FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2689, 562 aa 1>>>pF1KE2689 562 - 562 aa - 562 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6729+/-0.00067; mu= 17.7568+/- 0.041 mean_var=79.7699+/-15.515, 0's: 0 Z-trim(111.6): 22 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.143600 statistics sampled from 12493 (12509) to 12493 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16 Scan time: 2.660 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 562) 3917 820.9 0 CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 528) 2522 531.8 7.7e-151 CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 574) 1872 397.2 2.8e-110 CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 563) 1761 374.2 2.3e-103 CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 512) 1757 373.3 3.9e-103 CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 531) 1019 220.5 4.2e-57 CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 543) 1019 220.5 4.3e-57 CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 549) 1019 220.5 4.3e-57 CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 ( 505) 753 165.3 1.6e-40 CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 ( 647) 583 130.2 7.7e-30 >>CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (562 aa) initn: 3917 init1: 3917 opt: 3917 Z-score: 4383.0 bits: 820.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3917; 100.0% identity (100.0% similar) in 562 aa overlap (1-562:1-562) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MPIQIFCSMSFSSGEEAPGPLGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MPIQIFCSMSFSSGEEAPGPLGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 PMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 PMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDDPGVPLAPPGPEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 TLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDDPGVPLAPPGPEA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 FSGEPFNLHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 FSGEPFNLHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 PGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 PGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 MVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKAS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 AKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 AKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGAS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 ILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAG 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 MTYAANILPHHPARGTFEDFTC :::::::::::::::::::::: CCDS58 MTYAANILPHHPARGTFEDFTC 550 560 >>CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (528 aa) initn: 2814 init1: 2515 opt: 2522 Z-score: 2821.5 bits: 531.8 E(32554): 7.7e-151 Smith-Waterman score: 2794; 78.9% identity (88.7% similar) in 522 aa overlap (53-562:7-528) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 DIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFVE .: : .:... :::.: :::: ::: CCDS44 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSY 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 GGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTN . ...:::. :. .:...:: .:: ::. : ::: :.:::...:.:::::::: : CCDS44 ERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLN 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 pF1KE2 AVRLSQLSYPDLLYLAPMLGL--DESDDPGVPLAPPGP----------EAFSGEPFNLHR :.::.: :: . . .:.: .. . : . .: ..:. .:::... 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CCDS87 EFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMRE 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 FYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN ::.:. : ..:::: : ..: :. ..:.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 FYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK 340 350 360 370 380 390 440 450 460 pF1KE2 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLG----------------------- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKA 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 pF1KE2 -----------------------DIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 GCSLLSHEGPPPQRPFPKPCCLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGK 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 CQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 CQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC 520 530 540 550 560 570 >>CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (563 aa) initn: 1178 init1: 979 opt: 1761 Z-score: 1969.0 bits: 374.2 E(32554): 2.3e-103 Smith-Waterman score: 1964; 59.5% identity (76.6% similar) in 516 aa overlap (73-562:66-563) 50 60 70 80 90 pF1KE2 EEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFV----EGGPGPRQVLWAVAFVL ::: :. . :: :..::..:: CCDS11 GQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSLSRAKLHGLRHMCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCT 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 ALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLA ..: .: ..:. :.::.: : ... . .: :::::.::.: .:. .:: :: : . 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CCDS42 FDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV 460 470 480 490 550 560 pF1KE2 LPHHPARGTFEDFTC : . . ::.:...: CCDS42 -PLQTTLGTLEEIAC 500 510 >>CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (531 aa) initn: 1463 init1: 673 opt: 1019 Z-score: 1138.6 bits: 220.5 E(32554): 4.2e-57 Smith-Waterman score: 1744; 50.7% identity (76.8% similar) in 501 aa overlap (57-538:9-507) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 PHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPM-DLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGP :.. : :. .::..:..:: .:.: :. CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR . :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .: CCDS59 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE :.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :. 