Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2532
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2532, 1927 aa
1>>>pF1KE2532 1927 - 1927 aa - 1927 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9990+/-0.00111; mu= 20.5179+/- 0.067
mean_var=70.0148+/-13.826, 0's: 0 Z-trim(103.0): 19 B-trim: 441 in 1/49
Lambda= 0.153278
statistics sampled from 7201 (7207) to 7201 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2178.1 LCT gene_id:3938|Hs108|chr2 (1927) 13219 2933.4 0
CCDS10220.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15 ( 567) 1413 322.6 2.8e-87
CCDS61678.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15 ( 394) 995 230.1 1.3e-59
CCDS3451.1 KLB gene_id:152831|Hs108|chr4 (1044) 894 207.9 1.7e-52
CCDS9347.1 KL gene_id:9365|Hs108|chr13 (1012) 805 188.2 1.4e-46
>>CCDS2178.1 LCT gene_id:3938|Hs108|chr2 (1927 aa)
initn: 13219 init1: 13219 opt: 13219 Z-score: 15781.1 bits: 2933.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13219; 99.9% identity (100.0% similar) in 1927 aa overlap (1-1927:1-1927)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MELSWHVVFIALLSFSCWGSDWESDRNFISTAGPLTNDLLHNLSGLLGDQSSNFVAGDKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MELSWHVVFIALLSFSCWGSDWESDRNFISTAGPLTNDLLHNLSGLLGDQSSNFVAGDKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 MYVCHQPLPTFLPEYFSSLHASQITHYKVFLSWAQLLPAGSTQNPDEKTVQCYRRLLKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MYVCHQPLPTFLPEYFSSLHASQITHYKVFLSWAQLLPAGSTQNPDEKTVQCYRRLLKAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KTARLQPMVILHHQTLPASTLRRTEAFADLFADYATFAFHSFGDLVGIWFTFSDLEEVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KTARLQPMVILHHQTLPASTLRRTEAFADLFADYATFAFHSFGDLVGIWFTFSDLEEVIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ELPHQESRASQLQTLSDAHRKAYEIYHESYAFQGGKLSVVLRAEDIPELLLEPPISALAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ELPHQESRASQLQTLSDAHRKAYEIYHESYAFQGGKLSVVLRAEDIPELLLEPPISALAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DTVDFLSLDLSYECQNEASLRQKLSKLQTIEPKVKVFIFNLKLPDCPSTMKNPASLLFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 DTVDFLSLDLSYECQNEASLRQKLSKLQTIEPKVKVFIFNLKLPDCPSTMKNPASLLFSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FEAINKDQVLTIGFDINEFLSCSSSSKKSMSCSLTGSLALQPDQQQDHETTDSSPASAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 FEAINKDQVLTIGFDINEFLSCSSSSKKSMSCSLTGSLALQPDQQQDHETTDSSPASAYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RVWEAFANQSRAERDAFLQDTFPEGFLWGASTGAFNVEGGWAEGGRGVSIWDPRRPLNTT
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RIWEAFANQSRAERDAFLQDTFPEGFLWGASTGAFNVEGGWAEGGRGVSIWDPRRPLNTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EGQATLEVASDSYHKVASDVALLCGLRAQVYKFSISWSRIFPMGHGSSPSLPGVAYYNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EGQATLEVASDSYHKVASDVALLCGLRAQVYKFSISWSRIFPMGHGSSPSLPGVAYYNKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IDRLQDAGIEPMATLFHWDLPQALQDHGGWQNESVVDAFLDYAAFCFSTFGDRVKLWVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 