FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2631, 1116 aa 1>>>pF1KE2631 1116 - 1116 aa - 1116 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0437+/-0.000425; mu= 14.0083+/- 0.027 mean_var=114.0101+/-22.867, 0's: 0 Z-trim(113.2): 81 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.120116 statistics sampled from 22291 (22372) to 22291 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16 Scan time: 12.010 The best scores are: opt bits E(85289) NP_065759 (OMIM: 606726,616645,616685) solute carr (1116) 7466 1305.8 0 NP_001128243 (OMIM: 606726,616645,616685) solute c (1139) 7341 1284.2 0 XP_016883470 (OMIM: 606726,616645,616685) PREDICTE (1134) 7282 1273.9 0 NP_006589 (OMIM: 604879) solute carrier family 12 (1083) 4844 851.4 0 XP_005248288 (OMIM: 604879) PREDICTED: solute carr (1088) 4844 851.4 0 XP_011512241 (OMIM: 604879) PREDICTED: solute carr (1085) 4835 849.9 0 XP_011512243 (OMIM: 604879) PREDICTED: solute carr (1111) 4833 849.5 0 XP_011512242 (OMIM: 604879) PREDICTED: solute carr (1074) 4827 848.5 0 XP_016864447 (OMIM: 604879) PREDICTED: solute carr (1020) 4718 829.6 0 XP_016864448 (OMIM: 604879) PREDICTED: solute carr (1020) 4718 829.6 0 NP_001035960 (OMIM: 218000,604878) solute carrier (1091) 4699 826.3 0 NP_001035959 (OMIM: 218000,604878) solute carrier (1091) 4699 826.3 0 NP_005126 (OMIM: 218000,604878) solute carrier fam (1099) 4699 826.3 0 NP_001035962 (OMIM: 218000,604878) solute carrier (1135) 4699 826.3 0 NP_001035961 (OMIM: 218000,604878) solute carrier (1141) 4699 826.3 0 NP_598408 (OMIM: 218000,604878) solute carrier fam (1150) 4699 826.3 0 NP_001139436 (OMIM: 604119) solute carrier family (1054) 4638 815.7 0 NP_001139435 (OMIM: 604119) solute carrier family (1079) 4627 813.8 0 NP_005063 (OMIM: 604119) solute carrier family 12 (1085) 4627 813.8 0 NP_001139433 (OMIM: 604119) solute carrier family (1079) 4571 804.1 0 NP_001139434 (OMIM: 604119) solute carrier family (1087) 4517 794.8 0 XP_006720856 (OMIM: 218000,604878) PREDICTED: solu (1101) 4111 724.4 8.9e-208 XP_011520571 (OMIM: 218000,604878) PREDICTED: solu ( 680) 2897 513.9 1.3e-144 XP_005250559 (OMIM: 616861) PREDICTED: solute carr ( 825) 664 127.0 4.6e-28 XP_006716117 (OMIM: 616861) PREDICTED: solute carr ( 825) 664 127.0 4.6e-28 XP_011514716 (OMIM: 616861) PREDICTED: solute carr ( 722) 656 125.6 1.1e-27 NP_001254743 (OMIM: 616861) solute carrier family ( 538) 618 119.0 8e-26 XP_016865260 (OMIM: 600840) PREDICTED: solute carr ( 626) 617 118.8 1e-25 XP_005254663 (OMIM: 600839,601678) PREDICTED: solu (1099) 609 117.5 4.3e-25 XP_005256176 (OMIM: 263800,600968) PREDICTED: solu (1020) 565 109.9 8e-23 NP_001119580 (OMIM: 263800,600968) solute carrier (1021) 565 109.9 8e-23 NP_001119579 (OMIM: 263800,600968) solute carrier (1029) 565 109.9 8e-23 NP_000330 (OMIM: 263800,600968) solute carrier fam (1030) 565 109.9 8e-23 XP_005250561 (OMIM: 616861) PREDICTED: solute carr ( 556) 494 97.5 2.4e-19 NP_001171761 (OMIM: 600839,601678) solute carrier (1099) 402 81.7 2.7e-14 NP_000329 (OMIM: 600839,601678) solute carrier fam (1099) 392 79.9 9e-14 XP_011541890 (OMIM: 600840) PREDICTED: solute carr ( 628) 368 75.7 1e-12 NP_001243390 (OMIM: 600840) solute carrier family (1196) 368 75.8 1.7e-12 NP_001037 (OMIM: 600840) solute carrier family 12 (1212) 368 75.8 1.7e-12 XP_006716118 (OMIM: 616861) PREDICTED: solute carr ( 811) 356 73.6 5.2e-12 NP_001254741 (OMIM: 616861) solute carrier family ( 631) 352 72.9 6.9e-12 NP_064631 (OMIM: 616861) solute carrier family 12 ( 914) 352 73.0 9.4e-12 NP_078904 (OMIM: 611316) solute carrier family 12 ( 714) 282 60.8 3.4e-08 NP_001182412 (OMIM: 611316) solute carrier family ( 714) 282 60.8 3.4e-08 >>NP_065759 (OMIM: 606726,616645,616685) solute carrier (1116 aa) initn: 7466 init1: 7466 opt: 7466 Z-score: 6993.3 bits: 1305.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7466; 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XP_016 SALWGLFCNGSQPSAACDEYFIQNNVTEIQGIPGAASGVFLENLWSTYAHAGAFVEKKGV 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 TSVGLADGTPIDMDHPYVFSDMTSYFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIPTG :: .:. . . :::..:... :::::::::::::::::::::::::.::::::::: XP_016 PSVPVAEESRASA-LPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPTG 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 TILAIATTSAVYISSVVLFGACIEGVVLRDKFGEAVNGNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFS :::::.::: .:.: .:::::::::::::::::::..::::.: :::::::::::::::: XP_016 TILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPSPWVIVIGSFFS 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 TCGAGLQSLTGAPRLLQAISRDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTACICEIGILIASL :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::. ::: ::::::: XP_016 TCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTVLICETGILIASL 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 DEVAPILSMFFLMCYMFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFRYYHWTLSFLGMSLCLALMFICS : :::::::::::::.:::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::: XP_016 DSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFICS 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 WYYALVAMLIAGLIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQL ::::: :::::: :::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::::::::::. 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