Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2502
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2502, 724 aa
1>>>pF1KE2502 724 - 724 aa - 724 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7213+/-0.00104; mu= 17.1615+/- 0.062
mean_var=69.3155+/-13.743, 0's: 0 Z-trim(103.4): 52 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.154049
statistics sampled from 7332 (7376) to 7332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10298.1 ACSBG1 gene_id:23205|Hs108|chr15 ( 724) 4859 1089.7 0
CCDS12159.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19 ( 666) 2177 493.6 4e-139
CCDS82282.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19 ( 616) 2119 480.7 2.9e-135
CCDS74269.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19 ( 479) 1714 390.6 2.9e-108
CCDS7573.1 ACSL5 gene_id:51703|Hs108|chr10 ( 683) 575 137.6 6.2e-32
CCDS3839.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4 ( 698) 575 137.6 6.3e-32
CCDS7572.1 ACSL5 gene_id:51703|Hs108|chr10 ( 739) 575 137.6 6.7e-32
CCDS68826.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4 ( 698) 574 137.4 7.4e-32
CCDS56383.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5 ( 708) 565 135.4 3e-31
CCDS34229.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5 ( 722) 565 135.4 3.1e-31
CCDS56381.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5 ( 697) 564 135.1 3.5e-31
CCDS34228.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5 ( 722) 564 135.1 3.6e-31
CCDS68825.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4 ( 664) 506 122.2 2.5e-27
CCDS75213.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4 ( 527) 499 120.6 6e-27
CCDS2455.1 ACSL3 gene_id:2181|Hs108|chr2 ( 720) 438 107.1 9.6e-23
CCDS14549.1 ACSL4 gene_id:2182|Hs108|chrX ( 670) 387 95.8 2.3e-19
CCDS14548.1 ACSL4 gene_id:2182|Hs108|chrX ( 711) 387 95.8 2.4e-19
CCDS56382.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5 ( 622) 317 80.2 1e-14
>>CCDS10298.1 ACSBG1 gene_id:23205|Hs108|chr15 (724 aa)
initn: 4859 init1: 4859 opt: 4859 Z-score: 5831.9 bits: 1089.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4859; 99.9% identity (100.0% similar) in 724 aa overlap (1-724:1-724)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPRNSGAGYGCPHGDPSMLDSRETPQESRQDMIVRTTQEKLKTSSLTDRQPLSKESLNHA
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CCDS10 MPRNSGAGYGCPHGDPSMLDSRETPQESRQDMIVRTTQEKLKTSSLTDRQPLSKESLNHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LELSVPEKVNNAQWDAPEEALWTTRADGRVRLRIDPSCPQLPYTVHRMFYEALDKYGDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LELSVPEKVNNAQWDAPEEALWTTRADGRVRLRIDPSCPQLPYTVHRMFYEALDKYGDLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ALGFKRQDKWEHISYSQYYLLARRAAKGFLKLGLKQAHSVAILGFNSPEWFFSAVGTVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALGFKRQDKWEHISYSQYYLLARRAAKGFLKLGLKQAHSVAILGFNSPEWFFSAVGTVFA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GGIVTGIYTTSSPEACQYIAYDCCANVIMVDTQKQLEKILKIWKQLPHLKAVVIYKEPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGIVTGIYTTSSPEACQYIAYDCCANVIMVDTQKQLEKILKIWKQLPHLKAVVIYKEPPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NKMANVYTMEEFMELGNEVPEEALDAIIDTQQPNQCCVLVYTSGTTGNPKGVMLSQDNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NKMANVYTMEEFMELGNEVPEEALDAIIDTQQPNQCCVLVYTSGTTGNPKGVMLSQDNIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WTARYGSQAGDIRPAEVQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WTARYGSQAGDIRPAEVQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VNTLREVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLTCPGSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VNTLREVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLTCPGSDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KPFTTRLADYLVLAKVRQALGFAKCQKNFYGAAPMMAETQHFFLGLNIRLYAGYGLSETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPFTTRLADYLVLAKVRQALGFAKCQKNFYGAAPMMAETQHFFLGLNIRLYAGYGLSETS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GPHFMSSPYNYRLYSSGKLVPGCRVKLVNQDAEGIGEICLWGRTIFMGYLNMEDKTCEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPHFMSSPYNYRLYSSGKLVPGCRVKLVNQDAEGIGEICLWGRTIFMGYLNMEDKTCEAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DEEGWLHTGDAGRLDADGFLYITGRLKELIITAGGENVPPVPIEEAVKMELPIISNAMLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DEEGWLHTGDAGRLDADGFLYITGRLKELIITAGGENVPPVPIEEAVKMELPIISNAMLI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GDQRKFLSMLLTLKCTLDPDTSDQTDNLTEQAVEFCQRVGSRATTVSEIIEKKDEAVYQA
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GDQRKFLSMLLTLKCTLDPDTSDQTDNLTEQAMEFCQRVGSRATTVSEIIEKKDEAVYQA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 IEEGIRRVNMNAAARPYHIQKWAILERDFSISGGELGPTMKLKRLTVLEKYKGIIDSFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IEEGIRRVNMNAAARPYHIQKWAILERDFSISGGELGPTMKLKRLTVLEKYKGIIDSFYQ
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EQKM
::::
CCDS10 EQKM
>>CCDS12159.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19 (666 aa)
initn: 2083 init1: 1120 opt: 2177 Z-score: 2611.1 bits: 493.6 E(32554): 4e-139
Smith-Waterman score: 2177; 50.6% identity (78.3% similar) in 644 aa overlap (81-720:27-666)
60 70 80 90 100
pF1KE2 PLSKESLNHALELSVPEKVNNAQWDAPEEALWTTRADGRVRLRIDPSCP--QLPYTVHRM
:::: ::.: ::.. : . :.:. ..
