FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2538, 2564 aa 1>>>pF1KE2538 2564 - 2564 aa - 2564 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0937+/-0.00123; mu= -9.2297+/- 0.073 mean_var=395.1857+/-82.454, 0's: 0 Z-trim(113.0): 55 B-trim: 917 in 2/51 Lambda= 0.064517 statistics sampled from 13598 (13645) to 13598 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.419), width: 16 Scan time: 8.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2749.2 SETD2 gene_id:29072|Hs108|chr3 (2564) 17186 1615.7 0 CCDS33940.1 NSD2 gene_id:7468|Hs108|chr4 (1365) 706 81.6 3.1e-14 CCDS43729.1 NSD3 gene_id:54904|Hs108|chr8 (1437) 672 78.4 2.9e-13 CCDS4413.1 NSD1 gene_id:64324|Hs108|chr5 (2427) 660 77.4 9.8e-13 CCDS4412.1 NSD1 gene_id:64324|Hs108|chr5 (2696) 660 77.5 1.1e-12 CCDS1113.2 ASH1L gene_id:55870|Hs108|chr1 (2964) 649 76.5 2.4e-12 >>CCDS2749.2 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: ::..:..: ::.:. .: :.:.... .:.:::: ::: ::::::::.::::: CCDS33 YVGELIDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCQPNCETL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KE2 KWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIR ::::::. :::.:.. .:.:.::::.:... :.: : ::..:: :.:: . ..: CCDS33 KWTVNGDTRVGLFAVCDIPAGTELTFNYNLDCLGNEKTVCRCGASNCSGFLGDRPKTSTT 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KE2 AA----GGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQKLTC . : : ::. :.. . .:. .. : . .: .:.. .: .. : .:.: CCDS33 LSSEEKGKKTKKKTRRRRAKGEGKRQSEDECFR-CGDGGQLVLCDR---KFCTKAYHLSC 1220 1230 1240 1250 1260 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KE2 LELIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNM : : CCDS33 LGLGKRPFGKWECPWHHCDVCGKPSTSFCHLCPNSFCKEHQDGTAFSCTPDGRSYCCEHD 1270 1280 1290 1300 1310 1320 >>CCDS43729.1 NSD3 gene_id:54904|Hs108|chr8 (1437 aa) initn: 742 init1: 587 opt: 672 Z-score: 351.6 bits: 78.4 E(32554): 2.9e-13 Smith-Waterman score: 672; 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VNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFYMLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCNPNC 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KE2 ETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRV :::::::::..:::.:. .:.: ::::.:... :. .: ::. :: :.:: . . 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CCDS44 DENPCGIDSECINRMLLYECHPTVCPAGGRCQNQCFSKRQYPEVEIFRTLQRGWGLRTKT 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 DLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNI-HYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFM :. .. :: :: ::..:..: .::.. ::....: ..:...: .:.:::: ::: .::: CCDS44 DIKKGEFVNEYVGELIDEEECRARIR-YAQEHDITNFYMLTLDKDRIIDAGPKGNYARFM 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 NHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRG :: :.::::::::.:::. :::.:. . . .:.::::.:... :. : ::. :: : CCDS44 NHCCQPNCETQKWSVNGDTRVGLFALSDIKAGTELTFNYNLECLGNGKTVCKCGAPNCSG 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 YLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRK--KDSVDGELEALMENGEGLS--DKNQVLSLSR--- .:: . . . :. : :: .... : ..::. :. : .: : .:..: .. CCDS44 FLGVRPKNQPIATEEKSKKFKKKQQGKRRTQGEITKERED-ECFSCGDAGQLVSCKKPGC 1820 1830 1840 1850 1860 1750 1760 1770 1780 pF1KE2 -LMVRIETLEQ------KLTC----LELIQN---THSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAEL . . . :. : : .. . . . : .:: ..: ..:.: ..: CCDS44 PKVYHADCLNLTKRPAGKWECPWHQCDICGKEAASFCEMCPSSFCKQHREGMLFI--SKL 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE2 GDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPPLSEGDGYSSE ::: : :: : : :: ... . ::. : :. CCDS44 -DGRLS----------CTEHDPCGP-NPLEPGEIREYVP---------PPVPLPPGPST- 1930 1940 1950 1960 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE2 NTSRAHTPLNTPDPSTKLSTEADTDTPKKLMFRRLKIISENSMDSAISDATSELEGKDGK . .. : . . : :.: . .:: . : . . : .. . . . . :: :.. CCDS44 HLAEQSTGMAAQAP--KMSDKPPADTNQMLSLSK-KALAGTCQRPLLPE--RPLERTDSR 1970 1980 1990 2000 2010 2020 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KE2 -EDLDQLENVPVEEEEELQSQQLLPQQLPECKVDSETNIEASKLPTSEPEADAEIEPKES . ::..... .::.:. .: : .: . . . : . . :. : CCDS44 PQPLDKVRDL---AGSGTKSQSLVSSQRP---LDRPPAVAGPR-PQLSDKPSPVTSPSSS 2030 2040 2050 2060 2070 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KE2 NGTK---LEEPINEETPSQDEEEGVSDVESERSQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEV ... ::.:.. : :. :.. : : : ... ... : : CCDS44 PSVRSQPLERPLGTADPRLDKSIGAA---SPRPQ-----SLEKTSVPTGL---------- 2080 2090 2100 2110 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KE2 YRIPKKSQTEKENTTTERGRDAVGFRDQTPAPKTPNRSRERDPDKQTQN-KEKRKRRSSL :.: .. . ..: :.: .: .. . .: .: :.. CCDS44 -RLPPPDRL---------------LITSSPKPQTSDRPTDKPHASLSQRLPPPEKVLSAV 2120 2130 2140 2150 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KE2 SPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQKQQQQM : :.. :: :. .: .... . . : :. ... :. .. ... : .. CCDS44 VQTLVAKEKAL-RPVDQ-NTQSKNRAALVMDLIDLTPRQK----ERAASPHQVTPQADEK 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KE2 QNLGMTSPLPYDSLGYNAPHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPA . . .: : : : . : : : : :: . ..::. .:: :: . 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CCDS44 DENPCGIDSECINRMLLYECHPTVCPAGGRCQNQCFSKRQYPEVEIFRTLQRGWGLRTKT 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 DLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNI-HYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFM :. .. :: :: ::..:..: .::.. ::....: ..:...: .:.:::: ::: .::: CCDS44 DIKKGEFVNEYVGELIDEEECRARIR-YAQEHDITNFYMLTLDKDRIIDAGPKGNYARFM 1970 1980 1990 2000 2010 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 NHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRG :: :.::::::::.:::. :::.:. . . .:.::::.:... :. : ::. :: : CCDS44 NHCCQPNCETQKWSVNGDTRVGLFALSDIKAGTELTFNYNLECLGNGKTVCKCGAPNCSG 2020 2030 2040 2050 2060 2070 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 YLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRK--KDSVDGELEALMENGEGLS--DKNQVLSLSR--- .:: . . . :. : :: .... : ..::. :. : .: : .:..: .. CCDS44 FLGVRPKNQPIATEEKSKKFKKKQQGKRRTQGEITKERED-ECFSCGDAGQLVSCKKPGC 2080 2090 2100 2110 2120 2130 1750 1760 1770 1780 pF1KE2 -LMVRIETLEQ------KLTC----LELIQN---THSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAEL . . . :. : : .. . . . : .:: ..: ..:.: ..: CCDS44 PKVYHADCLNLTKRPAGKWECPWHQCDICGKEAASFCEMCPSSFCKQHREGMLFI--SKL 2140 2150 2160 2170 2180 2190 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE2 GDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPPLSEGDGYSSE ::: : :: : : :: ... . ::. : :. CCDS44 -DGRLS----------CTEHDPCGP-NPLEPGEIREYVP---------PPVPLPPGPST- 2200 2210 2220 2230 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE2 NTSRAHTPLNTPDPSTKLSTEADTDTPKKLMFRRLKIISENSMDSAISDATSELEGKDGK . .. : . . : :.: . .:: . : . . : .. . . . . :: :.. CCDS44 HLAEQSTGMAAQAP--KMSDKPPADTNQMLSLSK-KALAGTCQRPLLPE--RPLERTDSR 2240 2250 2260 2270 2280 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KE2 -EDLDQLENVPVEEEEELQSQQLLPQQLPECKVDSETNIEASKLPTSEPEADAEIEPKES . ::..... .::.:. .: : .: . . . : . . :. : CCDS44 PQPLDKVRDL---AGSGTKSQSLVSSQRP---LDRPPAVAGPR-PQLSDKPSPVTSPSSS 2290 2300 2310 2320 2330 2340 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KE2 NGTK---LEEPINEETPSQDEEEGVSDVESERSQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEV ... ::.:.. : :. :.. : : : ... ... : : CCDS44 PSVRSQPLERPLGTADPRLDKSIGAA---SPRPQ-----SLEKTSVPTGL---------- 2350 2360 2370 2380 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KE2 YRIPKKSQTEKENTTTERGRDAVGFRDQTPAPKTPNRSRERDPDKQTQN-KEKRKRRSSL :.: .. . ..: :.: .: .. . .: .: :.. CCDS44 -RLPPPDRL---------------LITSSPKPQTSDRPTDKPHASLSQRLPPPEKVLSAV 2390 2400 2410 2420 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KE2 SPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQKQQQQM : :.. :: :. .: .... . . : :. ... :. .. ... : .. CCDS44 VQTLVAKEKAL-RPVDQ-NTQSKNRAALVMDLIDLTPRQK----ERAASPHQVTPQADEK 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KE2 QNLGMTSPLPYDSLGYNAPHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPA . . .: : : : . : : : : :: . ..::. .:: :: . CCDS44 MPVLESSSWPA-SKGLG--HMPRA-VEKG----CVSDPLQ-TSGKA--AAPSEDPWQAVK 2490 2500 2510 2520 2530 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KE2 PYDHAQPLVGHSTEPLSAPPPVPVVPHVAAPVEVSSSQYVAQSDGVVHQDSS-VAVLPVP .:. : .. . : . . ...: .: . . ..:: :.:.: .. :. .: CCDS44 SLTQARLLSQPPAKAFLYEPTTQASGRASAGAEQTPGP-LSQSPGLVKQAKQMVGGQQLP 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2270 2280 2290 2300 2310 pF1KE2 APGPVQGQNYSVWDSNQQSVSVQQQ--YSPAQSQATIYYQGQTC---PTVYGVTSPYSQT : . .::.. . :. .... . :: .. .. : : : : : CCDS44 ALAAKSGQSFRSLGKAPASLPTEEKKLVTTEQSPWALGKASSRAGLWPIVAGQTLAQSCW 2600 2610 2620 2630 2640 2650 2320 2330 2340 2350 2360 2370 pF1KE2 TPPIVQSYAQPSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPAAAVTTIVAPGQPQPLQPSEMVVTNNL . .:. :: . .:: CCDS44 SAGSTQTLAQTCWSLGRGQDPKPEQNTLPALNQAPSSHKCAESEQK 2660 2670 2680 2690 >>CCDS1113.2 ASH1L gene_id:55870|Hs108|chr1 (2964 aa) initn: 463 init1: 281 opt: 649 