FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2680, 427 aa 1>>>pF1KE2680 427 - 427 aa - 427 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6246+/-0.000827; mu= 16.5747+/- 0.050 mean_var=70.0081+/-13.849, 0's: 0 Z-trim(107.1): 70 B-trim: 3 in 1/52 Lambda= 0.153285 statistics sampled from 9287 (9361) to 9287 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16 Scan time: 1.960 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 2822 633.0 1.7e-181 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 2594 582.6 2.6e-166 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 891 205.9 5.7e-53 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 874 202.2 7.8e-52 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 858 198.6 9.1e-51 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 838 194.3 2.2e-49 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 776 180.6 4.8e-45 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 735 171.5 1.5e-42 CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 716 167.3 3e-41 CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 704 164.6 1.9e-40 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 693 162.2 1e-39 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 686 160.7 4.5e-39 CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 668 156.6 3.7e-38 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 655 153.7 2.6e-37 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 641 150.7 2.9e-36 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 641 150.7 3.6e-36 CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 636 149.6 5.9e-36 CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 636 149.6 6e-36 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 638 150.2 8.9e-36 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 638 150.2 8.9e-36 CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 622 146.5 5e-35 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 597 140.9 2e-33 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 589 139.2 1.1e-32 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 579 137.1 7e-32 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 565 134.0 4.8e-31 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 565 134.0 4.8e-31 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 563 133.5 6e-31 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 560 132.8 9.1e-31 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 554 131.5 2.2e-30 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 554 131.5 2.2e-30 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 554 131.6 3e-30 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 554 131.6 3e-30 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 545 129.5 8.7e-30 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 537 127.8 4.1e-29 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 533 126.9 5.6e-29 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 519 123.8 5e-28 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 519 123.8 5.1e-28 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 512 122.2 1.5e-27 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 485 116.2 8.2e-26 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 485 116.3 9.7e-26 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 485 116.3 9.8e-26 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 485 116.3 1e-25 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 433 104.8 2.9e-22 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 433 104.8 3.1e-22 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 415 100.8 4.7e-21 CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 410 99.6 7.3e-21 CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 400 97.5 5.1e-20 CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 329 81.7 1.9e-15 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 292 73.5 6e-13 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 291 73.3 6.9e-13 >>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 (427 aa) initn: 2822 init1: 2822 opt: 2822 Z-score: 3371.9 bits: 633.0 E(32554): 1.7e-181 Smith-Waterman score: 2822; 100.0% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-427) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 DCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 DCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 TRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 NRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 NRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 FMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 FMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 ALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 ALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 YDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 YDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDIS 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 TYIEQSR ::::::: CCDS12 TYIEQSR >>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 (428 aa) initn: 2585 init1: 2519 opt: 2594 Z-score: 3099.4 bits: 582.6 E(32554): 2.6e-166 Smith-Waterman score: 2594; 90.0% identity (97.7% similar) in 428 aa overlap (1-427:1-428) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAEQDVENDLLDY-DEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI :::.::.:.:::: :.: : : ... :: :::.::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::: CCDS46 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 HTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALV :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::. CCDS46 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 RNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCR ::.:..::..:::.::::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::.:::::: CCDS46 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 KFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRC ::::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::: CCDS46 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 MALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVF .:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS46 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.:::: CCDS46 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI 370 380 390 400 410 420 420 pF1KE2 STYIEQSR :.::::.: CCDS46 SSYIEQTR >>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 (407 aa) initn: 797 init1: 411 opt: 891 Z-score: 1064.4 bits: 205.9 E(32554): 5.7e-53 Smith-Waterman score: 891; 38.3% identity (72.4% similar) in 373 aa overlap (46-417:35-403) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 EEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI : :. :: :::.: :::.:: .:.. : CCDS32 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERF : :.::. ::.:: ::::.:... :::.: .. .::. ::::: ::.: . CCDS32 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 SKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLD . :: .. . .:: ..... . :. . ::.:::::::.. .. : .: : .: :::: CCDS32 GDYM-GATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETK : :.:: . .. .. :::. : ...:::. :. : .:::.::....: : . CCDS32 