Result of FASTA (omim) for
pF1KE2551
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2551, 630 aa
1>>>pF1KE2551 630 - 630 aa - 630 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7443+/-0.00046; mu= 22.6882+/- 0.029
mean_var=70.2553+/-14.301, 0's: 0 Z-trim(109.8): 100 B-trim: 285 in 1/50
Lambda= 0.153015
statistics sampled from 17911 (18011) to 17911 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 9.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001036 (OMIM: 164230,182138,607834) sodium-depe ( 630) 4285 955.8 0
NP_001034 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent n ( 617) 2089 471.1 5.2e-132
NP_001165972 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependen ( 617) 2089 471.1 5.2e-132
XP_011521597 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 628) 2089 471.1 5.3e-132
NP_001165975 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependen ( 628) 2089 471.1 5.3e-132
XP_006721326 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 628) 2089 471.1 5.3e-132
NP_001035 (OMIM: 126455,188890,613135) sodium-depe ( 620) 2065 465.8 2.1e-130
XP_011519312 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 614) 1756 397.5 7e-110
NP_001116319 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 1756 397.5 7e-110
NP_001116320 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 1756 397.5 7e-110
NP_003035 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-depe ( 614) 1756 397.5 7e-110
NP_001193860 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 1756 397.5 7e-110
NP_057699 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-depe ( 602) 1733 392.5 2.3e-108
NP_055044 (OMIM: 607952) sodium- and chloride-depe ( 632) 1733 392.5 2.4e-108
NP_005620 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chlori ( 635) 1727 391.2 6e-108
XP_005253805 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 571) 1719 389.4 1.9e-107
XP_005253804 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 610) 1713 388.1 5e-107
XP_006719068 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 570) 1712 387.8 5.6e-107
XP_011532327 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
XP_005265468 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
XP_005265467 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
NP_003033 (OMIM: 137165,616421) sodium- and chlori ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
XP_006713369 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
XP_016862560 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
XP_016862561 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
XP_011532329 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1699 385.0 4.2e-106
XP_011532332 (OMIM: 186854) PREDICTED: sodium- and ( 620) 1656 375.5 3.1e-103
NP_003034 (OMIM: 186854) sodium- and chloride-depe ( 620) 1656 375.5 3.1e-103
XP_006713370 (OMIM: 186854) PREDICTED: sodium- and ( 649) 1656 375.5 3.2e-103
NP_001127839 (OMIM: 186854) sodium- and chloride-d ( 721) 1656 375.5 3.5e-103
NP_055043 (OMIM: 606205) sodium-dependent proline ( 636) 1655 375.3 3.7e-103
NP_001165973 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependen ( 512) 1638 371.4 4.2e-102
XP_011521600 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 395) 1455 330.9 5.1e-90
XP_016865259 (OMIM: 606205) PREDICTED: sodium-depe ( 555) 1436 326.9 1.2e-88
NP_001136278 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 520) 1364 310.9 6.9e-84
NP_001136277 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 625) 1342 306.2 2.3e-82
XP_011519314 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 483) 1334 304.3 6.5e-82
XP_016875333 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 394) 1310 298.9 2.2e-80
XP_011521602 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 376) 1271 290.3 8.3e-78
XP_011521601 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 376) 1271 290.3 8.3e-78
XP_016874033 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 505) 1222 279.6 1.9e-74
NP_001305298 (OMIM: 604159,614618) sodium- and chl ( 563) 1222 279.6 2e-74
NP_004202 (OMIM: 604159,614618) sodium- and chlori ( 797) 1222 279.8 2.6e-74
XP_016874034 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 450) 1214 277.8 5.8e-74
XP_011532335 (OMIM: 607952) PREDICTED: sodium- and ( 381) 1212 277.3 7e-74
NP_001248309 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 637) 1207 276.4 2.2e-73
XP_011519315 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440) 1186 271.6 4.1e-72
XP_011519316 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440) 1186 271.6 4.1e-72
NP_001177926 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-d ( 510) 1186 271.6 4.6e-72
XP_016875330 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 426) 1153 264.3 6.3e-70
>>NP_001036 (OMIM: 164230,182138,607834) sodium-dependen (630 aa)
initn: 4285 init1: 4285 opt: 4285 Z-score: 5110.8 bits: 955.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4285; 100.0% identity (100.0% similar) in 630 aa overlap (1-630:1-630)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 METTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 METTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLHSTSPAEEFYTRHVLQIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLHSTSPAEEFYTRHVLQIH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRIC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 WVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIIT
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE2 PGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV
610 620 630
>>NP_001034 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent norad (617 aa)
initn: 1655 init1: 766 opt: 2089 Z-score: 2491.0 bits: 471.1 E(85289): 5.2e-132
Smith-Waterman score: 2089; 52.6% identity (81.4% similar) in 555 aa overlap (79-626:56-607)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYI
:::::::.::::::.:.::::.:::::::.
