FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2530, 3122 aa 1>>>pF1KE2530 3122 - 3122 aa - 3122 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5691+/-0.00167; mu= 8.2012+/- 0.100 mean_var=357.7484+/-69.240, 0's: 0 Z-trim(107.6): 151 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.067809 statistics sampled from 9691 (9811) to 9691 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16 Scan time: 4.280 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs109|chr6 (3122) 21705 2140.8 0 CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs109|chr18 (3075) 7179 719.8 6.8e-206 CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs109|chr18 (3277) 1426 157.0 1.9e-36 CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs109|chr18 (3333) 1426 157.0 1.9e-36 CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs109|chr20 (3695) 1329 147.6 1.4e-33 CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs109|chr1 (1609) 1309 145.2 3.3e-33 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::::.::::::::::: ..:..:.:.:::::::::::.::::::::::::::: .:: : CCDS32 IRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDE 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 ATNKSRCECEHNTCGDSCDQCCPGFHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHGKAEECYYDENVA .:.: .:.:::::::.::..::::.::.::: :: . . :::::::.::..:::::.:: CCDS32 TTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVA 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 RRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQNTAGINCETCTDGFFRPKGVSPNYPRPCQPCHCDPIG ... ::: :.. :::::::: ::: ::::::: ::..::. ::: .::.::.:::.: CCDS32 KQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVG 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 pF1KE2 SLNEVCVKDEKHA--RRGLAPGSCHCKTGFGGVSCDRCARGYTGYPDCKACNCSGLGSKN ::. ::.::. :. . : ::.: :: :. : .:::: :: :: : .:.:. .:: . CCDS32 SLSSVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSAS 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 EDPCFGPCICKENVEGGDCSRCKSGFFNLQEDNWKGCDECFCSGVSNRCQSSYWTYGKIQ ..:: :::.::::::: :.::: ::.::.: : .::.:::: :::. :.: : :... CCDS32 DEPCTGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVN 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 DMSGWYLTDLPGRIRVAPQQDDLDSPQQISISNAEARQALPHSYYWSAPAPYLGNKLPAV .:::: .::: . .. ::: : . .:.::.:. . : : .:::.:: :::::: : CCDS32 SMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAF 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 GGQLTFTISYDLEEEEEDTERVLQLMIILEGNDLSISTAQDEVYLHPSEEHTNVLLLKEE :: : .:.:::. : :.. . . .:..:: :..:: . . :.: ::. ::. : : CCDS32 GGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPE 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 SFTIHGTHFPVRRKEFMTVLANLKRVLLQITYSFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTDGSIA .: .. . : ..::::::. ..:.. .:. . :..:: ::.:. : : : .: CCDS32 NFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVA 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 AAVEVCQCPPGYTGSSCESCWPRHRRVNGTIFGGICEPCQCFGHAESCDDVTGECLNCKD : :: :.:: ::::.::::: . ::.: .:::::.::.: ::: :. : : :. : CCDS32 ADVEHCECPQGYTGTSCESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECN-VHGVCIACAH 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 HTGGPYCDKCLPGFYGEPTKGTSEDCQPCACPLNIPSNNFSPTCHLDRSLGLICDGCPVG .: : .:..:::::::::..:: :::::::::.: ::::::::::. . ..:: : : CCDS32 NTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPG 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 YTGPRCERCAEGYFGQPSVPGGSCQPCQCNDNLDFSIPGSCDSLSGSCLICKPGTTGRYC :.: :::::.::.:.:.::: :: ::.:. :.: : : :::..: :: : .: : .: CCDS32 YSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHC 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 ELCADGYFGDAVDAKNCQPCRCNAGGSFSEVCHSQTGQCECRANVQGQRCDKCKAGTFGL : ::::..:::: ::::. :.:.. :: : ::: .:: :.:. :: ::.::.: : .:: CCDS32 ERCADGFYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGL 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 QSARGCVPCNCNSFGSKSFDCEESGQCWCQPGVTGKKCDRCAHGYFNFQEGGCTACECSH .:..:: ::::. :: : : . ::: : :::.::.:::::::.. .:.:.:: :.: : CCDS32 DSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPH 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 LGNNCDPKTGRCICPPNTIGEKCSKCAPNTWGHSITTGCKACNCSTVGSLDFQCNVNTGQ :.:::.::.:.:::.: : :: .: . ::.. .::.::::: ::: .:.: ::. CCDS32 TQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGH 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 CNCHPKFSGAKCTECSRGHWNYPRCNLCDCFLPGTDATTCDSETKKCSCSDQTGQCTCKV :.:. ::.: : .:: :. ..: : ::: : ::.. .:. : :.: ..:: : :: CCDS32 CQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 NVEGIHCDRCRPGKFGLDAKNPLGCSSCYCFGTTTQCSEAKGLIRTWVTLKAEQTILPLV :: : .:..:: : :.: : :::::: :.: : . ::: . .:: ::: ..: .: .: CCDS32 NVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVV 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 DEALQHTTTKGIVFQHPEIVAHMDLMREDLHLEPFYWKLPEQFEGKKLMAYGGKLKYAIY ... . ::.:. .: :... .:. .. :::::.::.::.: .::::::::::.. CCDS32 SQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 FEAREETGFSTYNPQVIIRGGTPTHARIIVRHMAAPLIGQLTRHEIEMTEKEWKYYGDDP : . . .: :...:::.:.:: . ..: :: : ..:. : :. :::. . CCDS32 FYSLDGVGTSNFEPQVLIKGGR-IRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYF--NS 1250 1260 1270 1280 1290 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 RVHRTVTREDFLDILYDIHYILIKATYGNFMRQSRISEISMEVAEQGRGTTMTPP----A .. ::::::...: ::.::::::.::. ..:::::.::::: :: . : : CCDS32 VSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEV---GRKAEKLHPEEEVA 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 DLIEKCDCPLGYSGLSCEACLPGFYRLRSQPGG-RTPGPTLGTCVPCQCNGHSSLCDPET .:.:.: :: : :.::. : ::..: . :. : : : .. ::::.::.::. :::.: CCDS32 SLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNT 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 SICQNCQHHTAGDFCERCALGYYGIVKGLPNDCQQCACPLISSSNNFSPSCVAEGLDDYR . : :: .:::: :. :. :::: : : .:: :::: : .:::.:: :: :.: CCDS32 GKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPH-SPPASFSPTCVLEGDHDFR 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 CTACPRGYEGQYCERCAPGYTGSPGNPGGSCQECECDPYGSLPVPCDPVTGFCTCRPGAT : :: ::::..::::. .: :.: .::::::.:.:.:.::. :: ..: :.:: ::. CCDS32 CDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGAS 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KE2 GRKCDGCKHWHAREGWECVFCGDECTGLLLGDLARLEQMVMSINLTGPLPAPYKMLYGLE : .:: :. : .:: : :::.:.::.:: .. . :.:.:::: .:.:: .: .:: CCDS32 GLRCDECEPRHILMETDCVSCDDECVGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLE 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KE2 NMTQELKHLLSPQRAPERLIQLAEGNLNTLVTEMNELLTRATKVTADGEQTGQDAERTNT : :. :.. : . . : .. .:. .. : ..: . :.. :. ..... .:: CCDS32 NTTKYLQESLLKENMQKDLGKI---KLEGVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFK 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KE2 RAKSLGEFIKELARDAEAVNEKAIKLNETLGTRDEAF---ERNLEGLQKEIDQMIKELRR ....:. :..: . . ::. ::.:: :: : . .:...:.. .... .. CCDS32 ESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTT-LNQTL---DEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQI 1660 1670 1680 1690 1700 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KE2 KNLETQKEIAEDELVAAEALLKKVKKLFGESRGENEEMEKDLREKLADYKNKVDDAWDLL ... .. : :: ::: ::..... . . : : ... . :. ..:.. : :. CCDS32 RDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALV 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KE2 REATDKIREANRLFAVNQKNMTALEKKKEAVESGKRQIENTLKEGNDILDEANRLADEIN ::: :..:.:.:. . . :. . :: :. . . . .: ..: : .: .. CCDS32 REAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQ 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KE2 SIIDYVEDIQTKLPPMSEELNDKIDDLSQEIKDRKLAEKVSQAESHAAQLNDSSAVLDGI . ....:: : :: : .. .:::: .....:. .. : .::.:::... . :: . CCDS32 DALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSG 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KE2 LDEAKNISFNATAAFKAYSNIKDYIDEAEKVAKEAKDLAHEATKLATGPRGLLKEDAKGC :.. .:.:.:::.: .. ::.. :.:.:..:..:. . :.. :. . : ..:. CCDS32 LENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTETSLLSES----LVSNGKAA 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KE2 LQKSFRILNEAKKLANDVKENEDHLNGLKTRIENADARNGDLLRTLNDTLGKLSAIPNDT .:.: :.:.:...:. . .:. :... . . .. : :..: : :::. CCDS32 VQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESLLILRAIPKGI 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KE2 AAKLQAVKDKARQANDTAKDVLAQITELHQNLDGLKKNYNKLADSVAKTNAVVKDPSKNK : .:. : .:...: ..: ... : :.: . . . ... .. .:. ...: . CCDS32 RDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMAT 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KE2 IIADADATVKNLEQEADRLIDKLKPIKELEDNLKKNISEIKELINQARKQANSIKVSVSS ..: ::..: .:. :.:.:::.: ::.::..:.:::: ::.:::::: ::::.::. CCDS32 LLAGR--KVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVSA 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2160 2170 2180 2190 2200 2210 pF1KE2 GGDCIRTYKPEIKKGSYNNIVVNVKTAVADNLLFYLGSAKFIDFLAIEMRKGKVSFLWDV ::::.:.:.:.. .::....:::: :::::::::. ::::.:::.:.:.::::. CCDS32 DRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGSSTASDFLAVEMRRGRVAFLWDL 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2220 2230 2240 2250 2260 2270 pF1KE2 GSGVGRVEYPDLTIDDSYWYRIVASRTGRNGTISVRALDGPKASIVPSTHHSTSPPGYTI ::: :.:.::. :::. :. : ..: : :..::. ... . : : :. : :: .. CCDS32 GSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKS--P-TKTSKSPGTANV 2190 2200 2210 2220 2230 2280 2290 2300 2310 2320 2330 pF1KE2 LDVDANAMLFVGGLTGKLKKADAVRVITFTGCMGETYFDNKPIGLWNFREKEGDCKGCTV :::. ....::::: :..::. ::.: : ::.::.....: :::::. :.:: :.:: CCDS32 LDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREGKCRGCFG 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KE2 SPQVEDSEGTIQFDGEGYALVSRPIRWYP-NISTVMFKFRTFSSSALLMYLATRDLRDFM : : :: ...::: ::..: . . : ... ... : ::: ..::.::.. .::. CCDS32 SSQNEDP--SFHFDGSGYSVVEKSL---PATVTQIIMLFNTFSPNGLLLYLGSYGTKDFL 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KE2 SVELTDGHIKVSYDLGSGMASVVSNQNHNDGKWKSFTLSRIQKQANISIVDI-DTNQEEN :.:: :..:: ::::: ...... .:.: : .....: .::. ....: .:...:. CCDS32 SIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGVLAVIDAYNTSNKET 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2450 2460 2470 2480 2490 2500 pF1KE2 IATSSSGNNFGLDLKADDKIYFGGLPTLRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNI . : . :. : :: :::: : . : :. :.. ::.:..::::. ... CCDS32 KQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVV----RRGVTTKSFVGCIKNLEISRSTFDL 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2510 2520 2530 2540 2550 2560 pF1KE2 LSSPDYVGVTKGCSLENVYTVSFPKPGFVELSPVPIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSG : . :: ::: :: . .::: : :..:: : .. .: ..:.: : ::::: . : CCDS32 LR--NSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSSGIILAALG 2480 2490 2500 2510 2520 2570 2580 2590 2600 2610 2620 pF1KE2 GTPAPPRRKRRQTGQAYYVILLNRGRLEVHLSTGART-MRKIVIRPEPNLFHDGREHSVH : . : :... .. ..: : .:::.. : : .:: ... . ::. ::. 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CCDS32 -------CVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIY 2710 2720 2730 2740 2750 2810 2820 2830 2840 2850 2860 pF1KE2 YMARINHADFATVQLRNGLPYFSYDLGSGDTHTMIPTKINDGQWHKIKIMRSKQEGILYV :::. :.::.:..::..: .: .:::.: :.. :. ..::.:: .: :..:.. : CCDS32 YMAHQNQADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITV 2760 2770 2780 2790 2800 2810 2870 2880 2890 2900 2910 2920 pF1KE2 DGASNRTISP-KKADILDVVGMLYVGGLPINYTTRRIGPVTYSIDGCVRNLHMAEAPADL :: . .. . .::: :..:.:::: .: .:.:: .:.:: .:. .. . : CCDS32 DGRESPMVTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDK 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2930 2940 2950 2960 2970 2980 pF1KE2 EQPTSSFHVGTCFANAQRGTYFDGTGFAKAVG-GFKVGLDLLVEFEFRTTTTTGVLLGIS ..:.:.: :. :.: ::.::::::.:.: : :.:: :. . .::::.. .::::::: CCDS32 DSPVSAFTVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGIS 2880 2890 2900 2910 2920 2930 2990 3000 3010 3020 3030 3040 pF1KE2 SQKMDGMGIEMIDEKLMFHVDNGAGRFTAVYDAGVPGHLCDGQWHKVTANKIKHRIELTV . :.:..:.:..: :..:::.:::::.::.:. . ::::.:: . ::: :::: : : CCDS32 TAKVDAIGLELVDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIV 2940 2950 2960 2970 2980 2990 3050 3060 3070 3080 3090 3100 pF1KE2 DGNQVEAQSPNPASTSADTNDPVFVGGFPDDLKQFGLTTSIPFRGCIRSLKLTKGTGKPL ::: : :.::. :::.:::.:..:::.: .:: : .. ::::.:.: : : . . CCDS32 DGNAVGAESPHTQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIK-SPQVQ 3000 3010 3020 3030 3040 3050 3110 3120 pF1KE2 EVNFAKALELRGVQPVSCPAN .:..:.::.:: ::: CCDS32 SFDFSRAFELHGVFLHSCPGTES 3060 3070 >>CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs109|chr18 (3277 aa) initn: 2076 init1: 743 opt: 1426 Z-score: 768.2 bits: 157.0 E(33420): 1.9e-36 Smith-Waterman score: 3496; 26.9% identity (52.1% similar) in 3358 aa overlap (29-3004:37-3166) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLASNALITTNATC :. : .: :. .::: : : ..::: CCDS45 PRGRALGPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEAARIWATATC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE2 GEKGP-------EMYCKLV--EHVPG--QPVRNPQCRICNQNSSNPNQRHPITNAIDGKN ::.:: :.::::: .:: . ... : : :: .: . ::.::::::.. 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CCDS45 PENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGFDPLAFPEFSWRGYAQMTSVQNDVRITLN 720 730 740 750 760 770 570 580 590 600 pF1KE2 ISISNAEA-----RQALP-------H-SYY--WSAPAP----YLGNKLPAV------GGQ .. :.. : . : : . : :.: .: .: :: : CCDS45 VGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPSWGAAQSKEIIFLPSKEPAFVTVPGNGFA 780 790 800 810 820 830 610 620 630 640 pF1KE2 LTFTISYDLEEEEEDTERVLQLMIIL------EGNDLSISTAQDEVYLHPSEE------H :.:. . .: :: ...: :.. :.. ... .: : .: : CCDS45 DPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLVLLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQENCLLYQH 840 850 860 870 880 890 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 TNV------LLLKEESFTIHGTHFPVRRKE---FMTVLANLKRVLLQITYSFGMDAIFRL : : . . : . : :: .. :...:. ... . . . . CCDS45 LPVTRFPCTLACEARHFLLDGEPRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRLRIPQVGHY 900 910 920 930 940 950 710 720 730 740 pF1KE2 SSV---NLESA------VSYPTDGSI-AAAVEVCQCPPGYTGSSCESCWPRH-RRVNGTI : . :.: :. ..::. :. :.. .: .:. :.: : :. .. 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CCDS45 TKFVDMLGWH--LETADRVDIPVSFNPG----SNSMVADLQELPATIHSAS--WVAPTSY 1480 1490 1500 1510 1520 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 EGKKLMAYGGKLKY-AIYFEAREETGFSTYNPQVIIRGGTPTHARIIVRHMAAPLIGQLT : :. .::: : : : : . . .:.: . : : :: .. .: .: CCDS45 LGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDMVLLEKKPDVQLTG---QHMSIIYEETNTPRPDRLH 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 RHEIEMTEKEWKYYGDDPRVHRTVTREDFLDILYDIHYILIKATYGNFMRQSRISEISME . .....: .... .. . :.::... .: . . :.. : . .. .::...: CCDS45 HGRVHVVEGNFRHASS----RAPVSREELMTVLSRLADVRIQGLYFTETQRLTLSEVGLE 1590 1600 1610 1620 1630 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 VA-EQGRGTTMTPPADLIEKCDCPLGYSGLSCEACLPGFYRLRSQPGGRTPGPTLGTCVP : . : : : .: : :: .:.: ::..: ::.: :.. : : : ::: CCDS45 EASDTGSGRI----ALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYY--RDHKGLYT-----GRCVP 1640 1650 1660 1670 1680 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 CQCNGHSSLCDPETSICQNCQHHTAGDFCERCALGYYGIVKGLPNDCQQCACPLISSSNN :.:::::. :. ..:: ::::.:::. :::: :::: ... ..:. : :: .:. 