FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2510, 1126 aa 1>>>pF1KE2510 1126 - 1126 aa - 1126 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6468+/-0.00111; mu= -8.7195+/- 0.066 mean_var=536.2202+/-111.862, 0's: 0 Z-trim(116.5): 147 B-trim: 185 in 1/52 Lambda= 0.055386 statistics sampled from 17201 (17345) to 17201 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.519), width: 16 Scan time: 2.970 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19 (1126) 7921 648.6 2.4e-185 CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19 (1123) 3601 303.4 2e-81 CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11 (2087) 1301 119.9 6.5e-26 CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11 (1738) 1235 114.5 2.2e-24 CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs109|chr3 (1444) 1059 100.4 3.3e-20 CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1 ( 890) 1031 97.9 1.1e-19 CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1 (1101) 1031 98.0 1.3e-19 >>CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19 (1126 aa) initn: 7921 init1: 7921 opt: 7921 Z-score: 3441.2 bits: 648.6 E(33420): 2.4e-185 Smith-Waterman score: 7921; 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CCDS44 KHVKKLPFTKGHFPKMAECAHFHYENVEFGSIQLSLSEEQNEVMKNGCESKELVYLVQIA 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 CQGRSWPVLRSYDDFRSLDAHLHRCIFDRRFSCLPELPPPPEGARAAQMLVPLLLQYLET :::.:: : :::.::: :: ::: ::.::::: : ::: . . .. .:. :: CCDS44 CQGKSWIVKRSYEDFRVLDKHLHLCIYDRRFSQLSELPRSDTLKDSPESVTQMLMAYLSR 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 LSGLVDSNLNCGPVLTWMELDNHGRRLLLSEEASLNIPAVAAAHVIKRYTAQAPDELSFE ::... ...::::.:::::.::.: .::. ::.:.: :::.::::::::::.:::::..: CCDS44 LSAIAGNKINCGPALTWMEIDNKGNHLLVHEESSINTPAVGAAHVIKRYTARAPDELTLE 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 VGDIVSVIDMPPTEDRSWWRGKRGFQVGFFPSECVELFTERPGPGLKADADGPPCGIPAP :::::::::::: .:::::.:::::.::..::::.... .: CCDS44 VGDIVSVIDMPPKVLSTWWRGKHGFQVGLFPGHCVELINQK-----------------VP 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 QGISSLTSAVPRP----RGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNS : :.:..::.: .::: .:::::.:::..:.:.:::::..::::::::::: :: CCDS44 Q---SVTNSVPKPVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNS 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 GQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHS : .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:. ..::::: CCDS44 GFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHS 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 VSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLL :.:::::::::::::::::::: :::.:.:. .::::...::::::::::::::::.:. CCDS44 VGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLM 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 RHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFLLT :::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::.:. CCDS44 RHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILN 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 HVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--TEP ::::::: .. : . : : ::::: : :::.::::::::::::.....: :: CCDS44 HVDVLFSGRISMAMQE--GAASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTEN 570 580 590 600 610 570 580 590 600 pF1KE2 T---TPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRKKP . ..::. : ::.. . : ..: :: :..:: ::.. :: ..: CCDS44 KYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMK-KSPVGS-WRSFFNLGKSSSVSKRK- 620 630 640 650 660 670 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 LPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASATPT : ... :. .:.: . :::::::::::.: : .. : : CCDS44 ---LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTS------LHAVDGDSKLFRPR 680 690 700 710 720 670 680 690 700 710 pF1KE2 PALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP-------LP : . .: . .: : . : .. :. .:. . : . :: : CCDS44 RPRSSSDALSASFNGEML-GNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI-PALMSPHSAEDVDLS 730 740 750 760 770 780 720 730 740 750 pF1KE2 PPPLSL----LRPGGAPPPPPKNPARLMALALA-------ERAQQVAEQQ------SQQE :: ... . : . ::: .. . . . . . :... :: . CCDS44 PPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQ 790 800 810 820 830 840 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 CGGTPPASQ--SPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW----VPGPPPYLPRQ :. .:. ::....:: :. : .: .. ..:... : . : . :. CCDS44 TPGSTASSEPVSPLQEKLS------PFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRK 850 860 870 880 890 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 QSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSAQLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFF : . . ..:.... CCDS44 LSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVK 900 910 920 930 940 950 >>CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11 (1738 aa) initn: 1422 init1: 1117 opt: 1235 Z-score: 551.5 bits: 114.5 E(33420): 2.2e-24 Smith-Waterman score: 1330; 43.2% identity (66.3% similar) in 588 aa overlap (293-828:1-565) 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS :.:::..:.:.:::::..::::::::::: CCDS31 MKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL 10 20 30 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI ::: .:::::. :. ::: .:.::::::::::.:::::::::::::..:.:. ..::: CCDS31 NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI 40 50 60 70 80 90 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY :::.:::::::::::::::::::: :::.:.:. .::::...::::::::::::::::. CCDS31 HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF 100 110 120 130 140 150 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL :.:::. .: . . :.:::.::::::::::::: ..::. ..:.::: :::.:::::::. CCDS31 LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP--T :.::::::: .. : . :. : ::::: : :::.::::::::::::.....: : CCDS31 LNHVDVLFSGRISMAMQEGAAS--LSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVT 220 230 240 250 260 570 580 590 600 pF1KE2 EPT---TPKAPAS-----------PAERRKGERGEKQRKPGGSSWKTFFALGRGPSVPRK : . ..::. : ::.. . .:..: .::..:: ::.. :: .. CCDS31 ENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQ--NKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKR 270 280 290 300 310 320 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 KPLPWLGGTRAPPQP------SGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASAT : : ... :. .:.: . :::::::::::.: : .. : CCDS31 K----LQRNESEPSEMKAMALKGGRAEG-TLRSAKSEESLTS------LHAVDGDSKLFR 330 340 350 360 370 670 680 690 700 710 pF1KE2 PTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP------- : : . .: . .: : . : .. :. .:. . : . :: CCDS31 PRRPRSSSDALSASFNGEML-GNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHI-PALMSPHSAEDVD 380 390 400 410 420 430 720 730 740 750 pF1KE2 LPPPPLSL----LRPGGAPPPPPKNPARLMALALA-------ERAQQVAEQQ------SQ : :: ... . : . ::: .. . . . . . :... :: CCDS31 LSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQ 440 450 460 470 480 490 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 QECGGTPPASQ--SPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW----VPGPPPYLP . :. .:. ::....:: :. : .: .. ..:... : . : . CCDS31 CQTPGSTASSEPVSPLQEKLS------PFFTLDLSPTEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIG 500 510 520 530 540 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 RQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVSAQLRAGGGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPG :. : . . ..:.... CCDS31 RKLSKSPSMSISEPISVTLPPRVSEVIGTVSNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQI 550 560 570 580 590 600 >>CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs109|chr3 (1444 aa) initn: 1021 init1: 923 opt: 1059 Z-score: 476.5 bits: 100.4 E(33420): 3.3e-20 Smith-Waterman score: 1114; 33.3% identity (54.1% similar) in 907 aa overlap (293-1108:1-864) 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS :... ..:.:...: .::::: :.: CCDS43 MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLE 10 20 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI .:::::: ::. :.::::.::.::::::::::.:::::::.:: :.. :.:. ..:::: CCDS43 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI 30 40 50 60 70 80 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY : :.:::::::::::::::::.:: ::.::.: :: .:.:...:::.::: ::::::: CCDS43 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY 90 100 110 120 130 140 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL :.::::..: :..:.:::::::.::::::::: :.:..: .: ::: ::::.::.::. CCDS43 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI 150 160 170 180 190 200 510 520 530 540 550 pF1KE2 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSL---AGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTP :.::: .:.. .. . .: : ::: : : : .:..:::::::. . . : CCDS43 LNHVDQIFNNGAPGSLENDENR---PIMKSLTLPALSLP-MKLVSLEEAQARSLAT-NHP 210 220 230 240 250 260 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 T-----EPTTPKA--PASPAERRKGERGEKQRKPGGSS--WKTFFALGRGPSVPRKKPLP . : . :. : . . : ...:: ...: ::..: :::. : ..: : CCDS43 ARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSK-LS 270 280 290 300 310 320 620 630 640 650 660 pF1KE2 WLGGTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSS-QASGAELLG-------AGGAPASATPT :.. . : . . .:.: ::: .:: : . : : : .:: :: CCDS43 RNGSVFVRGQRLSV--EKATIRPAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKM 330 340 350 360 370 