NP_001 RARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYL
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 CYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICII
::.:::::::.:::.. :..:.::::::::::::.:.: ..: ::::.:::.:::. .:
NP_001 CYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVW-KICPFFKGVGYAVILI
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 AFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTN------YFSEDNITWTL
:.:.. :::.:.::.::::.:::: .::::.: ..::. :::. .. ..
NP_001 ALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 HSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVW
.. .:: ::: : ::..:.:.:..:.: .::: ::.:.. :.:::.::::::::::::
NP_001 YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVW
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFG
.:::.::..: ::::.:.::::: :. ::. .. .: :. ::::::.::::::: :::
NP_001 ITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFG
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 VLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAG
::.::::::::.::::.:::.:: .::.:::::::.::..:::::. .. .. .:: . :
NP_001 VLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATE-G
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRR
.:.:: : :::... .:::.:..::.::..:::::...:.:.:::.. :.: .: ..:
NP_001 AGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDF-QVLKRHR
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFC
. :...:... :. .: .: :: ::. ::. .:.: ..: ..:.::..::::::. .:
NP_001 KLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFS
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 RDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIG
:...:.:: :: .::.:: .:: ::::.. ... : .: .: :. .:. :.
NP_001 NDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIA
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630
pF1KE2 TSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPTE-IPCGDIRLNAV
::.. .: :. :... : :.. ::. .::::. . . :::
NP_001 LSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
570 580 590 600 610
>>NP_001165972 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent no (617 aa)
initn: 1655 init1: 766 opt: 2089 Z-score: 2491.0 bits: 471.1 E(85289): 5.2e-132
Smith-Waterman score: 2089; 52.6% identity (81.4% similar) in 555 aa overlap (79-626:56-607)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYI
:::::::.::::::.:.::::.:::::::.
NP_001 RARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYL
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 CYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICII
::.:::::::.:::.. :..:.::::::::::::.:.: ..: ::::.:::.:::. .:
NP_001 CYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVW-KICPFFKGVGYAVILI
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 AFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTN------YFSEDNITWTL
:.:.. :::.:.::.::::.:::: .::::.: ..::. :::. .. ..
NP_001 ALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 HSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVW
.. .:: ::: : ::..:.:.:..:.: .::: ::.:.. :.:::.::::::::::::
NP_001 YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVW
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFG
.:::.::..: ::::.:.::::: :. ::. .. .: :. ::::::.::::::: :::
NP_001 ITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFG
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 VLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAG
::.::::::::.::::.:::.:: .::.:::::::.::..:::::. .. .. .:: . :
NP_001 VLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATE-G
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRR
.:.:: : :::... .:::.:..::.::..:::::...:.:.:::.. :.: .: ..:
NP_001 AGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDF-QVLKRHR
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFC
. :...:... :. .: .: :: ::. ::. .:.: ..: ..:.::..::::::. .:
NP_001 KLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFS
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 RDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIG
:...:.:: :: .::.:: .:: ::::.. ... : .: .: :. .:. :.
NP_001 NDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIA
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630
pF1KE2 TSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPTE-IPCGDIRLNAV
::.. .: :. :... : :.. ::. .::::. . . :::
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NP_001 LSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQMKTRQGRRRATN
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NP_001 SCQISC
>>XP_006721326 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodium-d (628 aa)
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pF1KE2 AVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYI
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pF1KE2 AFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTN------YFSEDNITWTL
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>>NP_001035 (OMIM: 126455,188890,613135) sodium-dependen (620 aa)
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XP_011 TSPVMEFWERRVLGI--TSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]