Result of FASTA (omim) for pF1KE2432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2432, 309 aa
  1>>>pF1KE2432     309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  65089639 residues in 91964 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8629+/-0.000459; mu= 18.2168+/- 0.028
 mean_var=74.9052+/-16.124, 0's: 0 Z-trim(109.0): 93  B-trim: 392 in 1/49
 Lambda= 0.148190
 statistics sampled from 17758 (17841) to 17758 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.194), width:  16
 Scan time:  3.220

The best scores are:                                      opt bits E(91964)
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 2007 439.0 6.3e-123
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1816 398.1 1.2e-110
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1734 380.6 2.3e-105
XP_003961040 (OMIM: 612668) taste receptor type 2  ( 299) 1645 361.6 1.2e-99
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1645 361.6 1.2e-99
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2  ( 319) 1622 356.7 3.9e-98
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1328 293.8 3.1e-79
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1311 290.2 3.9e-78
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1306 289.1   8e-78
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303)  808 182.6 9.1e-46
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317)  785 177.7 2.8e-44
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318)  655 149.9 6.6e-36
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312)  654 149.7 7.6e-36
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307)  616 141.6 2.1e-33
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314)  589 135.8 1.2e-31
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309)  556 128.8 1.5e-29
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316)  550 127.5 3.8e-29
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307)  473 111.0 3.3e-24
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299)  395 94.3 3.4e-19
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299)  393 93.9 4.6e-19
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323)  375 90.1   7e-18
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318)  358 86.4 8.6e-17
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299)  357 86.2 9.6e-17
NP_058641 (OMIM: 103780,604867,617956) taste recep ( 291)  320 78.3 2.3e-14
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333)  302 74.5 3.6e-13
NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380)  197 52.1 2.3e-06
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337)  140 39.9  0.0096


>>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member   (309 aa)
 initn: 2007 init1: 2007 opt: 2007  Z-score: 2328.5  bits: 439.0 E(91964): 6.3e-123
Smith-Waterman score: 2007; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE2 VKGEKPSSP
       :::::::::
NP_795 VKGEKPSSP
                

>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member   (309 aa)
 initn: 1816 init1: 1816 opt: 1816  Z-score: 2107.8  bits: 398.1 E(91964): 1.2e-110
Smith-Waterman score: 1816; 89.3% identity (96.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : ::.::::::.::: ::::::::::::::::::  ::::::::::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       ::::::::::.:::: ::::::::::.::: .::::::::.::::::::::::::.::::
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       ::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::.:::.::::::.::.:.:. :::
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
        ..:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.
NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE2 VKGEKPSSP
       ::::: :::
NP_795 VKGEKTSSP
                

>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member   (309 aa)
 initn: 1734 init1: 1734 opt: 1734  Z-score: 2013.0  bits: 380.6 E(91964): 2.3e-105
Smith-Waterman score: 1734; 85.4% identity (93.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : ::.::::: ..:: ::::::::::::::::::  ::::::::::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       ::.::::.: .:::: :.::: :::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       ::::::::.::.::::::::.:.::::::..:. :::::::.:::::::::.:::..:::
NP_795 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
        :.:::::::::. :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::  ::::::.
NP_795 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       :::::..::::: :::::::::::.:: ::::: :::::::::::::::::::: .::::
NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE2 VKGEKPSSP
       :::::::: 
NP_795 VKGEKPSSS
                

>>XP_003961040 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 memb  (299 aa)
 initn: 1645 init1: 1645 opt: 1645  Z-score: 1910.4  bits: 361.6 E(91964): 1.2e-99
Smith-Waterman score: 1645; 84.3% identity (94.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : ::.::::: .::: :::::::::::::::: : ::::::::::::.::::::::::::
XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       ::::::::::.::::::::.::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::.
XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       :::::::::::.::::::::::.:::.::..:: :::::::.::::::: :.::::.:::
XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
        :.::::::.::. ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::: :.:: :.
XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       ::.:..:::::: .::::::::::.:: ::  : :::::::::::::::.:::: :.:: 
XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 
              250       260       270       280       290          

                
pF1KE2 VKGEKPSSP

>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member   (299 aa)
 initn: 1645 init1: 1645 opt: 1645  Z-score: 1910.4  bits: 361.6 E(91964): 1.2e-99
Smith-Waterman score: 1645; 84.3% identity (94.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : ::.::::: .::: :::::::::::::::: : ::::::::::::.::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       ::::::::::.::::::::.::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::.
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       :::::::::::.::::::::::.:::.::..:: :::::::.::::::: :.::::.:::
NP_795 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
        :.::::::.::. ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::: :.:: :.
NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       ::.:..:::::: .::::::::::.:: ::  : :::::::::::::::.:::: :.:: 
NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 
              250       260       270       280       290          

