FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2582, 956 aa 1>>>pF1KE2582 956 - 956 aa - 956 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4515+/-0.00107; mu= -5.5358+/- 0.064 mean_var=309.4644+/-66.052, 0's: 0 Z-trim(114.0): 31 B-trim: 902 in 3/49 Lambda= 0.072907 statistics sampled from 14791 (14821) to 14791 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.443), width: 16 Scan time: 2.360 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS44712.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs109|chr11 ( 956) 6310 677.8 2.7e-194 CCDS73368.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs109|chr11 ( 906) 5870 631.5 2.2e-180 CCDS48154.1 AMOT gene_id:154796|Hs109|chrX (1084) 1884 212.3 4.2e-54 CCDS14563.1 AMOT gene_id:154796|Hs109|chrX ( 675) 1847 208.3 4.2e-53 CCDS87138.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs109|chr3 ( 779) 1306 151.4 6.4e-36 CCDS33860.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs109|chr3 ( 780) 1306 151.4 6.4e-36 CCDS63784.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs109|chr3 ( 837) 1306 151.5 6.8e-36 CCDS63783.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs109|chr3 ( 777) 1303 151.1 8e-36 >>CCDS44712.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs109|chr11 (956 aa) initn: 6310 init1: 6310 opt: 6310 Z-score: 3601.8 bits: 677.8 E(33420): 2.7e-194 Smith-Waterman score: 6310; 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CCDS48 TEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSLSERLMQMSLATSGVKAHPPVTSAPLSPP 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 pF1KE2 ----------NGKGFKVGGGPSPAQPAGKVLDPRGPPPEYPFKTKQMMSPVSKTQEHGLF ... : . :: : : . : .. :::::::::: .: : : :: : : CCDS48 QPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHRGPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHF 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 pF1KE2 YGDQHPGMLHEMVKPYPAPQPVRTDVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQ---LPFPSTMQQ-HS :.. :.. :: ::. ..::: :::::. .:: : ::. . .: :: CCDS48 YSE------HRL------NQPGRTEGQLMRYQHPPEYGA-ARPAQDISLPLSARNSQPHS 270 280 290 300 390 400 410 pF1KE2 PMSSQTSSASGPL----------------------HSVSLPLP----LP--------MAL : :: ::..: :: ::. :: : :: . : CCDS48 PTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHFLPNQAHQGDHYRL 310 320 330 340 350 360 420 430 pF1KE2 GAP-------------------------QP---P-------PAASPS----QQLGPDAFA . : :: : : :.:: : . : :: CCDS48 SQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASYQPVPADPFA 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 IVERAQQMVEILTEENRVLHQELQGYYDNADKLHKFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESL :: :::::::::..::: :.:::.: :... .:.: : :.::.:::::.::::..:::.: CCDS48 IVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREAL 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 DKAMRNKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETANRQLSSREYEGHED-KAAEGHYASQNKEFLK .:::::::::::::.::::::::.::::::.::. .:::: :: . . .. ..::: . 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CCDS48 KEEEEILMANKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSL 730 740 750 760 770 780 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 PSIA-AATGTHSRQTSLTSSQLAEEKKEEKTWKGSIGLLLGKEHHEHASAPLLPPPPTSA ::. :..: :....::.: . :::...:.::::.:.::: ... : .: : CCDS48 MSISNAGSGLLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYR----AEYVPSTP--- 790 800 810 820 830 840 860 870 880 890 900 910 pF1KE2 LSSIASTTAASSAHAKTGSKDSSTQTDKSAELFWPSMASLPSRGRLSTTPAHSPVLKHPA : . .: :::.::::.: ::::....: CCDS48 -SPVPPSTPLLSAHSKTGSRDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATA 850 860 870 880 890 900 920 930 940 950 pF1KE2 AKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGRVSSLLHKPEFPDGEMMEVLI CCDS48 ATITTTMVAAAPVAVAAAAAPAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVA 910 920 930 940 950 960 >>CCDS14563.1 AMOT gene_id:154796|Hs109|chrX (675 aa) initn: 1713 init1: 862 opt: 1847 Z-score: 1067.0 bits: 208.3 E(33420): 4.2e-53 Smith-Waterman score: 1847; 