Result of FASTA (omim) for
pF1KE2673
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2673, 793 aa
1>>>pF1KE2673 793 - 793 aa - 793 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61265892 residues in 86068 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2619+/-0.000413; mu= 21.4473+/- 0.026
mean_var=75.3295+/-15.791, 0's: 0 Z-trim(112.1): 95 B-trim: 1146 in 3/52
Lambda= 0.147772
statistics sampled from 20875 (21008) to 20875 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 12.350
The best scores are: opt bits E(86068)
NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793) 5237 1126.5 0
XP_016862610 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 732) 4851 1044.2 0
XP_005247795 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 695) 4546 979.2 0
XP_016862611 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 709) 4345 936.3 0
NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor ( 759) 4345 936.4 0
XP_005247796 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 661) 4338 934.8 0
NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient recept ( 893) 2284 497.0 1.5e-139
NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 977) 2284 497.1 1.6e-139
NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 982) 2272 494.5 9.2e-139
NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor ( 973) 2257 491.3 8.4e-138
XP_016885263 (OMIM: 300334) PREDICTED: short trans ( 973) 2257 491.3 8.4e-138
NP_001129429 (OMIM: 603651) short transient recept ( 836) 2211 481.4 6.7e-135
NP_001129428 (OMIM: 603651) short transient recept ( 828) 1921 419.6 2.7e-116
NP_001129430 (OMIM: 603651) short transient recept ( 804) 1397 307.9 1.1e-82
XP_016876213 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 557) 999 222.9 3e-57
XP_011533508 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 987 220.4 1.8e-56
XP_016876212 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 987 220.4 1.8e-56
NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient re ( 848) 747 169.3 6.1e-41
XP_016864068 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 893) 747 169.4 6.3e-41
XP_011530520 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 920) 747 169.4 6.5e-41
NP_001124170 (OMIM: 602345,616410) short transient ( 921) 747 169.4 6.5e-41
XP_016864067 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 936) 747 169.4 6.6e-41
XP_011530519 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 937) 747 169.4 6.6e-41
XP_016873711 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 845) 737 167.2 2.7e-40
XP_011541270 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 876) 737 167.2 2.7e-40
NP_004612 (OMIM: 603652,603965) short transient re ( 931) 737 167.2 2.9e-40
XP_016873710 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 815) 390 93.2 4.8e-18
NP_001307280 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1469) 261 65.9 1.4e-09
XP_016883946 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1499) 261 65.9 1.5e-09
XP_005261228 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1503) 261 65.9 1.5e-09
NP_003298 (OMIM: 603749) transient receptor potent (1503) 261 65.9 1.5e-09
XP_011528038 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533) 261 65.9 1.5e-09
XP_016883945 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533) 261 65.9 1.5e-09
NP_001307279 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1553) 261 65.9 1.5e-09
NP_002411 (OMIM: 603576,613216) transient receptor (1603) 193 51.4 3.6e-05
NP_001238953 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1625) 193 51.4 3.6e-05
NP_001238949 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1642) 193 51.4 3.6e-05
NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 182 48.9 0.00011
NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 182 48.9 0.00011
NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 182 48.9 0.00011
NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 182 48.9 0.00011
NP_001308211 (OMIM: 604559,606936) transient recep ( 678) 167 45.6 0.00086
XP_005259074 (OMIM: 604559,606936) PREDICTED: tran ( 785) 167 45.7 0.00096
NP_001308214 (OMIM: 604559,606936) transient recep ( 860) 167 45.7 0.001
NP_001308212 (OMIM: 604559,606936) transient recep (1040) 167 45.8 0.0012
NP_001182156 (OMIM: 604559,606936) transient recep (1069) 167 45.8 0.0012
NP_001308210 (OMIM: 604559,606936) transient recep (1099) 167 45.8 0.0012
NP_060106 (OMIM: 604559,606936) transient receptor (1214) 167 45.8 0.0013
XP_016870649 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1172) 162 44.7 0.0027
XP_016870648 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1184) 162 44.7 0.0028
>>NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient receptor p (793 aa)
initn: 5237 init1: 5237 opt: 5237 Z-score: 6029.7 bits: 1126.5 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 5237; 100.0% identity (100.0% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-793)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 FRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::
NP_001 FRTSKYAMFYPRN
790
>>XP_016862610 (OMIM: 602343) PREDICTED: short transient (732 aa)
initn: 4851 init1: 4851 opt: 4851 Z-score: 5585.5 bits: 1044.2 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 4851; 100.0% identity (100.0% similar) in 732 aa overlap (62-793:1-732)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 MALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDYYMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTIT
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTIT
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 IENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQN
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 PEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSR
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 FRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFL
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHG
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 ASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFL
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 EESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYL
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 RLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDC
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 VGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNV
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 VVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTI
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 CYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQ
640 650 660 670 680 690
760 770 780 790
pF1KE2 STDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 STDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
700 710 720 730
>>XP_005247795 (OMIM: 602343) PREDICTED: short transient (695 aa)
initn: 4546 init1: 4546 opt: 4546 Z-score: 5234.4 bits: 979.2 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 4546; 99.9% identity (100.0% similar) in 685 aa overlap (109-793:11-695)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 CVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVVGAVDILLNHRPKRSS
.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MRSFSCWRATRSADALLVAIDSEVVGAVDILLNHRPKRSS
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 RPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLC
