Result of FASTA (omim) for pF1KE2505
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2505, 1040 aa
  1>>>pF1KE2505 1040 - 1040 aa - 1040 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7234+/-0.000509; mu= -0.5088+/- 0.031
 mean_var=311.7376+/-64.452, 0's: 0 Z-trim(116.6): 656  B-trim: 33 in 1/57
 Lambda= 0.072641
 statistics sampled from 27160 (27946) to 27160 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.328), width:  16
 Scan time: 13.130

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001333012 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 pre (1040) 6991 748.1 5.8e-215
NP_005067 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 precur (1040) 6991 748.1 5.8e-215
XP_016857687 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: cont (1187) 6772 725.2 5.2e-208
XP_016857688 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: cont (1182) 6633 710.6 1.2e-203
XP_016874311 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101
XP_016874312 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101
XP_016874310 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101
XP_016874313 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101
XP_005268708 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100
XP_011536229 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100
NP_001834 (OMIM: 600016,612540) contactin-1 isofor (1018) 3362 367.8 1.7e-100
XP_006719304 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100
XP_011536228 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100
NP_778203 (OMIM: 600016,612540) contactin-1 isofor (1007) 3356 367.2 2.7e-100
XP_016861996 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 3084 338.7   1e-91
XP_011532070 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 3084 338.7   1e-91
NP_065923 (OMIM: 601325) contactin-3 precursor [Ho (1028) 3084 338.7   1e-91
XP_005264814 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 3084 338.7   1e-91
NP_780775 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 2 pre (1026) 3057 335.8 7.3e-91
XP_011541173 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 (1026) 3057 335.8 7.3e-91
NP_055176 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 1 pre (1100) 3054 335.5 9.6e-91
XP_016873415 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 (1100) 3054 335.5 9.6e-91
NP_001230199 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 1  (1100) 3054 335.5 9.6e-91
XP_011531733 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1015) 3050 335.1 1.2e-90
XP_011531727 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_011531731 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_011531730 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_016861273 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_016861271 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_016861272 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
NP_783200 (OMIM: 607280) contactin-4 isoform a pre (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_011531729 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
NP_001193884 (OMIM: 607280) contactin-4 isoform a  (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_011531732 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_011531728 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90
XP_016861275 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90
XP_006713067 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90
XP_016861274 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90
XP_016861276 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90
XP_016861997 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 ( 970) 2979 327.6   2e-88
NP_055276 (OMIM: 607220) contactin-6 isoform 1 pre (1028) 2912 320.6 2.8e-86
XP_016861661 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86
XP_005265115 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86
XP_016861660 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86
NP_001276009 (OMIM: 607220) contactin-6 isoform 1  (1028) 2912 320.6 2.8e-86
XP_011531892 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86
NP_001276010 (OMIM: 607220) contactin-6 isoform 2  ( 956) 2762 304.9 1.4e-81
XP_011531893 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 ( 956) 2762 304.9 1.4e-81
XP_016861663 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 ( 956) 2762 304.9 1.4e-81
NP_001230200 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 3  ( 911) 2653 293.4 3.8e-78


>>NP_001333012 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 precurs  (1040 aa)
 initn: 6991 init1: 6991 opt: 6991  Z-score: 3980.3  bits: 748.1 E(85289): 5.8e-215
Smith-Waterman score: 6991; 99.8% identity (99.9% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRNGEPLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040
pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
       ::::::::::::::::::::
NP_001 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
             1030      1040

>>NP_005067 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 precursor   (1040 aa)
 initn: 6991 init1: 6991 opt: 6991  Z-score: 3980.3  bits: 748.1 E(85289): 5.8e-215
Smith-Waterman score: 6991; 99.8% identity (99.9% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
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pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
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pF1KE2 LRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LRNGEPLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
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pF1KE2 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
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pF1KE2 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
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pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
       ::::::::::::::::::::
NP_005 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
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>>XP_016857687 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: contacti  (1187 aa)
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
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       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 LRNGEPLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
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pF1KE2 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
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pF1KE2 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
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pF1KE2 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..             
XP_016 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGAAPPLPLSPREIQDP
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pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL                                        
                                                                   
XP_016 PRYLRGSFPPRPTPISTRKGKWKAGRNQVQSSLRTASPPPFYPAPRTSPRAREGRRVQGE
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>>XP_016857688 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: contacti  (1182 aa)
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Smith-Waterman score: 6633; 99.5% identity (99.9% similar) in 984 aa overlap (24-1007:19-1002)

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                              .::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016      MFVAGDVSCTSHPTDQFFSWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
                    10        20        30        40        50     

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
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       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..             
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pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL                                        
                                                                   
