Result of FASTA (omim) for
pF1KE2504
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2504, 1014 aa
1>>>pF1KE2504 1014 - 1014 aa - 1014 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9620+/-0.000408; mu= 14.5551+/- 0.026
mean_var=119.6963+/-24.159, 0's: 0 Z-trim(114.8): 47 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.117229
statistics sampled from 24871 (24913) to 24871 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 14.280
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001609 (OMIM: 173870) poly [ADP-ribose] polymer (1014) 6661 1138.5 0
NP_001036083 (OMIM: 607725) poly [ADP-ribose] poly ( 570) 1314 234.0 1.7e-60
NP_005475 (OMIM: 607725) poly [ADP-ribose] polymer ( 583) 1312 233.7 2.2e-60
XP_016876401 (OMIM: 607725) PREDICTED: poly [ADP-r ( 487) 1067 192.2 5.7e-48
XP_005267304 (OMIM: 607725) PREDICTED: poly [ADP-r ( 500) 1065 191.9 7.4e-48
NP_001003931 (OMIM: 607726) poly [ADP-ribose] poly ( 540) 715 132.7 5.2e-30
NP_005476 (OMIM: 607726) poly [ADP-ribose] polymer ( 533) 712 132.2 7.3e-30
XP_016860979 (OMIM: 607726) PREDICTED: poly [ADP-r ( 533) 712 132.2 7.3e-30
XP_005264836 (OMIM: 607726) PREDICTED: poly [ADP-r ( 533) 712 132.2 7.3e-30
NP_006428 (OMIM: 607519) poly [ADP-ribose] polymer (1724) 332 68.3 4.2e-10
XP_011533234 (OMIM: 607519) PREDICTED: poly [ADP-r (1724) 332 68.3 4.2e-10
XP_011533233 (OMIM: 607519) PREDICTED: poly [ADP-r (1771) 332 68.3 4.3e-10
>>NP_001609 (OMIM: 173870) poly [ADP-ribose] polymerase (1014 aa)
initn: 6661 init1: 6661 opt: 6661 Z-score: 6090.6 bits: 1138.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6661; 99.9% identity (99.9% similar) in 1014 aa overlap (1-1014:1-1014)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAESSDKLYRVEYAKSGRASCKKCSESIPKDSLRMAIMVQSPMFDGKVPHWYHFSCFWKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAESSDKLYRVEYAKSGRASCKKCSESIPKDSLRMAIMVQSPMFDGKVPHWYHFSCFWKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GHSIRHPDVEVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVTGKGQDGIGSKAEKTLGDFAAEYAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GHSIRHPDVEVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVTGKGQDGIGSKAEKTLGDFAAEYAKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NRSTCKGCMEKIEKGQVRLFKKMVDPEKPQLGMIDRWYHPGCFVKNREELGFRPEYSASQ
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRSTCKGCMEKIEKGQVRLSKKMVDPEKPQLGMIDRWYHPGCFVKNREELGFRPEYSASQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LKGFSLLATEDKEALKKQLPGVKSEGKRKGDEVDGVDEVAKKKSKKEKDKDSKLEKALKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKGFSLLATEDKEALKKQLPGVKSEGKRKGDEVDGVDEVAKKKSKKEKDKDSKLEKALKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QNDLIWNIKDELKKVCSTNDLKELLIFNKQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNDLIWNIKDELKKVCSTNDLKELLIFNKQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 QLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKVKKQDRIFPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKVKKQDRIFPPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TSASVAATPPPSTASAPAAVNSSASADKPLSNMKILTLGKLSRNKDEVKAMIEKLGGKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSASVAATPPPSTASAPAAVNSSASADKPLSNMKILTLGKLSRNKDEVKAMIEKLGGKLT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GTANKASLCISTKKEVEKMNKKMEEVKEANIRVVSEDFLQDVSASTKSLQELFLAHILSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTANKASLCISTKKEVEKMNKKMEEVKEANIRVVSEDFLQDVSASTKSLQELFLAHILSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WGAEVKAEPVEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGAEVKAEPVEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSNK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LEQMPSKEDAIEHFMKLYEEKTGNAWHSKNFTKYPKKFYPLEIDYGQDEEAVKKLTVNPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEQMPSKEDAIEHFMKLYEEKTGNAWHSKNFTKYPKKFYPLEIDYGQDEEAVKKLTVNPG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGKLSKRQIQAAYSILSEVQQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGKLSKRQIQAAYSILSEVQQAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 SQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPPLLNNADSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPPLLNNADSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLRG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GSDDSSKDPIDVNYEKLKTDIKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDLEVIDIFKIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSDDSSKDPIDVNYEKLKTDIKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDLEVIDIFKIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 REGECQRYKPFKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REGECQRYKPFKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFADM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 VSKSANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELKHASHISKLPKGKHSVKGLGKTTPDPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSKSANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELKHASHISKLPKGKHSVKGLGKTTPDPSA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KE2 NISLDGVDVPLGTGISSGVNDTSLLYNEYIVYDIAQVNLKYLLKLKFNFKTSLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NISLDGVDVPLGTGISSGVNDTSLLYNEYIVYDIAQVNLKYLLKLKFNFKTSLW
970 980 990 1000 1010
>>NP_001036083 (OMIM: 607725) poly [ADP-ribose] polymera (570 aa)
initn: 1174 init1: 398 opt: 1314 Z-score: 1206.9 bits: 234.0 E(85289): 1.7e-60
Smith-Waterman score: 1314; 42.2% identity (72.1% similar) in 517 aa overlap (512-1014:59-570)
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GAEVKAEPVEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMK-LTLKGGAAVDPDSGLE
:.. .:... .: : ::: : :::. .
NP_001 APEDSSPAKKTRRCQRQESKKMPVAGGKANKDRTEDKQDESVKALLLKGKAPVDPECTAK
30 40 50 60 70 80
550 560 570 580 590
pF1KE2 -HSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSN
.::: .:. :... :. ... ..:.:: .:::::: . . .. ::::: .:..
NP_001 VGKAHVYCEGNDVYDVMLNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGK-MGQH
90 100 110 120 130 140
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 KLEQMPSKED-AIEHFMKLYEEKTGNAWHSKN-FTKYPKKFYPLEIDYG---QDEEAVKK
.: .. . : : :.: . .:: : :.... : : : :. :..::. :::: .::
NP_001 SLVACSGNLNKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQDEEETKK
150 160 170 180 190 200
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 ---LTVNPGTKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGKLSKRQIQAAYS
: .:.: ::.:::.: .:..:.. :.:.. . .: :::::. ::.:.:.
NP_001 EESLKSPLKPESQLDLRVQELIKLICNVQAMEEMMMEMKYNTKKAPLGKLTVAQIKAGYQ
210 220 230 240 250 260
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 ILSEVQQAVSQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPPLLNNADSVQAKVEMLDNLLDI
:..... . :. ... :.::: ::::::.. :::. . .. :...:. : ::
NP_001 SLKKIEDCIRAGQHGRALMEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTQKELSEKIQLLEALGDI
270 280 290 300 310 320
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 EVAYSLLRGGSDDSSKDPIDVNYEKLKTDIKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDL
:.: .:.. .: . :.: .:..:. .. .:..: : ..: .:...::: ::. : .
NP_001 EIAIKLVKT-ELQSPEHPLDQHYRNLHCALRPLDHESYEFKVISQYLQSTHAPTHSDYTM
330 340 350 360 370 380
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 EVIDIFKIEREGECQRYKPFKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMF
..:.:..:..:: . .. ..:::: ::::::: .:..::::.::::::::::.:::::
NP_001 TLLDLFEVEKDGEKEAFR--EDLHNRMLLWHGSRMSNWVGILSHGLRIAPPEAPITGYMF
390 400 410 420 430 440
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 GKGIYFADMVSKSANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELKHASHISK-LPKGKHSVKG
::::::::: ::::::: .:. ::.::.:::::. :: .:. .. : .::::.::
NP_001 GKGIYFADMSSKSANYCFASRLKNTGLLLLSEVALGQCNELLEANPKAEGLLQGKHSTKG
450 460 470 480 490 500
960 970 980 990 1000
pF1KE2 LGKTTPDPSANISLDGVDVPLGTGISSGV---NDTSLLYNEYIVYDIAQVNLKYLLKLKF
::: .:. . ..:.: :::: . ..:. . .: :::::::. :: ..::::..:
NP_001 LGKMAPSSAHFVTLNGSTVPLGPASDTGILNPDGYTLNYNEYIVYNPNQVRMRYLLKVQF
510 520 530 540 550 560
1010
pF1KE2 NFKTSLW
:: .::
NP_001 NF-LQLW
570
>>NP_005475 (OMIM: 607725) poly [ADP-ribose] polymerase (583 aa)
initn: 1183 init1: 398 opt: 1312 Z-score: 1205.0 bits: 233.7 E(85289): 2.2e-60
Smith-Waterman score: 1312; 42.6% identity (71.9% similar) in 509 aa overlap (519-1014:80-583)
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PVEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLE-HSAHVLE
::. : ::: : :::. . .:::
NP_005 MPVAGGKANKDRTEDKQDGMPGRSWASKRVSESVKALLLKGKAPVDPECTAKVGKAHVYC
50 60 70 80 90 100
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSK
.:. :... :. ... ..:.:: .:::::: . . .. ::::: .:...: ..
