Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2627
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2627, 271 aa
1>>>pF1KE2627 271 - 271 aa - 271 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0102+/-0.000746; mu= 16.3075+/- 0.045
mean_var=63.2615+/-13.432, 0's: 0 Z-trim(107.7): 27 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.161252
statistics sampled from 9711 (9737) to 9711 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8792.1 AQP2 gene_id:359|Hs108|chr12 ( 271) 1772 420.6 5.6e-118
CCDS8793.1 AQP5 gene_id:362|Hs108|chr12 ( 265) 1158 277.8 5.5e-75
CCDS8919.1 MIP gene_id:4284|Hs108|chr12 ( 263) 1082 260.1 1.2e-69
CCDS31798.1 AQP6 gene_id:363|Hs108|chr12 ( 282) 993 239.4 2.1e-63
CCDS58617.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 ( 301) 776 189.0 3.5e-48
CCDS11889.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 ( 323) 776 189.0 3.7e-48
CCDS5431.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 269) 768 187.1 1.1e-47
CCDS82244.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 ( 296) 555 137.6 1e-32
CCDS55096.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 154) 435 109.5 1.5e-24
CCDS55098.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 186) 435 109.5 1.8e-24
CCDS55097.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 218) 435 109.6 2e-24
CCDS10626.1 AQP8 gene_id:343|Hs108|chr16 ( 261) 420 106.1 2.6e-23
>>CCDS8792.1 AQP2 gene_id:359|Hs108|chr12 (271 aa)
initn: 1772 init1: 1772 opt: 1772 Z-score: 2231.5 bits: 420.6 E(32554): 5.6e-118
Smith-Waterman score: 1772; 100.0% identity (100.0% similar) in 271 aa overlap (1-271:1-271)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQALG
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CCDS87 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQALG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 HISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 CSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLKGL
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CCDS87 CSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLKGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE2 EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
250 260 270
>>CCDS8793.1 AQP5 gene_id:362|Hs108|chr12 (265 aa)
initn: 1170 init1: 892 opt: 1158 Z-score: 1459.7 bits: 277.8 E(32554): 5.5e-75
Smith-Waterman score: 1158; 66.0% identity (90.3% similar) in 259 aa overlap (3-259:4-262)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQAL
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CCDS87 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 GHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVN
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CCDS87 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYT
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CCDS87 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GCSMNPARSLAPAVVTGKFDD-HWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLK
:::::::::..:::: ..:. :::::.::.:::.:...:: :.::: . :::::.:..:
CCDS87 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE2 GL-EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
: ::: ::::.. .:....::
CCDS87 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
250 260
>>CCDS8919.1 MIP gene_id:4284|Hs108|chr12 (263 aa)
initn: 1077 init1: 1077 opt: 1082 Z-score: 1364.2 bits: 260.1 E(32554): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 1082; 61.5% identity (86.4% similar) in 265 aa overlap (1-265:1-263)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQALG
:::::: .: ::.::::.:::..:::::::.: : . :::.::::::...::::..:
CCDS89 MWELRSASFWRAIFAEFFATLFYVFFGLGSSLRWAPGPLHVLQVAMAFGLALATLVQSVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNA
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CCDS89 HISGAHVNPAVTFAFLVGSQMSLLRAFCYMAAQLLGAVAGAAVLYSVTPPAVRGNLALNT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTG
: ....:::.:::.:::::.::::::. ::::. . :. ::..:::.:::::.:..:::
CCDS89 LHPAVSVGQATTVEIFLTLQFVLCIFATYDERRNGQLGSVALAVGFSLALGHLFGMYYTG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 CSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLKGL
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CCDS89 AGMNPARSFAPAILTGNFTNHWVYWVGPIIGGGLGSLLYDFLLFPRLKSISERLSVLKGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE2 EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
.::.. . :: . :::.. :.:
CCDS89 KPDVSNGQPEVTG-EPVELNT-QAL
250 260
>>CCDS31798.1 AQP6 gene_id:363|Hs108|chr12 (282 aa)
initn: 977 init1: 574 opt: 993 Z-score: 1251.8 bits: 239.4 E(32554): 2.1e-63
Smith-Waterman score: 993; 62.3% identity (85.4% similar) in 239 aa overlap (1-239:19-251)
10 20 30 40
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVL
.:. :.:::.::::::: :.::::.::.. :: ::::::
CCDS31 MDAVEPGGRGWASMLACRLWK----AISRALFAEFLATGLYVFFGVGSVMRWPTALPSVL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 QIAMAFGLGIGTLVQALGHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAA
:::..:.: . ::. . :::: :::::.: ::: :.:. ::. ::::::.::..:::
CCDS31 QIAITFNLVTAMAVQVTWKASGAHANPAVTLAFLVGSHISLPRAVAYVAAQLVGATVGAA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LLHEITPADIRGDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPAL
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CCDS31 LLYGVMPGDIRETLGINVVRNSVSTGQAVAVELLLTLQLVLCVFASTDSR--QTSGSPAT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 SIGFSVALGHLLGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYV
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CCDS31 MIGISVALGHLIGIHFTGCSMNPARSFGPAIIIGKFTVHWVFWVGPLMGALLASLIYNFV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 LFPPAKSLSERLAVLKGLEPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
::: .:.:..:::.: :
CCDS31 LFPDTKTLAQRLAILTGTVEVGTGAGAGAEPLKKESQPGSGAVEMESV
240 250 260 270 280
>>CCDS58617.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 (301 aa)
initn: 775 init1: 677 opt: 776 Z-score: 978.6 bits: 189.0 E(32554): 3.5e-48
Smith-Waterman score: 776; 51.4% identity (82.9% similar) in 222 aa overlap (8-225:11-232)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNW---PQALP-SVLQIAMAFGLGIG
:: .:: ::::: :.::...:::..:: . :: ... :.. :::.:.
