Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2566
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2566, 570 aa
1>>>pF1KE2566 570 - 570 aa - 570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2905+/-0.00114; mu= 13.5063+/- 0.068
mean_var=70.5637+/-13.682, 0's: 0 Z-trim(102.3): 26 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.152680
statistics sampled from 6864 (6882) to 6864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS944.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 570) 3666 817.1 0
CCDS72904.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 447) 2825 631.9 5.1e-181
CCDS60244.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 538) 2259 507.2 2.1e-143
CCDS45948.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 590) 328 81.9 2.5e-15
CCDS12181.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 593) 319 79.9 9.9e-15
CCDS62522.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 604) 319 79.9 1e-14
CCDS35146.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 ( 594) 293 74.2 5.2e-13
CCDS6874.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 ( 603) 293 74.2 5.3e-13
>>CCDS944.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 (570 aa)
initn: 3666 init1: 3666 opt: 3666 Z-score: 4362.7 bits: 817.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3666; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERIDSQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERIDSQNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELRRPKYTIYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELRRPKYTIYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NDHSSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NDHSSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RLKENLYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RLKENLYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNT
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE2 KSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
550 560 570
>>CCDS72904.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 (447 aa)
initn: 2874 init1: 2825 opt: 2825 Z-score: 3363.3 bits: 631.9 E(32554): 5.1e-181
Smith-Waterman score: 2825; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (134-570:11-447)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KSDVKSLAEADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MNVVFAVKQYPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLT
10 20 30 40
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 ALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAI
50 60 70 80 90 100
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 TPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEI
110 120 130 140 150 160
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVS
170 180 190 200 210 220
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ERNLLEVSEVEQELACQNDHSSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ERNLLEVSEVEQELACQNDHSSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSL
230 240 250 260 270 280
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PGLMMDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PGLMMDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVY
290 300 310 320 330 340
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 TQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNR
350 360 370 380 390 400
530 540 550 560 570
pF1KE2 TTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
410 420 430 440
>>CCDS60244.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 (538 aa)
initn: 2259 init1: 2259 opt: 2259 Z-score: 2688.2 bits: 507.2 E(32554): 2.1e-143
Smith-Waterman score: 2653; 86.3% identity (86.3% similar) in 505 aa overlap (37-541:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 VKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERIDSQNREIMKHL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MVYTQSEILQKEVYLFERIDSQNREIMKHL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KAICFLRPTKENVDYIIQELRRPKYTIYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVAEVQEFY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KAICFLRPTKENVDYIIQELRRPKYTIYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVAEVQ---
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKR
CCDS60 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ------QVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNR
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLE
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDHSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDHSSA
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYRKLVSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYRKLVSAV
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENL
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 YPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKRDGVS
390 400 410 420 430 440
550 560 570
pF1KE2 VLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
CCDS60 LCSPAWFRTPGLKRSTRLSLPKCWDYSFPRGSSGFWTAQPKQGELSSHIKVSEQKMKRWL
450 460 470 480 490 500
>>CCDS45948.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (590 aa)
initn: 183 init1: 112 opt: 328 Z-score: 388.7 bits: 81.9 E(32554): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 443; 23.4% identity (57.1% similar) in 576 aa overlap (23-549:29-579)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFER
:::.::. . :.: .:.:: . . . :
CCDS45 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 IDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELRRPKYTIYFIYFSNVISKSDVKSLAEAD
:... :: . :.:: .: ::.. . .: : :.:... . . :...
CCDS45 INKR-REPIPSLEAIYLLSPTEKALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGRSR
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE2 EQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNI------LGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLS
.:: ..:.. .. . ..:::. : : . :: .: ...: .
CCDS45 LAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLCAT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 LKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPL----------LLILDR
:.. : :::. . : . .::. : ..: : :. ...: : :::.::
CCDS45 LQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAV---LAK---LNAFK-ADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 CDDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYL
: ..:::.. :.:::...:: :... .. :.:. ...:: :.:..... ..
CCDS45 AADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRY-ETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHM
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 NFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGEL
..:...... .:.. : ..: .: .: :.. .....::..: . : :. .. .
CCDS45 HIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDK-ANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDC
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYAL
. . .. .. :::.:: .: ..... : .: . : .: :...:: :
CCDS45 MKHF-KGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYIL
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 HYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYR---KLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITK
. : ..: :.. .. : : .: ..:.. ::. . :. . :.. . :
CCDS45 LRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGT--SSRLEPRERMEPTY
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490
pF1KE2 QFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLG---PST-------------
:. .. : ...... .. :: .::.:... :..