NP_005 EGNDVYDVMLNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGK-MGQHSLVACSGN
110 120 130 140 150 160
610 620 630 640 650
pF1KE2 ED-AIEHFMKLYEEKTGNAWHSKN-FTKYPKKFYPLEIDYG---QDEEAVKK---LTVNP
. : : :.: . .:: : :.... : : : :. :..::. :::: .:: :
NP_005 LNKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQDEEETKKEESLKSPL
170 180 190 200 210 220
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 GTKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGKLSKRQIQAAYSILSEVQQA
.:.: ::.:::.: .:..:.. :.:.. . .: :::::. ::.:.:. :.....
NP_005 KPESQLDLRVQELIKLICNVQAMEEMMMEMKYNTKKAPLGKLTVAQIKAGYQSLKKIEDC
230 240 250 260 270 280
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 VSQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPPLLNNADSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLR
. :. ... :.::: ::::::.. :::. . .. :...:. : :::.: .:..
NP_005 IRAGQHGRALMEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTQKELSEKIQLLEALGDIEIAIKLVK
290 300 310 320 330 340
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 GGSDDSSKDPIDVNYEKLKTDIKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDLEVIDIFKI
.: . :.: .:..:. .. .:..: : ..: .:...::: ::. : . ..:.:..
NP_005 T-ELQSPEHPLDQHYRNLHCALRPLDHESYEFKVISQYLQSTHAPTHSDYTMTLLDLFEV
350 360 370 380 390 400
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 EREGECQRYKPFKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFAD
:..:: . .. ..:::: ::::::: .:..::::.::::::::::.:::::::::::::
NP_005 EKDGEKEAFR--EDLHNRMLLWHGSRMSNWVGILSHGLRIAPPEAPITGYMFGKGIYFAD
410 420 430 440 450 460
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 MVSKSANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELKHASHISK-LPKGKHSVKGLGKTTPDP
: ::::::: .:. ::.::.:::::. :: .:. .. : .::::.::::: .:.
NP_005 MSSKSANYCFASRLKNTGLLLLSEVALGQCNELLEANPKAEGLLQGKHSTKGLGKMAPSS
470 480 490 500 510 520
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 SANISLDGVDVPLGTGISSGV---NDTSLLYNEYIVYDIAQVNLKYLLKLKFNFKTSLW
. ..:.: :::: . ..:. . .: :::::::. :: ..::::..::: .::
NP_005 AHFVTLNGSTVPLGPASDTGILNPDGYTLNYNEYIVYNPNQVRMRYLLKVQFNF-LQLW
530 540 550 560 570 580
>>XP_016876401 (OMIM: 607725) PREDICTED: poly [ADP-ribos (487 aa)
initn: 932 init1: 364 opt: 1067 Z-score: 982.2 bits: 192.2 E(85289): 5.7e-48
Smith-Waterman score: 1067; 41.2% identity (72.0% similar) in 422 aa overlap (512-923:59-476)
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GAEVKAEPVEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMK-LTLKGGAAVDPDSGLE
:.. .:... .: : ::: : :::. .
XP_016 APEDSSPAKKTRRCQRQESKKMPVAGGKANKDRTEDKQDESVKALLLKGKAPVDPECTAK
30 40 50 60 70 80
550 560 570 580 590
pF1KE2 -HSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSN
.::: .:. :... :. ... ..:.:: .:::::: . . .. ::::: .:..