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 SAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDY
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 EELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQ
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 KEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGR
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 IIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSD
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 IKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVA
350 360 370 380 390 400
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 EGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQL
410 420 430 440 450 460
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 YDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQ
470 480 490 500 510 520
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 SFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTL
530 540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 PPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCL
590 600 610 620 630 640
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 VHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
650 660 670 680 690
>>XP_016862611 (OMIM: 602343) PREDICTED: short transient (709 aa)
initn: 4662 init1: 4338 opt: 4345 Z-score: 5002.7 bits: 936.3 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 4605; 95.1% identity (95.1% similar) in 739 aa overlap (55-793:5-709)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 SSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDYYMVKKILEENSSGDLNINCVDVLG
: :::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MFVYCYLGDYYMVKKILEENSSGDLNINCVDVLG
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90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVK
::::::::::::::::::::::::: :
XP_016 RNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQ----------------------------------K
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150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKK
70 80 90 100 110 120
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pF1KE2 DSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQ
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pF1KE2 CKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPF
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pF1KE2 MKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAF
370 380 390 400 410 420
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pF1KE2 ANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYT
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pF1KE2 SKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAV
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pF1KE2 IVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNI
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pF1KE2 IPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLT
610 620 630 640 650 660
750 760 770 780 790
pF1KE2 SMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
670 680 690 700
>>NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor pote (759 aa)
initn: 5016 init1: 4338 opt: 4345 Z-score: 5002.3 bits: 936.4 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 4952; 95.7% identity (95.7% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQ-----------
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pF1KE2 EVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 -----------------------KLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
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pF1KE2 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
150 160 170 180 190 200
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pF1KE2 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
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pF1KE2 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
330 340 350 360 370 380
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pF1KE2 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
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pF1KE2 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
450 460 470 480 490 500
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pF1KE2 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
510 520 530 540 550 560
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pF1KE2 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
570 580 590 600 610 620
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pF1KE2 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
630 640 650 660 670 680
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pF1KE2 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
690 700 710 720 730 740
790
pF1KE2 FRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::
NP_003 FRTSKYAMFYPRN
750
>>XP_005247796 (OMIM: 602343) PREDICTED: short transient (661 aa)
initn: 4338 init1: 4338 opt: 4338 Z-score: 4995.0 bits: 934.8 E(86068): 0
Smith-Waterman score: 4338; 100.0% identity (100.0% similar) in 650 aa overlap (144-793:12-661)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LLVAIDSEVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MRSFSCWRATRKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYE
10 20 30 40
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDP
50 60 70 80 90 100
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDE
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMT
170 180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 VLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKK
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 NTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALK
290 300 310 320 330 340
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 VVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQM
350 360 370 380 390 400
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFA
410 420 430 440 450 460
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 LFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIA
470 480 490 500 510 520
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 NHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKR
530 540 550 560 570 580
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 QNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRN
590 600 610 620 630 640
780 790
pF1KE2 EIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
::::::::::::::::::::
XP_005 EIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
650 660
>>NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient receptor p (893 aa)
initn: 2217 init1: 881 opt: 2284 Z-score: 2626.7 bits: 497.0 E(86068): 1.5e-139
Smith-Waterman score: 2284; 48.3% identity (75.0% similar) in 768 aa overlap (37-793:20-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
.: :. :. :. :: .: : .:::: ::
NP_001 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KILEENSSG-DLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVV
: ::: .::::.: :::.:. :.::::::....:::... .:::: :: .:::
NP_001 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDV
:::..::::. : :.. . .. : :. : :..:.::::: :::::. .:... :
NP_001 GAVELLLNHK-KPSGEKQVPPILLDKQFSEF--TPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSAD
:.:.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .
NP_001 SVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEE
:.::: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::
NP_001 LQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RM--NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFW
. .:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...
NP_001 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALE
::.:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : : ... : .::
NP_001 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFH
...... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :.
NP_001 IVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFL
. :..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. :::
NP_001 ALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE2 GMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKD--CVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIF
.. :::..:. ::.::: . .: : : :: ::.: :..: ... : .::: ::
NP_001 FIYCLVLLAFANGLNQLY---FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIF
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 SLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKE
.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : :
NP_001 GL--INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIE
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 WKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQ----N
:::::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:. .
NP_001 WKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFG
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEI
.. . . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :.
NP_001 TIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEV
700 710 720 730 740 750
780 790
pF1KE2 RDLLGFRTSKYAMFYPRN
:: : :: . . :
NP_001 LGLL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLA
760 770 780 790 800
>>NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor pote (977 aa)
initn: 2217 init1: 881 opt: 2284 Z-score: 2626.1 bits: 497.1 E(86068): 1.6e-139
Smith-Waterman score: 2284; 48.3% identity (75.0% similar) in 768 aa overlap (37-793:20-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
.: :. :. :. :: .: : .:::: ::
NP_057 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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: ::: .::::.: :::.:. :.::::::....:::... .:::: :: .:::
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:::..::::. : :.. . .. : :. : :..:.::::: :::::. .:... :
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.. :::..:. ::.::: . .: : : :: ::.: :..: ... : .::: ::
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pF1KE2 SLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKE
.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : :
NP_057 GL--INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIE
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NP_057 WKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFG
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pF1KE2 SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEI
.. . . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :.
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pF1KE2 RDLLGFRTSKYAMFYPRN
:: : :: . . :
NP_057 LGLL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSA
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>>NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor pote (982 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
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NP_003 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
10 20 30 40
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pF1KE2 KILEENSSG-DLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVV
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NP_003 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
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pF1KE2 GAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDV
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NP_003 GAVELLLNHK-KPSGEKQVPPILLDKQFSEF--TPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGV
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pF1KE2 SLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSAD
:.:.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .
NP_003 SVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWE
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pF1KE2 LKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEE
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pF1KE2 RM--NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFW
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NP_003 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
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pF1KE2 PVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALE
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NP_003 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPT
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NP_003 IVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYS
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pF1KE2 DFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFL
. :..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. :::
NP_003 ALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFL
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pF1KE2 SLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKE
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NP_003 GL--INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIE
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 WKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNS---
:::::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:.
NP_003 WKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFG
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pF1KE2 -----LKEWRNLKQ-KRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSK
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pF1KE2 FRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
:: :. :: : :: . . :
NP_003 FRFEVLGLL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLI
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>>NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor pote (973 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSP-NEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGD
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pF1KE2 YYMVKKILEENS-SGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAI
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NP_036 YATVKQALQEAEIYYNVNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAI
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pF1KE2 DSEVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTML
.::::::..::..: . :.. . :: : :. : :..:..:::: :::::. .:
NP_036 RKEVVGAVELLLSYR-RPSGEKQVPTLMMDTQFSEF--TPDITPIMLAAHTNNYEIIKLL
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pF1KE2 LKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAF
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NP_036 VQKRVTIPRPHQIRCNCVECVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAF
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pF1KE2 ELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSS-DEPLDK
.:. .::::: :: ::. .::::..:::.:::::: :::.:::::.:::: .. .: ::
NP_036 RLGWELKELSKVENEFKAEYEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDP
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pF1KE2 RGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTV
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NP_036 ----QKYHDLAKLKVAIKYHQKEFVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTI
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pF1KE2 GIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMG
:...:.::. :::.:.:..: .:. ::.::: : :::.:::..: : : . ...:
NP_036 GFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFIKKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQG
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pF1KE2 PALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAH
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NP_036 PPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIKEMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAY
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pF1KE2 NKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDF
:.. :..:. .::::.::.:::..:.:: :::. ..:..: :::::::.:.:: :.
NP_036 VKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEALFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDI
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pF1KE2 GKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSK---EQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFAL
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NP_036 LKFLFIYCLVLLAFANGLNQLY-FYYETRAIDEPNNCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSL
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pF1KE2 FWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIAN
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NP_036 FWSVFGL--LNLYVTNVKARHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIAD
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 HEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSK-GKVKR
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NP_036 HADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPPFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRR
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pF1KE2 QN--SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKF
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NP_036 RNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNLVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSF
700 710 720 730 740 750
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pF1KE2 RNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
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NP_036 RYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]