CCDS45 QL-----------SRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHW
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KE2 --------LRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGV-RIVLGGTTVHNTKSFLE
: :. .::.:.::... : ..:...:.: : ....:.. . . ::.
CCDS45 HKNKAGIEARAGPR-LIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLD
520 530 540 550 560 570
550 560 570
pF1KE2 EVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
.. :
CCDS45 DLKALDKKLEDIALP
580 590
>>CCDS12181.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (593 aa)
initn: 212 init1: 112 opt: 319 Z-score: 378.0 bits: 79.9 E(32554): 9.9e-15
Smith-Waterman score: 460; 23.7% identity (58.2% similar) in 579 aa overlap (23-549:29-582)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFER
:::.::. . :.: .:.:: . . . :
CCDS12 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 IDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELR-RPKYTIY--FIYFSNVISKSDVKSLA
:... :: . :.:: .: ::...:. .:.... : .: :.:... . . :.
CCDS12 INKR-REPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE2 EADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNI------LGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTAL
.. .:: ..:.. .. . ..:::. : : . :: .: ...:
CCDS12 RSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 LLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPL----------LLI
.:.. : :::. . : . .::. : ..: : :. ...: : :::
CCDS12 CATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAV---LAK---LNAFK-ADTPSLGEGPEKTRSQLLI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANN
.:: : ..:::.. :.:::...:: :... .. :.:. ...:: :.:.....
CCDS12 MDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRY-ETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVEL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVV
....:...... .:.. : ..: .: .: :.. .....::..: . : :. ..
CCDS12 RHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDK-ANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLA
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 GELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVML
. . . .. .. :::.:: .: ..... : .: . : .: :...:
CCDS12 DDCMKHF-KGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLL
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KE2 YALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYR---KLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVA
: : . : ..: :.. .. : : .: ..:.. ::. . :. . :.. .
CCDS12 YILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGT--SSRLEPRERME
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KE2 ITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLG---PST----------
: :. .. : ...... .. :: .::.:... :..
CCDS12 PTYQL-----------SRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARF
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KE2 -----------LRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGV-RIVLGGTTVHNTKS
: :. .::.:.::... : ..:...:.: : ....:.. . .
CCDS12 GHWHKNKAGIEARAGPR-LIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTR
520 530 540 550 560 570
550 560 570
pF1KE2 FLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
::... :
CCDS12 FLDDLKALDKKLEDIALP
580 590
>>CCDS62522.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (604 aa)
initn: 195 init1: 112 opt: 319 Z-score: 377.8 bits: 79.9 E(32554): 1e-14
Smith-Waterman score: 429; 23.2% identity (57.1% similar) in 590 aa overlap (23-549:29-593)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFER
:::.::. . :.: .:.:: . . . :
CCDS62 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 IDSQNREIMKHLKAICFLRPTK-----------ENVDYIIQELR-RPKYTIY--FIYFSN
:... :: . :.:: .: ::. ..:. .:.... : .: :.:..
CCDS62 INKR-REPIPSLEAIYLLSPTEKAQAQRVIHLPQSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTD
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE2 VISKSDVKSLAEADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNI------LGCCQGRNWDPAQ
. . . :... .:: ..:.. .. . ..:::. : : . :
CCDS62 TCPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQ
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPL--
: .: ...: .:.. : :::. . : . .::. : ..: : :. ...: :
CCDS62 LEVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAV---LAK---LNAFK-ADTPSLGE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE2 --------LLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVL
:::.:: : ..:::.. :.:::...:: :... .. :.:. ...::
CCDS62 GPEKTRSQLLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRY-ETTGLSEAREKAVL
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 SAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKM
:.:..... ....:...... .:.. : ..: .: .: :.. .....::..:
CCDS62 LDEDDDLWVELRHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDK-ANIKDLSQILKKMPQYQKE
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370
pF1KE2 SGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKV
. : :. .. . . . .. .. :::.:: .: ..... : .: . :
CCDS62 LNKYSTHLHLADDCMKHF-KGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAV
360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 TEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYR---KLVSAVVEYGGKRVRG
.: :...:: : . : ..: :.. .. : : .: ..:.. ::. .
CCDS62 PAYDKIRVLLLYILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGT--
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLG---PS
:. . :.. . : :. .. : ...... .. :: .::.:... :.
CCDS62 SSRLEPRERMEPTYQL-----------SRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPT
470 480 490 500 510
500 510 520 530
pF1KE2 T---------------------LRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGV-RIV
. : :. .::.:.::... : ..:...:.: : ...
