FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2416, 639 aa 1>>>pF1KE2416 639 - 639 aa - 639 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3873+/-0.000361; mu= 15.0618+/- 0.023 mean_var=98.9753+/-19.516, 0's: 0 Z-trim(116.7): 20 B-trim: 277 in 1/48 Lambda= 0.128917 statistics sampled from 28013 (28033) to 28013 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16 Scan time: 9.210 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003043 (OMIM: 182309,612286,613388,616963) sodi ( 639) 4193 790.5 0 XP_016865262 (OMIM: 182309,612286,613388,616963) P ( 546) 3016 571.5 2.7e-162 XP_016865263 (OMIM: 182309,612286,613388,616963) P ( 323) 2152 410.7 4.2e-114 XP_005266032 (OMIM: 182309,612286,613388,616963) P ( 583) 2154 411.2 5.2e-114 NP_001161051 (OMIM: 182309,612286,613388,616963) s ( 340) 2020 386.1 1.1e-106 XP_016865264 (OMIM: 182309,612286,613388,616963) P ( 321) 2017 385.6 1.5e-106 NP_001170787 (OMIM: 241530,609826) sodium-dependen ( 599) 1897 363.4 1.3e-99 NP_543153 (OMIM: 241530,609826) sodium-dependent p ( 599) 1897 363.4 1.3e-99 NP_001170788 (OMIM: 241530,609826) sodium-dependen ( 599) 1897 363.4 1.3e-99 XP_016869781 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 599) 1889 361.9 3.7e-99 XP_016869780 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 607) 1414 273.6 1.5e-72 XP_011516562 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 625) 1414 273.6 1.5e-72 XP_011516559 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 625) 1414 273.6 1.5e-72 XP_011516560 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 625) 1414 273.6 1.5e-72 XP_011516563 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 625) 1414 273.6 1.5e-72 XP_016869779 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 625) 1414 273.6 1.5e-72 XP_011516561 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodi ( 625) 1414 273.6 1.5e-72 NP_001171470 (OMIM: 265100,604217,610441) sodium-d ( 689) 1257 244.4 1e-63 NP_001171469 (OMIM: 265100,604217,610441) sodium-d ( 689) 1257 244.4 1e-63 NP_006415 (OMIM: 265100,604217,610441) sodium-depe ( 690) 1257 244.4 1e-63 >>NP_003043 (OMIM: 182309,612286,613388,616963) sodium-d (639 aa) initn: 4193 init1: 4193 opt: 4193 Z-score: 4216.7 bits: 790.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4193; 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52.1% identity (77.3% similar) in 591 aa overlap (41-618:5-584) 20 30 40 50 60 pF1KE2 PAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEHT------CPC .:: : :.: : :.:.: NP_001 MPSSLPG-SQVPHPTLDAVDLVEKTLRNEGTSSS 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 GEVLERHEPLPAKLA-LEEEQKP--ESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDML . :::. . : : :.. ..: : :.. .::.... .::. .: ::.:.::::.: NP_001 APVLEEGDTDPWTLPQLKDTSQPWKELRVAGRLRRVAGSVLKACGLLGSLYFFICSLDVL 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 SSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLEV :::::: :.::::::::::..:::::::::.:.:::.::::::::.::.::::.. :: : NP_001 SSAFQLLGSKVAGDIFKDNVVLSNPVAGLVIGVLVTALVQSSSTSSSIVVSMVAAKLLTV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAAT ..::::: :.:::.:.:.:.. :.::: .:.:::.:..:: ::::.::::::::.:: NP_001 RVSVPIIMGVNVGTSITSTLVSMAQSGDRDEFQRAFSGSAVHGIFNWLTVLVLLPLESAT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 GYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHSL . :.....:.... .. .:::.::..:.:.:.::.::: ..: : :::. . : :: NP_001 ALLERLSELALGAASLTPRAQAPDILKVLTKPLTHLIVQLDSDMIMSSATGNAT--NSSL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KE2 