FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2432, 309 aa 1>>>pF1KE2432 309 - 309 aa - 309 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 65089639 residues in 91964 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8629+/-0.000459; mu= 18.2168+/- 0.028 mean_var=74.9052+/-16.124, 0's: 0 Z-trim(109.0): 93 B-trim: 392 in 1/49 Lambda= 0.148190 statistics sampled from 17758 (17841) to 17758 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 3.220 The best scores are: opt bits E(91964) NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 2007 439.0 6.3e-123 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1816 398.1 1.2e-110 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1734 380.6 2.3e-105 XP_003961040 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 ( 299) 1645 361.6 1.2e-99 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1645 361.6 1.2e-99 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1622 356.7 3.9e-98 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1328 293.8 3.1e-79 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1311 290.2 3.9e-78 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1306 289.1 8e-78 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 808 182.6 9.1e-46 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 785 177.7 2.8e-44 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 655 149.9 6.6e-36 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 654 149.7 7.6e-36 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 616 141.6 2.1e-33 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 589 135.8 1.2e-31 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 556 128.8 1.5e-29 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 550 127.5 3.8e-29 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 473 111.0 3.3e-24 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 395 94.3 3.4e-19 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 393 93.9 4.6e-19 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 375 90.1 7e-18 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 358 86.4 8.6e-17 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 357 86.2 9.6e-17 NP_058641 (OMIM: 103780,604867,617956) taste recep ( 291) 320 78.3 2.3e-14 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 302 74.5 3.6e-13 NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380) 197 52.1 2.3e-06 NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 140 39.9 0.0096 >>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 2007 init1: 2007 opt: 2007 Z-score: 2328.5 bits: 439.0 E(91964): 6.3e-123 Smith-Waterman score: 2007; 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NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW ::.:..:::::: .::::::::::.:: :: : :::::::::::::::.:::: :.:: NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 250 260 270 280 290 pF1KE2 VKGEKPSSP >>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa) initn: 1622 init1: 1622 opt: 1622 Z-score: 1883.5 bits: 356.7 E(91964): 3.9e-98 Smith-Waterman score: 1622; 82.1% identity (93.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW : ::.::::: ..::.:::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::::::: NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH ::::.::.: .:::::::::: :::::::::.:::.:::::::.::::.::::::::::. NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT .:::::::.::.::::::::.:.:::::: : : :::::::.:::::::::.: :. :.: NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV :.:.::.::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::. NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW ::::..::: .:: ::..::::::.:: ::::: :::::: ::::::: ::::::.:::: NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 VKGEKPSSP :: NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF 310 >>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1322 init1: 1322 opt: 1328 Z-score: 1544.1 bits: 293.8 E(91964): 3.1e-79 Smith-Waterman score: 1328; 69.1% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW : ::. :.:: ...::::.:::::::::::: :. :::.::: ::::::::::::.:::: NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH .:::::: ::.::::::::.: :.::.:.::.::: :::..:::::::::::::::.::: NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT :::::.:::::.::: :.::.:.:.: :: : . ..:::::.: :.:::..:.:: ::: NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV :: ...::::.:. ::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::.: ::::::. 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NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV :.::.::::::. ::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::: ::.: :. 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NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR 250 260 270 280 290 pF1KE2 VKGEKPSSP >>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa) initn: 742 init1: 241 opt: 808 Z-score: 943.2 bits: 182.6 E(91964): 9.1e-46 Smith-Waterman score: 808; 44.4% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW : . .: ::. :... :.:::..::::.:.: :. :.....: .:..: ::.::.::.: NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFY--SVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF .:..:. .. :.. .. .: .. : :..::. :::: .:::::::::.::. : NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRS--AVYLSD :.:: ::..:::..::: :.:: .:. :::. .:: : ::.... . . .: NP_076 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 ATVTTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLL . :. .:.:::.... ::::: :: :::.::::. :: .:: :::: .::. :: ::: NP_076 KFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LCAVYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQ . : .:: ..:: : .: ..:.:..: :: : :.:: :: ::.:.:: : . NP_076 FYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 VRYWVKGEKPSSP : :.: NP_076 V--WAKR 300 309 residues in 1 query sequences 65089639 residues in 91964 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Oct 12 17:02:57 2018 done: Fri Oct 12 17:02:58 2018 Total Scan time: 3.220 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]