IDRLQDAGIEPMATLFHWDLPQALQDHGGWQNESVVDAFLDYAAFCFSTFGDRVKLWVTF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HEPWVMSYAGYGTGQHPPGISDPGVASFKVAHLVLKAHARTWHHYNSHHRPQQQGHVGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 HEPWVMSYAGYGTGQHPPGISDPGVASFKVAHLVLKAHARTWHHYNSHHRPQQQGHVGIV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LNSDWAEPLSPERPEDLRASERFLHFMLGWFAHPVFVDGDYPATLRTQIQQMNRQCSHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LNSDWAEPLSPERPEDLRASERFLHFMLGWFAHPVFVDGDYPATLRTQIQQMNRQCSHPV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 AQLPEFTEAEKQLLKGSADFLGLSHYTSRLISNAPQNTCIPSYDTIGGFSQHVNHVWPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 AQLPEFTEAEKQLLKGSADFLGLSHYTSRLISNAPQNTCIPSYDTIGGFSQHVNHVWPQT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 SSSWIRVVPWGIRRLLQFVSLEYTRGKVPIYLAGNGMPIGESENLFDDSLRVDYFNQYIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SSSWIRVVPWGIRRLLQFVSLEYTRGKVPIYLAGNGMPIGESENLFDDSLRVDYFNQYIN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 EVLKAIKEDSVDVRSYIARSLIDGFEGPSGYSQRFGLHHVNFSDSSKSRTPRKSAYFFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EVLKAIKEDSVDVRSYIARSLIDGFEGPSGYSQRFGLHHVNFSDSSKSRTPRKSAYFFTS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 IIEKNGFLTKGAKRLLPPNTVNLPSKVRAFTFPSEVPSKAKVVWEKFSSQPKFERDLFYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 IIEKNGFLTKGAKRLLPPNTVNLPSKVRAFTFPSEVPSKAKVVWEKFSSQPKFERDLFYH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 GTFRDDFLWGVSSSAYQIEGAWDADGKGPSIWDNFTHTPGSNVKDNATGDIACDSYHQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GTFRDDFLWGVSSSAYQIEGAWDADGKGPSIWDNFTHTPGSNVKDNATGDIACDSYHQLD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 ADLNMLRALKVKAYRFSISWSRIFPTGRNSSINSHGVDYYNRLINGLVASNIFPMVTLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ADLNMLRALKVKAYRFSISWSRIFPTGRNSSINSHGVDYYNRLINGLVASNIFPMVTLFH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 WDLPQALQDIGGWENPALIDLFDSYADFCFQTFGDRVKFWMTFNEPMYLAWLGYGSGEFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 WDLPQALQDIGGWENPALIDLFDSYADFCFQTFGDRVKFWMTFNEPMYLAWLGYGSGEFP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 PGVKDPGWAPYRIAHAVIKAHARVYHTYDEKYRQEQKGVISLSLSTHWAEPKSPGVPRDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PGVKDPGWAPYRIAHAVIKAHARVYHTYDEKYRQEQKGVISLSLSTHWAEPKSPGVPRDV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 EAADRMLQFSLGWFAHPIFRNGDYPDTMKWKVGNRSELQHLATSRLPSFTEEEKRFIRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EAADRMLQFSLGWFAHPIFRNGDYPDTMKWKVGNRSELQHLATSRLPSFTEEEKRFIRAT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 ADVFCLNTYYSRIVQHKTPRLNPPSYEDDQEMAEEEDPSWPSTAMNRAAPWGTRRLLNWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ADVFCLNTYYSRIVQHKTPRLNPPSYEDDQEMAEEEDPSWPSTAMNRAAPWGTRRLLNWI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 KEEYGDIPIYITENGVGLTNPNTEDTDRIFYHKTYINEALKAYRLDGIDLRGYVAWSLMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KEEYGDIPIYITENGVGLTNPNTEDTDRIFYHKTYINEALKAYRLDGIDLRGYVAWSLMD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 