IQIWCHPDSLQAPTSMSRAEANSSQTLGNATMEK----CNHIFVDTGLPDLAVGLILLAG :. :: . : : : . : :.: : :.:. : : ::::: ::::: NP_001 IKHWCGTTG-QPTQENSSCGAFGPCTEKNSTAPADRLPCRHLFAGTELTDLAVGCILLAG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SLVLLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFVVQ ::..:: ::.:.::.:::.:.:.::.:.. :::.::: :. :. ::.:...::..::..: NP_001 SLLVLCGCLVLIVKLLNSVLRGRVAQVVRTVINADFPFPLGWLGGYLAVLAGAGLTFALQ 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SSSVFTSAITPLIGLGVISIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPREKLSSAFQIALCH ::::::.:..::.:.::::..::::: :::::::::::.::::::: ... ::.:.:: : NP_001 SSSVFTAAVVPLMGVGVISLDRAYPLLLGSNIGTTTTALLAALASPADRMLSALQVALIH 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 FFFNISGILLWYPVPCTRLPIRMAKALGKRTAKYRWFAVLYLLVCFLLLPSLVFGISMAG ::::..:::::: :: :::: .:. .: ::.::: : .:::. ::::: .::.:.:: NP_001 FFFNLAGILLWYLVPALRLPIPLARHFGVVTARYRWVAGVYLLLGFLLLPLAAFGLSLAG 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 WQVMVGVGTPFGALLAFVVLINVLQSRSPGHLPKWLQTWDFLPRWMHSLKPLDHLITRAT .:...:: :. .:. .:.:..::: : :. :: :..: .:: :.:::.: :.:.:: NP_001 GMVLAAVGGPLVGLVLLVILVTVLQRRRPAWLPVRLRSWAWLPVWLHSLEPWDRLVTR-- 520 530 540 550 560 600 610 620 630 pF1KE2 LCCARPEPRSPPLPPRVFLEELPPATPSPRLALPAHHNATRL :: : . ::.. .: NP_001 -CC----PCNVCSPPKATTKEAYCYENPEILASQQL 570 580 590 >>NP_543153 (OMIM: 241530,609826) sodium-dependent phosp (599 aa) initn: 1869 init1: 1069 opt: 1897 Z-score: 1909.3 bits: 363.4 E(85289): 1.3e-99 Smith-Waterman score: 1904; 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52.1% identity (77.3% similar) in 591 aa overlap (41-618:5-584) 20 30 40 50 60 pF1KE2 PAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEHT------CPC .:: : :.: : :.:.: NP_001 MPSSLPG-SQVPHPTLDAVDLVEKTLRNEGTSSS 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 GEVLERHEPLPAKLA-LEEEQKP--ESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDML . :::. . : : :.. ..: : :.. .::.... .::. .: ::.:.::::.: NP_001 APVLEEGDTDPWTLPQLKDTSQPWKELRVAGRLRRVAGSVLKACGLLGSLYFFICSLDVL 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 SSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLEV :::::: :.::::::::::..:::::::::.:.:::.::::::::.::.::::.. :: : NP_001 SSAFQLLGSKVAGDIFKDNVVLSNPVAGLVIGVLVTALVQSSSTSSSIVVSMVAAKLLTV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAAT ..::::: :.:::.:.:.:.. :.::: .:.:::.:..:: ::::.::::::::.:: NP_001 RVSVPIIMGVNVGTSITSTLVSMAQSGDRDEFQRAFSGSAVHGIFNWLTVLVLLPLESAT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 GYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHSL . :.....:.... .. .:::.::..:.:.:.::.::: ..: : :::. . : :: NP_001 ALLERLSELALGAASLTPRAQAPDILKVLTKPLTHLIVQLDSDMIMSSATGNAT--NSSL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KE2 IQIWCHPDSLQAPTSMSRAEANSSQTLGNATMEK----CNHIFVDTGLPDLAVGLILLAG :. :: . : : : . : :.: : :.:. : : ::::: ::::: NP_001 IKHWCGTTG-QPTQENSSCGAFGPCTEKNSTAPADRLPCRHLFAGTELTDLAVGCILLAG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SLVLLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFVVQ ::..:: ::.:.::.:::.:.:.::.:.. :::.::: :. :. ::.:...::..::..: NP_001 SLLVLCGCLVLIVKLLNSVLRGRVAQVVRTVINADFPFPLGWLGGYLAVLAGAGLTFALQ 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SSSVFTSAITPLIGLGVISIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPREKLSSAFQIALCH ::::::.:..::.:.::::..::::: :::::::::::.::::::: ... ::.:.:: : NP_001 SSSVFTAAVVPLMGVGVISLDRAYPLLLGSNIGTTTTALLAALASPADRMLSALQVALIH 