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CCDS45 AISNHGSKI-EGLERELT---DLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLNNNVNRATQS------ 1880 1890 1900 1910 1920 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE2 GLQKEIDQMIKELRRKNLETQKEIAEDELVAAEALLKKVKKLFGESRGENEEMEKDLREK ::.: ::.. : :.. .:.... .:::. . ...:.. CCDS45 --AKELDVKIKNVIR-NVH---------------MLNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDS 1930 1940 1950 1960 1970 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KE2 LADYKNKVDDAWDLLREATDKIREANRLFAVNQKNMTALEKKKEAVESGKRQIENTLKEG : .:. :..: :.::. . ..:: : :.. . :.... . ..: . .. . : . CCDS45 LNEYEAKLSDLRARLQEAAAQAKQANGLNQENERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTA 1980 1990 2000 2010 2020 2030 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 NDILDEANRLADEINSIIDYVEDIQTKLPPMSEELNDKIDDLSQEIKDRKLAEKVSQAES .. : ..: . ... : . ..: .::.::. .::. .:.: .::. CCDS45 DSSLLQTNIALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVE---EAEK 2040 2050 2060 2070 2080 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 HAAQLNDSSAVLDGILDEAKN--ISFNATAAFKAYSNIKDYIDEAEKVAKEAKDLAHEAT :: .:.. . :. : .:.. . :. : :: :: . : :: .:..: . .. : CCDS45 HARSLQELAKQLEEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESA- 2090 2100 2110 2120 2130 2140 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KE2 KLATGPRGLLKEDAKGCLQKSFRILNEAKKLANDVK-ENEDHLNGLKTRIENADARNGDL : : . : . :: ..: ..::::: . .: : ::.:. .. . ... . CCDS45 -LQTVIKEDLPRKAKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVI 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KE2 ---LRTLNDTLGKLSAIPNDTAAKLQAVKDKARQANDTAKDVLAQITELHQNLDGLKKNY : :: : : .. .: : ....:. .:.::: . .:: .. .. ... .: .: CCDS45 DTNLTTLRDGLHGIQR--GDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTY 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KE2 NKLADSVAKTNAVVKDPSKNKIIADADATVKNLEQEADRLIDKLKPIKELEDNLKKNISE .. . : . : : ::. . .: .. . . ..: :. .. ::. . CCDS45 GRTQNEDFKKALTDADNSVNKLTN----KLPDLWRKIESINQQLLPLGNISDNMDR---- 2270 2280 2290 2300 2310 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE2 IKELINQARKQANSIKVSVS-SGGDCIRTYKP---EIKKGSYNNIVVNVKT-------AV :.:::.::: :... : . .: . ... : : :: :... . .. .. CCDS45 IRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKSGVEVRLPNDLEDLKG-YTSLSLFLQRPNSRENGGT 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KE2 ADNLLFYLGSAKFI-DFLAIEMRKGKVSFLWDVGSGVGRVEYPDLTIDDSYWYRIVASRT . ...:::. :.... . :... ....:. .... : . : . : .:. CCDS45 ENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQLTCVYNLGDREAELQV-DQILTKSETKEAVMDRV 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2240 2250 2260 2270 2280 2290 pF1KE2 GRNGTISVRALDGPKASI-----VPSTHHSTSPPGYTILDVDA-NAMLFVGGLTGKLKKA . . :. :.. .:... . . :.:..: :....::: .: CCDS45 KFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLP 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE2 DAVRVITFTGCMGETYFDNKPIGLWNFREKEGDCKGCTVSP---QVEDSEGTIQFDGEGY . . . ::. .... ..:.::. : . . : : . :.:. . :.: :: CCDS45 SRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYNFK-KTFNLNTTEVEPCRRRKEESDKNY-FEGTGY 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2350 2360 2370 2380 2390 2400 pF1KE2 ALVSRPIRWYPNISTVMFKFRTFSSSALLMYLATRDLRDFMSVELTDGHIKVSYDLGSGM : : : . . : : ..: . .::.. . : :.:... ::.. : : :.: . CCDS45 ARV--PTQPHAPIPTFGQTIQTTVDRGLLFFAENGD--RFISLNIEDGKLMVRYKLNSEL 2560 2570 2580 2590 2600 2410 2420 2430 2440 2450 2460 pF1KE2 ASVVSNQNH-NDGKWKSFTLS--RIQKQANISIVDIDTNQEENIATSSSGNNFGLDLKAD . . . :.:. .:. .. ..::. :. ::... : .:. : :... CCDS45 PKERGVGDAINNGRDHSIQIKIGKLQKRMWIN-VDVQN-------TIIDGEVF--DFST- 2610 2620 2630 2640 2650 2470 2480 2490 2500 2510 2520 pF1KE2 DKIYFGGLPTLRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNILSSPDYVGVTKGCSLEN :.::.: .... : ... . ::.:.. . ... : ::::: :: . CCDS45 --YYLGGIP----IAIRERFNISTPAFRGCMKNL---KKTSGVVRLNDTVGVTKKCSEDW 2660 2670 2680 2690 2700 2530 2540 2550 2560 2570 2580 pF1KE2 --VYTVSFPKPG---FVELSPVPIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSGGTPAPPRRKRRQ : ..:: . : :..:. : : . ...:.: . :::.: .: CCDS45 KLVRSASFSRGGQLSFTDLGLPPTD-HLQASFGFQTFQPSGILL-------------DHQ 2710 2720 2730 2740 2750 2590 2600 2610 2620 2630 2640 pF1KE2 TGQAYYVILLNRGRLEVHLSTGARTMRKIVIRPEPNLFHDGREHSVHVERTRGIFTVQVD : . :. : .:. : .. . : :. . :: : : : . . . .: CCDS45 TWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFK-----SPQTYMDGLLHYVSVISDNSGLRLLID 2760 2770 2780 2790 2800 2650 2660 2670 2680 2690 pF1KE2 E----NRRYMQNLTVEQPIEVKKLFVGGAPPEFQPSPLRNIPPFEGCIWNLVINSV---P . : . ..... . ..: .::. ::::: :. .. . : CCDS45 DQLLRNSKRLKHISSSR----QSLRLGGS-------------NFEGCISNVFVQRLSLSP 2810 2820 2830 2840 2850 2700 2710 2720 2730 2740 pF1KE2 --MDFARPVSFKNADIGRCAHQK----------LREDEDGAAPAEIVIQPEPVPTPAFPT .:.. .....: :. .: : .. . . ..: :: .: CCDS45 EVLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDTPVASPR--- 2860 2870 2880 2890 2900 2750 2760 2770 2780 2790 2800 pF1KE2 PTPVLTHGPCAAESEPALLIGSKQFGLSRNSHIAIAFDDTKVKNRLTIELEVRTEAESGL . . . :. . :. ::: .::. . . . .: : . ....: . :: CCDS45 -SVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTTSSRGL 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KE2 LFYMARINHADFATVQLRNGLPYFSYDLGSGDTHTMIPTK--INDGQWHKIKIMRSKQEG .:. . : .: .. : .: :. ::. . : .: :::.:: . . .. ..: CCDS45 VFHTGTKN--SFMALYLSKGRLVFA--LGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDGEKG 2970 2980 2990 3000 3010 3020 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KE2 ILYVDGASNRTISPKKADILDVVGMLYVGGLPINYTTRRIGPVTYSIDGCVRNLHMAEAP : ::: : : . ... . .:.:. : . . . : : :. ::..:... : CCDS45 RLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAPVYLGS-PPSGKPKSL-P-TNSFVGCLKNFQLDSKP 3030 3040 3050 3060 3070 3080 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KE2 ADLEQPTSSFHVGTCFANA-QRGTYFDGTGFAKAVGGFKV--GLDLLVEFEFRTTTTTGV : :.::: :..:... ..: ::. : ...: . .: : .. . : .: . ::. CCDS45 --LYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEG-GHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRPRSLTGI 3090 3100 3110 3120 3130 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KE2 LLGISSQKMDGMGIEMIDEKLMFHVDNGAGRFTAVYDAGVPGHLCDGQWHKVTANKIKHR :. :.:: . . . :. .:.: CCDS45 LIHIGSQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTIKQHILH 3140 3150 3160 3170 3180 3190 >>CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs109|chr18 (3333 aa) initn: 2076 init1: 743 opt: 1426 Z-score: 768.1 bits: 157.0 E(33420): 1.9e-36 Smith-Waterman score: 3554; 27.1% identity (52.6% similar) in 3308 aa overlap (29-2948:37-3165) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLASNALITTNATC :. : .: :. .::: : : ..::: CCDS42 PRGRALGPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEAARIWATATC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE2 GEKGP-------EMYCKLV--EHVPG--QPVRNPQCRICNQNSSNPNQRHPITNAIDGKN ::.:: :.::::: .:: . ... : :: : .: . ::.::::::.. 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CCDS42 PENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGFDPLAFPEFSWRGYAQMTSVQNDVRITLN 720 730 740 750 760 770 570 580 590 600 pF1KE2 ISISNAEA-----RQALP-------H-SYY--WSAPAP----YLGNKLPAV------GGQ .. :.. : . : : . : :.: .: .: :: : CCDS42 VGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPSWGAAQSKEIIFLPSKEPAFVTVPGNGFA 780 790 800 810 820 830 610 620 630 640 pF1KE2 LTFTISYDLEEEEEDTERVLQLMIIL------EGNDLSISTAQDEVYLHPSEE------H :.:. . .: :: ...: :.. :.. ... .: : .: : CCDS42 DPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLVLLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQENCLLYQH 840 850 860 870 880 890 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 TNV------LLLKEESFTIHGTHFPVRRKE---FMTVLANLKRVLLQITYSFGMDAIFRL : : . . : . : :: .. :...:. ... . . . . CCDS42 LPVTRFPCTLACEARHFLLDGEPRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRLRIPQVGHY 900 910 920 930 940 950 710 720 730 740 pF1KE2 SSV---NLESA------VSYPTDGSI-AAAVEVCQCPPGYTGSSCESCWPRH-RRVNGTI : . :.: :. ..::. :. :.. .: .:. :.: : :. .. 