62.1% identity (86.0% similar) in 470 aa overlap (418-884:2-462) 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 HSPMSSQTSSASGPLHSVSLPLPLPMALGAPQPPPAASPSQQLGPDAFAIVERAQQMVEI :. :... : . : :::: :::::::: CCDS14 MPRAQPSSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVEI 10 20 30 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 LTEENRVLHQELQGYYDNADKLHKFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESLDKAMRNKLEGE :..::: :.:::.: :... .:.: : :.::.:::::.::::..:::.:.:::::::::: CCDS14 LSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEGE 40 50 60 70 80 90 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 IRRLHDFNRDLRDRLETANRQLSSREYEGHED-KAAEGHYASQNKEFLKEKEKLEMELAA :::.::::::::.::::::.::. .:::: :: . . .. ..::: .:::::: :::. CCDS14 IRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELAT 100 110 120 130 140 150 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 VRTASEDHRRHIEILDQALSNAQARVIKLEEELREKQAYVEKVEKLQQALTQLQSACEKR .:...::.:::::: :::::::::.:.::::::..::.::.::::.::::.:::.::::: CCDS14 ARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEKR 160 170 180 190 200 210 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 EQMERRLRTWLERELDALRTQQKHGNGQPANMPEYNAPALLELVREKEERILALEADMTK ::.:.:::: :::::..:: ::..:: ::.:. :::: ::.::.:::::::::::::::: CCDS14 EQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMTK 220 230 240 250 260 270 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 WEQKYLEESTIRHFAMNAAATAAAERDTTIINHSRNGSYGESSLEAHIWQEEEEVVQANR ::::::::...::::..::::.::.::::.:.:: : :: ...:::.: .::::...::. 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CCDS87 ERQTADAPARLTTDRAPTEE---PVVTAPP--------------AAHAKHGSRDGSTQTE 690 700 710 720 730 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 KSAELFWPSMASLPSRGRLSTTPAHSPVLKHPAAKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGRVSSL CCDS87 GPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI 740 750 760 770 >>CCDS33860.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs109|chr3 (780 aa) initn: 1438 init1: 415 opt: 1306 Z-score: 758.5 bits: 151.4 E(33420): 6.4e-36 Smith-Waterman score: 1818; 44.3% identity (67.8% similar) in 810 aa overlap (87-880:1-732) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 EATSSIREKVVEDPLCNFHSPNFLRISEVEMRGSEDAAAGTVLQRLIQEQLRYGTPTENM :: ::.. ::::.::::::::::. ::. CCDS33 MRTLEDSS-GTVLHRLIQEQLRYGNLTETR 10 20 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NLLAIQHQAT-GSAGPAHPTNNFSSTENLTQEDPQMVYQSARQEPQGQEHQV-DNTVMEK .:::::.:: :.:: . . .: : :. :: :.. :..:::::::::: .: . :. CCDS33 TLLAIQQQALRGGAGTGGTGSPQASLEILAPEDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAEN 30 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 QVRSTQPQQNN-EELPTYEEAKAQSQFFRGQQQQQQQQGAVGHGYYMAGGTSQKSRTEGR . :: .. :::::::::::.::.. .: : :. : :: . . : CCDS33 TLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQ-----QAGTRPH----AGDRDPR----GA 90 100 110 120 130 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PTVNRANSGQAHKDEALKELKQGHVRSLSERIMQLSLERNGAK--QHLPGSGNGKGF-KV : .:. ..::::.::..:::::::::..:::::::::. .:. .: . . . CCDS33 P------GGSRRQDEALRELRHGHVRSLSERLLQLSLERNGARAPSHMSSSHSFPQLARN 140 150 160 170 180 190 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 GGGPSPAQPAGKVLDPRGPPPEYPFKTKQMMSPVSKTQEHGLFYGDQHPGMLHEMVKPYP :: : .. . :::::.:: : .. . .. . CCDS33 QQGPPLRGPPAEGPESRGPPPQYP---------------HVVLAHETTTAVTDPRYRARG 200 210 220 230 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 APQPVRTDVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQLPFPSTMQQHSPMSSQTSSASGPLHSVSLPLP .:. ...: .:. : :: . .. : . . :.: : .. . ::: :.: CCDS33 SPHFQHAEVRILQAQVPPVF--LQQQQQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLS---- 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 LPMALGAPQPPPAASPSQQLGPDAFAIVERAQQMVEILTEENRVLHQELQGYYDNADKLH : :. .: :.: .. : .: .: . . : ..:. :..::.. ..: ... CCDS33 -PPAVEGPVSAQASSATS--GSAHLAQMEAVLRENARLQRDNERLQRELESSAEKAGRIE 290 300 310 320 330 340 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 KFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESLDKAMRNKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETANRQLS :.:.:.::.:::.:::.....:::.:.:.::::...:.:::.:::::::.:::.:::.:. 