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 FFFNISGILLWYPVPCTRLPIRMAKALGKRTAKYRWFAVLYLLVCFLLLPSLVFGISMAG ::::..:::::: :: :::: .:. .: ::.::: : .:::. ::::: .::.:.:: NP_001 FFFNLAGILLWYLVPALRLPIPLARHFGVVTARYRWVAGVYLLLGFLLLPLAAFGLSLAG 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 WQVMVGVGTPFGALLAFVVLINVLQSRSPGHLPKWLQTWDFLPRWMHSLKPLDHLITRAT .:...:: :. .:. .:.:..::: : :. :: :..: .:: :.:::.: :.:.:: NP_001 GMVLAAVGGPLVGLVLLVILVTVLQRRRPAWLPVRLRSWAWLPVWLHSLEPWDRLVTR-- 520 530 540 550 560 600 610 620 630 pF1KE2 LCCARPEPRSPPLPPRVFLEELPPATPSPRLALPAHHNATRL :: : . ::.. .: NP_001 -CC----PCNVCSPPKATTKEAYCYENPEILASQQL 570 580 590 >>XP_016869781 (OMIM: 241530,609826) PREDICTED: sodium-d (599 aa) initn: 1861 init1: 1061 opt: 1889 Z-score: 1901.2 bits: 361.9 E(85289): 3.7e-99 Smith-Waterman score: 1896; 51.9% identity (77.2% similar) in 591 aa overlap (41-618:5-584) 20 30 40 50 60 pF1KE2 PAVSPLPVRGGHVMRGTAFAYVPSPQVLHRIPGTSAYAFPSLGPVALAEHT------CPC .:: : :.: : :.:.: XP_016 MPSSLPG-SQVPHPTLDAVDLVEKTLRNEGTSSS 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 GEVLERHEPLPAKLA-LEEEQKP--ESRLVPKLRQAGAMLLKVPLMLTFLYLFVCSLDML . :::. . : : :.. ..: : :.. .::.... .::. .: ::.:.::::.: XP_016 APVLEEGDTDPWTLPQLKDTSQPWKELRVAGRLRRVAGSVLKACGLLGSLYFFICSLDVL 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 SSAFQLAGGKVAGDIFKDNAILSNPVAGLVVGILVTVLVQSSSTSTSIIVSMVSSGLLEV :::::: :.::::::::::..:::::::::.:.:::.::::::::.::.::::.. :: : XP_016 SSAFQLLGSKVAGDIFKDNVVLSNPVAGLVIGVLVTALVQSSSTSSSIVVSMVAAKLLTV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SSAIPIIMGSNIGTSVTNTIVALMQAGDRTDFRRAFAGATVHDCFNWLSVLVLLPLEAAT ..::::: :.:::.:.:.:.. :.::: .:.:::.:..:: ::::.::::::::.:: XP_016 RVSVPIIMGVNVGTSITSTLVSMAQSGDRDEFQRAFSGSAVHGIFNWLTVLVLLPLESAT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 GYLHHITRLVVASFNIHGGRDAPDLLKIITEPFTKLIIQLDESVITSIATGDESLRNHSL . :.....:.... .. .:::.::..:.:.:.::.::: ..: : :::. . : :: XP_016 ALLERLSELALGAASLTPRAQAPDILKVLTKPLTHLIVQLDSDMIMSSATGNAT--NSSL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KE2 IQIWCHPDSLQAPTSMSRAEANSSQTLGNATMEK----CNHIFVDTGLPDLAVGLILLAG :. :: . : : : . : :.: : :.:. : : ::::: ::::: XP_016 IKHWCGTTG-QPTQENSSCGAFGPCTEKNSTAPADRLPCRHLFAGTELTDLAVGCILLAG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SLVLLCTCLILLVKMLNSLLKGQVAKVIQKVINTDFPAPFTWVTGYFAMVVGASMTFVVQ ::..:: ::.:.::.:::.:.:.::.:.. :::.::: :. :. ::.:...::..::..: XP_016 SLLVLCGCLVLIVKLLNSVLRGRVAQVVRTVINADFPFPLGWLGGYLAVLAGAGLTFALQ 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SSSVFTSAITPLIGLGVISIERAYPLTLGSNIGTTTTAILAALASPREKLSSAFQIALCH ::::::.:..::.:.::::..::::: :::::::::::.::::::: ... ::.:.:: : XP_016 SSSVFTAAVVPLMGVGVISLDRAYPLLLGSNIGTTTTALLAALASPADRMLSALQVALIH 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 FFFNISGILLWYPVPCTRLPIRMAKALGKRTAKYRWFAVLYLLVCFLLLPSLVFGISMAG ::::..:::::: :: :::: .:. .: ::.::: : .:::. ::::: .::.:.:: XP_016 FFFNLAGILLWYLVPALRLPIPLARHFGVVTARYRWVAGVYLLLGFLLLPLAAFGLSLAG 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 WQVMVGVGTPFGALLAFVVLINVLQSRSPGHLPKWLQTWDFLPRWMHSLKPLDHLITRAT . ...:: :. .:. .:.:..::: : :. :: :..: .:: :.:::.: :.:.:: XP_016 GMELAAVGGPLVGLVLLVILVTVLQRRRPAWLPVRLRSWAWLPVWLHSLEPWDRLVTR-- 520 530 540 550 560 600 610 620 630 pF1KE2 LCCARPEPRSPPLPPRVFLEELPPATPSPRLALPAHHNATRL :: : . ::.. .: XP_016 -CC----PCNVCSPPKATTKEAYCYENPEILASQQL 570 580 590 639 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 03:32:03 2016 done: Tue Nov 8 03:32:04 2016 Total Scan time: 9.210 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]