Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2556
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2556, 1174 aa
1>>>pF1KE2556 1174 - 1174 aa - 1174 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8295+/-0.00108; mu= 1.9654+/- 0.066
mean_var=217.0947+/-43.551, 0's: 0 Z-trim(111.8): 155 B-trim: 57 in 1/50
Lambda= 0.087046
statistics sampled from 12478 (12642) to 12478 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 5.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9884.1 PTPN21 gene_id:11099|Hs108|chr14 (1174) 7908 1006.7 0
CCDS1514.1 PTPN14 gene_id:5784|Hs108|chr1 (1187) 2539 332.5 3.7e-90
CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15 ( 593) 589 87.4 1.1e-16
CCDS62381.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18 ( 865) 565 84.5 1.2e-15
CCDS62382.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18 ( 883) 565 84.5 1.2e-15
CCDS82237.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18 ( 918) 565 84.5 1.3e-15
CCDS332.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1 ( 641) 556 83.3 2e-15
CCDS11838.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18 (1087) 561 84.1 2.1e-15
CCDS47474.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6 ( 673) 553 83.0 2.8e-15
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 548 82.2 2.9e-15
CCDS59037.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6 ( 747) 553 83.0 3e-15
CCDS82236.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18 ( 756) 552 82.8 3.3e-15
CCDS56450.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6 ( 852) 553 83.0 3.4e-15
CCDS5141.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6 (1005) 553 83.0 3.9e-15
CCDS81741.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 597) 546 82.0 4.6e-15
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2 ( 926) 545 82.0 7.3e-15
CCDS331.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1 ( 588) 540 81.3 7.6e-15
CCDS53289.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1 ( 720) 541 81.5 8.3e-15
CCDS53288.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1 ( 864) 541 81.5 9.7e-15
CCDS58770.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20 ( 701) 537 80.9 1.1e-14
CCDS13272.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20 ( 779) 537 81.0 1.3e-14
CCDS58771.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20 ( 880) 537 81.0 1.4e-14
CCDS13271.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20 ( 881) 537 81.0 1.4e-14
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 525 79.6 6.1e-14
CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 353) 507 77.0 8.7e-14
CCDS11863.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 387) 507 77.1 9.4e-14
CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 415) 507 77.1 1e-13
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 505 76.9 1.6e-13
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 505 76.9 1.6e-13
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 505 76.9 1.7e-13
CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 737) 500 76.3 3e-13
CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 782) 500 76.3 3.2e-13
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 502 76.7 4.5e-13
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 500 76.6 8e-13
CCDS43350.1 EPB41L4A gene_id:64097|Hs108|chr5 ( 686) 486 74.5 9.5e-13
CCDS59133.1 FRMD3 gene_id:257019|Hs108|chr9 ( 556) 473 72.9 2.5e-12
CCDS43840.1 FRMD3 gene_id:257019|Hs108|chr9 ( 597) 473 72.9 2.6e-12
CCDS54392.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2 ( 505) 463 71.6 5.4e-12
CCDS330.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1 ( 775) 466 72.1 6e-12
CCDS54393.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2 ( 687) 463 71.7 7.1e-12
CCDS82506.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2 ( 732) 463 71.7 7.5e-12