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CCDS42 TKFVDMLGWH--LETADRVDIPVSFNPG----SNSMVADLQELPATIHSAS--WVAPTSY 1480 1490 1500 1510 1520 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 EGKKLMAYGGKLKY-AIYFEAREETGFSTYNPQVIIRGGTPTHARIIVRHMAAPLIGQLT : :. .::: : : : : . . .:.: . : : :: .. .: .: CCDS42 LGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDMVLLEKKPDVQLTG---QHMSIIYEETNTPRPDRLH 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 RHEIEMTEKEWKYYGDDPRVHRTVTREDFLDILYDIHYILIKATYGNFMRQSRISEISME . .....: .... .. . :.::... .: . . :.. : . .. .::...: CCDS42 HGRVHVVEGNFRHASS----RAPVSREELMTVLSRLADVRIQGLYFTETQRLTLSEVGLE 1590 1600 1610 1620 1630 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 VA-EQGRGTTMTPPADLIEKCDCPLGYSGLSCEACLPGFYRLRSQPGGRTPGPTLGTCVP : . : : : .: : :: .:.: ::..: ::.:: .. : : : ::: CCDS42 EASDTGSGRI----ALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYYR--DHKGLYT-----GRCVP 1640 1650 1660 1670 1680 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 CQCNGHSSLCDPETSICQNCQHHTAGDFCERCALGYYGIVKGLPNDCQQCACPLISSSNN :.:::::. :. ..:: ::::.:::. :::: :::: ... ..:. : :: .:. CCDS42 CNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYG--NAVHGSCRACPCP---HTNS 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 FSPSCVAEGLDDYRCTACPRGYEGQYCERCAPGYTGSPGNPGGSCQECECDPYGSLPVPC :. .::..: : ::. : :: : :::::::: :.: . ::::: : :. :.: : CCDS42 FATGCVVNG-GDVRCS-CKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCSCNSNGQLG-SC 1750 1760 1770 1780 1790 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 DPVTGFCTC---RPGATGRKCDGCKHWHAREGWECVFCGDECTGLLLGDLARL-EQMVMS :.:: : . .. ...:: : : :. ::.::: . ::. . CCDS42 HPLTGDCINQEPKDSSPAEECDDC---------------DSCVMTLLNDLATMGEQLRLV 1800 1810 1820 1830 1840 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KE2 INLTGPLPAPYKMLYGLENMTQELK----HLLSPQRAPERLIQLAEGNLNTLVTEMN--- . : : .: ...: . : .::. . : . :: :. .:..: CCDS42 KSQLQGLSASAGLLEQMRHMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEG-LERELTDLNQEF 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KE2 ELLTRATKVTADGEQT-GQDAERTNTRAKSLGEFIKELARDAEAVNEKAIKLNETLGTRD : : . ..:.. :: .....:.. :: : ::.. :... . . ... : : . CCDS42 ETLQEKAQVNSRKAQTLNNNVNRATQSAKELDVKIKNVIRNVHILLK---QISGTDGEGN 1910 1920 1930 1940 1950 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 EAFERNLEGLQKEIDQMIKELRRKNLETQKEIAEDELVAAEALLKKVKKLFGESRGENEE .. .. : ..:..::: .:. . . :: . .. ::.... .:::. CCDS42 NVPSGDFSREWAEAQRMMRELRNRNFGKHLREAEADKRESQLLLNRIRTWQKTHQGENNG 1960 1970 1980 1990 2000 2010 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE2 MEKDLREKLADYKNKVDDAWDLLREATDKIREANRLFAVNQKNMTALEKKKEAVESGKRQ . ...:..: .:. :..: :.::. . ..:: : :.. . :.... . ..: . . CCDS42 LANSIRDSLNEYEAKLSDLRARLQEAAAQAKQANGLNQENERALGAIQRQVKEINSLQSD 2020 2030 2040 2050 2060 2070 1830 1840 1850 1860 1870 1880 pF1KE2 IENTLKEGNDILDEANRLADEINSIIDYVEDIQTKLPPMSEELNDKIDDLSQEIKDRKLA . . : ... : ..: . ... : . ..: .::.::. .::. .:. CCDS42 FTKYLTTADSSLLQTNIALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLV 2080 2090 2100 2110 2120 2130 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 EKVSQAESHAAQLNDSSAVLDGILDEAKN--ISFNATAAFKAYSNIKDYIDEAEKVAKEA : .::.:: .:.. . :. : .:.. . :. : :: :: . : :: .:..: CCDS42 E---EAEKHARSLQELAKQLEEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRA 2140 2150 2160 2170 2180 2190 1950 1960 1970 1980 1990 2000 pF1KE2 KDLAHEATKLATGPRGLLKEDAKGCLQKSFRILNEAKKLANDVK-ENEDHLNGLKTRIEN . .. : : : . : . :: ..: ..::::: . .: : ::.:. .. CCDS42 ASASESA--LQTVIKEDLPRKAKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNI 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2010 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KE2 ADARNGDL---LRTLNDTLGKLSAIPNDTAAKLQAVKDKARQANDTAKDVLAQITELHQN . ... . : :: : : .. .: : ....:. .:.::: . .:: .. .. . CCDS42 VTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQR--GDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTD 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KE2 LDGLKKNYNKLADSVAKTNAVVKDPSKNKIIADADATVKNLEQEADRLIDKLKPIKELED .. .: .:.. . : . : : ::. . .: .. . . ..: :. .. : CCDS42 VERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSVNKLT----NKLPDLWRKIESINQQLLPLGNISD 2320 2330 2340 2350 2360 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE2 NLKKNISEIKELINQARKQANSIKVSVS-SGGDCIRTYKP---EIKKGSYNNIVVNVKT- :. . :.:::.::: :... : . .: . ... : : :: :... . .. CCDS42 NMDR----IRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKSGVEVRLPNDLEDLKG-YTSLSLFLQRP 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KE2 ------AVADNLLFYLGSAKFI-DFLAIEMRKGKVSFLWDVGSGVGRVEYPDLTIDDSYW .. . ...:::. :.... . :... ....:. .... : . : CCDS42 NSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQLTCVYNLGDREAELQV-DQILTKSET 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2230 2240 2250 2260 2270 2280 pF1KE2 YRIVASRTGRNGTISVRALDGPKASI-----VPSTHHSTSPPGYTILDVDA-NAMLFVGG . : .:. . . :. :.. .:... . . :.:..: :....::: CCDS42 KEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGG 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2290 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE2 LTGKLKKADAVRVITFTGCMGETYFDNKPIGLWNFREKEGDCKGCTVSP---QVEDSEGT .: . . . ::. .... ..:.::. : . . : : . :.:. . CCDS42 YPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYNFK-KTFNLNTTEVEPCRRRKEESDKN 2550 2560 2570 2580 2590 2600 2350 2360 2370 2380 2390 2400 pF1KE2 IQFDGEGYALVSRPIRWYPNISTVMFKFRTFSSSALLMYLATRDLRDFMSVELTDGHIKV :.: ::: : : . . : : ..: . .::.. . : :.:... ::.. : CCDS42 Y-FEGTGYARV--PTQPHAPIPTFGQTIQTTVDRGLLFFAENGD--RFISLNIEDGKLMV 2610 2620 2630 2640 2650 2410 2420 2430 2440 2450 pF1KE2 SYDLGSGMASVVSNQNH-NDGKWKSFTLS--RIQKQANISIVDIDTNQEENIATSSSGNN : :.: . . . . :.:. .:. .. ..::. :. ::... : .:. CCDS42 RYKLNSELPKERGVGDAINNGRDHSIQIKIGKLQKRMWIN-VDVQN-------TIIDGEV 2660 2670 2680 2690 2700 2460 2470 2480 2490 2500 2510 pF1KE2 FGLDLKADDKIYFGGLPTLRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNILSSPDYVGV : .. :.::.: .... : ... . ::.:.. . ... : ::: CCDS42 FDFST-----YYLGGIP----IAIRERFNISTPAFRGCMKNL---KKTSGVVRLNDTVGV 2710 2720 2730 2740 2750 2520 2530 2540 2550 2560 2570 pF1KE2 TKGCSLEN--VYTVSFPKPG---FVELSPVPIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSGGTPA :: :: . : ..:: . : :..:. : : . ...:.: . :::.: CCDS42 TKKCSEDWKLVRSASFSRGGQLSFTDLGLPPTD-HLQASFGFQTFQPSGILL-------- 2760 2770 2780 2790 2800 2580 2590 2600 2610 2620 2630 pF1KE2 PPRRKRRQTGQAYYVILLNRGRLEVHLSTGARTMRKIVIRPEPNLFHDGREHSVHVERTR .:: . :. : .:. : .. . : :. . :: : : : CCDS42 -----DHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFK-----SPQTYMDGLLHYVSVISDN 2810 2820 2830 2840 2850 2640 2650 2660 2670 2680 pF1KE2 GIFTVQVDE----NRRYMQNLTVEQPIEVKKLFVGGAPPEFQPSPLRNIPPFEGCIWNLV . . . .:. : . ..... . ..: .::. ::::: :. CCDS42 SGLRLLIDDQLLRNSKRLKHISSSR----QSLRLGGSN-------------FEGCISNVF 2860 2870 2880 2890 2900 2690 2700 2710 2720 2730 pF1KE2 INSV---P--MDFARPVSFKNADIGRCAHQK----------LREDEDGAAPAEIVIQPEP .. . : .:.. .....: :. .: : .. . . ..: : CCDS42 VQRLSLSPEVLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDTP 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2740 2750 2760 2770 2780 2790 pF1KE2 VPTPAFPTPTPVLTHGPCAAESEPALLIGSKQFGLSRNSHIAIAFDDTKVKNRLTIELEV : .: . . . :. . :. ::: .::. . . . .: : . ... CCDS42 VASPR----SVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDM 2970 2980 2990 3000 3010 2800 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KE2 RTEAESGLLFYMARINHADFATVQLRNGLPYFSYDLGSGDTHTMIPTK--INDGQWHKIK .: . ::.:. . : .: .. : .: :. ::. . : .: :::.:: . CCDS42 