CCDS12 MTGTPKTQEGAKDLEVDMNKTEVTPRLWTTCRDGEVLLRLSKHGPGHETPMTIPEF
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 FYEALDKYGDLIALGFKRQDKWEHISYSQYYLLARRAAKGFLKLGLKQAHSVAILGFNSP
: :.....: ::. : ::: ....::: :.:::...::::.. :.:.::::::
CCDS12 FRESVNRFGTYPALASKNGKKWEILNFNQYYEACRKAAKSLIKLGLERFHGVGILGFNSA
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 EWFFSAVGTVFAGGIVTGIYTTSSPEACQYIAYDCCANVIMVDTQKQLEKILKI-WKQLP
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CCDS12 EWFITAVGAILAGGLCVGIYATNSAEVCQYVITHAKVNILLVENDQQLQKILSIPQSSLE
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 HLKAVVIYKEPPPNKMANVYTMEEFMELGNEVPEEALDAIIDTQQPNQCCVLVYTSGTTG
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CCDS12 PLKAIIQYRLPM-KKNNNLYSWDDFMELGRSIPDTQLEQVIESQKANQCAVLIYTSGTTG
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 NPKGVMLSQDNITWTARYGSQAGDIRPAEVQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQ
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CCDS12 IPKGVMLSHDNITWIA--GAVTKDFKLTD-KHETVVSYLPLSHIAAQMMDIWVPIKIGAL
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 VCFAEPDALKGSLVNTLREVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSV
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CCDS12 TYFAQADALKGTLVSTLKEVKPTVFIGVPQIWEKIHEMVKKNSAKSMGLKKKAFVWARNI
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 TLEQNLTCP-GSDLKPFTTRLADYLVLAKVRQALGFAKCQKNFYGAAPMMAETQHFFLGL
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CCDS12 GFKVNSKKMLGKYNTPVSYRMAKTLVFSKVKTSLGLDHCHSFISGTAPLNQETAEFFLSL
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 NIRLYAGYGLSETSGPHFMSSPYNYRLYSSGKLVPGCRVKLVNQDAEGIGEICLWGRTIF
.: . :::::.:::: .:. :::: : ::.. ::. : .:. .:::::::::: ::
CCDS12 DIPIGELYGLSESSGPHTISNQNNYRLLSCGKILTGCKNMLFQQNKDGIGEICLWGRHIF
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 MGYLNMEDKTCEAIDEEGWLHTGDAGRLDADGFLYITGRLKELIITAGGENVPPVPIEEA
::::. : .: ::::.:::::.:: :.::. ::::.::..::..::::::::::.:.:
CCDS12 MGYLESETETTEAIDDEGWLHSGDLGQLDGLGFLYVTGHIKEILITAGGENVPPIPVETL
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 VKMELPIISNAMLIGDQRKFLSMLLTLKCTLDPDTSDQTDNLTEQAVEFCQRVGSRATTV
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CCDS12 VKKKIPIISNAMLVGDKLKFLSMLLTLKCEMNQMSGEPLDKLNFEAINFCRGLGSQASTV
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 SEIIEKKDEAVYQAIEEGIRRVNMNAAARPYHIQKWAILERDFSISGGELGPTMKLKRLT
.::....: ::.::..:: ::..: .:.::.:::.:::: :::::: :::::
CCDS12 TEIVKQQDPLVYKAIQQGINAVNQEAMNNAQRIEKWVILEKDFSIYGGELGPMMKLKRHF
600 610 620 630 640 650
710 720
pF1KE2 VLEKYKGIIDSFYQEQKM
: .::: :: .:.