380 670 680 690 700 pF1KE2 PALSPGRS--LRPHLIPL----LLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPD------- . . : : : . . :::. . :. ... :.:.:::. :. CCDS43 HSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGF-DVSSDR--SHLQGAQARPPPEQLKVFRP 390 400 410 420 430 710 720 730 740 pF1KE2 MESP----LPPPPLSLLRPGGAPP-------------PPPKNPARLM------ALALAER .:.: : :... .. : : :.: . . :... : CCDS43 VEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSVFTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPLR 440 450 460 470 480 490 750 760 770 780 790 pF1KE2 AQQVAEQQSQQECGGTPPASQS-------PFHRSLSLEVGG-----EPLG--TSGSGPPP .. : .: : : :: :: : : :: .::: ::... : CCDS43 VSAVISTNSTP-CRTPPKELQSLSSLEEFSFHGS---ESGGWPEEEKPLGAETSAASVPK 500 510 520 530 540 550 800 810 820 830 840 pF1KE2 NSLAHPGAWVPGPPPYLP-----RQQSDGSLLRSQRPMGT-SRRGLRGPAQVSAQLRAGG .. . . :: : . :. . : ... : .. : . : . .. CCDS43 KAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVE 560 570 580 590 600 610 850 860 870 880 890 pF1KE2 GGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPK-----------PGLYPLG ::.: : ... : .. .. : : :. : : CCDS43 EGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLP 620 630 640 650 660 670 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 PPSFQPSSPAPVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRLN ::... : :. .::::: : . .: : : .: : : . :. : CCDS43 PPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSL--PCG-SFPAPVSTPLEVWT--------RDP 680 690 700 710 720 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 ASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQH--PARRPTPPEPLYVNLAL :. . : : : : . . :: :. :: . : .. .: . :. CCDS43 ANQSTQGASTAASREK------PEPEQGLHPD-LASLAPLEIVPFEKASPQATVEVG--- 730 740 750 760 770 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 GPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPG--PWGPPEPL :: . :: . ::. : .: : :... . :: . :: CCDS43 GPGNLSPPLPPAPPPPT-PLEESTPVLLSKGGPEREDSSRKLRTDLYIDQLKSQDSPEIS 780 790 800 810 820 830 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 LLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQTRSYC : .. : : .. . . .:....:.: : : : CCDS43 SLCQGEE-ATPRHSDKQNS---KNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSD 840 850 860 870 880 CCDS43 CDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHRP 890 900 910 920 930 940 >>CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1 (890 aa) initn: 1137 init1: 996 opt: 1031 Z-score: 467.0 bits: 97.9 E(33420): 1.1e-19 Smith-Waterman score: 1128; 35.0% identity (56.4% similar) in 839 aa overlap (298-1097:3-782) 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 PQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNSGQD :::. ...: ..::::::: :::..:::. 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CCDS12 QLFGGAALSGGEVESGWRSLPGTRA-SGS-P-------EDLMPRP-----LPYHLPSILQ 220 230 240 250 570 580 590 600 610 pF1KE2 APASPAERRKG----ERGEKQRKPGGS----SWKTFFALGRGPSVPRKKPLPWLGGTRAP : .: . : : .:..:: :: .:...: :::. ..: :: . : CCDS12 AGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRK--GSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRK-LPRGAEDRED 260 270 280 290 300 310 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 PQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAELLGAGGAPASATPTPALSPGRSLRPHLIPL . .: ::: ::: .:::. :.:: : : ..:. : :: :: CCDS12 KSNKG------TLRPAKSMDSLSA-AAGA----------SDEPEGLVGPS-SPRPS--PL 320 330 340 350 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 LLRGAEAPLTDACQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESPLPPPPLSLLRPGGAPPPPPKNPARL : .. : .: . :. . :.. : . : : : .: ::. . : CCDS12 LPESLENDSIEAAEGEQEPE---AEALGGTNSEPGTPRAGRSAIRAGGS-----SRAERC 360 370 380 390 400 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 MALALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPASQSPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHP .. ... .: ..:: : . ::. . : . : : : : CCDS12 AGVHISD-PYNVNLPLHITSILSVPPNIIS--NVSLARLTRGLECPALQHRPSPASGPGP 410 420 430 440 450 460 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 GAWV-PGPPPYLPRQQSDGSLLRSQRPMGTS---RRGLRGPAQVSAQLRAGGGGRDAPEA : . :::: . . .: : .. : . . .: .: : .. ... . :: CCDS12 GPGLGPGPPDEKLEASPASSPLADSGPDDLAPALEDSLSQEVQDSFSFLEDSSSSE-PEW 470 480 490 500 510 520 860 870 880 890 900 pF1KE2 AAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRE----CLPPFLGV-PKPGLYPLGPP----SFQPS--- .. : . . . :::. . : .::: :. . . :: :.. . CCDS12 VGAEDGEVAQAEAAGAAFSPGEDDPGMGYLEELLGVGPQVEEFSVEPPLDDLSLDEAQFV 530 540 550 560 570 580 910 920 930 940 950 pF1KE2 -SPAPVWRSSLGPPAPLDR--GENLYYEIGASEGSPYSGPTRS-WSPFRSMPPDRLNASY .:. .: :: ... ::... . .. :: :: :. :. . . . 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