                    

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 SLVLLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFVVQ

>>CCDS7038.1 SLC34A3 gene_id:142680|Hs108|chr9            (599 aa)
 initn: 1861 init1: 1061 opt: 1889  Z-score: 1944.4  bits: 369.9 E(32554): 5.5e-102
Smith-Waterman score: 1896; 51.9% identity (77.2% similar) in 591 aa overlap (41-618:5-584)

               20        30        40        50        60          
pF1KE2 PAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEHT------CPC
                                     .:: :    :.:  : :.:.:         
CCDS70                           MPSSLPG-SQVPHPTLDAVDLVEKTLRNEGTSSS
                                          10        20        30   

           70         80          90       100       110       120 
pF1KE2 GEVLERHEPLPAKLA-LEEEQKP--ESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDML
       . :::. .  :  :  :.. ..:  : :.. .::.... .::.  .:  ::.:.::::.:
CCDS70 APVLEEGDTDPWTLPQLKDTSQPWKELRVAGRLRRVAGSVLKACGLLGSLYFFICSLDVL
            40        50        60        70        80        90   

             130       140       150       160       170       180 
pF1KE2 SSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLEV
       :::::: :.::::::::::..:::::::::.:.:::.::::::::.::.::::.. :: :
CCDS70 SSAFQLLGSKVAGDIFKDNVVLSNPVAGLVIGVLVTALVQSSSTSSSIVVSMVAAKLLTV
           100       110       120       130       140       150   

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE2 SSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAAT
         ..::::: :.:::.:.:.:.. :.::: .:.:::.:..::  ::::.::::::::.::
CCDS70 RVSVPIIMGVNVGTSITSTLVSMAQSGDRDEFQRAFSGSAVHGIFNWLTVLVLLPLESAT
           160       170       180       190       200       210   

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE2 GYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHSL
       . :.....:.... ..    .:::.::..:.:.:.::.::: ..: : :::. .  : ::
CCDS70 ALLERLSELALGAASLTPRAQAPDILKVLTKPLTHLIVQLDSDMIMSSATGNAT--NSSL
           220       230       240       250       260         270 

             310       320       330           340       350       
pF1KE2 IQIWCHPDSLQAPTSMSRAEANSSQTLGNATMEK----CNHIFVDTGLPDLAVGLILLAG
       :. ::   . :     :   : .  :  :.:       : :.:. : : ::::: :::::
CCDS70 IKHWCGTTG-QPTQENSSCGAFGPCTEKNSTAPADRLPCRHLFAGTELTDLAVGCILLAG
             280        290       300       310       320       330

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 SLVLLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFVVQ
       ::..:: ::.:.::.:::.:.:.::.:.. :::.::: :. :. ::.:...::..::..:
CCDS70 SLLVLCGCLVLIVKLLNSVLRGRVAQVVRTVINADFPFPLGWLGGYLAVLAGAGLTFALQ
              340       350       360       370       380       390

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 SSSVFTSAITPLIGLGVISIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPREKLSSAFQIALCH
       ::::::.:..::.:.::::..::::: :::::::::::.::::::: ... ::.:.:: :
CCDS70 SSSVFTAAVVPLMGVGVISLDRAYPLLLGSNIGTTTTALLAALASPADRMLSALQVALIH
              400       410       420       430       440       450

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE2 FFFNISGILLWYPVPCTRLPIRMAKALGKRTAKYRWFAVLYLLVCFLLLPSLVFGISMAG
       ::::..:::::: ::  :::: .:. .:  ::.::: : .:::. :::::  .::.:.::
CCDS70 FFFNLAGILLWYLVPALRLPIPLARHFGVVTARYRWVAGVYLLLGFLLLPLAAFGLSLAG
              460       470       480       490       500       510

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE2 WQVMVGVGTPFGALLAFVVLINVLQSRSPGHLPKWLQTWDFLPRWMHSLKPLDHLITRAT
        . ...:: :. .:. .:.:..::: : :. ::  :..: .:: :.:::.: :.:.::  
CCDS70 GMELAAVGGPLVGLVLLVILVTVLQRRRPAWLPVRLRSWAWLPVWLHSLEPWDRLVTR--
              520       530       540       550       560          

       600       610       620       630         
pF1KE2 LCCARPEPRSPPLPPRVFLEELPPATPSPRLALPAHHNATRL
        ::    : .   ::..  .:                     
CCDS70 -CC----PCNVCSPPKATTKEAYCYENPEILASQQL      
       570           580       590               

>>CCDS54750.1 SLC34A2 gene_id:10568|Hs108|chr4            (689 aa)
 initn: 2194 init1: 1250 opt: 1257  Z-score: 1293.4  bits: 249.6 E(32554): 1e-65
Smith-Waterman score: 2176; 64.8% identity (87.0% similar) in 514 aa overlap (103-599:99-612)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KE2 PLPAKLALEEEQKPESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDMLSSAFQLAGGKV
                                     .. :.: :::.::::::.:::::::.:::.
CCDS54 WNLPTLQDSGIKWSERDTKGKILCFFQGIGRLILLLGFLYFFVCSLDILSSAFQLVGGKM
       70        80        90       100       110       120        

            140       150       160       170       180       190  
pF1KE2 AGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLEVSSAIPIIMGSN
       ::..:....:.:::. :::.:.:::::::::::::::.::::::.:: : .:::::::.:
CCDS54 AGQFFSNSSIMSNPLLGLVIGVLVTVLVQSSSTSTSIVVSMVSSSLLTVRAAIPIIMGAN
      130       140       150       160       170       180        