CCDS2130.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2 ( 733) 463 71.7 7.5e-12
CCDS6776.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 913) 463 71.7 9e-12
CCDS75852.1 FRMD3 gene_id:257019|Hs108|chr9 ( 553) 451 70.1 1.7e-11
CCDS10107.2 FRMD5 gene_id:84978|Hs108|chr15 ( 570) 450 70.0 1.9e-11
CCDS9163.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 593) 445 69.4 3e-11
CCDS47096.1 PTPN13 gene_id:5783|Hs108|chr4 (2294) 454 70.8 4.3e-11
CCDS43860.1 EPB41L4B gene_id:54566|Hs108|chr9 ( 518) 439 68.6 4.5e-11
CCDS47095.1 PTPN13 gene_id:5783|Hs108|chr4 (2466) 454 70.8 4.6e-11
CCDS47094.1 PTPN13 gene_id:5783|Hs108|chr4 (2485) 454 70.8 4.7e-11
>>CCDS9884.1 PTPN21 gene_id:11099|Hs108|chr14 (1174 aa)
initn: 7908 init1: 7908 opt: 7908 Z-score: 5376.0 bits: 1006.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7908; 100.0% identity (100.0% similar) in 1174 aa overlap (1-1174:1-1174)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEFTLSVESTGQESLEAVAQRLELRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEFTLSVESTGQESLEAVAQRLELRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VTYFSLWYYNKQNQRRWVDLEKPLKKQLDKYALEPTVYFGVVFYVPSVSQLQQEITRYQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 VTYFSLWYYNKQNQRRWVDLEKPLKKQLDKYALEPTVYFGVVFYVPSVSQLQQEITRYQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YLQLKKDILEGSIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDFDQYESQDFLQKFALFPVGWLQDEKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 YLQLKKDILEGSIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDFDQYESQDFLQKFALFPVGWLQDEKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERMDGYGEESYPAKDSQGSDISIGACLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 LEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERMDGYGEESYPAKDSQGSDISIGACLEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IFVKHKNGRHPVVFRWHDIANMSHNKSFFALELANKEETIQFQTEDMETAKYIWRLCVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 IFVKHKNGRHPVVFRWHDIANMSHNKSFFALELANKEETIQFQTEDMETAKYIWRLCVAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HKFYRLNQCNLQTQTVTVNPIRRRSSSRMSLPKPQPYVMPPPPQLHYNGHYTEPYASSQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 HKFYRLNQCNLQTQTVTVNPIRRRSSSRMSLPKPQPYVMPPPPQLHYNGHYTEPYASSQD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NLFVPNQNGYYCHSQTSLDRAQIDLNGRIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQPSPMSSNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 NLFVPNQNGYYCHSQTSLDRAQIDLNGRIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQPSPMSSNPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ITGSDVMRPDYLPSHRHSAVIPPSYRPTPDYETVMKQLNRGLVHAERQSHSLRNLNIGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ITGSDVMRPDYLPSHRHSAVIPPSYRPTPDYETVMKQLNRGLVHAERQSHSLRNLNIGSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 YAYSRPAALVYSQPEIREHAQLPSPAAAHCPFSLSYSFHSPSPYPYPAERRPVVGAVSVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 YAYSRPAALVYSQPEIREHAQLPSPAAAHCPFSLSYSFHSPSPYPYPAERRPVVGAVSVP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ELTNAQLQAQDYPSPNIMRTQVYRPPPPYPPPRPANSTPDLSRHLYISSSNPDLITRRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ELTNAQLQAQDYPSPNIMRTQVYRPPPPYPPPRPANSTPDLSRHLYISSSNPDLITRRVH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 HSVQTFQEDSLPVAHSLQEVSEPLTAARHAQLHKRNSIEVAGLSHGLEGLRLKERTLSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 HSVQTFQEDSLPVAHSLQEVSEPLTAARHAQLHKRNSIEVAGLSHGLEGLRLKERTLSAS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 AAEVAPRAVSVGSQPSVFTERTQREGPEEAEGLRYGHKKSLSDATMLIHSSEEEEDEDFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 AAEVAPRAVSVGSQPSVFTERTQREGPEEAEGLRYGHKKSLSDATMLIHSSEEEEDEDFE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 EESGARAPPARAREPRPGLAQDPPGCPRVLLAGPLHILEPKAHVPDAEKRMMDSSPVRTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 EESGARAPPARAREPRPGLAQDPPGCPRVLLAGPLHILEPKAHVPDAEKRMMDSSPVRTT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 