FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2597, 1939 aa 1>>>pF1KE2597 1939 - 1939 aa - 1939 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.5390+/-0.00105; mu= -32.5943+/- 0.063 mean_var=888.6934+/-187.547, 0's: 0 Z-trim(113.3): 737 B-trim: 1075 in 1/54 Lambda= 0.043023 statistics sampled from 21897 (22582) to 21897 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16 Scan time: 14.580 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005954 (OMIM: 160730) myosin-1 [Homo sapiens] (1939) 12261 779.4 0 XP_016880164 (OMIM: 160730) PREDICTED: myosin-1 is (1939) 12261 779.4 0 NP_001093582 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo (1941) 11738 746.9 4.5e-214 NP_060004 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo sap (1941) 11738 746.9 4.5e-214 NP_060003 (OMIM: 160742) myosin-4 [Homo sapiens] (1939) 11701 744.6 2.2e-213 XP_016880165 (OMIM: 160742) PREDICTED: myosin-4 is (1939) 11701 744.6 2.2e-213 NP_002463 (OMIM: 158300,160741,608837) myosin-8 [H (1937) 11449 729.0 1.1e-208 XP_011522172 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 10546 673.0 8.5e-192 NP_002461 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) myos (1940) 10546 673.0 8.5e-192 XP_011522173 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 10546 673.0 8.5e-192 NP_003793 (OMIM: 603487) myosin-13 [Homo sapiens] (1938) 10387 663.1 7.9e-189 XP_016876829 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25 (1935) 10335 659.9 7.4e-188 NP_000248 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25516 (1935) 10335 659.9 7.4e-188 NP_002462 (OMIM: 160710,192600,613251,613252,61408 (1939) 10247 654.4 3.3e-186 NP_065935 (OMIM: 609928) myosin-7B [Homo sapiens] (1983) 8607 552.6 1.5e-155 XP_006723903 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1989) 8607 552.6 1.5e-155 NP_055796 (OMIM: 609929) myosin-15 precursor [Homo (1946) 6913 447.5 6.5e-124 XP_011510861 (OMIM: 609929) PREDICTED: myosin-15 i (1946) 6913 447.5 6.5e-124 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::::.:.::::::::::::::::.::::::::.:::::::..:::::::::::::::::: NP_001 QLSELKSKEEEQQRLINDLTAQRGRLQTESGEFSRQLDEKEALVSQLSRGKQAFTQQIEE 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 LKRQLEEEIKAKSALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQRAMSKANSEVAQWRTK ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::.:::::::: NP_001 LKRQLEEEIKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQESKAELQRALSKANTEVAQWRTK 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 YETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLMIDVER :::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.:::: NP_001 YETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQAAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLMLDVER 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 TNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKCEETHAELEASQKESRSLSTELFKIKNAYEESLDQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::: NP_001 TNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKCEETHAELEASQKEARSLGTELFKIKNAYEESLDQ 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 QRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAATLRK 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 KHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEIDDLASNMETVSKAKGNLEKMCRALED ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::: NP_060 KHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEIDDLASNVETVSKAKGNLEKMCRTLED 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 QLSEIKTKEEEQQRLINDLTAQRARLQTESGEYSRQLDEKDTLVSQLSRGKQAFTQQIEE ::::.:.::::::::::::::::.::::::::.:::::::..:::::::::::::::::: NP_060 QLSELKSKEEEQQRLINDLTAQRGRLQTESGEFSRQLDEKEALVSQLSRGKQAFTQQIEE 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 LKRQLEEEIKAKSALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQRAMSKANSEVAQWRTK ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::.:::::::: NP_060 LKRQLEEEIKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQESKAELQRALSKANTEVAQWRTK 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 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