XP_016 VGKAHVYCEGNDVYDVMLNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGK-MGQH
90 100 110 120 130 140
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 KLEQMPSKED-AIEHFMKLYEEKTGNAWHSKN-FTKYPKKFYPLEIDYG---QDEEAVKK
.: .. . : : :.: . .:: : :.... : : : :. :..::. :::: .::
XP_016 SLVACSGNLNKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQDEEETKK
150 160 170 180 190 200
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 ---LTVNPGTKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGKLSKRQIQAAYS
: .:.: ::.:::.: .:..:.. :.:.. . .: :::::. ::.:.:.
XP_016 EESLKSPLKPESQLDLRVQELIKLICNVQAMEEMMMEMKYNTKKAPLGKLTVAQIKAGYQ
210 220 230 240 250 260
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 ILSEVQQAVSQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPPLLNNADSVQAKVEMLDNLLDI
:..... . :. ... :.::: ::::::.. :::. . .. :...:. : ::
XP_016 SLKKIEDCIRAGQHGRALMEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTQKELSEKIQLLEALGDI
270 280 290 300 310 320
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 EVAYSLLRGGSDDSSKDPIDVNYEKLKTDIKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDL
:.: .:.. .: . :.: .:..:. .. .:..: : ..: .:...::: ::. : .
XP_016 EIAIKLVKT-ELQSPEHPLDQHYRNLHCALRPLDHESYEFKVISQYLQSTHAPTHSDYTM
330 340 350 360 370 380
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 EVIDIFKIEREGECQRYKPFKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMF
..:.:..:..:: . .. ..:::: ::::::: .:..::::.::::::::::.:::::
XP_016 TLLDLFEVEKDGEKEAFR--EDLHNRMLLWHGSRMSNWVGILSHGLRIAPPEAPITGYMF
390 400 410 420 430 440
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 GKGIYFADMVSKSANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELKHASHISKLPKGKHSVKGL
::::::::: ::::::: .:. ::.::.:
XP_016 GKGIYFADMSSKSANYCFASRLKNTGLLLLSEEWEYSAIRTSK
450 460 470 480
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 GKTTPDPSANISLDGVDVPLGTGISSGVNDTSLLYNEYIVYDIAQVNLKYLLKLKFNFKT
>>XP_005267304 (OMIM: 607725) PREDICTED: poly [ADP-ribos (500 aa)
initn: 941 init1: 364 opt: 1065 Z-score: 980.2 bits: 191.9 E(85289): 7.4e-48
Smith-Waterman score: 1065; 41.8% identity (71.7% similar) in 414 aa overlap (519-923:80-489)
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PVEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLE-HSAHVLE
::. : ::: : :::. . .:::
XP_005 MPVAGGKANKDRTEDKQDGMPGRSWASKRVSESVKALLLKGKAPVDPECTAKVGKAHVYC
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pF1KE2 KGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSK
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XP_005 EGNDVYDVMLNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGK-MGQHSLVACSGN
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pF1KE2 ED-AIEHFMKLYEEKTGNAWHSKN-FTKYPKKFYPLEIDYG---QDEEAVKK---LTVNP
. : : :.: . .:: : :.... : : : :. :..::. :::: .:: :
XP_005 LNKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQDEEETKKEESLKSPL
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pF1KE2 GTKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGKLSKRQIQAAYSILSEVQQA
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XP_005 KPESQLDLRVQELIKLICNVQAMEEMMMEMKYNTKKAPLGKLTVAQIKAGYQSLKKIEDC
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pF1KE2 VSQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPPLLNNADSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLR
. :. ... :.::: ::::::.. :::. . .. :...:. : :::.: .:..
XP_005 IRAGQHGRALMEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTQKELSEKIQLLEALGDIEIAIKLVK
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pF1KE2 GGSDDSSKDPIDVNYEKLKTDIKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDLEVIDIFKI
.: . :.: .:..:. .. .:..: : ..: .:...::: ::. : . ..:.:..
XP_005 T-ELQSPEHPLDQHYRNLHCALRPLDHESYEFKVISQYLQSTHAPTHSDYTMTLLDLFEV
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pF1KE2 EREGECQRYKPFKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFAD
:..:: . .. ..:::: ::::::: .:..::::.::::::::::.:::::::::::::
XP_005 EKDGEKEAFR--EDLHNRMLLWHGSRMSNWVGILSHGLRIAPPEAPITGYMFGKGIYFAD
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: ::::::: .:. ::.::.:
XP_005 MSSKSANYCFASRLKNTGLLLLSEEWEYSAIRTSK
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Smith-Waterman score: 867; 33.7% identity (64.8% similar) in 563 aa overlap (472-1007:4-540)
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:::: ..: : .: :.. .:. :.:
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pF1KE2 AALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMKL--TLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGGKVFSATLG
.. :. .:. . .. . .: . : ::: : :.. . . .. ::.