CCDS58 MVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGTEKPLPVDMVLISLCFGLSIA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 TLVQALGHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIR
:.:: .:::::.::::::::: . ..:. ...::.::: :::. ::..:. .:: ..
CCDS58 TMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQCLGAIIGAGILYLVTPPSVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHL
: :.:. . .. :::... :::..:.:::. :::: : .: . :. ::.::::::.:::
CCDS58 GGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKRTDVTGSIALAIGFSVAIGHL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSER
..:.::: :::::::..:::. :....::..:.::..::.:.. ::.::. :
CCDS58 FAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWENHWIYWVGPIIGAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE2 LAVLKGLEPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
CCDS58 KEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSS
250 260 270 280 290 300
>>CCDS11889.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 (323 aa)
initn: 775 init1: 677 opt: 776 Z-score: 978.2 bits: 189.0 E(32554): 3.7e-48
Smith-Waterman score: 776; 51.4% identity (82.9% similar) in 222 aa overlap (8-225:33-254)
10 20 30
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNW---
:: .:: ::::: :.::...:::..::
CCDS11 DRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 PQALP-SVLQIAMAFGLGIGTLVQALGHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQ
. :: ... :.. :::.:.:.:: .:::::.::::::::: . ..:. ...::.:::
CCDS11 EKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERR
:::. ::..:. .:: .. : :.:. . .. :::... :::..:.:::. :::: : .:
CCDS11 CLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKR
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 GENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAI
. :. ::.::::::.:::..:.::: :::::::..:::. :....::..:.::..::.
CCDS11 TDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWENHWIYWVGPIIGAV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLKGLEPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
:.. ::.::. :
CCDS11 LAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVI
250 260 270 280 290 300
>>CCDS5431.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 (269 aa)
initn: 787 init1: 664 opt: 768 Z-score: 969.3 bits: 187.1 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 768; 45.0% identity (79.6% similar) in 260 aa overlap (3-254:4-263)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALN--WP-----QALPSVLQIAMAFGLGI
:... : ::: :::::: ::::...::::. .: :. . .....::::.:
CCDS54 MASEFKKKLFWRAVVAEFLATTLFVFISIGSALGFKYPVGNNQTAVQDNVKVSLAFGLSI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 GTLVQALGHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADI
.::.:..:::::::.:::::.. :..:..:..:: .:. :: .::....:.: :: .
CCDS54 ATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISIFRALMYIIAQCVGAIVATAILSGITSSLT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 RGDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGH
..:. : :......::.. .:.. :::::::..:.::.:: . :. :.::.::::::
CCDS54 GNSLGRNDLADGVNSGQGLGIEIIGTLQLVLCVLATTDRRRRDLGGSAPLAIGLSVALGH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LLGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSE
::.: ::::..:::::.. ::.: .:..::.::.::..:. :. :.:...: : ...:..
CCDS54 LLAIDYTGCGINPARSFGSAVITHNFSNHWIFWVGPFIGGALAVLIYDFILAPRSSDLTD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE2 RLAV-LKGLEPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
:. : .: . : . .. :
CCDS54 RVKVWTSGQVEEYDLDADDINSRVEMKPK
250 260
>>CCDS82244.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 (296 aa)
initn: 577 init1: 448 opt: 555 Z-score: 700.9 bits: 137.6 E(32554): 1e-32
Smith-Waterman score: 579; 44.1% identity (71.6% similar) in 222 aa overlap (8-225:33-227)
10 20 30
pF1KE2 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNW---
:: .:: ::::: :.::...:::..::
CCDS82 DRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 PQALP-SVLQIAMAFGLGIGTLVQALGHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQ
. :: ... :.. :::.:.:.:: .:::::.::::::::: . ..:. ...::.:::
CCDS82 EKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERR
:::. ::..:. .:: .. : :.:. . .. :::... :::..:.:::. :::: : .:
CCDS82 CLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKR
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 GENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAI
. :. ::.::::::.:::..: .:.::..::.
CCDS82 TDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAI---------------------------YWVGPIIGAV
190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLKGLEPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
:.. ::.::. :
CCDS82 LAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVI
220 230 240 250 260 270
>>CCDS55096.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 (154 aa)
initn: 457 init1: 421 opt: 435 Z-score: 554.1 bits: 109.5 E(32554): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 435; 44.4% identity (80.7% similar) in 135 aa overlap (121-254:14-148)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 AAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTD
:......::.. .:.. :::::::..:.::
CCDS55 MQSGMGWNVLDFWLADGVNSGQGLGIEIIGTLQLVLCVLATTD
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 ERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLV
.:: . :. :.::.::::::::.: ::::..:::::.. ::.: .:..::.::.::..
CCDS55 RRRRDLGGSAPLAIGLSVALGHLLAIDYTGCGINPARSFGSAVITHNFSNHWIFWVGPFI
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KE2 GAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAV-LKGLEPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGT
:. :. :.:...: : ...:..:. : .: . : . .. :
CCDS55 GGALAVLIYDFILAPRSSDLTDRVKVWTSGQVEEYDLDADDINSRVEMKPK
110 120 130 140 150
270
pF1KE2 KA
>>CCDS55098.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 (186 aa)
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Smith-Waterman score: 435; 44.4% identity (80.7% similar) in 135 aa overlap (121-254:46-180)
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