XP_016 PRYLRGSFPPRPTPISTRKGKWKAGRNQVQSSLRTASPPPFYPAPRTSPRAREGRRVQGE
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>>XP_016874311 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: contacti  (1015 aa)
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pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTT-----FGPVFEDQPLSVLFPEESTEE
                ::.... .. ..  .:    :  ..     :::.::.::.....:::: : 
XP_016  MKMWLLVSHLVIISITTCLAEFTWYRRYGHGVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEG
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pF1KE2 QVLLACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASN
       .: : :::::::  .:.:.::. .. :  ..:...::::::: :: : .:::.: :::::
XP_016 KVSLNCRARASPFPVYKWRMNNGDVDLT-SDRYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASN
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pF1KE2 PVGTVVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPG-LSYRWLLNEFP
         : : : :: : ::.:. :  :::  :...:: :..: :.:: :.:  :::::::::::
XP_016 NYGMVRSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFP
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pF1KE2 NFIPTDGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQL-NLAAED
        ::  : :.:::::.:::::: ..::: :::::...:     ::::::::  :  .  . 
XP_016 VFITMDKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSS--PSITKSVFSKFIPLIPIPERT
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pF1KE2 TRLFAPSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT---
       :. .  .: ..:  ..:::.::.:::::::.::::: :.::::   : :. .::: .   
XP_016 TKPYPADIVVQFK-DVYALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKV---LEPMPSTAEISTSG
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pF1KE2 --LQIPSVSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGC
         :.: ....:::: ::::::: .:.:  :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :
XP_016 AVLKIFNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPC
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KE2 AAAGKPRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASA
       .:.::: ::.:::.::   : ..      :.::.  ...:..:::::.::: .:.:::.:
XP_016 VATGKPIPTIRWLKNG--YAYHK------GELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANA
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pF1KE2 ELAVQALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVT
       :: . :::: :..::... : ::.::...: :.:.::::    :::::: ::::::. . 
XP_016 ELKILALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIW
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pF1KE2 PDGTLIIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTL
        ::.: : ::.:.: : :::::::  ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.
XP_016 EDGSLEINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATM
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pF1KE2 QCHASHDPTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCM
       :: :: ::..::::.:... . :::.: . ::.:. . .. :.: : ::::.:.:.::: 
XP_016 QCAASFDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCT
          530       540       550       560       570       580    

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pF1KE2 AQTVVDSASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTP
       :::.::..:  : ..::::::::::. ..::  :.. :.:::: ::::::.:::.:..: 
XP_016 AQTIVDNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTI
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pF1KE2 PAGKWKQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREA
        .  ::...:.:  :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.:  :
XP_016 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
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pF1KE2 APSVAPSGLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADA
       ::.:::: ..::::   :: ..:.:.::::. :..:::...:.   . .:. . : . :.
XP_016 APNVAPSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDT
          710       720       730       740       750       760    

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pF1KE2 QYFVYSNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSE
         .:...:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. :  :::.: .: .::::
XP_016 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
          770       780       790       800       810       820    

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pF1KE2 MNVTWEPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTV
       ..: :: :   .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . :
XP_016 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
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pF1KE2 RAYNRAGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYK
        : : :: :: :   .: : : :: .::  :: . :.:   : :: :: . :::.:::::
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pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
       .::. : .    :. : :. ::.:.:.: :. .:..:. . ::::. ..:.: .. .::.
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XP_016 RSKTAKDHRSIRTMS                 
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         :.: ....:::: ::::::: .:.:  :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :
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        ::.: : ::.:.: : :::::::  ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.
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        .  ::...:.:  :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.:  :
XP_016 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
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pF1KE2 QYFVYSNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSE
         .:...:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. :  :::.: .: .::::
XP_016 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
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XP_016 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
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pF1KE2 RAYNRAGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYK
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pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
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XP_016 VLYRPDGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISEGKSTSL
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XP_016 RSKTAKDHRSIRTMS                 
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XP_016 VFITMDKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSS--PSITKSVFSKFIPLIPIPERT
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XP_016 AVLKIFNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPC
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XP_016 VATGKPIPTIRWLKNG--YAYHK------GELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANA
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pF1KE2 ELAVQALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVT
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XP_016 ELKILALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIW
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pF1KE2 PDGTLIIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTL
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XP_016 EDGSLEINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATM
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XP_016 QCAASFDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCT
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XP_016 AQTIVDNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTI
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pF1KE2 PAGKWKQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREA
        .  ::...:.:  :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.:  :
XP_016 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
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pF1KE2 APSVAPSGLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADA
       ::.:::: ..::::   :: ..:.:.::::. :..:::...:.   . .:. . : . :.
XP_016 APNVAPSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDT
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pF1KE2 QYFVYSNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSE
         .:...:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. :  :::.: .: .::::
XP_016 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
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pF1KE2 MNVTWEPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTV
       ..: :: :   .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . :
XP_016 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
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pF1KE2 RAYNRAGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYK
        : : :: :: :   .: : : :: .::  :: . :.:   : :: :: . :::.:::::
XP_016 GACNSAGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYK
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pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
       .::. : .    :. : :. ::.:.:.: :. .:..:. . ::::. ..:.: .. .::.
XP_016 VLYRPDGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISEGKSTSL
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pF1KE2 MVENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
                                       