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..: ...:..: .:::.:. ::.. . ::::: : :..:.... ::: . : :
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..::: : : .. :...: :. .:.. ..:: ::: :. .: : .: .:
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pF1KE2 GECQRYKPFKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFADMVS
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:::.: . .: ..::::::: .... . ... : : :: . :.: :::.
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initn: 576 init1: 159 opt: 712 Z-score: 657.1 bits: 132.2 E(85289): 7.3e-30
Smith-Waterman score: 864; 33.7% identity (65.2% similar) in 549 aa overlap (486-1007:4-533)
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pF1KE2 EDFLQDVSASTKSLQELFLAHILSPWGAEVKAEP-VEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEE
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pF1KE2 PHDFGMKKPPLLNNADSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLRGGSDDSSKD----PIDVNYEK
::.:: ..:: .:. . .::: .:: : :::.: .: . .... . :.: .:.
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:: .....: . : ..:. :...: ...: :. :.:...::: .:.. ..: :
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pF1KE2 RRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFADMVSKSANYC--HTSQGD
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Smith-Waterman score: 864; 33.7% identity (65.2% similar) in 549 aa overlap (486-1007:4-533)
460 470 480 490 500 510
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:: .....: . : ..:. :...: ...: :. :.:...::: .:.. ..: :
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.: ..::::::: .... . ... : : :: . :.: :::. . . ::: : :
XP_016 HVGYMFLGEVALGREHHINTDNPSLKSPPPGFDSVIARGHTEPDPTQDTELELDGQQVVV
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XP_016 PQGQPVPCPEFSSSTFSQSEYLIYQESQCRLRYLLEVHL
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>>XP_005264836 (OMIM: 607726) PREDICTED: poly [ADP-ribos (533 aa)
initn: 576 init1: 159 opt: 712 Z-score: 657.1 bits: 132.2 E(85289): 7.3e-30
Smith-Waterman score: 864; 33.7% identity (65.2% similar) in 549 aa overlap (486-1007:4-533)
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pF1KE2 EDFLQDVSASTKSLQELFLAHILSPWGAEVKAEP-VEVVAPRGKSGAALSKKSKGQVKEE
: .: :.. .:. :.: .. :. .:.
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::.:: ..:: .:. . .::: .:: : :::.: .: . .... . :.: .:.
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:: .....: . : ..:. :...: ...: :. :.:...::: .:.. ..: :
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XP_005 HVGYMFLGEVALGREHHINTDNPSLKSPPPGFDSVIARGHTEPDPTQDTELELDGQQVVV
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XP_005 PQGQPVPCPEFSSSTFSQSEYLIYQESQCRLRYLLEVHL
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pF1KE2 TASAPAAVNSSASADKPLSNMKILTLGKLSRNKDEVKAMIEKLGGKLTGTANKASLCIST
..: .... :.. :::.. . : :
NP_006 MVMGIFANCIFCLKVKYLPQQQKKKLQTDIKENGGKFSFSLNPQCTHIIL
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pF1KE2 KKEVEKMNKKMEEVKEANIRVVSEDFLQDVSASTKSLQELFLAHI--LSPWGAEVKAEPV
. . ... ... ...... ::. ::..: : . .:. .:.
NP_006 DNADVLSQYQLNSIQKNHVHIANPDFIW------KSIREKRLLDVKNYDPY------KPL
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... : ..... :..: . .. .. : ..:: : :. . : . .: .
NP_006 DITPPPDQKASSSEVKTEG-LCPDSATEEEDTVELTEFGMQNVE----IPHLPQDFEVAK
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:: : . : .. .:: .:... . : . . .. ..::
NP_006 Y---NTLEKVGMEGGQEAVVVELQCSRDSRDCPFLISSHFLLDDGMETRRQFAIKKTSED
160 170 180 190 200 210
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pF1KE2 AIEHFMKLYEEKTGNAWHSKNFTKYPKKFYPLEIDYGQDEEAVKKLTVNPGTKSKLPKPV
: :.: . :: ....: ..: : : .:. : . ..: : . :
NP_006 ASEYFENYIEE-----LKKQGFLLR-EHFTP-EATQLASEQLQALLLEEVMNSSTLSQEV
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