FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2480, 1453 aa 1>>>pF1KE2480 1453 - 1453 aa - 1453 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5279+/-0.00128; mu= 16.8045+/- 0.076 mean_var=81.2895+/-16.229, 0's: 0 Z-trim(101.7): 37 B-trim: 148 in 1/49 Lambda= 0.142252 statistics sampled from 6616 (6632) to 6616 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16 Scan time: 4.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32123.1 MLH3 gene_id:27030|Hs108|chr14 (1453) 9549 1970.6 0 CCDS9837.1 MLH3 gene_id:27030|Hs108|chr14 (1429) 7959 1644.3 0 CCDS2663.1 MLH1 gene_id:4292|Hs108|chr3 ( 756) 392 91.3 1.2e-17 CCDS46473.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 ( 770) 308 74.1 1.8e-12 CCDS2302.1 PMS1 gene_id:5378|Hs108|chr2 ( 932) 308 74.1 2.2e-12 >>CCDS32123.1 MLH3 gene_id:27030|Hs108|chr14 (1453 aa) initn: 9549 init1: 9549 opt: 9549 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