Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2575
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2575, 175 aa
1>>>pF1KE2575 175 - 175 aa - 175 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3682+/-0.000865; mu= 12.7439+/- 0.052
mean_var=76.4609+/-15.234, 0's: 0 Z-trim(106.7): 72 B-trim: 5 in 1/51
Lambda= 0.146674
statistics sampled from 9088 (9160) to 9088 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 1.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5478.1 MYL7 gene_id:58498|Hs108|chr7 ( 175) 1140 250.2 4.7e-67
CCDS43197.1 MYL5 gene_id:4636|Hs108|chr4 ( 173) 736 164.7 2.5e-41
CCDS31901.1 MYL2 gene_id:4633|Hs108|chr12 ( 166) 692 155.4 1.6e-38
CCDS10677.1 MYLPF gene_id:29895|Hs108|chr16 ( 169) 686 154.2 3.8e-38
CCDS34713.1 MYL10 gene_id:93408|Hs108|chr7 ( 226) 591 134.1 5.4e-32
CCDS11830.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 ( 171) 559 127.3 4.7e-30
CCDS77145.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 ( 177) 559 127.3 4.8e-30
CCDS11831.1 MYL12B gene_id:103910|Hs108|chr18 ( 172) 557 126.9 6.3e-30
CCDS13276.1 MYL9 gene_id:10398|Hs108|chr20 ( 172) 552 125.8 1.3e-29
CCDS33061.1 CALM3 gene_id:808|Hs108|chr19 ( 149) 296 71.6 2.4e-13
CCDS1832.1 CALM2 gene_id:805|Hs108|chr2 ( 149) 296 71.6 2.4e-13
CCDS9892.1 CALM1 gene_id:801|Hs108|chr14 ( 149) 296 71.6 2.4e-13
CCDS7069.1 CALML3 gene_id:810|Hs108|chr10 ( 149) 281 68.4 2.2e-12
>>CCDS5478.1 MYL7 gene_id:58498|Hs108|chr7 (175 aa)
initn: 1140 init1: 1140 opt: 1140 Z-score: 1317.3 bits: 250.2 E(32554): 4.7e-67
Smith-Waterman score: 1140; 100.0% identity (100.0% similar) in 175 aa overlap (1-175:1-175)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
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CCDS54 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
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CCDS54 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE2 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
130 140 150 160 170
>>CCDS43197.1 MYL5 gene_id:4636|Hs108|chr4 (173 aa)
initn: 730 init1: 714 opt: 736 Z-score: 855.4 bits: 164.7 E(32554): 2.5e-41
Smith-Waterman score: 736; 63.4% identity (89.7% similar) in 175 aa overlap (1-175:1-173)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
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CCDS43 MASRK--TKKKEGGALRAQRASSNVFSNFEQTQIQEFKEAFTLMDQNRDGFIDKEDLKDT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
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CCDS43 YASLGKTNVKDDELDAMLKEASGPINFTMFLNLFGEKLSGTDAEETILNAFKMLDPDGKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
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CCDS43 KINKEYIKRLLMSQADKMTAEEVDQMFQFASIDVAGNLDYKALSYVITHGEEKEE
120 130 140 150 160 170
>>CCDS31901.1 MYL2 gene_id:4633|Hs108|chr12 (166 aa)
initn: 716 init1: 680 opt: 692 Z-score: 805.3 bits: 155.4 E(32554): 1.6e-38
Smith-Waterman score: 692; 62.7% identity (87.0% similar) in 161 aa overlap (14-174:6-166)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
: :.: ..:::::::::.:::::::::. .::::::.: : :::.:
CCDS31 MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
.. ::.:.: .::.: :..:. ::::::::::.:::::.:.::::.::.::..::: :::
CCDS31 FAALGRVNVKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
:.. : ...: :::..:: ::.:::: : :..::.:::.: .:::::.::.
CCDS31 VLKADYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD
120 130 140 150 160
>>CCDS10677.1 MYLPF gene_id:29895|Hs108|chr16 (169 aa)
initn: 712 init1: 679 opt: 686 Z-score: 798.3 bits: 154.2 E(32554): 3.8e-38
Smith-Waterman score: 686; 58.2% identity (86.7% similar) in 165 aa overlap (11-175:4-168)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
: : . .. :::.:::::.:.:::::::::. ::::::::: : :::.:
CCDS10 MAPKRAKRRTVEGGSSSVFSMFDQTQIQEFKEAFTVIDQNRDGIIDKEDLRDT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
.. .:...: .::::::..:..::::::::::.:::::.:.:::..: .::...:: :::
CCDS10 FAAMGRLNVKNEELDAMMKEASGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEDVITGAFKVLDPEGKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
...: ...:: :: :.:: :...:.: : :..::.:::..::.::::: :..