NFEWLNGYTVKFGLYHVDFNNTNRPRTARASARYYTEVITNNGMPLAREDEFLYGRFPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NFEWLNGYTVKFGLYHVDFNNTNRPRTARASARYYTEVITNNGMPLAREDEFLYGRFPEG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 FIWSAASAAYQIEGAWRADGKGLSIWDTFSHTPLRVENDAIGDVACDSYHKIAEDLVTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 FIWSAASAAYQIEGAWRADGKGLSIWDTFSHTPLRVENDAIGDVACDSYHKIAEDLVTLQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 NLGVSHYRFSISWSRILPDGTTRYINEAGLNYYVRLIDTLLAASIQPQVTIYHWDLPQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NLGVSHYRFSISWSRILPDGTTRYINEAGLNYYVRLIDTLLAASIQPQVTIYHWDLPQTL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 QDVGGWENETIVQRFKEYADVLFQRLGDKVKFWITLNEPFVIAYQGYGYGTAAPGVSNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QDVGGWENETIVQRFKEYADVLFQRLGDKVKFWITLNEPFVIAYQGYGYGTAAPGVSNRP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 GTAPYIVGHNLIKAHAEAWHLYNDVYRASQGGVISITISSDWAEPRDPSNQEDVEAARRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GTAPYIVGHNLIKAHAEAWHLYNDVYRASQGGVISITISSDWAEPRDPSNQEDVEAARRY
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 VQFMGGWFAHPIFKNGDYSEVMKTRIRDRSLAAGLNKSRLPEFTESEKRRINGTYDFFGF
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VQFMGGWFAHPIFKNGDYNEVMKTRIRDRSLAAGLNKSRLPEFTESEKRRINGTYDFFGF
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 NHYTTVLAYNLNYATAISSFDADRGVASIADRSWPDSGSFWLKMTPFGFRRILNWLKEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NHYTTVLAYNLNYATAISSFDADRGVASIADRSWPDSGSFWLKMTPFGFRRILNWLKEEY
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 NDPPIYVTENGVSQREETDLNDTARIYYLRTYINEALKAVQDKVDLRGYTVWSAMDNFEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NDPPIYVTENGVSQREETDLNDTARIYYLRTYINEALKAVQDKVDLRGYTVWSAMDNFEW
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 ATGFSERFGLHFVNYSDPSLPRIPKASAKFYASVVRCNGFPDPATGPHACLHQPDAGPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ATGFSERFGLHFVNYSDPSLPRIPKASAKFYASVVRCNGFPDPATGPHACLHQPDAGPTI
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 SPVRQEEVQFLGLMLGTTEAQTALYVLFSLVLLGVCGLAFLSYKYCKRSKQGKTQRSQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SPVRQEEVQFLGLMLGTTEAQTALYVLFSLVLLGVCGLAFLSYKYCKRSKQGKTQRSQQE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 LSPVSSF
:::::::
CCDS21 LSPVSSF
>>CCDS10220.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15 (567 aa)
initn: 1362 init1: 592 opt: 1413 Z-score: 1680.5 bits: 322.6 E(32554): 2.8e-87
Smith-Waterman score: 1661; 48.6% identity (76.1% similar) in 486 aa overlap (1363-1843:25-506)
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE2 GLYHVDFNNTNRPRTARASARYYTEVITNNGMPLAREDEFLYGRFPEGFIWSAASAAYQI
: : .: : :: :: :: :...:.:::
CCDS10 MKPVWVATLLWMLLLVPRLGAARKGSP--EEASFYYGTFPLGFSWGVGSSAYQT
10 20 30 40 50
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE2 EGAWRADGKGLSIWDTFSHTPL-RVENDAIGDVACDSYHKIAEDLVTLQNLGVSHYRFSI
:::: :::: ::::.:.:. .: .. .:::::.:.:. ::.. :..: :.:::::.
