Result of FASTA (omim) for
pF1KE2661
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2661, 645 aa
1>>>pF1KE2661 645 - 645 aa - 645 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61265892 residues in 86068 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9057+/-0.000464; mu= 16.4035+/- 0.029
mean_var=77.4861+/-15.483, 0's: 0 Z-trim(109.7): 66 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.145701
statistics sampled from 17973 (18039) to 17973 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 9.140
The best scores are: opt bits E(86068)
NP_775924 (OMIM: 608396,613410) sodium/hydrogen ex ( 645) 4280 909.9 0
XP_016861691 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 578) 3543 755.0 1.7e-217
XP_016861692 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 528) 3456 736.7 5e-212
XP_011511005 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 429) 2840 607.2 4e-173
XP_006724789 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 649) 2523 540.6 6.5e-153
XP_016884713 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 649) 2523 540.6 6.5e-153
NP_001171122 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ( 649) 2523 540.6 6.5e-153
XP_016884712 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 649) 2523 540.6 6.5e-153
NP_001036002 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ( 701) 2523 540.6 7e-153
XP_006724627 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 706) 2512 538.3 3.5e-152
XP_016885395 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 706) 2512 538.3 3.5e-152
NP_001244220 (OMIM: 300368) sodium/hydrogen exchan ( 726) 2190 470.6 8.5e-132
XP_005272739 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 2190 470.6 8.5e-132
XP_011542292 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 2190 470.6 8.5e-132
XP_005272738 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 2190 470.6 8.5e-132
XP_016885394 (OMIM: 300368) PREDICTED: sodium/hydr ( 726) 2190 470.6 8.5e-132
XP_011511006 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodi ( 369) 2176 467.6 3.6e-131
NP_115980 (OMIM: 300368) sodium/hydrogen exchanger ( 725) 2161 464.5 5.8e-130
XP_016884714 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodi ( 617) 2150 462.2 2.5e-129
NP_001317581 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ( 617) 2150 462.2 2.5e-129
NP_006350 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen ex ( 669) 2150 462.2 2.7e-129
NP_056081 (OMIM: 612730) sodium/hydrogen exchanger ( 581) 931 206.0 3.2e-52
XP_016879083 (OMIM: 600477) PREDICTED: sodium/hydr ( 544) 765 171.0 9.8e-42
NP_001310900 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 675) 765 171.1 1.2e-41
NP_001310902 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 895) 765 171.1 1.5e-41
NP_004585 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchanger ( 896) 765 171.1 1.5e-41
NP_001247420 (OMIM: 612730) sodium/hydrogen exchan ( 597) 746 167.1 1.7e-40
NP_004165 (OMIM: 182307,616868) sodium/hydrogen ex ( 834) 746 167.1 2.3e-40
NP_001271280 (OMIM: 182307,616868) sodium/hydrogen ( 825) 697 156.8 2.8e-37
NP_001011552 (OMIM: 600531) sodium/hydrogen exchan ( 798) 694 156.2 4.2e-37
NP_003039 (OMIM: 600530) sodium/hydrogen exchanger ( 812) 691 155.6 6.6e-37
XP_011540323 (OMIM: 107310,616291) PREDICTED: sodi ( 705) 680 153.2 2.9e-36
NP_003038 (OMIM: 107310,616291) sodium/hydrogen ex ( 815) 680 153.3 3.3e-36
NP_001310901 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 795) 597 135.8 5.8e-31
XP_011509460 (OMIM: 600531) PREDICTED: sodium/hydr ( 769) 552 126.3 4e-28
XP_016883245 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 334) 534 122.4 2.7e-27
XP_011527045 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 334) 534 122.4 2.7e-27
XP_011527044 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 395) 534 122.4 3.1e-27
XP_016883244 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 395) 534 122.4 3.1e-27
XP_011527039 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 602) 534 122.5 4.4e-27
XP_006723819 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 614) 534 122.5 4.5e-27
XP_011527038 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 630) 534 122.5 4.6e-27
XP_011527042 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 564) 531 121.9 6.5e-27
XP_016883243 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 565) 531 121.9 6.5e-27
XP_011527041 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 589) 506 116.6 2.6e-25
XP_011527040 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 591) 489 113.0 3.1e-24
XP_011527046 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 304) 463 107.4 7.6e-23
XP_011527043 (OMIM: 612730) PREDICTED: sodium/hydr ( 558) 344 82.6 4.4e-15
NP_001310903 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 600) 295 72.3 5.9e-12
NP_001310904 (OMIM: 600477) sodium/hydrogen exchan ( 601) 295 72.3 5.9e-12
>>NP_775924 (OMIM: 608396,613410) sodium/hydrogen exchan (645 aa)