AEAQRPWRDGLLMPSMSESDLTTSGRYRARRDSLKKRPVSDLLSGKKNIVEGLPPLGGMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 AEAQRPWRDGLLMPSMSESDLTTSGRYRARRDSLKKRPVSDLLSGKKNIVEGLPPLGGMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KTRVDAKKIGPLKLAALNGLSLSRVPLPDEGKEVATRATNDERCKILEQRLEQGMVFTEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 KTRVDAKKIGPLKLAALNGLSLSRVPLPDEGKEVATRATNDERCKILEQRLEQGMVFTEY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 ERILKKRLVDGECSTARLPENAERNRFQDVLPYDDVRVELVPTKENNTGYINASHIKVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ERILKKRLVDGECSTARLPENAERNRFQDVLPYDDVRVELVPTKENNTGYINASHIKVSV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 SGIEWDYIATQGPLQNTCQDFWQMVWEQGIAIIAMVTAEEEGGREKSFRYWPRLGSRHNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 SGIEWDYIATQGPLQNTCQDFWQMVWEQGIAIIAMVTAEEEGGREKSFRYWPRLGSRHNT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 VTYGRFKITTRFRTDSGCYATTGLKMKHLLTGQERTVWHLQYTDWPEHGCPEDLKGFLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 VTYGRFKITTRFRTDSGCYATTGLKMKHLLTGQERTVWHLQYTDWPEHGCPEDLKGFLSY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LEEIQSVRRHTNSTSDPQSPNPPLLVHCSAGVGRTGVVILSEIMIACLEHNEVLDIPRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 LEEIQSVRRHTNSTSDPQSPNPPLLVHCSAGVGRTGVVILSEIMIACLEHNEVLDIPRVL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170
pF1KE2 DMLRQQRMMLVQTLCQYTFVYRVLIQFLKSSRLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 DMLRQQRMMLVQTLCQYTFVYRVLIQFLKSSRLI
1150 1160 1170
>>CCDS1514.1 PTPN14 gene_id:5784|Hs108|chr1 (1187 aa)
initn: 3257 init1: 1359 opt: 2539 Z-score: 1732.0 bits: 332.5 E(32554): 3.7e-90
Smith-Waterman score: 4164; 54.5% identity (78.5% similar) in 1210 aa overlap (3-1174:1-1187)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEFTLSVESTGQESLEAVAQRLELRE
.::::::.:::::.: ::.:.:.::.::... .: :::::::::: ::::::::::::
CCDS15 MPFGLKLRRTRRYNVLSKNCFVTRIRLLDSNVIECTLSVESTGQECLEAVAQRLELRE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VTYFSLWYYNKQNQRRWVDLEKPLKKQLDKYALEPTVYFGVVFYVPSVSQLQQEITRYQY
. ::.::. .:..: :::.:::::::.:::.: :: ..:::.::::.:: :::: :::::
CCDS15 THYFGLWFLSKSQQARWVELEKPLKKHLDKFANEPLLFFGVMFYVPNVSWLQQEATRYQY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YLQLKKDILEGSIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDFDQYESQDFLQKFALFPVGWLQDEKV
:::.:::.::: . :::.:.:.::::::::::::..:..:::::....:::. .: :
CCDS15 YLQVKKDVLEGRLRCTLDQVIRLAGLAVQADFGDYNQFDSQDFLREYVLFPMDLALEEAV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERMDGYGEESYPAKDSQGSDISIGACLEG
::: ::::: :. . :. .::..:..::::.::.:.: .:.::..:. . .: . :
CCDS15 LEELTQKVAQEHKAHSGILPAEAELMYINEVERLDGFGQEIFPVKDNHGNCVHLGIFFMG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IFVKHKNGRHPVVFRWHDIANMSHNKSFFALELANKEETIQFQTEDMETAKYIWRLCVAR
:::... ::. :..::.:..:..:::: . .:: ::::: :.:.:.:.:::: :: ..:
CCDS15 IFVRNRIGRQAVIYRWNDMGNITHNKSTILVELINKEETALFHTDDIENAKYISRLFATR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE2 HKFYRLNQ-CNLQTQTVTVNPIRRRSS-SRMSLPKPQPYVMPPPPQLHYNGHYTEPYASS
::::. :. :. :... ::::. . :: :::. :::..:: ... . ::.: . .:
CCDS15 HKFYKQNKICTEQSNSPP--PIRRQPTWSRSSLPRQQPYILPPV-HVQCGEHYSETH-TS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 QDNLFVPNQNGYYCHSQTSLDRAQIDLNGRIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQPSPMSSN
::..: :... ::.:..::: ::: . :::: :.::.:::: : ..: ::.:::
CCDS15 QDSIFHGNEEALYCNSHNSLDLNY--LNGTVTNGSVCSVHSVNSLNCSQSFIQASPVSSN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 PSITGSDVMRPDYLPSHRHSAVIPPSYRPTPDYETVMKQLNRGLVHAERQSHSLRNLNIG
:: :::.:: ::.:::::::.: :::::::::::::.:..::..:.. ::.:::::::
CCDS15 LSIPGSDIMRADYIPSHRHSAIIVPSYRPTPDYETVMRQMKRGILHTDSQSQSLRNLNII
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SSYAYSRPAALVYSQPEIREHAQLPSPAAAHCPFSLSYSFHSPSPYPYPAER----RPVV
...::..: :::::::.::. : . . . : .. ::: : . .: .