QTTSSRGLVFHTGTKN--SFMALYLSKGRLVFA--LGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVV 3020 3030 3040 3050 3060 3070 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KE2 IMRSKQEGILYVDGASNRTISPKKADILDVVGMLYVGGLPINYTTRRIGPVTYSIDGCVR . .. ..: : ::: : : . ... . .:.:. : . . . : : :. ::.. CCDS42 FGHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAPVYLGS-PPSGKPKSL-P-TNSFVGCLK 3080 3090 3100 3110 3120 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KE2 NLHMAEAPADLEQPTSSFHVGTCFANA-QRGTYFDGTGFAKAVGGFKVGLDLLVEFEFRT :... : : :.::: :..:... ..: ::. : CCDS42 NFQLDSKP--LYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIR 3130 3140 3150 3160 3170 3180 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KE2 TTTTGVLLGISSQKMDGMGIEMIDEKLMFHVDNGAGRFTAVYDAGVPGHLCDGQWHKVTA CCDS42 PRSLTGILIHIGSQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVT 3190 3200 3210 3220 3230 3240 >>CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs109|chr20 (3695 aa) initn: 1665 init1: 498 opt: 1329 Z-score: 716.3 bits: 147.6 E(33420): 1.4e-33 Smith-Waterman score: 2892; 25.6% identity (47.9% similar) in 3261 aa overlap (3-2563:15-3162) 10 20 30 40 pF1KE2 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLAS : : :::. ::. . : : ... : .: : .::: CCDS33 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLV--GLALLGAARAREE----AGGGFSLHPPYFNLAE 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KE2 NALITTNATCGEKGP---------EMYCKLVEHV-----PGQPVRNPQCRICNQNSSNPN .: :...:::::..: ..::::: :.: .:. : ::. ..: : CCDS33 GARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICT--AANSN 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 QRHPITNAIDGKNTWWQSPSIKNGIEYHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWIL . :: .::::: . ::::: .. :.::. :..:::: :::..:::..: :::::: :.: CCDS33 KAHPASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 ERSLD-DVEYKPWQYHAVTDTECLTLYNIYPRTGPPSY---AKDDEVICTSFYSKIHPLE :::.: :.:::. : . .:: : :: . ..:: .:::. ::.: ::: CCDS33 ERSMDFGRTYQPWQFFASSKRDCLE------RFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLE 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 pF1KE2 NGEIHISLINGRPSADD--PSPELLEFTSARYIRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDP :::: .::.::::.: . :: : :::.: .:::: : :: . :: : .: : CCDS33 NGEIVVSLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRD-----P 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 IVTRRYYYSVKDISVGGMCICYGHARAC----PLDPATNKSRCECEHNTCGDSCDQCCPG ::::::::.::::.:: :.:.::: :: : :: . .: :.::::: .::.:::: CCDS33 TVTRRYYYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPF--RLQCTCQHNTCGGTCDRCCPG 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 FHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHGKAEECYYDENVARRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQN :.:.::. .: . .::..:::.:.: .:::: .: :: : .. : : ::::::.: .. CCDS33 FNQQPWKPATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHH 340 350 360 370 380 390 390 400 410 pF1KE2 TAGINCETCTDGFFRPKGVSPNYP------------------------------RP---- :.:.::: : ::.: :::.: :: CCDS33 TTGVNCERCLPGFYR----SPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSG 400 410 420 430 440 450 420 430 pF1KE2 ---------------CQP--------------------CHCDPIGSLNEVCVKDEKHAR- : : : :. :. ...: :: . .: CCDS33 ERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRC 460 470 480 490 500 510 440 450 pF1KE2 ------RGL-----APG--------------------------SCHCKTGFGGVSCDRCA .: ::: .:.:..:: :..::::: CCDS33 LCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCA 520 530 540 550 560 570 460 470 pF1KE2 RGYT---------------------------------------------GYPDCKACNCS :: :.:.:.::.:. 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CCDS33 GFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVV 1060 1070 1080 1090 1100 1110 750 760 pF1KE2 FG---------GIC---------------EPCQ----CFGHAESCDD------------- :. .:: : : :.. .: CCDS33 EYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASV 1120 1130 1140 1150 1160 1170 770 780 790 800 pF1KE2 -VTGEC------------------------LNCKDHTG--GPYCDKCLPGFYGEPTKGTS .:.: ..: . : :: :::. . .: . CCDS33 RLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPII 1180 1190 1200 1210 1220 1230 810 820 830 840 850 pF1KE2 -EDCQPCACPLNIP-------SNNFSPTCHLDRSLGLIC-DGCPVGYTGPRCERCAEGY- .::: : ..: . .::. : . :. :. :. . CCDS33 LRDCQVIPLPPGLPLTHAQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHV 1240 1250 1260 1270 1280 1290 860 870 880 890 900 pF1KE2 --FGQPSVPGGSCQPCQCNDNLDFSI-PGSCDSLSGSCLICKPGTTGRYCELCADGYFGD .:. . . :: . . .. : : . .. .: : : .: . : CCDS33 PTLGRYAFLLHGYQPAHPTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLD 1300 1310 1320 1330 1340 1350 910 920 930 940 950 pF1KE2 AVDAKNCQPCRCNAG------------------GSFSEVCHSQTGQCECRANVQGQRCDK .. .. : : : . : ... . . .:: . . CCDS33 VTHSELTVTVRVPKGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISP 1360 1370 1380 1390 1400 1410 960 970 980 990 1000 pF1KE2 ------CK--AGTFGLQSARGCVPCNCNSFGSKSFDCEE-SGQCWCQPGVTGKKCDRCAH :. :....: : ::.:. :. . :: .::: :. : :. :.::: CCDS33 SSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCAT 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 GYFNFQEGGCTACECSHLGNNCDPKTGRCICPPNTIGEKCSKCAPNTWGHSITTGCKACN ::..: . : :.:. . :: ::.::::: :: : : :.:.: .::. :: CCDS33 GYWGFPN--CRPCDCG--ARLCDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECN 1480 1490 1500 1510 1520 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 CSTVGS---LDFQCNVNTGQCNCHPKFSGAKCTECSRGHWNYPRCNLCDCFLPGTDATTC :: : : :....:::.:.:. .: .: :: : .:::: ::: :: .: CCDS33 CSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVC 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 DSETKKCSCSDQTGQCTCKVNVEGIHCDRCRPGKFGLDAKNPLGCSSCYCFGTTTQCSEA : :::: :: ::.: .::.: : :.::: :: ::. :.:::.: .: . CCDS33 DP---------LTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSS 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 KGL------IRTWVTLKAEQTILPLVDEALQHTTTKGIVFQH-PEIVAHMDLMREDLHLE . .. :: :.... ..: : : ..: :: : . . CCDS33 SYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVP--HERQPGTEMLRADLRHVPEAVPEA--------FP 1650 1660 1670 1680 1690 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 PFYWKLPEQFEGKKLMAYGGKLKYAIYFEAREETGFSTYN--PQVIIRGGTPTHARIIVR .::. : .. : .. .::: :.: .. :... : .. :.:...:. . : CCDS33 ELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGN---QMSITFL 1700 1710 1720 1730 1740 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 HMAAPLIGQLTRHEIEMTEKEWKYYGDDPRVHRTVTREDFLDILYDIHYILIKATYGNFM . : : :.. : .....: .... ... ::.::... .: ... . :.: .... CCDS33 EPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRH----TETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFSQIS 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE2 RQSRISEISMEVAEQ-GRGTTMTPPADLIEKCDCPLGYSGLSCEACLPGFYRLRSQPGGR . ....::: :.:. :. .: : :: .: : ::. : ::::: CCDS33 SAVFLRRVALEVASPAGQGAL----ASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYR-------D 1810 1820 1830 1840 1850 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE2 TPGPTLGTCVPCQCNGHSSLCDPETSICQNCQHHTAGDFCERCALGYYGIVKGLPNDCQQ . : :: ::::::.:::. : : ...: .:::.: : :::: :. . : . CCDS33 VKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFVSSRDDPSAPCVS 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE2 CACPLISSSNNFSPSCVAEGLDDYRCTACPRGYEGQYCERCAPGYTGSPGNPGGSCQECE : ::: ::::. .:: .: .: : :: : :::::::. :.: :.::: :. CCDS33 CPCPLSVPSNNFAEGCVLRG-GRTQCL-CKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCD 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1530 pF1KE2 C----DP---------------------------------YGSLPVP------------- : :: ::. .: CCDS33 CSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGT 1980 1990 2000 2010 2020 2030 1540 1550 1560 1570 pF1KE2 --CDPVTGFCTCRPGATGRKCDGCKHWH----------------AREGWEC--------- ::: .: : :. :.:::.:: :.. : : :: :: CCDS33 EACDPHSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHC 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KE2 ------------------------------------------------------------ CCDS33 RPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQ 2100 2110 2120 2130 2140 2150 1580 1590 1600 1610 pF1KE2 -----------VFCG--DECTGLLLGDLAR-------LEQMVMSINLTGPLPAP-YKMLY . : :.:. ::: :: : ..... .:: .. : ... CCDS33 VPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNA 2160 2170 2180 2190 2200 2210 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KE2 GLENMTQELKHLLSPQRAPERLIQLAEGNLNTLVTEMNELLTRATKVTADGEQTGQDAER .. .. ..:. :.:.. . ... : . ..: . .: .:. . .. : .: CCDS33 SIADLQSQLRSPLGPRHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEA 2220 2230 2240 2250 2260 2270 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 TNTRAKSLGEFIKELARD-AEAVNEKA-IKLNETLGTRDEAFERNLEGLQKEIDQMIKEL : .::.: :. . : .: ... . . : .. . : . :.: :..... :. CCDS33 TLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLA----EVERLLWEM 2280 2290 2300 2310 2320 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KE2 RRKNLETQKEIAEDELVAAEALLKKVKKLFGESRGENEEMEKDLREKLADYKNKVDDAWD : ..: . . :: ::.::. :: .:.. .. ::. . . :..::... . : . CCDS33 RARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLRE 2330 2340 2350 2360 2370 2380 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE2 LLREATDKIREANRLFAVNQKNMTALEKKKEAVESGKRQIENTLKEGNDILDEANRLADE : .:.: :::..: . ::. . ..:. . . .. ::. . : : . :: CCDS33 ALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHS 2390 2400 2410 2420 2430 2440 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE2 INSIIDYVEDIQTKLPPMSEELNDKIDDLSQEIKDRKLAEKVSQAESHAAQLNDSSAVLD ... . .: . ..: : .... .: . .:.: ::.:: ::.. . :. CCDS33 LDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEA---AEAHAQQLGQLALNLS 2450 2460 2470 2480 2490 2500 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KE2 GI-LDEAKN-ISFNATAAFKAYSNIKDYIDEAEKVAKEAKDLAHEATKLATGPRGLLKED .: :: .. .. : : .::: : . .. :: .: .: : . :: : : . CCDS33 SIILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQA--LQQADHTWATVVRQGLVDR 2510 2520 2530 2540 2550 2560 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KE2 AKGCLQKSFRILNEAKKLANDVKENEDHLNGLKTRIENADARNGDLLRTLNDTLGKLSAI :. : .: . . . . . :.: .:..... :.. .: .. . . :. CCDS33 AQQLLANSTALEEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMD 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KE2 PNDTAAKLQAVKDKARQANDTAKDVLAQITELHQNLDGLKKNYNKLADSVAKTNAVVKDP ..:. :. .: : .:.::: : .:. ...:.. . .:. : . CCDS33 TDETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGL-----------RGQ 2630 2640 2650 2660 2670 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KE2 SKNKIIADADATVKNLEQEADRLIDKL-----KPIKELEDNLKKNISEIKELINQARKQA . .. . :: .:..::. .:. :: . ... :. .:....::: ::: : CCDS33 DLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAA 2680 2690 2700 2710 2720 2730 2150 2160 2170 2180 2190 pF1KE2 NSIKVSVSSGGDC---IRTYKPEIKKGSYNNIVVNVK-------TAVADNLLFYLGSAKF ...:: .. .: .:: . ..:. . .. .. : ...:.:: . CCDS33 SKVKVPMKFNGRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQA 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2200 2210 2220 2230 2240 2250 pF1KE2 I-DFLAIEMRKGKVSFLWDVGSGVGRVEYPDLTIDDSYWYRIVASRTGRNGTISVRALDG :.... .: :: .....: . : : : ... . .:: . : .:: . CCDS33 TGDYMGVSLRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGEQF-AAVSLDRTLQFGHMSVTV--- 2800 2810 2820 2830 2840 2260 2270 2280 2290 2300 pF1KE2 PKASIVPSTHHSTSPPGYT-ILDVDANAMLF-VGGLTGKLKKADAVRVITFTGCMGETYF . ... :. .: :: .:.. . ..: ::: . . .: . ::. . CCDS33 -ERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTL 2850 2860 2870 2880 2890 2900 2310 2320 2330 2340 2350 2360 pF1KE2 DNKPIGLWNF-REKEGDC---KGCTVSPQVED---SEGTIQFDGEGYALVSRPIRWYPNI ... ..:.:: : . : . :. : .. : ..:. .:: :.: .: . .: CCDS33 NEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSY-LDGTGFARIS----FDSQI 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2370 2380 2390 2400 2410 pF1KE2 STVM-FK--FRTFSSSALLMYLATRDLRDFMSVELTDGHIKVSYDLGSGMASVVSNQ--- ::. :. .: : :..:..: .. .:. . . .: . . ::.:.:. ..: : CCDS33 STTKRFEQELRLVSYSGVLFFL--KQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPP 2970 2980 2990 3000 3010 2420 2430 2440 2450 2460 2470 pF1KE2 --NHNDGKWKSFTLSRIQKQANISIVDIDTNQEENIATSSSGNNFGLDLKADDKIYFGGL . . . : :. .:.. . . :. . : .: ::. : :.::. CCDS33 PLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRV-------ERATVYSVEQDN---DLELADAYYLGGV 3020 3030 3040 3050 3060 2480 2490 2500 2510 2520 2530 pF1KE2 PTLRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNILSSPDYVGVTKGCSLENVY--TVSF : . : . . ::.: :. . : :. . .::. ::. . . ...: CCDS33 PPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIK-ALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTF 3070 3080 3090 3100 3110 3120 2540 2550 2560 2570 2580 pF1KE2 PKPGFVEL--SPV-PIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSGGTPAPPRRKRRQTGQAYYVI ::..: : : :. .. ...: . ..:... CCDS33 HGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLR 3130 3140 3150 3160 3170 3180 2590 2600 2610 2620 2630 2640 pF1KE2 LLNRGRLEVHLSTGARTMRKIVIRPEPNLFHDGREHSVHVERTRGIFTVQVDENRRYMQN CCDS33 TEVKTQAGFADGAPHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLG 3190 3200 3210 3220 3230 3240 >>CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs109|chr1 (1609 aa) initn: 952 init1: 264 opt: 1309 Z-score: 709.9 bits: 145.2 E(33420): 3.3e-33 Smith-Waterman score: 2341; 36.2% identity (60.6% similar) in 1090 aa overlap (7-1060:20-1031) 10 20 30 40 pF1KE2 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLA :: .: ... : .:: . .. .. :: . : .: : CCDS13 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEG-GRPQRCM-PEFVNAA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 SNALITTNATCGEKGPEMYCKLVEHVPGQPVRNPQCRICNQNSSNPNQRHPITNAIDGKN :. .... ::: :: :: . : : . .:..:. ...:. .: . : .: CCDS13 FNVTVVATNTCGTP-PEEYC-VQTGVTGV---TKSCHLCD--AGQPHLQHGAAFLTDYNN 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 ----TWWQSPSIKNGIEY-HYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNW-ILERSLDDV ::::: .. :..: ...:: : ..:.:.:: .: .: :: .. : .:. .: CCDS13 QADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTS-RPESFAIYKRTREDG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 EYKPWQYHAVTDTECLTLYNIYPRTGPPSYAKDDEVICTSFYSKIHPLENGEIHISLING . :.::.. . : . :. : . . .....::. .: : :: .:.. .: ..: CCDS13 PWIPYQYYSGS---CENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 RPSAD--DPSPELLEFTSARYIRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDPIVTRRYYYSVK :::: : :: : :...: ::. ..:. :.. ... :: : . :::... CCDS13 RPSAYNFDNSPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFN---------DPKVLKSYYYAIS 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 DISVGGMCICYGHARACPLDPATNKSRCECEHNTCGDSCDQCCPGFHQKPWRAGTFLTKT :..::: : : ::: : . .: :.:.::: : .:..: : :...::: .: . . CCDS13 DFAVGGRCKCNGHASEC-MKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESAS 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 ECEACNCHGKAEECYYDENVARRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQNTAGINCETCTDGFFR :: :.:.:...:::.: .. : . :. :: : :: .:: : .:: : ..::: CCDS13 ECLPCDCNGRSQECYFDPELYRST------GH---GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 PKGVSPNYPRPCQPCHCDPIGSLNEVCVKDEKHARRGLAPGSCHCKTGFGGVSCDRCARG .. : . :. :::.:.:::. : : . : : :: : : .:::: : CCDS13 ---LGNN--EACSSCHCSPVGSLSTQC--D--------SYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPG 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 YTGYPD--CKACNCSGLGSKNE-DPCFGPCICKENVEGGDCSRCKSGFFNLQEDNWKGCD . . . :. :.:. :: .: . : :.::.:::: .: ::: :::::. .: .:: CCDS13 FHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCT 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 ECFCSGVSNRCQSSYWTYGKIQDMSGWYLTDLPGRIRVAPQQDDLDSPQQISISNAEARQ ::: : :. : .. :. . ..:. . : : : : :.: .. . : :. . 