                
pF1KE2 VKGEKPSSP

>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb  (319 aa)
 initn: 1622 init1: 1622 opt: 1622  Z-score: 1883.5  bits: 356.7 E(91964): 3.9e-98
Smith-Waterman score: 1622; 82.1% identity (93.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : ::.::::: ..::.:::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::
NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       ::::.::.: .:::::::::: :::::::::.:::.:::::::.::::.::::::::::.
NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       .:::::::.::.::::::::.:.:::::: : : :::::::.:::::::::.: :. :.:
NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
        :.:.::.::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::  ::::::.
NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       ::::..::: .:: ::..::::::.:: ::::: :::::: ::::::: ::::::.::::
NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
              250       260       270       280       290       300

                          
pF1KE2 VKGEKPSSP          
       ::                 
NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
              310         

>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member   (299 aa)
 initn: 1322 init1: 1322 opt: 1328  Z-score: 1544.1  bits: 293.8 E(91964): 3.1e-79
Smith-Waterman score: 1328; 69.1% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : ::. :.:: ...::::.:::::::::::: :. :::.::: ::::::::::::.::::
NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       .:::::: ::.::::::::.: :.::.:.::.::: :::..:::::::::::::::.:::
NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       :::::.:::::.::: :.::.:.:.: :: : . ..:::::.: :.:::..:.::  :::
NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
       :: ...::::.:. ::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::.: ::::::.
NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       .:: ...::::   :.: :: :  ::.   : ..  ::::: .::::.::: .: :.:  
NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC 
              250       260       270       280       290          

                
pF1KE2 VKGEKPSSP

>>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member   (309 aa)
 initn: 1310 init1: 1286 opt: 1311  Z-score: 1524.3  bits: 290.2 E(91964): 3.9e-78
Smith-Waterman score: 1311; 65.7% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : .:. :.:: .::: :..::::::::::.: :  ::::::: ::::..:::::::::::
NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       :.::.:::::.::.  ...:     :.::::.::: ::::::::::::::.::: ::: :
NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       :::..:::.::..:: :.::.:.: . .    : :.: :::.:::::::.:..::. ::.
NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
        :.::.::::::. ::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::  ::.: :.
NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       ::: ..:: :.:    .. :.:.:.:. . :::.: :::::::: ::::::::: ::  :
NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE2 VKGEKPSSP
       .::.. :.:
NP_795 AKGQNQSTP
                

>>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member   (299 aa)
 initn: 1325 init1: 1295 opt: 1306  Z-score: 1518.7  bits: 289.1 E(91964): 8e-78
Smith-Waterman score: 1306; 68.0% identity (87.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       :  :. :: : .::  ::.:: ::::::::: :. :. .::: :.::::::.:::.::::
NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
       :.:. ::.:::: :.:..::: .: :.::::.::: :::.::::: ::::::::::: ::
NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
       ::.:.:::.::.:::::.:: :.: ::.: : : :::::::.:::::::.:..::. :::
NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
       ::.::.::::.:.::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::  ::.: :.
NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
       ::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::: :.   
NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR 
              250       260       270       280       290          

                
pF1KE2 VKGEKPSSP

>>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member   (303 aa)
 initn: 742 init1: 241 opt: 808  Z-score: 943.2  bits: 182.6 E(91964): 9.1e-46
Smith-Waterman score: 808; 44.4% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
       : . .: ::. :... :.:::..::::.:.: :. :.....: .:..:  ::.::.::.:
NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
               10        20        30        40        50        60

               70          80        90       100       110        
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFY--SVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
        .:..:. ..   :..  .. .:   .. : :..::. :::: .:::::::::.::.  :
NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
               70        80         90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRS--AVYLSD
       :.:: ::..:::..::: :.::  .:. :::.      .:: : ::.... .  .  .: 
NP_076 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV
     120       130       140       150       160       170         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE2 ATVTTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLL
         . :. .:.:::.... ::::: :: :::.::::. :: .:: :::: .::. :: :::
NP_076 KFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLL
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE2 LCAVYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQ
       . : .:: ..:: :     .:  ..:.:..:    :: : :.:: :: ::.:.:: :  .
NP_076 FYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK
     240       250        260       270       280       290        

        300         
pF1KE2 VRYWVKGEKPSSP
       :  :.:       
NP_076 V--WAKR      
        300         




309 residues in 1 query   sequences
65089639 residues in 91964 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Oct 12 17:02:57 2018 done: Fri Oct 12 17:02:58 2018
 Total Scan time:  3.220 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com