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 LTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAI :::.:..:.:.... : : : :: ..: ..:..::... .. :.. . ..: . CCDS32 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 AIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRV :.: : :.:: ...:.. . :.:..:.:..::.:...:..:.:::.: . ..:.::. CCDS32 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 pF1KE2 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR .:.:::: ::.::.::..: : .:: :.. ....: :.: .. CCDS32 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI 370 380 390 400 >>CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (406 aa) initn: 781 init1: 405 opt: 874 Z-score: 1044.1 bits: 202.2 E(32554): 7.8e-52 Smith-Waterman score: 874; 36.5% identity (72.0% similar) in 389 aa overlap (30-417:19-402) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV :. :.... : .: : :. :. :::.: CCDS11 MSASQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDS-FDDMNLSESLLRGIY 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 DCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCH :::.:: .:.. : : :.::. ::.:: ::::.:... ::::: . .::. CCDS11 AYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAP 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVR ::::: ::.: .. :: ... . .:: ... . . :. . ::..::::::.. .. CCDS11 TRELAQQIQKVVMALGDYM-GASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLN 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 NRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRK : .: : .: ::::: :.:: . .. .. .::. . : ...:::. .:. : .: CCDS11 RRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSR-GFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKK 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KE2 FMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRC ::.::....: : .:::.:..:.:.... : : : :: ..: ..:..::... .. CCDS11 FMRDPIRILVKKE-ELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 MALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVF :.. . ..: . :.: : :.:: ...:.. . :.:..:.:..::.:...:..:. CCDS11 DWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVI 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDI :::.: . ..:.::..:.:::: ::.::..:..: : . : :.. ..... :.: .. CCDS11 NYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEE-DKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVAD 350 360 370 380 390 400 420 pF1KE2 STYIEQSR CCDS11 LI >>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 (411 aa) initn: 715 init1: 379 opt: 858 Z-score: 1024.9 bits: 198.6 E(32554): 9.1e-51 Smith-Waterman score: 858; 35.9% identity (71.6% similar) in 373 aa overlap (46-417:40-407) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 EEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI : . :. .:::.: :::.:: .:.. : CCDS11 SGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERF : : : ::. :..:: ::::.: ...:: .. .. .:.. ::::: ::.: . CCDS11 KQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLAL 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 SKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLD . :: .:. . .:: .. .: . : . :::.:::::.. ..: ::. . .: .::: CCDS11 GDYM-NVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYG-QHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLD 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETK : :.::.. ..... ...: : : ...:::: ..: . ::: ::....: . . CCDS11 EADEMLNK-GFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRD-E 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 LTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAI :::.:..:..: .. : : : :: :.: ..:..:: .. .. :.. . : :: . CCDS11 LTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVS 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 AIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRV ..: : :.:: : ...:.. :.:..:....::.:. .:....:::.:.. . :.::. CCDS11 SMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRI 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 pF1KE2 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR .:.::.: ::.::.::... : .:: :... . ... :.: .. CCDS11 GRSGRYGRKGVAINFVKND-DIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI 370 380 390 400 410 >>CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 (483 aa) initn: 725 init1: 358 opt: 838 Z-score: 999.9 bits: 194.3 E(32554): 2.2e-49 Smith-Waterman score: 838; 35.7% identity (69.7% similar) in 406 aa overlap (23-425:73-472) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKK-DIKGSYV-SIHSSGFRDFL ... ::: :: : : : ... :.:. CCDS44 NQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTTIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYC 50 60 70 80 90 100 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVN :: ::: .: . :.:.:: .:.: :: :. : :.: .::.: ::...... :.... . CCDS44 LKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKK 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 pF1KE2 GQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLK-KNCPHVVV .. ..:. :::::.:.:. . ::.: ..:: . :: ... : ... . :::. CCDS44 DNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDD--IMRLDDTVHVVI 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 GTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSAT .:::::: :... .. .:. .:::: ::.: : :. . ...:. :...: ...::: CCDS44 ATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQ-DFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSAT 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQV . ... . .: :.:. . .: :::.:. :::. . . .: . : :.. :..:: CCDS44 FPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEE--LTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQS 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 IIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRG ::: .: :: ::. . . .. . :: : ::.: ...:.. : :: :.:: :: CCDS44 IIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRG 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 MDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVN .::. ::.:.:.:.:. ..:::::..:.:::: ::::.... .: :....... .. CCDS44 IDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLIT-YDDRFNLKSIEEQLGTE 400 410 420 430 440 450 410 420 pF1KE2 VAELPEEIDISTYIEQSR . .: .:: : :. . CCDS44 IKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP 460 470 480 >>CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 (824 aa) initn: 775 init1: 370 opt: 776 Z-score: 922.2 bits: 180.6 E(32554): 4.8e-45 Smith-Waterman score: 783; 34.1% identity (65.9% similar) in 419 aa overlap (20-417:26-440) 10 20 30 40 pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQ-ESTPAPPK-----KDIK------GSYVSIH :.: : ::.: . .:.. :. . . CCDS84 MAAAFEASGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAE 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 SSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLAT . :...::. .:... :::.:: :: . :: . :.:.. ::::: ::: :: . CCDS84 PADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 LQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKK :... : .. .:.. :::.: :: . .. : ... ::.:: ...:. ::: CCDS84 LDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 NCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQ : :..::.:::: :.. .. ... :.::: ::.::. ....... :. : :: CCDS84 -C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQ 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE2 CMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDS---------EK . ::: . . . :.:.:: : ... . .: ::.::: :. .: :: CCDS84 MLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNS-SDPSLIGLKQYY-KVVNSYPLAHKVFEEK 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 NRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFK ...: .:.. . :::...: . .: . ::..: ..::: : .: :..::. . ..: CCDS84 TQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLK 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 DFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDE :. :.:..:.: .::.: :.::.: : :.: : .::.::..::::::: ::..:. CCDS84 HFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRG 360 370 380 390 400 410 400 410 420 pF1KE2 NDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR .. ... . .. ..:. ::. : CCDS84 EEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQI 420 430 440 450 460 470 >>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa) initn: 649 init1: 315 opt: 735 Z-score: 877.2 bits: 171.5 E(32554): 1.5e-42 Smith-Waterman score: 735; 32.3% identity (68.6% similar) in 405 aa overlap (17-418:5-394) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQE-STPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI :: ..: : : : ... : :.:. . : .: CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKT---------FKDLGVTDVLCEAC 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMC . :. .:...: : :: :. : :.. :..: :::..:.: :. . . .. .::. CCDS86 DQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLT 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 HTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGL-SIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILAL :::::::::...: ... . .:. .:. ::. :.... . :: ::....::::.. CCDS86 PTRELAFQISEQFEALGSSI-GVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKK--PHIIIATPGRLIDH 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRN-RSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPV ..: ..:.:. .:..:.:: :..:. .:.. .:..:... :.... ..::::..: .. . CCDS86 LENTKGFNLRALKYLVMDEADRILN-MDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKL 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 CRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQ : ...:.. :... . :.. :::::. . .. :. : .:. : :. .:: .. . CCDS86 QRAALKNPVKCAVSSKYQ-TVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCN 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 RCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNI . : :: . .: :: .: :.: .::. ..:: : ::.::.. .::.:: .:.. CCDS86 NTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDV 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 VFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEI : :.:.: : :.:::.:..: : .: :::::. . :..... .. . .. .: . CCDS86 VVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVT-QYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQD 340 350 360 370 380 390 420 pF1KE2 DISTYIEQSR : CCDS86 DEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRK 400 410 420 430 440 450 >>CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 (479 aa) initn: 679 init1: 279 opt: 716 Z-score: 854.2 bits: 167.3 E(32554): 3e-41 Smith-Waterman score: 716; 31.8% identity (67.2% similar) in 399 aa overlap (31-418:81-472) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV ..: .. :..: :... :::.::... CCDS10 EEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKS--FEELRLKPQLLQGVY 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 pF1KE2 DCGFEHPSEVQHECIPQAIL--GMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVM ::..::..:.. .: . .... :..:: ::::.:::: :.:.::.: : . CCDS10 AMGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCL 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 CHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILAL : :::.: .: :...:..: .:.. : .... ... .. .:.:::: .: CCDS10 SPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQ----IVIGTPGTVLDW 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRNRSF-SLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPV . .: . :..: ::::: : :. . . .: :. :.. : ..::::. .. CCDS10 CSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKF 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 CRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD-SEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSV .: . :: . . : . :: ..:::: .. .:: . : .: .. . :..:: .. CCDS10 AQKVVPDPNVIKLKREEE-TLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTR 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVN . :: : ... . . : :.: . ..:.. ....::.::. .::.:.:.:. CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 IVFNYDMPEDSD------TYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNV .:.:.:.: :.: :::::..:.:::: .:::...:..... .::: .:..:. .. CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI 410 420 430 440 450 460 420 pF1KE2 AELP-EEIDISTYIEQSR .: ...: CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN 470 >>CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 (478 aa) initn: 666 init1: 279 opt: 704 Z-score: 839.8 bits: 164.6 E(32554): 1.9e-40 Smith-Waterman score: 704; 31.3% identity (67.2% similar) in 399 aa overlap (31-418:80-471) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV ..: .. :..: :... :::.::... CCDS10 EEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKS--FEELRLKPQLLQGVY 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 pF1KE2 DCGFEHPSEVQHECIPQAIL--GMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVM ::..::..:.. .:. . .... :..:: ::::.:::: :...:: . : . CCDS10 AMGFNRPSKIQENALPMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCLCL 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 CHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILAL : :::.: .: :...:..: .:.. : .... ... .. .:.:::: .: CCDS10 SPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQ----IVIGTPGTVLDW 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRNRSF-SLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPV . .: . :..: ::::: : :. . . .: :. :.. : ..::::. .. CCDS10 CSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKF 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 CRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD-SEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSV .: . :: . . : . :: ..:::: .. .:: . : .: .. . :..:: .. CCDS10 AQKVVPDPNVIKLKREEE-TLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTR 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVN . :: : ... . . : :.: . ..:.. ....::.::. .::.:.:.:. CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 IVFNYDMPEDSD------TYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNV .:.:.:.: :.: :::::..:.:::: .:::...:..... .::: .:..:. .. CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI 410 420 430 440 450 460 420 pF1KE2 AELP-EEIDISTYIEQSR .: ...: CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN 470 427 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Mar 1 16:48:51 2017 done: Wed Mar 1 16:48:51 2017 Total Scan time: 1.960 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]