XP_016 RSKTAKDHRSIRTMS                 
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                ::.... .. ..  .:    :  ..     :::.::.::.....:::: : 
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       .: : :::::::  .:.:.::. .. :  ..:...::::::: :: : .:::.: :::::
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pF1KE2 TRLFAPSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT---
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pF1KE2 --LQIPSVSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGC
         :.: ....:::: ::::::: .:.:  :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :
XP_016 AVLKIFNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPC
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pF1KE2 AAAGKPRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASA
       .:.::: ::.:::.::   : ..      :.::.  ...:..:::::.::: .:.:::.:
XP_016 VATGKPIPTIRWLKNG--YAYHK------GELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANA
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pF1KE2 ELAVQALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVT
       :: . :::: :..::... : ::.::...: :.:.::::    :::::: ::::::. . 
XP_016 ELKILALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIW
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pF1KE2 PDGTLIIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTL
        ::.: : ::.:.: : :::::::  ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.
XP_016 EDGSLEINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATM
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pF1KE2 QCHASHDPTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCM
       :: :: ::..::::.:... . :::.: . ::.:. . .. :.: : ::::.:.:.::: 
XP_016 QCAASFDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCT
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       :::.::..:  : ..::::::::::. ..::  :.. :.:::: ::::::.:::.:..: 
XP_016 AQTIVDNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTI
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pF1KE2 PAGKWKQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREA
        .  ::...:.:  :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.:  :
XP_016 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
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       ::.:::: ..::::   :: ..:.:.::::. :..:::...:.   . .:. . : . :.
XP_016 APNVAPSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDT
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pF1KE2 QYFVYSNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSE
         .:...:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. :  :::.: .: .::::
XP_016 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
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pF1KE2 MNVTWEPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTV
       ..: :: :   .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . :
XP_016 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
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pF1KE2 RAYNRAGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYK
        : : :: :: :   .: : : :: .::  :: . :.:   : :: :: . :::.:::::
XP_016 GACNSAGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYK
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pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
       .::. : .    :. : :. ::.:.:.: :. .:..:. . ::::. ..:.: .. .::.
XP_016 VLYRPDGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISEGKSTSL
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pF1KE2 MVENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
                                       
XP_016 RSKTAKDHRSIRTMS                 
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>>XP_005268708 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: contacti  (1018 aa)
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pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTT-----FGPVFEDQPLSVLFPEESTEE
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pF1KE2 QVLLACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASN
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XP_005 KVSLNCRARASPFPVYKWRMNNGDVDLT-SDRYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASN
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pF1KE2 PVGTVVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPG-LSYRWLLNEFP
         : : : :: : ::.:. :  :::  :...:: :..: :.:: :.:  :::::::::::
XP_005 NYGMVRSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFP
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pF1KE2 NFIPTDGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQL-NLAAED
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XP_005 VFITMDKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSSPS--ITKSVFSKFIPLIPIPERT
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pF1KE2 TRLFAPSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT---
       :. .  .: ..:  ..:::.::.:::::::.::::: :.::::   : :. .::: .   
XP_005 TKPYPADIVVQFK-DVYALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKV---LEPMPSTAEISTSG
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pF1KE2 --LQIPSVSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGC
         :.: ....:::: ::::::: .:.:  :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :
XP_005 AVLKIFNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPC
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pF1KE2 AAAGKPRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASA
       .:.::: ::.:::.::             :.::.  ...:..:::::.::: .:.:::.:
XP_005 VATGKPIPTIRWLKNG--------YAYHKGELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANA
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       :: . :::: :..::... : ::.::...: :.:.::::    :::::: ::::::. . 
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        ::.: : ::.:.: : :::::::  ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.
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       :: :: ::..::::.:... . :::.: . ::.:. . .. :.: : ::::.:.:.::: 
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       :::.::..:  : ..::::::::::. ..::  :.. :.:::: ::::::.:::.:..: 
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pF1KE2 QYFVYSNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSE
         .:...:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. :  :::.: .: .::::
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pF1KE2 MNVTWEPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTV
       ..: :: :   .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . :
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pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
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XP_005 SLLGLLLPAFGILVYLEF              
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>>XP_011536229 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: contacti  (1018 aa)
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pF1KE2 TRLFAPSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT---
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pF1KE2 PAGKWKQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREA
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XP_011 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
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XP_011 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
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XP_011 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
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pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
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1040 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 19:22:52 2016 done: Thu Nov  3 19:22:54 2016
 Total Scan time: 13.130 Total Display time:  0.430

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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