CCDS10 EGAWDQDGKGPSIWDVFTHSGKGKVLGNETADVACDGYYKVQEDIILLRELHVNHYRFSL
60 70 80 90 100 110
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 SWSRILPDGT-TRYINEAGLNYYVRLIDTLLAASIQPQVTIYHWDLPQTLQ-DVGGWENE
:: :.:: : .. .:. :...: :::.::...: : ::..:::::: :: :::.:
CCDS10 SWPRLLPTGIRAEQVNKKGIEFYSDLIDALLSSNITPIVTLHHWDLPQLLQVKYGGWQNV
120 130 140 150 160 170
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 TIVQRFKEYADVLFQRLGDKVKFWITLNEPFVIAYQGYGYGTAAPGVSNRPGTAPYIVGH
.... :..::.. :. .::.:: :::...: ..: .:: : :::.. : ::. : ..:
CCDS10 SMANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPRAMAEKGYETGHHAPGLKLR-GTGLYKAAH
180 190 200 210 220 230
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 NLIKAHAEAWHLYNDVYRASQGGVISITISSDWAEPRDPSNQEDVEAARRYVQFMGGWFA
..:::::.::: :: ..:..: :...:... ::.:: : :: .:.:::.::.:: ::::
CCDS10 HIIKAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNCDWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFA
240 250 260 270 280 290
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 HPIFKNGDYSEVMKTRIRDRSLAAGLNKSRLPEFTESEKRRINGTYDFFGFNHYTTVLAY
.::. ::: .::: : .: ::. :::: :. .:: :.:: ::.:..:.::
CCDS10 NPIYA-GDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRLPVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYIT
300 310 320 330 340 350
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 NLNYATAIS-SFDADRGVASIADRSWPDSGSFWLKMTPFGFRRILNWLKEEYNDPPIYVT
. :: . . :.. :: . ..: .::: :: :: .:.::::.::. . .:.::::::
CCDS10 ERNYPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGSKWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVM
360 370 380 390 400 410
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 ENGVSQREE-TDLNDTARIYYLRTYINEALKAVQDKVDLRGYTVWSAMDNFEWATGFSER
:::.::. . :.: : :: ::. :::: :::..: ....::: :: .:.::: :.:.:
CCDS10 ENGASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLKAIKDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDR
420 430 440 450 460 470
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 FGLHFVNYSDPSLPRIPKASAKFYASVVRCNGFPDPATGPHACLHQPDAGPTISPVRQEE
.:...:...: . :: ::::...: ... ::::.:
CCDS10 YGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIANGFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAE
480 490 500 510 520 530
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 VQFLGLMLGTTEAQTALYVLFSLVLLGVCGLAFLSYKYCKRSKQGKTQRSQQELSPVSSF
CCDS10 PLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLMLLLRRQS
540 550 560
>>CCDS61678.1 LCTL gene_id:197021|Hs108|chr15 (394 aa)
initn: 939 init1: 539 opt: 995 Z-score: 1183.5 bits: 230.1 E(32554): 1.3e-59
Smith-Waterman score: 1122; 47.5% identity (76.4% similar) in 335 aa overlap (1511-1843:1-333)
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE2 LAASIQPQVTIYHWDLPQTLQDVGGWENETIVQRFKEYADVLFQRLGDKVKFWITLNEPF
... :..::.. :. .::.:: :::...:
CCDS61 MANYFRDYANLCFEAFGDRVKHWITFSDPR
10 20 30
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE2 VIAYQGYGYGTAAPGVSNRPGTAPYIVGHNLIKAHAEAWHLYNDVYRASQGGVISITISS
..: .:: : :::.. : ::. : ..:..:::::.::: :: ..:..: :...:...