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CCDS13 VSVPLIAQGNSY--PSE--TTVKYV----FRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIK 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 LQITYSFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTDGSIAAAVEVCQCPPGYTGSSCESCWPRHRRV .. ::: . :..:.: :: : : :. :: : :: :: :. :: : .:: CCDS13 IRGTYS--ERSAGYLDDVTLASA--RPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRE 660 670 680 690 700 710 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 NGTIFGGI--CEPCQCFGHAESCDDVTGECLNCKDHTGGPYCDKCLPGFYGEPTKGTSED . .. : : : : ::.:.:: :: : ::.:.:.::.:.:: :.::. : ::: : CCDS13 TPNL-GPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSD 720 730 740 750 760 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 CQPCACPLNIPSNNFSPTCHLDRSLGLICDGCPVGYTGPRCERCAEGYFGQPSVPGGS-- :::: :: . : : .. ..: .::.: :: ::: : .::::.: .: CCDS13 CQPCPCPGG-SSCAVVP-----KTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVR 770 780 790 800 810 820 870 880 890 900 910 pF1KE2 -CQPCQCNDNLDFSIPGSCDSLSGSCLICKPGTTGRYCELCADGYFGDAV---DAKNCQP :. :::.::.: . :.:. :.: :: : .:.: ::. : ::.::. . : .:. CCDS13 LCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKA 830 840 850 860 870 880 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 CRCNAGGSFSE--VCHSQTGQCECRANVQGQRCDKCKAGTFGLQSARGCVPCNCNSFGSK : :: :.... :. :::::: .: :: : : : ..:::..:: :.:...:: CCDS13 CNCNLYGTMKQQSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGST 890 900 910 920 930 940 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE2 SFDCE-ESGQCWCQPGVTGKKCDRCAHGYFNFQEGGCTACECSHLGN---NCDPKTGRCI . .:. ..::: ::::.::..:.:: ..:.: :: :.: :. .: ::: CCDS13 NGQCDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDD-GRCE 950 960 970 980 990 1000 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE2 CPPNTIGEKCSKCAPNTWGHSITTGCKACNCSTVGSLDFQCNVNTGQCNCHPKFSGAKCT : . .:..:..: : . . ::. : CCDS13 CREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 >>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs109|chr7 (1786 aa) initn: 1236 init1: 342 opt: 1056 Z-score: 575.6 bits: 120.5 E(33420): 9.9e-26 Smith-Waterman score: 1785; 30.5% identity (53.7% similar) in 1128 aa overlap (92-1062:90-1182) 70 80 90 100 110 pF1KE2 GPEMYCKLVEHVPGQPVRNPQCRICNQNSSNPNQRHPITNAI-----DGKNTWWQSPSIK ::.. : : :.. . . :::: . CCDS57 KPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDS-HLIENVVTTFAPNRLKIWWQS---E 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NGIEYHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWILERSLDDVEYKPWQYHAVTDTEC ::.: ::: :::. :.....:. . .. ::. ..::: : : : . .: CCDS57 NGVEN--VTIQLDLEAEFHFTHLIM-TFKTFRPAAMLIERSSD--FGKTWGVYRYFAYDC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LTLYNIYPRTGPPSYAKDDEVICTSFYSKIHPLENGEIHISLINGRPSADDP-SPELLEF . . ::: . : :..:: : :: :.: .::. . .. . .:: ::.. .. CCDS57 EASFPGIS-TGP--MKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNL 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TSARYIRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDPIVTRRYYYSVKDISVGGMCICYGHARA . .:..: ...::. .:. : : . ..:::.: :. : : :.::::: CCDS57 LKITNLRIKFVKLHTLGDNLL-----DSRM---EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASE 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE2 C-PLDPATNK------SRCECEHNTCGDSCDQCCPGFHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHG : :.: ... ..: :.::: : .:. : .:. ::: . ... :. :::. CCDS57 CAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNE 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 KAEECYYDENVARRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQNTAGINCETCTDGFFRPKGVSPNYP .. :..: ... . ..:::: .: .:: : ::: : ... . : CCDS57 HSISCHFD-------MAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDP 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 RPCQPCHCDPIGSLNE-VCVKDEKHARRGLAPGSCHCKTGFGGVSCDRCARGYTGYPD-- :. : ::: :: :: .: . :: :.:.:: . : :: : .:. . CCDS57 NFCERCTCDPAGSQNEGIC-DSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSED 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 pF1KE2 ---CKACNCSGLGS-KNEDPC---FGPCICKENVEGGDCSRCKSGFFNLQEDNWKGCDEC ::.: :. ::. . .:: : : ::. : : :..: ..:..: :: : CCDS57 PFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSND-LDGCRPC 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 FCS---GVSNRC-----QSSYWTY--GKIQDM--SGWYLTDL-------------PGRIR :. ...: : : : . :. . :.:.. : :: CCDS57 DCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSI 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 pF1KE2 VAPQ--QDDLDSPQQISISNAEARQAL-------PHSYYWSAPAPYLGNKLPAVGGQLTF : : :: . : .. . : :.:. .. : .:: . .. CCDS57 VERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEP-QLPDHWEKAVI 580 590 600 610 620 610 620 630 pF1KE2 TI---------SYDLEEEEEDTERVLQL-----MIIL-------EGNDLSIS------TA :. : . .: ..:..: ...: .:.. .. :. CCDS57 TVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTS 630 640 650 660 670 680 640 650 660 670 680 pF1KE2 QDEVYLHPSEEHTNVLLLKE----ESFTIHGTHFPVRRK------EFMTVLANLKRVLLQ .: : ...:. . ::. :. : . . . : : . :. CCDS57 SDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKT 690 700 710 720 730 740 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 ITYSFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTD--GSIAAAVEV----CQCPPGYTGSSCESCWPR . . :: .:.. ..... : ::.... . ::: :. .: .:. : : CCDS57 PMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPG 750 760 770 780 790 800 750 pF1KE2 ------------HRRVNGTI-------------FGGI-----------------CEPCQC . ...:.. : :. :.:::: CCDS57 TFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQC 810 820 830 840 850 860 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 FGHAESCDDVTGECLNCKDHTGGPYCDKCLPGFYGEPTKGTSEDCQPCACPLNIPSN-NF :::..:: ::::::::.:.: : :..:: :.::.: :... :.:: :: . :. .: CCDS57 NGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQF 870 880 890 900 910 920 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 SPTCHLDR-SLGLICDGCPVGYTGPRCERCAEGYFGQPSVPGGSCQPCQCNDNLDFSIPG . .:. : .: : : : :: : ::. :: ::::.:: :::::::::..:.: . : CCDS57 ARSCYQDPVTLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPE 930 940 950 960 970 980 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 SCDSLSGSCLICKPGTTGRYCELCADGYFGDAVDAKNCQPCRCNAGGSFSEVCHSQ---- .::. .: :: : : :..:..: ::.:::.. ..:. : :: :. .: :... CCDS57 ACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALQ-QDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQC 990 1000 1010 1020 1030 1040 940 950 960 970 980 pF1KE2 ---TGQCECRANVQGQRCDKCKAGTFGLQSARGCVPCNCNSFGSKSFDCEE-SGQCWCQP :::: : :: :: ::.: .:. : :. :: :::::. : . .:.: .::: :.: CCDS57 DKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 GVTGKKCDRCAHGYFNFQEGGCTACECSHLG---NNCDPKTGRCICPPNTIGEKCSKCAP : :. :..: . ... . : ::.:. : .:: .::.:.: .. : .:.:: CCDS57 GFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKC-- 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 NTWGHS-ITTGCKACN-CSTVGSLDFQCNVNTGQCNCHPKFSGAKCTECSRGHWNYPRCN : :.: . : :. : CCDS57 -TRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVE 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs109|chr1 (4391 aa) initn: 1519 init1: 626 opt: 951 Z-score: 515.6 bits: 110.7 E(33420): 2.2e-22 Smith-Waterman score: 2049; 30.7% identity (50.7% similar) in 1445 aa overlap (291-1524:278-1668) 270 280 290 300 310 pF1KE2 KDPREIDPIVTRRYYYSVKDISVGGMCICYGHARACPLDP---ATNKSRC-----ECE-H : .: : : : ...: :. . CCDS30 LVETTSLPPRPETTIMRQPPVTHAPQPLLPGSVRPLPCGPQEAACRNGHCIPRDYLCDGQ 