CCDS62 ASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPR-LIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVL
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570
pF1KE2 LGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
.:.. . . ::... :
CCDS62 IGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
580 590 600
>>CCDS35146.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 (594 aa)
initn: 221 init1: 102 opt: 293 Z-score: 347.0 bits: 74.2 E(32554): 5.2e-13
Smith-Waterman score: 411; 20.1% identity (55.8% similar) in 581 aa overlap (11-545:18-580)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFE
. : .. .: :::..:. . ..: ...:. . . . :
CCDS35 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGE-WKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RIDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELRRP---KYTIYFIYFSNVISKSDVKSL
:. . :: . :.:. .. :....: .:.... : :: ..:.. . . :
CCDS35 DIN-KRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE2 AEADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDP--AQ-----LSRTTQGLT
... .:. . :. .. . ...::. :. ..: :: : : .. ..
CCDS35 VKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSF-YSPHKAQMKNPILERLAEQIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 ALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPP----LLLILDRC
.: .::. : .::. . ::. ... . :. . : : ::::::
CCDS35 TLCATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDA-YKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 DDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLN
: .:.:.. :.::: ..:: :.:. . .. ::.. . :: :.:... . .
CCDS35 FDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIEND-VYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 FAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELS
.::..... ..::...: . . .. :.. .....::..: . : :. .. .
CCDS35 IAEVSQEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCM
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RLVSERNLLEVSEVEQELACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALH
. . .. .. .:::.:: .: .. .. : .: . .:. .: :...:: .
CCDS35 KHY-QGTVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 YERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLF---SPKDAVAITKQ
. . ..: :. .. . . .... ... : : : : .:. :..:
CCDS35 KNGITEENLNKLI---QHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQ
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KE2 FLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLG--------------------
. .. :.... .. :. .: . :::..
CCDS35 TYQ--------LSRWTPIIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWH
480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
pF1KE2 ----PSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEV
:. :. :. .:.:..::.. .: .:...... ....:.: . . ...:.
CCDS35 KNKAPGEYRSGPR-LIIFILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTL
530 540 550 560 570 580
550 560 570
pF1KE2 LASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
CCDS35 KKLNKTDEEISS
590
>>CCDS6874.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 (603 aa)
initn: 221 init1: 102 opt: 293 Z-score: 346.9 bits: 74.2 E(32554): 5.3e-13
Smith-Waterman score: 424; 20.5% identity (55.6% similar) in 599 aa overlap (11-563:18-594)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFE
. : .. .: :::..:. . ..: ...:. . . . :
CCDS68 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGE-WKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RIDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELRRP---KYTIYFIYFSNVISKSDVKSL
:... :: . :.:. .. :....: .:.... : :: ..:.. . . :
CCDS68 DINKR-REPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE2 AEADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDP--AQ-----LSRTTQGLT
... .:. . :. .. . ...::. :. ..: :: : : .. ..
CCDS68 VKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSF-YSPHKAQMKNPILERLAEQIA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 ALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPP----LLLILDRC
.: .::. : .::. . ::. ... . :. . : : ::::::
CCDS68 TLCATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDA-YKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 DDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLN
: .:.:.. :.::: ..:: :.:. . .. ::.. . :: :.:... . .
CCDS68 FDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIEND-VYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 FAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELS
.::..... ..::...: . . .. :.. .....::..: . : :. .. .
CCDS68 IAEVSQEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCM
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RLVSERNLLEVSEVEQELACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALH
. . .. .. .:::.:: .: .. .. : .: . .:. .: :...:: .
CCDS68 KHY-QGTVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 YERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLF---SPKDAVAITKQ
. . ..: :. .. . . .... ... : : : : .:. :..:
CCDS68 KNGITEENLNKLI---QHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQ
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KE2 FLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLG--------------------
. .. :.... .. :. .: . :::..
CCDS68 TYQ--------LSRWTPIIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWH
480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
pF1KE2 ----PSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEV
:. :. :. .:.:..::.. .: .:...... ....:.: . . .:: ..
CCDS68 KNKAPGEYRSGPR-LIIFILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPTKFLMDL
530 540 550 560 570 580
550 560 570
pF1KE2 LASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
: .:::.:.
CCDS68 R----HPDFRESSRVSFEDQAPTME
590 600
570 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 16:28:15 2016 done: Tue Nov 8 16:28:15 2016
Total Scan time: 2.250 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]