CCDS61 AMAEKGYETGHHAPGLKLR-GTGLYKAAHHIIKAHAKAWHSYNTTWRSKQQGLVGISLNC
40 50 60 70 80
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KE2 DWAEPRDPSNQEDVEAARRYVQFMGGWFAHPIFKNGDYSEVMKTRIRDRSLAAGLNKSRL
::.:: : :: .:.:::.::.:: ::::.::. ::: .::: : .: ::. :::
CCDS61 DWGEPVDISNPKDLEAAERYLQFCLGWFANPIYA-GDYPQVMKDYIGRKSAEQGLEMSRL
90 100 110 120 130 140
1670 1680 1690 1700 1710
pF1KE2 PEFTESEKRRINGTYDFFGFNHYTTVLAYNLNYATAIS-SFDADRGVASIADRSWPDSGS
: :. .:: :.:: ::.:..:.:: . :: . . :.. :: . ..: .::: ::
CCDS61 PVFSLQEKSYIKGTSDFLGLGHFTTRYITERNYPSRQGPSYQNDRDLIELVDPNWPDLGS
150 160 170 180 190 200
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KE2 FWLKMTPFGFRRILNWLKEEYNDPPIYVTENGVSQREE-TDLNDTARIYYLRTYINEALK
:: .:.::::.::. . .:.:::::: :::.::. . :.: : :: ::. :::: ::
CCDS61 KWLYSVPWGFRRLLNFAQTQYGDPPIYVMENGASQKFHCTQLCDEWRIQYLKGYINEMLK
210 220 230 240 250 260
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE2 AVQDKVDLRGYTVWSAMDNFEWATGFSERFGLHFVNYSDPSLPRIPKASAKFYASVVRCN
:..: ....::: :: .:.::: :.:.:.:...:...: . :: ::::...: ... :
CCDS61 AIKDGANIKGYTSWSLLDKFEWEKGYSDRYGFYYVEFNDRNKPRYPKASVQYYKKIIIAN
270 280 290 300 310 320
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KE2 GFPDPATGPHACLHQPDAGPTISPVRQEEVQFLGLMLGTTEAQTALYVLFSLVLLGVCGL
:::.:
CCDS61 GFPNPREVESWYLKALETCSINNQMLAAEPLLSHMQMVTEIVVPTVCSLCVLITAVLLML
330 340 350 360 370 380
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CCDS34 AERFLQFEIAWFAEPLFKTGDYPAAMREYIASKH-RRGLSSSALPRLTEAERRLLKGTVD
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CCDS34 FCALNHFTT--RFVMHEQLAGSRYDSDRDIQFLQDITRLSSPTR-LAVIPWGVRKLLRWV
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CCDS34 RRNYGDMDIYITASGIDDQALED--DRLRKYYLGKYLQEVLKAYLIDKVRIKGYYA----
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CCDS34 --FKLAEEKSKPRFGFFTSDFK-------AKSSIQFYNKVISSRGFPFENSSSRCSQTQE
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CCDS34 NTECTVCLFLVQKKPLIFLGCCFFST-----LVLLLSIAIFQRQKRRKFWKAKNLQHIPL
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1920
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CCDS34 KKGKRVVS
1040
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CCDS93 FLWAVGSAAYQTEGGWQQHGKGASIWDTFTHHPLAPPGDSRNASLPLGAPSPLQPATGDV
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CCDS93 ASDSYNNVFRDTEALRELGVTHYRFSISWARVLPNGSAGVPNREGLRYYRRLLERLRELG
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CCDS93 VQPVVTLYHWDLPQRLQDAYGGWANRALADHFRDYAELCFRHFGGQVKYWITIDNPYVVA
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CCDS93 WHGYATGRLAPGIRGSPRLGYLVAHNLLLAHAKVWHLYNTSFRPTQGGQVSIALSSHWIN
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CCDS93 PRRM-TDHSIKECQKSLDFVLGWFAKPVFIDGDYPESMKNNL----------SSILPDFT
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CCDS93 ESEKKFIKGTADFFALCF---------GPTLSFQLLDPHMKFRQLESPN-----------
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CCDS93 --LRQLLSWIDLEFNHPQIFIVENGWFVSGTTKRDDAKYMYYLKKFIMETLKAIKLDGVD
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CCDS93 VIGYTAWSLMDGFEWHRGYSIRRGLFYVDFLSQDKMLLPKSSALFYQKLIEKNGFPPLPE
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CCDS93 YCVDFAAIQPQIALLQEMHVTHFRFSLDWALILPLGNQSQVNHTILQYYRCMASELVRVN
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CCDS93 ITPVVALWQPMAPNQGLPRLLARQGAWENPYTALAFAEYARLCFQELGHHVKLWITMNEP
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CCDS93 ALWQPMAPNQGLPRLLARQGAWENPYTALAFAEYARLCFQELGHHVKLWITMNEPYT---
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]