FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2523, 1251 aa 1>>>pF1KE2523 1251 - 1251 aa - 1251 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6919+/-0.000565; mu= 15.3594+/- 0.035 mean_var=96.5962+/-19.563, 0's: 0 Z-trim(107.8): 196 B-trim: 336 in 1/53 Lambda= 0.130495 statistics sampled from 15650 (15855) to 15650 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.502), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16 Scan time: 10.180 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005594 (OMIM: 147480,211600,243300,602397) phos (1251) 8283 1571.4 0 XP_011524324 (OMIM: 147480,211600,243300,602397) P (1251) 8278 1570.4 0 XP_006722544 (OMIM: 147480,211600,243300,602397) P (1251) 8278 1570.4 0 XP_011524325 (OMIM: 147480,211600,243300,602397) P (1213) 7397 1404.5 0 XP_011526009 (OMIM: 605866) PREDICTED: phospholipi (1301) 3687 706.1 3.8e-202 NP_620168 (OMIM: 605866) 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(OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1654 323.3 5.4e-87 XP_011520364 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1654 323.3 5.4e-87 XP_011520365 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1654 323.3 5.4e-87 XP_011520361 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1105) 1654 323.3 5.5e-87 XP_011520360 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1111) 1654 323.3 5.5e-87 XP_016878083 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1111) 1654 323.3 5.5e-87 NP_079113 (OMIM: 609123) probable phospholipid-tra (1192) 1654 323.3 5.9e-87 XP_016878081 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1192) 1654 323.3 5.9e-87 XP_011520354 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1654 323.3 6e-87 XP_016878080 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1654 323.3 6e-87 XP_011520355 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1654 323.3 6e-87 XP_011520351 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1654 323.3 6e-87 XP_011520353 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1654 323.3 6e-87 XP_011520349 (OMIM: 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KTNVIRTAKYNFYSFLPLNLYEQFHRVSNLFFLIIIILQSIPDISTLPWFSLSTPMVCLL 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 GVTAIKDLVDDVARHKMDKEINNRTCEVIKDGRFKVAKWKEIQVGDVIRLKKNDFVPADI . : .:::::..::: :. :::: :... :: ::... ::::. :.:...::::. 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XP_011 LDLLMNKLVVVIFISVVLVCLVLAFGFGFSVKEFKDHHYYLSGVHGSSVAAESFFVFWSF 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 IIVLNTMVPISLYVSVEVIRLGQSHFINWDLQMYYAEKDTPAKARTTTLNEQLGQIHYIF .:.:.. .:.:... : : ::.: ::.::.:::: .:.:::::.:.::..:::..::: XP_011 LILLSVTIPMSMFILSEFIYLGNSVFIDWDVQMYYKPQDVPAKARSTSLNDHLGQVEYIF 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 SDKTGTLTQNIMTFKKCCINGQIYGDHRDASQHNHNKIEQVDFSWNTYADGKLAFYDHYL :::::::::::.::.::::.:..:: .:. .. .. . :: .::::: :.. : XP_011 SDKTGTLTQNILTFNKCCISGRVYGPDSEAT----TRPKENPYLWNKFADGKLLFHNAAL 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 pF1KE2 IEQIQSGKEPEVRQFFFLLAVCHTVMV-----DRTDGQLNYQAASPDEGALVNAARNFGF .. .... . ::.:. :::.:::::: .: : :: ::::::::::::.::::::. 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