CCDS15 NTHAYNQPEDLVYSQPEMRERHPYTVPYGPQGVY--SNKLVSPSDQRNPKNNVVPSKPGA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KE2 GA----VSVPELTNAQLQ-AQDYPSPNIMRTQVYRPPPPYPPPRPANSTPDLS--RHLYI
.: ::.:::.: ::: ...: . ..... ..::::::: ::::.:::::. :: :.
CCDS15 SAISHTVSTPELANMQLQGSHNYSTAHMLKNYLFRPPPPYPRPRPATSTPDLASHRHKYV
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 SSSNPDLITRRVHHSVQTFQEDSLPVAH-SLQEVSEPLTAARH-AQLHKRNSIEVAG-LS
:.:.:::.::.:. ::.:::::: ::.: :::::::::::..: . ..::.:.:: . .
CCDS15 SGSSPDLVTRKVQLSVKTFQEDSSPVVHQSLQEVSEPLTATKHHGTVNKRHSLEVMNSMV
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 HGLEGLRLKERTLSASAAEVAPRAVSVGSQPSVFTERTQREGPEEAEGL-RYGHKKSLSD
.:.:.. :: : .: : . . : . : .:. : .: :::..::
CCDS15 RGMEAMTLKSLHLP-----MARRNTLREQGPP-----EEGSGSHEVPQLPQYHHKKTFSD
660 670 680 690 700
710 720 730 740 750
pF1KE2 ATMLIHSSEEEEDEDFEEESGARAPPARAR-----EPRPGLAQDP-------PGCPRVLL
::::::::: ::.:. :: . : : . . . .::. : :: . .
CCDS15 ATMLIHSSESEEEEEEAPESVPQIPMLREKMEYSAQLQAALARIPNKPPPEYPGPRKSVS
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800
pF1KE2 AGPLHILEPKAHVPDA--EKRMMDSSPVRTTAEAQR--PWRDGL-LMPSMSESDLTTSGR
: :. . .: .: : . :.. .:... . .. : .: : ::.:: ::: : .
CCDS15 NGALR--QDQASLPPAMARARVLRHGPAKAISMSRTDPPAVNGASLGPSISEPDLT-SVK
770 780 790 800 810
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 YRARRDSLKKRPVSDLLSGKKNIVEGLPPLGGMKKTRV---DAKKIGPLKLAALNGLSLS
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CCDS15 ERVKKEPVKERPVSEMFSLEDSIIEREMMIRNLEKQKMAGLEAQK-RPLMLAALNGLSVA
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870 880 890 900 910 920
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CCDS15 RVSGREENRVDATRVPMDERFRTLKKKLEEGMVFTEYEQIPKKK-ANGIFSTAALPENAE
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pF1KE2 RNRFQDVLPYDDVRVELVPTKENNTGYINASHIKVSVSGIEWDYIATQGPLQNTCQDFWQ
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CCDS15 RSRIREVVPYEENRVELIPTKENNTGYINASHIKVVVGGAEWHYIATQGPLPHTCHDFWQ
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CCDS15 MVWEQGVNVIAMVTAEEEGGRTKSHRYWPKLGSKHSSATYGKFKVTTKFRTDSVCYATTG
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CCDS15 LKVKHLLSGQERTVWHLQYTDWPDHGCPEDVQGFLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNRHP
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CCDS15 PIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHNEKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQ
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1170
pF1KE2 VLIQFLKSSRLI
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CCDS15 VLIQFLQNSRLI
1180
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CCDS10 HPDPFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYVNARQKQG-IYEEYEDIRRENP
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CCDS10 VGTFHCSMS--PGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTKRSGHTQTDYINASFM----DGYKQK