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 pF1KE2 NTCGDSCDQ--CCPGFHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHGKAEECYYDENVARRNLSLNI- . : :. :. : : : . . : : .: : .: : . :. : CCDS30 EDCEDGSDELDCGP---PPPCEPNEF----PCGNGHCALKLWRCDGDFDCEDRTDEANCP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 --RGKYIGGGVCINCTQNT----AGINCET---CTD-----GFFRPKGVSPNYPRPC-QP : . . : . . :.... :...:. : : : . :. :.: :: : CCDS30 TKRPEEVCGPTQFRCVSTNMCIPASFHCDEESDCPDRSDEFGCMPPQVVTP--PRESIQA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 CH-------CDPIGSLNEVCVKDEKHARRGLAPG----SCHCKTGFGGVSCDRCARGYTG . : :: . . . . : :. . . : : . .. : CCDS30 SRGQTVTFTCVAIGVPTPII---NWRLNWGHIPSHPRVTVTSEGGRGTLIIRDVKESDQG 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 YPDCKACNCSGLGSKNEDPCFG-PCICKENV-EGGDCSRCKSGFFNLQEDNWKGCDECFC :.: : :. :: : : : . : : .: : :... .: ::: CCDS30 AYTCEAMNARGM-------VFGIPDGVLELVPQRGPCP---DGHFYLEHSA--ACLPCFC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 SGVSNRCQSSYWTYGKIQ-------DMSGWYLT--DLPGRIRVAPQQDDLD-SPQQISIS :... :::. .:. :..: .: :: .. : ..: : ..... CCDS30 FGITSVCQSTRRFRDQIRLRFDQPDDFKGVNVTMPAQPGTPPLSSTQLQIDPSLHEFQLV 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 NAEARQALPHSYYWSAPAPYLGNKLPAVGGQLTFTISYDLEEEEEDTERVLQLMIILEGN . .:. : :. .:. : .::::. . ::.: ... :.: . : : . ..: : CCDS30 DL-SRRFLVHDSFWALPEQFLGNKVDSYGGSLRYNVRYELARGM--LEPVQRPDVVLMGA 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 DLSISTAQDEVYLHPSEEHTNVLLLKEESFTIHGTHFPVRRKEFMTVLANLKRVLLQITY . .. .. .:. . . ..:: . .: . ::.: :.. :: .:. ::.: .: CCDS30 GYRL-LSRGHTPTQPGALNQRQVQFSEEHW-VHESGRPVQRAELLQVLQSLEAVLIQTVY 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 SFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTDGSIAAAVEVCQCPPGYTGSSCESCWPRHRRVNGTIF . : .. ::.. ....:.. :. . : .:: :.:: ::.: ::::: . :: : . CCDS30 NTKMASV-GLSDIAMDTTVTHATSHGRAHSVEECRCPIGYSGLSCESCDAHFTRVPGGPY 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 GGICEPCQCFGHAESCDDVTGECLNCKDHTGGPYCDKCLPGFYGEPTKGTSEDCQPCACP : : :.: ::: ::: : :.::::. .: :: :.:: ::.:. :.:. .:.:: :: CCDS30 LGTCSGCNCNGHASSCDPVYGHCLNCQHNTEGPQCNKCKAGFFGDAMKATATSCRPCPCP 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 LNIPSNNFSPTCHLDRSLGLICDGCPVGYTGPRCERCAEGYFGQPSVPGGSCQPCQCNDN : :: :: :: . ::.: :::: ::: :: :: :.: :::.:.: . .. CCDS30 YIDASRRFSDTCFLDTDGQATCDACAPGYTGRRCESCAPGYEGNPIQPGGKCRPVN-QEI 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 LDFSIPGSCDSLSGSCLICKPGTTGRYCELCADGYFGDAV-DAKNCQPCRC--------- . . :: . . .: :: ...:: :. :::: : .. . .: : : CCDS30 VRCDERGSMGTSGEACR-CKNNVVGRLCNECADGSFHLSTRNPDGCLKCFCMGVSRHCTS 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 ---------------------NA------------------------------------- :: CCDS30 SSWSRAQLHGASEEPGHFSLTNAASTHTTNEGIFSPTPGELGFSSFHRLLSGPYFWSLPS 940 950 960 970 980 990 930 940 pF1KE2 ----------GGS--FSEVCHSQTGQCECRAN----VQG--------------------- :: :. . .:: :. ... .:: CCDS30 RFLGDKVTSYGGELRFTVTQRSQPGSTPLHGQPLVVLQGNNIILEHHVAQEPSPGQPSTF 1000 1010 1020 1030 1040 1050 950 960 970 980 pF1KE2 ---------QRCDKCKA------------GTFGLQSARGCVPCNCNSFGSKSFDC---EE :: : : :. .... . : . : :.: :: CCDS30 IVPFREQAWQRPDGQPATREHLLMALAGIDTLLIRASYAQQPAESRVSGI-SMDVAVPEE 1060 1070 1080 1090 1100 1110 990 1000 1010 1020 pF1KE2 SGQ--------CWCQPGVTGKKCDRCAHGYF----NFQEGGCTACECSHLGNNCDPKTGR .:: : : :: : .:. : :: .. : : : : .. :.:.:: CCDS30 TGQDPALEVEQCSCPPGYRGPSCQDCDTGYTRTPSGLYLGTCERCSCHGHSEACEPETGA 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 CI-CPPNTIGEKCSKCAPNTWGHS---ITTGCKACNC---STVGSLDFQCNVNT-GQ--C : : .: : .: .: :. .: . :. : : ..:. : ..: :. : CCDS30 CQGCQHHTEGPRCEQCQPGYYGDAQRGTPQDCQLCPCYGDPAAGQAAHTCFLDTDGHPTC 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 N-CHPKFSGAKCTECSRGHWNYPRCNL-C--DCFLPGTDATTCDSETKKCSCSDQTGQCT . : : :: .: .:. :... : . : : .:: . .:: . . : : .::: CCDS30 DACSPGHSGRHCERCAPGYYGNPSQGQPCQRDSQVPGPIGCNCDPQGSVSSQCDAAGQCQ 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 CKVNVEGIHCDRCRPGKFGLDAKNPLGCSSCYCFGTTTQCSEA---KGLIRTWVTLKAEQ ::..:::. :..::: .: :.:.:: :: :.:.: : ::. . . :: : . : CCDS30 CKAQVEGLTCSHCRPHHFHLSASNPDGCLPCFCMGITQQCASSAYTRHLISTHFAPGDFQ 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 TILPLVDEALQHTTTKGIVFQHPEIVAHMDLMR-EDLHLEPFYWKLPEQFEGKKLMAYGG . . . .. : . : :: :.... .: : :::.::: ..: :. :::: CCDS30 GFALVNPQRNSRLTGEFTVEPVPEG-AQLSFGNFAQLGHESFYWQLPETYQGDKVAAYGG 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 KLKYAIYFEAREETGFSTYNPQVIIRGGTPTHARIIVRHMAAPLIGQLTR-HEIEMTEKE ::.:.. . : . : .:.: : :.. :.. : : : .:: . :. CCDS30 KLRYTLSYTAGPQ-GSPLSDPDVQITGNN-----IMLVASQPALQGPERRSYEIMFREEF 1420 1430 1440 1450 1460 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 WKYYGDDPRVHRTVTREDFLDILYDIHYILIKATYGNFMRQSRISEISMEVAEQGRGTTM :. .: .::: .: : :. .::.::... . :: .:.:::. : . CCDS30 WRRPDGQP-----ATREHLLMALADLDELLIRATFSSVPLAASISAVSLEVAQP--GPSN 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 TPPADLIEKCDCPLGYSGLSCEACLPGFYRLRSQPGGRTPGPTLGTCVPCQCNGHSSLCD : : .:.: :: :: ::::. : ::. : : : :: : :.:::::.:: CCDS30 RPRALEVEECRCPPGYIGLSCQDCAPGYTRTGS-------GLYLGHCELCECNGHSDLCH 1530 1540 1550 1560 1570 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE2 PETSICQNCQHHTAGDFCERCALGYYG-IVKGLPNDCQQCACPLISSSNNFSPSCVAEGL :::. :..:::..::.::: :: :::: . : :.::: ::::: . : :: .: . : CCDS30 PETGACSQCQHNAAGEFCELCAPGYYGDATAGTPEDCQPCACPLTNPENMFSRTCESLGA 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE2 DDYRCTACPRGYEGQYCERCAPGYTGSPGNPGGSCQECECDPYGSLPVPCDPVTGFCTCR :::::: :: :::::.:.:::.:.:. ::.: CCDS30 GGYRCTACEPGYTGQYCEQCGPGYVGNPSVQGGQCLPETNQAPLVVEVHPARSIVPQGGS 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE2 PGATGRKCDGCKHWHAREGWECVFCGDECTGLLLGDLARLEQMVMSINLTGPLPAPYKML CCDS30 HSLRCQVSGSPPHYFYWSREDGRPVPSGTQQRHQGSELHFPSVQPSDAGVYICTCRNLHQ 1700 1710 1720 1730 1740 1750 >>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs109|chr3 (1798 aa) initn: 1072 init1: 331 opt: 927 Z-score: 507.4 bits: 107.9 E(33420): 6.2e-22 Smith-Waterman score: 1771; 30.5% identity (52.8% similar) in 1169 aa overlap (92-1170:102-1195) 70 80 90 100 110 pF1KE2 GPEMYCKLVEHVPGQPVRNPQCRICNQNSSNPNQRHPITNAIDG-----KNTWWQSPSIK ::.. : : :.. . . .:::: . CCDS27 GPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHS-HRIQNVVTSFAPQRRAAWWQS---E 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NGIEYHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWILERSLDDVEYKPWQYHAVTDTEC ::: ::: :::. :.....:. . .. ::. ..::: : . :. . . .: CCDS27 NGIPA--VTIQLDLEAEFHFTHLIM-TFKTFRPAAMLVERSAD--FGRTWHVYRYFSYDC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LTLYNIYPRTGPPSYAKDDEVICTSFYSKIHPLENGEIHISLINGRPSADDP-SPELLEF . . : .:: . :.:.: : ::.:.: .::. ... :: : .. .. 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CCDS34 APLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPG--FARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTI 570 580 590 600 610 620 620 630 640 650 pF1KE2 E---EEEEDTERVLQLMIILEGNDLSI--STAQDEVYLHPSEEHTNVLLLK-------EE : . .. ..:... :.. .: :.. : ..:: . CCDS34 AIHYETQSAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDV 630 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 pF1KE2 SFTIHGTHF--PVRRKEFMT--VLANLKRVLLQITY--SF----GMDAIFRLSSVNLESA ...: ..: :.. . ::.. .. ::. .: .: . :.. :: CCDS34 QYSID-VYFSQPLQGESHAHSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEIASA 690 700 710 720 730 740 710 720 730 740 pF1KE2 VSYPT-DG-------SIAAAVE----VCQC-PPGYTGSSCE------SCWPR------HR .. . : :..: .. .:.: : : .:::: .: : : CCDS34 MGPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDR 750 760 770 780 790 800 750 760 770 780 790 pF1KE2 RVNGTIFGGI--CEPCQCF--GHAES-CDDVTGECLNCKDHTGGPYCDKCLPGFYGEPTK .:. : :.::.: : .. ::.:::.: :. ...: ::.:: :..: :. 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