CCDS10 TIKKKFLEELLTTQCDRFSQEEIKNMWAAFPPDVGGNVDYKNICYVITHGDAKDQE
120 130 140 150 160
>>CCDS34713.1 MYL10 gene_id:93408|Hs108|chr7 (226 aa)
initn: 719 init1: 589 opt: 591 Z-score: 687.9 bits: 134.1 E(32554): 5.4e-32
Smith-Waterman score: 623; 51.2% identity (70.4% similar) in 203 aa overlap (7-174:24-226)
10 20 30
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQ-RGSSNVFSMFEQAQIQEFKE---
: .. : :.:. .::::::::.:.:::::::
CCDS34 MLLRLVSNSWPQVILPPRPPKVLGLQAPRRARKRAEGTASSNVFSMFDQSQIQEFKESLA
10 20 30 40 50 60
40 50 60
pF1KE2 -------------------------------AFSCIDQNRDGIICKADLRETYSQLGKVS
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CCDS34 LSPRLERNGMISAHCNLCLTGSSNSPASASQAFTIMDQNRDGFIDKEDLRDTFAALGRIN
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKGVVNKDEFK
: .:::.::..:. ::::::::::.:::::.::::::.:: ::..:: ::: :. : .:
CCDS34 VKNEELEAMVKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGTDPEETILHAFKVFDTEGKGFVKADVIK
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170
pF1KE2 QLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
. :.::::.:: ::.:::: : :. ::.::..:::.::::.::.
CCDS34 EKLMTQADRFSEEEVKQMFAAFPPDVCGNLDYRNLCYVITHGEEKD
190 200 210 220
>>CCDS11830.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 (171 aa)
initn: 570 init1: 338 opt: 559 Z-score: 653.0 bits: 127.3 E(32554): 4.7e-30
Smith-Waterman score: 559; 48.6% identity (78.3% similar) in 175 aa overlap (1-175:1-170)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
:.:... :. : :. ::..::::.::.:.:::::::::. :::::::.: : ::..
CCDS11 MSSKRTKTKTK----KRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
..::: . .: ::::..:. ::::::.:::.:::::::::::..: .:: :: . :
CCDS11 LASLGK-NPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
....: ...:: :..:.:. ::.... .:.: ::..: . :. :: . ..
CCDS11 TIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD
120 130 140 150 160 170
>>CCDS77145.1 MYL12A gene_id:10627|Hs108|chr18 (177 aa)
initn: 572 init1: 338 opt: 559 Z-score: 652.8 bits: 127.3 E(32554): 4.8e-30
Smith-Waterman score: 559; 48.6% identity (78.3% similar) in 175 aa overlap (1-175:7-176)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICK
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CCDS77 MDLTTTMSSKRTKTKTK----KRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ADLRETYSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMF
::.. ..::: . .: ::::..:. ::::::.:::.:::::::::::..: .:: :
CCDS77 EDLHDMLASLGK-NPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DPSGKGVVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKE
: . :....: ...:: :..:.:. ::.... .:.: ::..: . :. :: . .
CCDS77 DEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDK
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 E
.
CCDS77 DD
>>CCDS11831.1 MYL12B gene_id:103910|Hs108|chr18 (172 aa)
initn: 561 init1: 338 opt: 557 Z-score: 650.7 bits: 126.9 E(32554): 6.3e-30
Smith-Waterman score: 557; 48.6% identity (78.3% similar) in 175 aa overlap (1-175:1-171)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
:.:.:: :. .. :. ::..::::.::.:.:::::::::. :::::::.: : ::..
CCDS11 MSSKKAKTK---TTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
..::: . . ::::..:. ::::::.:::.:::::::::::..: .:: :: . :
CCDS11 LASLGK-NPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
....: ...:: :..:.:. ::.... .:.: ::..: . :. :: . ..
CCDS11 TIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD
120 130 140 150 160 170
>>CCDS13276.1 MYL9 gene_id:10398|Hs108|chr20 (172 aa)
initn: 535 init1: 312 opt: 552 Z-score: 645.0 bits: 125.8 E(32554): 1.3e-29
Smith-Waterman score: 552; 47.4% identity (79.4% similar) in 175 aa overlap (1-175:1-171)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
:.:..: .. .. :. ::..::::.::.:.:::::::::. :::::::.: : ::..
CCDS13 MSSKRAKAK---TTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQEGKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDPSGKG
..::: . .: :..:..:. ::::::.:::.:::::::::::..: .:: :: ..:
CCDS13 LASLGK-NPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 VVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
...:....:: :..:.:. ::..:. .:.: ::..: . :. :: . ..
CCDS13 FIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD
120 130 140 150 160 170
>>CCDS33061.1 CALM3 gene_id:808|Hs108|chr19 (149 aa)
initn: 231 init1: 149 opt: 296 Z-score: 353.1 bits: 71.6 E(32554): 2.4e-13
Smith-Waterman score: 296; 35.2% identity (69.0% similar) in 142 aa overlap (31-168:7-147)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASRKAGTRGKVAATKQAQRGSSNVFSMFEQAQIQEFKEAFSCIDQNRDGIICKADLRET
. :: ::::::: .:.. :: : .: .
CCDS33 MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTV
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE2 YSQLGKVSVPEEELDAMLQE----GKGPINFTVFLTLFGEKLNGTDPEEAILSAFRMFDP
. .::. . : ::. :..: :.: :.: :::....:.. :: :: : :::.::
CCDS33 MRSLGQ-NPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDK
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SGKGVVNKDEFKQLLLTQADKFSPAEVEQMFALTPMDLAGNIDYKSLCYIITHGDEKEE
.:.: .. :..... . ..:.. ::..:. . .: :...:. . ..:
CCDS33 DGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK
100 110 120 130 140
175 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:16:35 2016 done: Fri Nov 4 18:16:36 2016
Total Scan time: 1.900 Total Display time: -0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]