CCDS12 VAQKYKKQIDHMYH
660
>>CCDS82282.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 2041 init1: 1120 opt: 2119 Z-score: 2542.0 bits: 480.7 E(32554): 2.9e-135
Smith-Waterman score: 2119; 50.9% identity (78.8% similar) in 619 aa overlap (104-720:2-616)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 WDAPEEALWTTRADGRVRLRIDPSCPQLPYTVHRMFYEALDKYGDLIALGFKRQDKWEHI
:. ..: :.....: ::. : ::: .
CCDS82 MTIPEFFRESVNRFGTYPALASKNGKKWEIL
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 SYSQYYLLARRAAKGFLKLGLKQAHSVAILGFNSPEWFFSAVGTVFAGGIVTGIYTTSSP
...::: :.:::...::::.. :.:.:::::: :::..:::...:::. .:::.:.:
CCDS82 NFNQYYEACRKAAKSLIKLGLERFHGVGILGFNSAEWFITAVGAILAGGLCVGIYATNSA
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 EACQYIAYDCCANVIMVDTQKQLEKILKI-WKQLPHLKAVVIYKEPPPNKMANVYTMEEF
:.:::. .:...:....::.:::.: ..: :::.. :. : .: :.:. ..:
CCDS82 EVCQYVITHAKVNILLVENDQQLQKILSIPQSSLEPLKAIIQYRLPM-KKNNNLYSWDDF
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MELGNEVPEEALDAIIDTQQPNQCCVLVYTSGTTGNPKGVMLSQDNITWTARYGSQAGDI
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CCDS82 MELGRSIPDTQLEQVIESQKANQCAVLIYTSGTTGIPKGVMLSHDNITWIA--GAVTKDF
160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 RPAEVQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSLVNTLREVEPTSH
. .. ..:.:::::::::::::..:.:. :. :: . ::. :::::.::.::.::.::
CCDS82 KLTD-KHETVVSYLPLSHIAAQMMDIWVPIKIGALTYFAQADALKGTLVSTLKEVKPTVF
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 MGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLTCP-GSDLKPFTTRLADYL
.:::..:::: : ... .:.: ...: ..:: .. .. : :. : . :.: :
CCDS82 IGVPQIWEKIHEMVKKNSAKSMGLKKKAFVWARNIGFKVNSKKMLGKYNTPVSYRMAKTL
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 VLAKVRQALGFAKCQKNFYGAAPMMAETQHFFLGLNIRLYAGYGLSETSGPHFMSSPYNY
:..::. .::. .:.. . :.::. :: .:::.:.: . :::::.:::: .:. ::
CCDS82 VFSKVKTSLGLDHCHSFISGTAPLNQETAEFFLSLDIPIGELYGLSESSGPHTISNQNNY
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 RLYSSGKLVPGCRVKLVNQDAEGIGEICLWGRTIFMGYLNMEDKTCEAIDEEGWLHTGDA
:: : ::.. ::. : .:. .:::::::::: ::::::. : .: ::::.:::::.::
CCDS82 RLLSCGKILTGCKNMLFQQNKDGIGEICLWGRHIFMGYLESETETTEAIDDEGWLHSGDL
390 400 410 420 430 440
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 GRLDADGFLYITGRLKELIITAGGENVPPVPIEEAVKMELPIISNAMLIGDQRKFLSMLL
:.::. ::::.::..::..::::::::::.:.: :: ..::::::::.::. :::::::
CCDS82 GQLDGLGFLYVTGHIKEILITAGGENVPPIPVETLVKKKIPIISNAMLVGDKLKFLSMLL
450 460 470 480 490 500
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 TLKCTLDPDTSDQTDNLTEQAVEFCQRVGSRATTVSEIIEKKDEAVYQAIEEGIRRVNMN
:::: .. ... :.:. .:..::. .::.:.::.::....: ::.::..:: ::..
CCDS82 TLKCEMNQMSGEPLDKLNFEAINFCRGLGSQASTVTEIVKQQDPLVYKAIQQGINAVNQE
510 520 530 540 550 560
680 690 700 710 720
pF1KE2 AAARPYHIQKWAILERDFSISGGELGPTMKLKRLTVLEKYKGIIDSFYQEQKM
: .:.::.:::.:::: :::::: ::::: : .::: :: .:.