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CCDS10 NAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPL--EKDSRIRFG
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CCDS10 FLTVTNLGVENMNHYKKTTLEIHNTEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAASLIDFLRVV
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CCDS10 RNQQSLAVSNMGARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEELGTLNVFQTV
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CCDS10 SRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
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10 20 30
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CCDS62 S--FNVKFYPPDPAQLSEDITRYYLCLQLRDDIVSGRLPCSFVTLALLGSYTVQSELGDY
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CCDS62 DPDECGSDYISEFRFAP----NHTKELED---KVIELHKSHRGMTPAEAEMHFLENAKKL
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CCDS62 SMYGVDLHHAKDSEGVEIMLGVCASGLLI-YRDRLRINRFAWPKVLKISYKRNNFYIKIR
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280 290 300 310 320
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CCDS62 PGEFEQFESTIGFKLPNHRAAKRLWKVCVEHHTFFRLLLPEAPPKKFLTLGSKFRYSGRT
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. ... . .:: ... :
CCDS62 TGQYATTKGISQTNLITTVTPEKKAEEERDEEEDKRRKGEEVTPISAIRHEGKTDSERTD
470 480 490 500 510 520
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10 20 30
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::.:. :.. . . .. ::.. :.
CCDS62 KEQEFAARAAKQLEYQQLEDDKLSQKSSSSKLSRSPLKIVKKPKSMQCKVILLDGS--EY
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CCDS62 TCDVEKRSRGQVLFDKVCEHLNLLEKDYFGLTYRDAENQKNWLDPAKEIKKQVRSGAWHF
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CCDS62 SMYGVDLHHAKDSEGVEIMLGVCASGLLI-YRDRLRINRFAWPKVLKISYKRNNFYIKIR
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CCDS62 PGEFEQFESTIGFKLPNHRAAKRLWKVCVEHHTFFRLLLPEAPPKKFLTLGSKFRYSGRT
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CCDS62 QAQTRRASALIDRPAPYFERSSSKRYTMSRSLDGASV-NEN-HEIYMKDSMSAAEV---G
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10 20 30
pF1KE2 MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEF
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CCDS82 KEQEFAARAAKQLEYQQLEDDKLSQKSSSSKLSRSPLKIVKKPKSMQCKVILLDGS--EY
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CCDS82 TCDVEKRSRGQVLFDKVCEHLNLLEKDYFGLTYRDAENQKNWLDPAKEIKKQVRSGAWHF
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CCDS82 S--FNVKFYPPDPAQLSEDITRYYLCLQLRDDIVSGRLPCSFVTLALLGSYTVQSELGDY
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pF1KE2 DQYE-SQDFLQKFALFPVGWLQDEKVLEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERM
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CCDS82 DPDECGSDYISEFRFAP----NHTKELED---KVIELHKSHRGMTPAEAEMHFLENAKKL
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. :: . . ::::.: .: .:.: :... ... . : : . ..:.... : .