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CCDS33 LEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQGSLRPAKSVPSVFAAAAAGTQG--------------- 640 650 660 670 680 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 EEKTWKGSIGLLLGKEHHEHASAPLLPPPPTSALSSIASTTAASSAHAKTGSKDSSTQTD :.: :.. ... :.:: : . .:: .:::: ::.:.::::. CCDS33 ----WQG-----LSSSERQTADAPARLTTADRAPTEEPVVTAPPAAHAKHGSRDGSTQTE 690 700 710 720 730 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 KSAELFWPSMASLPSRGRLSTTPAHSPVLKHPAAKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGRVSSL CCDS33 GPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI 740 750 760 770 780 >>CCDS63784.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs109|chr3 (837 aa) initn: 1438 init1: 415 opt: 1306 Z-score: 758.1 bits: 151.5 E(33420): 6.8e-36 Smith-Waterman score: 1822; 44.5% identity (67.9% similar) in 814 aa overlap (83-880:55-789) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ALTVEATSSIREKVVEDPLCNFHSPNFLRISEVEMRGSEDAAAGTVLQRLIQEQLRYGTP :. :: ::.. ::::.::::::::::. 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CCDS63 LARNQQGPPLRGPPAEGPESRGPPPQYP---------------HVVLAHETTTAVTDPRY 250 260 270 280 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 KPYPAPQPVRTDVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQLPFPSTMQQHSPMSSQTSSASGPLHSVS . .:. ...: .:. : :: . .. : . . :.: : .. . ::: :.: CCDS63 RARGSPHFQHAEVRILQAQVPPVF--LQQQQQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLS 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LPLPLPMALGAPQPPPAASPSQQLGPDAFAIVERAQQMVEILTEENRVLHQELQGYYDNA : :. .: :.: .. : .: .: . . : ..:. :..::.. ..: CCDS63 -----PPAVEGPVSAQASSATS--GSAHLAQMEAVLRENARLQRDNERLQRELESSAEKA 350 360 370 380 390 400 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 DKLHKFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESLDKAMRNKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETAN ...:.:.:.::.:::.:::.....:::.:.:.::::...:.:::.:::::::.:::.:: CCDS63 GRIEKLESEIQRLSEAHESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESAN 410 420 430 440 450 460 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 RQLSSREYE---GHEDKAAEGHYASQNKEFLKEKEKLEMELAAVRTASEDHRRHIEILDQ :.:.:. : : .: .:. .:. : .:.:::: :.: .: : ::.::. :.:.: CCDS63 RRLASKTQEAQAGSQDMVAK--LLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQ 470 480 490 500 510 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 ALSNAQARVIKLEEELREKQAYVEKVEKLQQALTQLQSACEKREQMERRLRTWLERELDA ::.:::.:. . :::::.:::::::::.::::: :::.:::::::.: :::: ::.:: : CCDS63 ALGNAQGRAARAEEELRKKQAYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKA 520 530 540 550 560 570 650 660 670 680 690 pF1KE2 LRTQQKH-----GNGQPANMPEYNAPALLELVREKEERILALEADMTKWEQKYLEESTIR ::.::.. :.. .. :: .: : : .:::::.:::::::::::::::::: ..: CCDS63 LRAQQRQAGAPGGSSGSGGSPELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMR 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 HFAMNAAATAAAERDTTIINHSRNGSYGESSLEAHIWQEEEEVVQANRRCQDMEYTIKNL .:::.:::::::.::::.: :: . : . ::.. : .. ...: :.:: .: : CCDS63 QFAMDAAATAAAQRDTTLIRHSPQPSPS-SSFN-------EGLLTGGHRHQEMESRLKVL 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 HAKIIEKDAMIKVLQQRSRKDAGKTDSSSLRPARSVPSI--AAATGTHSRQTSLTSSQLA ::.:.::::.:::::::::.: ::. ..:::::.::::. :::.::.. : .:.:: CCDS63 HAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQGSLRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQ-GLSSS--- 700 710 720 730 740 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 EEKKEEKTWKGSIGLLLGKEHHEHASAPLLPPPPTSALSSIASTTAASSAHAKTGSKDSS :..: . : . :. :.. :: .:::: ::.:.: CCDS63 ----ERQTADAPARLTTDRAPTEE---PVVTAPP--------------AAHAKHGSRDGS 750 760 770 780 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 TQTDKSAELFWPSMASLPSRGRLSTTPAHSPVLKHPAAKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGR :::. 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