CCDS82 AMNNAQRIEKWVILEKDFSIYGGELGPMMKLKRHFVAQKYKKQIDHMYH
570 580 590 600 610
>>CCDS74269.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19 (479 aa)
initn: 1691 init1: 1120 opt: 1714 Z-score: 2057.3 bits: 390.6 E(32554): 2.9e-108
Smith-Waterman score: 1714; 52.9% identity (79.0% similar) in 480 aa overlap (242-720:3-479)
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 TQKQLEKILKIWKQLPHLKAVVIYKEPPPNKMANVYTMEEFMELGNEVPEEALDAIIDTQ
: :.:. ..::::: .:. :. .:..:
CCDS74 MKKNNNLYSWDDFMELGRSIPDTQLEQVIESQ
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 QPNQCCVLVYTSGTTGNPKGVMLSQDNITWTARYGSQAGDIRPAEVQQEVVVSYLPLSHI
. ::: ::.::::::: :::::::.::::: : :. . :.. .. ..:.::::::::::
CCDS74 KANQCAVLIYTSGTTGIPKGVMLSHDNITWIA--GAVTKDFKLTD-KHETVVSYLPLSHI
40 50 60 70 80
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSLVNTLREVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAA
:::..:.:. :. :: . ::. :::::.::.::.::.:: .:::..:::: : ... .:
CCDS74 AAQMMDIWVPIKIGALTYFAQADALKGTLVSTLKEVKPTVFIGVPQIWEKIHEMVKKNSA
90 100 110 120 130 140
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLTCP-GSDLKPFTTRLADYLVLAKVRQALGFAKCQKNFY
.: ...: ..:: .. .. : :. : . :.: ::..::. .::. .:.. .
CCDS74 KSMGLKKKAFVWARNIGFKVNSKKMLGKYNTPVSYRMAKTLVFSKVKTSLGLDHCHSFIS
150 160 170 180 190 200
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 GAAPMMAETQHFFLGLNIRLYAGYGLSETSGPHFMSSPYNYRLYSSGKLVPGCRVKLVNQ
:.::. :: .:::.:.: . :::::.:::: .:. :::: : ::.. ::. : .:
CCDS74 GTAPLNQETAEFFLSLDIPIGELYGLSESSGPHTISNQNNYRLLSCGKILTGCKNMLFQQ
210 220 230 240 250 260
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 DAEGIGEICLWGRTIFMGYLNMEDKTCEAIDEEGWLHTGDAGRLDADGFLYITGRLKELI
. .:::::::::: ::::::. : .: ::::.:::::.:: :.::. ::::.::..::..
CCDS74 NKDGIGEICLWGRHIFMGYLESETETTEAIDDEGWLHSGDLGQLDGLGFLYVTGHIKEIL
270 280 290 300 310 320
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 ITAGGENVPPVPIEEAVKMELPIISNAMLIGDQRKFLSMLLTLKCTLDPDTSDQTDNLTE
::::::::::.:.: :: ..::::::::.::. ::::::::::: .. ... :.:.
CCDS74 ITAGGENVPPIPVETLVKKKIPIISNAMLVGDKLKFLSMLLTLKCEMNQMSGEPLDKLNF
330 340 350 360 370 380
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 QAVEFCQRVGSRATTVSEIIEKKDEAVYQAIEEGIRRVNMNAAARPYHIQKWAILERDFS
.:..::. .::.:.::.::....: ::.::..:: ::..: .:.::.:::.:::
CCDS74 EAINFCRGLGSQASTVTEIVKQQDPLVYKAIQQGINAVNQEAMNNAQRIEKWVILEKDFS
390 400 410 420 430 440
700 710 720
pF1KE2 ISGGELGPTMKLKRLTVLEKYKGIIDSFYQEQKM
: :::::: ::::: : .::: :: .:.
CCDS74 IYGGELGPMMKLKRHFVAQKYKKQIDHMYH
450 460 470
>>CCDS7573.1 ACSL5 gene_id:51703|Hs108|chr10 (683 aa)
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CCDS38 QIDDLYSTIKV
690
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240 250 260 270 280 290
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CCDS75 LKAKRGELSKYFRTQIDSLYEHIQD
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CCDS68 AQVFVHGE-----SLQAFLIAIVVPDV--------ETLCSWAQKRGFEGS-FEELCRNKD
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