            200       210       220       230       240       250  
pF1KE2 IGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAATGYLHHITRLVV
       ::::.:::::::::.:::..:::::::::::: :::::::::::.:.:: ::. ::.:.:
CCDS54 IGTSITNTIVALMQVGDRSEFRRAFAGATVHDFFNWLSVLVLLPVEVATHYLEIITQLIV
      190       200       210       220       230       240        

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pF1KE2 ASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHSLIQIWCH-----
        ::....:.:::::::.::.::::::.:::..::..:: .::. .:.::..:::.     
CCDS54 ESFHFKNGEDAPDLLKVITKPFTKLIVQLDKKVISQIAMNDEKAKNKSLVKIWCKTFTNK
      250       260       270       280       290       300        

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pF1KE2 -------PDSLQAPT-SMSRAEANSSQTLGNATME----KCNHIFVDTGLPDLAVGLILL
              :.. .  . :.  ... .. :. :.:..    ::.::::.  ::::::: :::
CCDS54 TQINVTVPSTANCTSPSLCWTDGIQNWTMKNVTYKENIAKCQHIFVNFHLPDLAVGTILL
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pF1KE2 AGSLVLLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFV
         ::..:: :::..::.:.:.:::::: ::.:.:::::: ::.:.:::.:..:::.:::.
CCDS54 ILSLLVLCGCLIMIVKILGSVLKGQVATVIKKTINTDFPFPFAWLTGYLAILVGAGMTFI
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pF1KE2 VQSSSVFTSAITPLIGLGVISIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPREKLSSAFQIAL
       ::::::::::.:::::.:::.::::::::::::::::::::::::::: . : :..::::
CCDS54 VQSSSVFTSALTPLIGIGVITIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPGNALRSSLQIAL
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pF1KE2 CHFFFNISGILLWYPVPCTRLPIRMAKALGKRTAKYRWFAVLYLLVCFLLLPSLVFGISM
       :::::::::::::::.: :::::::::.::. .::::::::.::.. :.:.:  :::.:.
CCDS54 CHFFFNISGILLWYPIPFTRLPIRMAKGLGNISAKYRWFAVFYLIIFFFLIPLTVFGLSL
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pF1KE2 AGWQVMVGVGTPFGALLAFVVLINVLQSRSPGHLPKWLQTWDFLPRWMHSLKPLDHLITR
       :::.:.::::.:   .. .:. . .:::: :  ::: ::.:.::: ::.:::: : ....
CCDS54 AGWRVLVGVGVPVVFIIILVLCLRLLQSRCPRVLPKKLQNWNFLPLWMRSLKPWDAVVSK
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pF1KE2 ATLCCARPEPRSPPLPPRVFLEELPPATPSPRLALPAHHNATRL                
        : :                                                        
CCDS54 FTGCFQMRCCCCCRVCCRACCLLCDCPKCCRCSKCCEDLEEAQEGQDVPVKAPETFDNIT
      610       620       630       640       650       660        

>>CCDS3435.1 SLC34A2 gene_id:10568|Hs108|chr4             (690 aa)
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             80        90       100       110       120       130  
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                                     .. :.: :::.::::::.:::::::.:::.
CCDS34 WNLPTLQDSGIKWSERDTKGKILCFFQGIGRLILLLGFLYFFVCSLDILSSAFQLVGGKM
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pF1KE2 AGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLEVSSAIPIIMGSN
       ::..:....:.:::. :::.:.:::::::::::::::.::::::.:: : .:::::::.:
CCDS34 AGQFFSNSSIMSNPLLGLVIGVLVTVLVQSSSTSTSIVVSMVSSSLLTVRAAIPIIMGAN
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pF1KE2 IGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAATGYLHHITRLVV
       ::::.:::::::::.:::..:::::::::::: :::::::::::.:.:: ::. ::.:.:
CCDS34 IGTSITNTIVALMQVGDRSEFRRAFAGATVHDFFNWLSVLVLLPVEVATHYLEIITQLIV
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pF1KE2 ASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHSLIQIWCH-----
        ::....:.:::::::.::.::::::.:::..::..:: .::. .:.::..:::.     
CCDS34 ESFHFKNGEDAPDLLKVITKPFTKLIVQLDKKVISQIAMNDEKAKNKSLVKIWCKTFTNK
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pF1KE2 -------PDSLQAPT-SMSRAEANSSQTLGNATME----KCNHIFVDTGLPDLAVGLILL
              :.. .  . :.  ... .. :. :.:..    ::.::::.  ::::::: :::
CCDS34 TQINVTVPSTANCTSPSLCWTDGIQNWTMKNVTYKENIAKCQHIFVNFHLPDLAVGTILL
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CCDS34 ILSLLVLCGCLIMIVKILGSVLKGQVATVIKKTINTDFPFPFAWLTGYLAILVGAGMTFI
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CCDS34 VQSSSVFTSALTPLIGIGVITIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPGNALRSSLQIAL
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CCDS34 AGWRVLVGVGVPVVFIIILVLCLRLLQSRCPRVLPKKLQNWNFLPLWMRSLKPWDAVVSK
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        : :                                                        
CCDS34 FTGCFQMRCCCCCRVCCRACCLLCDCPKCCRCSKCCEDLEEAQEGQDVPVKAPETFDNIT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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