CCDS82 SMYGVDLHHAKDSEGVEIMLGVCASGLLI-YRDRLRINRFAWPKVLKISYKRNNFYIKIR
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 --ELANKEETIQFQTEDMETAKYIWRLCVARHKFYRLNQCNLQTQTVTVNPIRRRSSSRM
:. . : :: :. . ..:: .:..:: .: :.:: . . . . : :.:
CCDS82 PGEFEQFESTIGFKLPNHRAAKRLWKVCVEHHTFFRLLLPEAPPKKFLTLGSKFRYSGRT
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330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SLP--KPQPYVMPPPPQLHYNGHYTEPYASSQDNLFVPNQNGYYCHSQTSLDRAQIDLNG
. . . . : : .. .. .. : :. : :.: . . . :.. :.. :
CCDS82 QAQTRRASALIDRPAPYFERSSSKRYTMSRSLDGASV-NEN-HEIYMKDSMSAAEV---G
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pF1KE2 RIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQPSPMSSNPSITGSDVMRPDYLPSHRHSAVIPPSYRP
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CCDS82 TGQYATTKGISQTNLITTVTPEKKAEEERDEEEDKRRKGEEVTPISAIRHEGKTDSERTD
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pF1KE2 MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEFTLSVESTGQESLEAVAQRLELRE
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CCDS33 MHCKVSLLDDTVYECVVEKHAKGQDLLKRVCEHLNLLE
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CCDS33 EDYFGLAIWDNATSKTWLDSAKEIKKQVRGVPWNFT--FNVKFYPPDPAQLTEDITRYYL
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pF1KE2 YLQLKKDILEGSIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDFD-QYESQDFLQKFALFPVGWLQDEK
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CCDS33 CLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDPELHGVDYVSDFKLAP----NQTK
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pF1KE2 VLEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERMDGYGEESYPAKDSQGSDISIGACLE
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CCDS33 ELEE---KVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHKAKDLEGVDIILGVCSS
160 170 180 190 200
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pF1KE2 GIFVKHKNGRHPVVFRWHDIANMSHNKSFFAL-----ELANKEETIQFQTEDMETAKYIW
:..: .:. . : : . ..:...: : . : . : :: :. ....:: .:
CCDS33 GLLV-YKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLW
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pF1KE2 RLCVARHKFYRLNQCNL--QTQTVTVNPIRRRSSSRMSLPKPQPYVMPPPPQLHYNGHYT
..:: .: :.::.. . ... .... . : :.: . : .. : :.. .
CCDS33 KVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGS-KFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPHFERTAS
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pF1KE2 EPYASSQDNLFVPNQNGYYCHSQTSLDRAQIDLNGRIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQP
. . : :. . ... :: : .:.. .:.: .: . ...
CCDS33 KRASRSLDGA-AAVDSADRSPRPTS---APAITQGQVAEGGVLDASAKKTV---------
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pF1KE2 SPMSSNPSITGSDVMRPDYLPSHRHSAVIPPSYRPTPDYETVMKQLNRGLVHAERQSHSL
: ... .. ..: . : : . . :... : .. .:. .
CCDS33 VPKAQKETVK-AEVKKEDEPPEQAEPEPTEAWKVEKTHIEVTVPTSNGDQTQKKRERLDG
380 390 400 410 420 430
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pF1KE2 RNLNIGSSYAYSRPAALVYSQPEIREHAQLPSPAAAHCPFS-LSYSFHSPSPYPYPAERR
.:. : : . . : :: ::..: : .: :. .: : : :.:
CCDS33 ENIYIRHSNLMLED--LDKSQEEIKKH---------HASISELKKNFMESVPEPRPSEWD
440 450 460 470 480
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pF1KE2 PVVGAVSVPELTNAQLQAQDYPSPNIMRTQVYRPPPPYPPPRPANSTPDLSRHLYISSSN
... : . : . : .: ...::
CCDS33 KRLSTHSPFRTLNINGQIPTGEGPPLVKTQTVTISDNANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTI
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10 20 30
pF1KE2 MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEF
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CCDS11 KEQEFAARAAKQLEYQQLEDDKLSQKSSSSKLSRSPLKIVKKPKSMQCKVILLDGS--EY
70 80 90 100 110 120
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CCDS11 TCDVEKRSRGQVLFDKVCEHLNLLEKDYFGLTYRDAENQKNWLDPAKEIKKQVRSGAWHF
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pF1KE2 TVYFGVVFYVPSVSQLQQEITRYQYYLQLKKDILEGSIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDF
. :.: :: :. .::...:::: :::. ::. : .::.. :.. .::...::.
CCDS11 S--FNVKFYPPDPAQLSEDITRYYLCLQLRDDIVSGRLPCSFVTLALLGSYTVQSELGDY
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 DQYE-SQDFLQKFALFPVGWLQDEKVLEEATQKVALLHQKYRGLTAPDAEMLYMQEVERM
: : ..:....: . : . : ::. :: ::...::.: .::: ........
CCDS11 DPDECGSDYISEFRFAP----NHTKELED---KVIELHKSHRGMTPAEAEMHFLENAKKL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]