Z-score: 335.2 bits: 76.5 E(32554): 2.4e-12 Smith-Waterman score: 657; 27.0% identity (51.8% similar) in 786 aa overlap (1014-1718:1570-2309) 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 RGEGGHVHTSDDSEVVFSSCDLNLTMEDSDGVTYALKCDSSGHAPEIVSTVHEDYSGSSE :. :. : : .: . . .: . CCDS11 CPHLSPSKSLINREEQWVHREPSESSPLALGLQTPLQIDCSESSPSL------SLGGFTP 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 SSNDESDSEDTDSDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHYSDHWED .:. :..: :. :.: :... :..: :: . :.:. : . CCDS11 NSEPASSDEHTNLFTSAIGSCRVSN----PNSSGRKKLTDSP-GLFSAQDTSLNRLH-RK 1600 1610 1620 1630 1640 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 ERLESRRHLYEEKFESIASKACPQTDKFFLHKG-------TEKNPEISFTQSSRKQIDNR : : : :. ...:.. : .:: . . :.: :.:. . . .: CCDS11 ESLPSN----ERAVQTLAGSQ-PTSDKPSQRPSESTNCSPTRKRSSSESTSSTVNGVPSR 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 LPELSHPQSDGVDSTSHTDVKSDPLGHPNSEETVKAKIPSRQQEELPIYSSDFEDVPNKS :.: .:.::: . :... . :... : : . . : :: :..: CCDS11 SPRLVASGDDSVDSLLQRMVQNED--QEPMEKSIDAVIATASA---PPSSS-----PGRS 1710 1720 1730 1740 1750 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE2 WQQTTFQNRPDSRLGKTELS-------------FSSSCEIPHVDGLHSSEELRNLGWDFS .. ..::: : . : ..::: :. :. . CCDS11 HSKDRTLGKPDSLLVPAVTSDSCNNSISLLSEKLTSSCSPHHIKRSVVEAMQRQARKMCN 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 QEKPSTTYQQPDSSYGACGGHKYQQNAEQYGGTRDYWQGNGYWDPRSGRP---PGTGVV- .: .: .. : ..: :..:. ::.. : ::: : .:: CCDS11 YDKILATKKNLDHVNKILKAKKLQRQART---------GNNFVKRRPGRPRKCPLQAVVS 1820 1830 1840 1850 1860 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 ---YDRTQ-----------GQV----PDSLTDDRE----------EEENWDQQDGSHFSD .. .: : . ::..:: : :... .. : . . CCDS11 MQAFQAAQFVNPELNRDEEGAALHLSPDTVTDVIEAVVQSVNLNPEHKKGLKRKGWLLEE 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE2 QSDKFLLSL------QKDKGSVQAP-EISSNSIKDTLAVNEKKDFSK--NLEKNDIKDRG :. : : ...:. .:: :: : : . . .. .. .: . : CCDS11 QTRKKQKPLPEEEEQENNKSFNEAPVEIPSPSETPAKPSEPESTLQPVLSLIPREKKPPR 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE2 PLKKRRQE--IESD----SESDGELQDRKKVRVEVEQGET--SVPPGSALVGPSCVMD-- : ::. :. . :: .. ..: . :: ..: :: .. :. :: . CCDS11 PPKKKYQKAGLYSDVYKTTDPKSRLIQLKKEKLEYTPGEHEYGLFPAPIHVGKYLRQKRI 1990 2000 2010 2020 2030 2040 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE2 DFRDPQ----RWK--ECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSK ::. : .:: . :. .: : :. :::. : . :.: . CCDS11 DFQLPYDILWQWKHNQLYKKPDVPLY-KKIRSNVYV----DVKPLSGYEATTCNCKKPDD 2050 2060 2070 2080 2090 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KE2 DERAQGEIACGEDCLNRLLMIECS-SRCPNGDYCSNRRFQRKQHAD-VEVILTEKKGWGL : : .: : .:::::... ::: . :: :. : :.:.::.. .. .: . .:.::::. CCDS11 DTR-KG---CVDDCLNRMIFAECSPNTCPCGEQCCNQRIQRHEWVQCLERFRAEEKGWGI 2100 2110 2120 2130 2140 2150 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 RAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCS :. . : .. :..:: :::....::. :. : .:.. :: . : . .::. . :: . 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