FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2431, 309 aa 1>>>pF1KE2431 309 - 309 aa - 309 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 64942286 residues in 91783 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0345+/-0.000498; mu= 17.2277+/- 0.030 mean_var=75.0796+/-16.793, 0's: 0 Z-trim(107.4): 94 B-trim: 700 in 2/49 Lambda= 0.148018 statistics sampled from 16034 (16088) to 16034 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.5), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16 Scan time: 3.080 The best scores are: opt bits E(91783) NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1996 436.3 4.1e-122 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1808 396.1 5e-110 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1803 395.1 1e-109 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1670 366.7 3.6e-101 XP_003961040 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 ( 299) 1670 366.7 3.6e-101 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1631 358.3 1.2e-98 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1356 299.6 5.6e-81 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1309 289.6 5.8e-78 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1281 283.6 3.6e-76 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 814 183.9 3.9e-46 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 778 176.2 8.2e-44 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 667 152.5 1.1e-36 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 617 141.8 1.8e-33 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 610 140.3 5.1e-33 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 608 139.9 6.8e-33 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 574 132.6 1e-30 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 564 130.5 4.7e-30 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 505 117.9 2.8e-26 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 425 100.8 3.9e-21 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 398 95.0 2.1e-19 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 378 90.8 4.3e-18 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 356 86.1 1.1e-16 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 341 82.9 9.7e-16 NP_058641 (OMIM: 103780,604867,617956) taste recep ( 291) 328 80.1 6.5e-15 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 317 77.8 3.7e-14 NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380) 156 43.4 0.00091 >>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 1996 init1: 1996 opt: 1996 Z-score: 2313.9 bits: 436.3 E(91783): 4.1e-122 Smith-Waterman score: 1996; 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NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT .:::::::.::.::::::::.::::::::.: : :::.:::.::::::.:::: ::::.: NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI :.::.::.::::.::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::: :::::::: NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW ::::..::: .:: ::..::::::.:: ::::: :::::: ::::::: ::::. ..::: NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 VKGEKTSSP :: NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF 310 >>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 1371 init1: 1345 opt: 1356 Z-score: 1575.3 bits: 299.6 E(91783): 5.6e-81 Smith-Waterman score: 1356; 66.3% identity (85.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW :..:: :.:: ::::.:..::::::::::.: : :::::: ::::..::::::::::: NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH :.::.::::::::. ....: : ::: :::: ::::.:::::::::.::: .:: : NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT :::..:::.::..:: :.::.::: . . : :.: :::.::::::..::..::.::. NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI :.:::.::::::.::.::: :::::::::::.::::::::::.:::::::: :::.: :: NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW ::: ..:: :.: .. :.:.:.:. . :::.: :::::::: ::::::::.::. : NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 VKGEKTSSP .::.. :.: NP_795 AKGQNQSTP >>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1298 init1: 1298 opt: 1309 Z-score: 1521.3 bits: 289.6 E(91783): 5.8e-78 Smith-Waterman score: 1309; 67.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW ::::: :.:: :..: ::.:::::::::::: :. ::.::: ::::::::::::.:::: NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH .:::::: ::::::: :::.: :.:: :.: :::: :::..::::::::::::::..::: NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT :::::.:::::.::: :.::.:::.: ::.: . ..:.::::: :.::......: .::: NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI . ...::::.:.::..::::::::::::::.:.:::: :::::::::::.::::::::: NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW .:: ...:::: :.: :: : ::. : .. ::::: .::::.::: .. :.: NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC 250 260 270 280 290 pF1KE2 VKGEKTSSP >>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1281 init1: 1281 opt: 1281 Z-score: 1489.0 bits: 283.6 E(91783): 3.6e-76 Smith-Waterman score: 1281; 65.7% identity (87.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW :. :: :: : ::: .::.:: ::::::::: :. . .::: :.::::::.:::.:::: NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH :.:. ::.::.: :. ..::: .: : ::: :::: :::..:::: :::::::::.: :: NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT ::.:.:::.::.:::::.:: :.: ::.:.: : :::.:::.::::::..:...:..::: NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI .:::.::::.:. :.:::::::::::::.:..:::::::::::::::::: :::.: :: NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW ::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::.::: NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR 250 260 270 280 290 pF1KE2 VKGEKTSSP >>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa) initn: 776 init1: 263 opt: 814 Z-score: 949.9 bits: 183.9 E(91783): 3.9e-46 Smith-Waterman score: 814; 45.0% identity (72.6% similar) in 307 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIESFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW : . :: ::. .... :.:::..::::.:.: :. .....: .:..: ::.::.::.: NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 VLLLNWYSTV--LNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIF .:..:. .. : ... .: .. : : :::. :::: .:::::::::.::. : NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFS--- :.:: ::..:::..::: :.:: .:. :::. ..: : ::...... :: NP_076 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NMTVTMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLRGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFL ..:.:: . :.:::....::.::: :: :::.:::: :: .:: :::: .::. ::::: NP_076 KFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LLCAIYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFW :. : .:: ..:: : .: ..:.:..: :: : :.:: :: ::.:.:: : NP_076 LFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV-- 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 QMRYWVKGEKTSSP . :.: NP_076 AAKVWAKR 300 309 residues in 1 query sequences 64942286 residues in 91783 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Sep 11 18:47:31 2018 done: Tue Sep 11 18:47:31 2018 Total Scan time: 3.080 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]