initn: 4280 init1: 4280 opt: 4280 Z-score: 4862.3 bits: 909.9 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 4280; 100.0% identity (100.0% similar) in 645 aa overlap (1-645:1-645)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MERQSRVMSEKDEYQFQHQGAVELLVFNFLLILTILTIWLFKNHRFRFLHETGGAMVYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 MERQSRVMSEKDEYQFQHQGAVELLVFNFLLILTILTIWLFKNHRFRFLHETGGAMVYGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IMGLILRYATAPTDIESGTVYDCVKLTFSPSTLLVNITDQVYEYKYKREISQHNINPHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 IMGLILRYATAPTDIESGTVYDCVKLTFSPSTLLVNITDQVYEYKYKREISQHNINPHQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFFQNLGSILTYAFLGTAISCIVIGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 NAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFFQNLGSILTYAFLGTAISCIVIGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 MYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 VLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIVAVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 KFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIVAVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALFILGAFLAIFVARACNIYPLSFLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 TKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALFILGAFLAIFVARACNIYPLSFLLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIRNTESQPKQMMFTTTLLLVFFTVWVFGGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIRNTESQPKQMMFTTTLLLVFFTVWVFGGGT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TPMLTWLQIRVGVDLDENLKEDPSSQHQEANNLDKNMTKAESARLFRMWYSFDHKYLKPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 TPMLTWLQIRVGVDLDENLKEDPSSQHQEANNLDKNMTKAESARLFRMWYSFDHKYLKPI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LTHSGPPLTTTLPEWCGPISRLLTSPQAYGEQLKEDDVECIVNQDELAINYQEQASSPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LTHSGPPLTTTLPEWCGPISRLLTSPQAYGEQLKEDDVECIVNQDELAINYQEQASSPCS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE2 PPARLGLDQKASPQTPGKENIYEGDLGLGGYELKLEQTLGQSQLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 PPARLGLDQKASPQTPGKENIYEGDLGLGGYELKLEQTLGQSQLN
610 620 630 640
>>XP_016861691 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodium/h (578 aa)
initn: 3537 init1: 3537 opt: 3543 Z-score: 4025.8 bits: 755.0 E(86068): 1.7e-217
Smith-Waterman score: 3543; 94.9% identity (96.3% similar) in 572 aa overlap (1-567:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MERQSRVMSEKDEYQFQHQGAVELLVFNFLLILTILTIWLFKNHRFRFLHETGGAMVYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MERQSRVMSEKDEYQFQHQGAVELLVFNFLLILTILTIWLFKNHRFRFLHETGGAMVYGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IMGLILRYATAPTDIESGTVYDCVKLTFSPSTLLVNITDQVYEYKYKREISQHNINPHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IMGLILRYATAPTDIESGTVYDCVKLTFSPSTLLVNITDQVYEYKYKREISQHNINPHQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFFQNLGSILTYAFLGTAISCIVIGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFFQNLGSILTYAFLGTAISCIVIGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIVAVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIVAVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALFILGAFLAIFVARACNIYPLSFLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALFILGAFLAIFVARACNIYPLSFLLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIRNTESQPKQMMFTTTLLLVFFTVWVFGGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIRNTESQPKQMMFTTTLLLVFFTVWVFGGGT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE2 TPMLTWLQIRVGVDLDENLKEDPSSQHQEANNLDKNMTKAESARLFRMWYSFDHKY----
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPMLTWLQIRVGVDLDENLKEDPSSQHQEANNLDKNMTKAESARLFRMWYSFDHKYPLII
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 -LKPILTHSGPPLTTTLPEWCGPISRLLTSPQAYGEQLKEDDVECIVNQDELAINYQEQA
.. :: .. . . : : : : .:.
XP_016 TISQILLQAENYFKLLIIEVCTPA--LQETPKELLTAVGY
550 560 570
600 610 620 630 640
pF1KE2 SSPCSPPARLGLDQKASPQTPGKENIYEGDLGLGGYELKLEQTLGQSQLN
>>XP_016861692 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodium/h (528 aa)
initn: 3456 init1: 3456 opt: 3456 Z-score: 3927.6 bits: 736.7 E(86068): 5e-212
Smith-Waterman score: 3456; 100.0% identity (100.0% similar) in 519 aa overlap (127-645:10-528)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ITDQVYEYKYKREISQHNINPHQGNAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFF
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKLEEQWCMMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFF
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 QNLGSILTYAFLGTAISCIVIGLIMYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNLGSILTYAFLGTAISCIVIGLIMYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDP
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220 230 240 250 260 270
pF1KE2 VTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGESVLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGESVLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVG
100 110 120 130 140 150
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pF1KE2 NFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLTKFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLTKFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIV
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIRTKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIRTKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALF
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 ILGAFLAIFVARACNIYPLSFLLNLGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIRNTESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILGAFLAIFVARACNIYPLSFLLNLGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIRNTESQ
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 PKQMMFTTTLLLVFFTVWVFGGGTTPMLTWLQIRVGVDLDENLKEDPSSQHQEANNLDKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKQMMFTTTLLLVFFTVWVFGGGTTPMLTWLQIRVGVDLDENLKEDPSSQHQEANNLDKN
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 MTKAESARLFRMWYSFDHKYLKPILTHSGPPLTTTLPEWCGPISRLLTSPQAYGEQLKED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTKAESARLFRMWYSFDHKYLKPILTHSGPPLTTTLPEWCGPISRLLTSPQAYGEQLKED
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 DVECIVNQDELAINYQEQASSPCSPPARLGLDQKASPQTPGKENIYEGDLGLGGYELKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVECIVNQDELAINYQEQASSPCSPPARLGLDQKASPQTPGKENIYEGDLGLGGYELKLE
460 470 480 490 500 510
640
pF1KE2 QTLGQSQLN
:::::::::
XP_016 QTLGQSQLN
520
>>XP_011511005 (OMIM: 608396,613410) PREDICTED: sodium/h (429 aa)
initn: 2840 init1: 2840 opt: 2840 Z-score: 3229.2 bits: 607.2 E(86068): 4e-173
Smith-Waterman score: 2840; 99.8% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (217-645:1-429)
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGESVLNDAV
.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGESVLNDAV
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLTKFTKLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITALLTKFTKLC
40 50 60 70 80 90
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XP_011 EFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIVAVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKIRTKQLFE
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..:::. . ..: ...::.: .:: ::::::::::..: ::::::: ::.:::
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:::::::::::. :: :.: .: ..::..:.:.:.: :::::.::::::.: ...:::
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. . :: . .. .. .:. . .:..: .:: .. :
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XP_016 TRHGPA
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NP_001 DNEMLRKVTFDPEVFFNILLPPIIFYAGYSLKRRHFFRNLGSILAYAFLGTAISCFVIGS
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pF1KE2 IMYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGE
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NP_001 SVLNDAVAIVLSSSIVAYQPAGDNSHTFDVTAMFKSIGIFLGIFSGSFAMGAATGVVTAL
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NP_001 TVNTEPATSSAPRRFMGNS--SEDALDRELAFGDHELVIRGTRLVLPMDDSEPPLNLLDN
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NP_001 TRHGPA
>>XP_016884712 (OMIM: 300231,300243) PREDICTED: sodium/h (649 aa)
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pF1KE2 IMGLILRYAT-APTDIESGTVYDCVKLTFSPSTLLVNITDQVYEYKYKREISQHNINPHQ
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XP_016 LVGLVLRYGIHVPSDVNNVTL-SC-EVQSSPTTLLVNVSGKFYEYMLKGEISSHELNNVQ
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pF1KE2 GNAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFFQNLGSILTYAFLGTAISCIVIGL
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XP_016 DNEMLRKVTFDPEVFFNILLPPIIFYAGYSLKRRHFFRNLGSILAYAFLGTAISCFVIGS
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pF1KE2 IMYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDPDLYTLLFGE
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XP_016 IMYGCVTLMKVTGQLA-GDFYFTDCLLFGAIVSATDPVTVLAIFHELQVDVELYALLFGE
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pF1KE2 SVLNDAVAIVLTYSISIYSPK-ENPNAFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAIITAL
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XP_016 SVLNDAVAIVLSSSIVAYQPAGDNSHTFDVTAMFKSIGIFLGIFSGSFAMGAATGVVTAL
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XP_016 VTKFTKLREFQLLETGLFFLMSWSTFLLAEAWGFTGVVAVLFCGITQAHYTYNNLSTESQ
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pF1KE2 IRTKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALFILGAFLAIFVARACNIYPLSFL
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XP_016 HRTKQLFELLNFLAENFIFSYMGLTLFTFQNHVFNPTFVVGAFVAIFLGRAANIYPLSLL
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pF1KE2 LNLGRKQKIPWNFQHMMMFSGLRGAIAFALAIRNTESQPKQMMFTTTLLLVFFTVWVFGG
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XP_016 LNLGRRSKIGSNFQHMMMFAGLRGAMAFALAIRDTATYARQMMFSTTLLIVFFTVWVFGG
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pF1KE2 GTTPMLTWLQIRVGVDLDENLKEDPSSQHQEANNLDKNMTKAESARLFRMWYSFDHKYLK
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XP_016 GTTAMLSCLHIRVGVDSDQ--------EHLGVPENERRTTKAESAWLFRMWYNFDHNYLK
480 490 500 510 520
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pF1KE2 PILTHSGPPLTTTLPEWCGPISRLLTSPQAY--GEQLKEDDVECIVNQDELAINYQEQAS
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XP_016 PLLTHSGPPLTTTLPACCGPIARCLTSPQAYENQEQLKDDDSDLILNDGDISLTYGD--S
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KE2 SPCSPPARLGLDQKASPQTPGKENIYEGDLGLGGYELKLEQTLGQSQLN
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XP_016 TVNTEPATSSAPRRFMGNS--SEDALDRELAFGDHELVIRGTRLVLPMDDSEPPLNLLDN
590 600 610 620 630 640
XP_016 TRHGPA
>>NP_001036002 (OMIM: 300231,300243) sodium/hydrogen exc (701 aa)
initn: 2435 init1: 1591 opt: 2523 Z-score: 2865.8 bits: 540.6 E(86068): 7e-153
Smith-Waterman score: 2536; 62.4% identity (83.6% similar) in 636 aa overlap (7-638:57-677)
10 20 30
pF1KE2 MERQSRVMSEKDEYQFQHQGAVELLVFNFLLILTIL
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640
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: .. :
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10 20 30
pF1KE2 MERQSRVMSEKDEYQFQHQGAVELLVFNFLLILTILTI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]