FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2505, 1040 aa 1>>>pF1KE2505 1040 - 1040 aa - 1040 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7234+/-0.000509; mu= -0.5088+/- 0.031 mean_var=311.7376+/-64.452, 0's: 0 Z-trim(116.6): 656 B-trim: 33 in 1/57 Lambda= 0.072641 statistics sampled from 27160 (27946) to 27160 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16 Scan time: 13.130 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001333012 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 pre (1040) 6991 748.1 5.8e-215 NP_005067 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 precur (1040) 6991 748.1 5.8e-215 XP_016857687 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: cont (1187) 6772 725.2 5.2e-208 XP_016857688 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: cont (1182) 6633 710.6 1.2e-203 XP_016874311 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101 XP_016874312 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101 XP_016874310 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101 XP_016874313 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1015) 3371 368.7 9.1e-101 XP_005268708 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100 XP_011536229 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100 NP_001834 (OMIM: 600016,612540) contactin-1 isofor (1018) 3362 367.8 1.7e-100 XP_006719304 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100 XP_011536228 (OMIM: 600016,612540) PREDICTED: cont (1018) 3362 367.8 1.7e-100 NP_778203 (OMIM: 600016,612540) contactin-1 isofor (1007) 3356 367.2 2.7e-100 XP_016861996 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 3084 338.7 1e-91 XP_011532070 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 3084 338.7 1e-91 NP_065923 (OMIM: 601325) contactin-3 precursor [Ho (1028) 3084 338.7 1e-91 XP_005264814 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 3084 338.7 1e-91 NP_780775 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 2 pre (1026) 3057 335.8 7.3e-91 XP_011541173 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 (1026) 3057 335.8 7.3e-91 NP_055176 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 1 pre (1100) 3054 335.5 9.6e-91 XP_016873415 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 (1100) 3054 335.5 9.6e-91 NP_001230199 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 1 (1100) 3054 335.5 9.6e-91 XP_011531733 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1015) 3050 335.1 1.2e-90 XP_011531727 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_011531731 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_011531730 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_016861273 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_016861271 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_016861272 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 NP_783200 (OMIM: 607280) contactin-4 isoform a pre (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_011531729 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 NP_001193884 (OMIM: 607280) contactin-4 isoform a (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_011531732 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_011531728 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 3050 335.1 1.2e-90 XP_016861275 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90 XP_006713067 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90 XP_016861274 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90 XP_016861276 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 3038 333.8 2.9e-90 XP_016861997 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 ( 970) 2979 327.6 2e-88 NP_055276 (OMIM: 607220) contactin-6 isoform 1 pre (1028) 2912 320.6 2.8e-86 XP_016861661 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86 XP_005265115 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86 XP_016861660 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86 NP_001276009 (OMIM: 607220) contactin-6 isoform 1 (1028) 2912 320.6 2.8e-86 XP_011531892 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 (1028) 2912 320.6 2.8e-86 NP_001276010 (OMIM: 607220) contactin-6 isoform 2 ( 956) 2762 304.9 1.4e-81 XP_011531893 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 ( 956) 2762 304.9 1.4e-81 XP_016861663 (OMIM: 607220) PREDICTED: contactin-6 ( 956) 2762 304.9 1.4e-81 NP_001230200 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 3 ( 911) 2653 293.4 3.8e-78 >>NP_001333012 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 precurs (1040 aa) initn: 6991 init1: 6991 opt: 6991 Z-score: 3980.3 bits: 748.1 E(85289): 5.8e-215 Smith-Waterman score: 6991; 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