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CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR . :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .: CCDS59 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE :.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :. 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CCDS59 LNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEI 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI .:: ::.. :. .....: :. . : .. ::. .::: : .. CCDS59 LDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HL 460 470 480 490 500 550 560 pF1KE2 LPHHPARGTFEDFTC :: : : CCDS59 LPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS 510 520 530 540 >>CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (549 aa) initn: 1463 init1: 673 opt: 1019 Z-score: 1138.4 bits: 220.5 E(32554): 4.3e-57 Smith-Waterman score: 1741; 50.0% identity (76.4% similar) in 512 aa overlap (57-549:9-516) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 PHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPM-DLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGP :.. : :. .::..:..:: .:.: :. CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR . :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .: CCDS59 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE :.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :. CCDS59 RSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLD 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 DMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQ :::: : ..: ::::.::...:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.:: CCDS59 DMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQ 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 DEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPP .:::::: ...:: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .:::: CCDS59 EEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPP 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 pF1KE2 WGTCKAVTMDSDLDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD :: :...... . . : :.. .::. :::::....:.::::.:::: CCDS59 WGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGD 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK .: :.:.:::.:: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.: CCDS59 VPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARK 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL .:.:: ::.::.:.::::::.:::::.:::::::.. ::::::::::::::::.::.::. CCDS59 LNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEI 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI .:: ::.. :. .....: :. . . .: . . . : :: : :. . . .. CCDS59 LDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLLQEGLGSHRTQVPHLSL-G-PSTLLCSEDL 460 470 480 490 500 510 550 560 pF1KE2 LPHHPARGTFEDFTC : CCDS59 PPLPVPSPRLSPPPTAPATLSHSSRPAVCVLGAPP 520 530 540 >>CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 (505 aa) initn: 683 init1: 250 opt: 753 Z-score: 841.1 bits: 165.3 E(32554): 1.6e-40 Smith-Waterman score: 753; 30.4% identity (62.4% similar) in 441 aa overlap (67-492:41-468) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGPRQVLWAVAF :: : ..:: ..: :.. :.::: :. CCDS37 AENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGIHNI-VQNRSKIRRVLWLVVV 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 VLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLY . ... :. :. :...: .: .. . .. :::::.:: : . . .. ... CCDS37 LGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNRFQTDAVAKFGVIF 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 L-----APMLGLDESDDPGVPLAPPGPEAFSGEPFNLHRFY-NRSCHRLEDMLLYCSYQG . . .: :.: .. : : . :.. .: :.. . .. :: : . : CCDS37 FLWHIVSKVLHLQEITANSTGSREATDFAASHQNFSIVEFIRNKGFYLNNSTLLDCEFFG 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 pF1KE2 GPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYL--PVWG ::.:..:. :::.::.:.::: :. . . :. . .: :: ......:. . :. : CCDS37 KPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGETLQAKRKV--SVSGRGLSLLFNVNQEAFTDNPALG 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 ETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVT .: ::: ::: . : .: ::. :... :. .. . .. ::: :. CCDS37 FVD-----AGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQVKTVHQEYPWGECNP-- 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 MDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLV . :. :.::: ..: .:..... ..:.: .:: . : ..: :..:.:: . CCDS37 -NIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCVSPVLDHIE 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 EKDQEYCV-------CEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILV :: :. : . :. .: .:. ..::. . :::.::.:.:..:: ::.. CCDS37 FKD--LCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIRENLVK 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 LDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCR ..: . :::. .:.:: .. ::.:.:::.::: :::..:..:...: . CCDS37 IEINYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNFYWICIF 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFT CCDS37 FLLKISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC 480 490 500 >>CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 (647 aa) initn: 1379 init1: 532 opt: 583 Z-score: 649.2 bits: 130.2 E(32554): 7.7e-30 Smith-Waterman score: 1619; 48.5% identity (70.7% similar) in 546 aa overlap (36-562:136-647) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 FCSMSFSSGEEAPGPLGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEA-----SEGHS :. .::. . ::::: ... . : . CCDS24 PGLLAREGQGREALASPSSRGQMPIEIVCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAA 110 120 130 140 150 160 70 80 90 100 110 pF1KE2 PMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGP---RQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSY : ::..::.. :::: .. :::: :..:::.:.. .:.::: :.. . ::. CCDS24 PRDLATFASTSTLHGLGRAC---GPGPHGLRRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTR 170 180 190 200 210 220 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 PHVTLLNEVATTELA-FPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDDPG---VPL ::.. .. .: . .: :::::::: : : : :: :...:: . :: .: : . : CCDS24 PHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRHSALSDADIFHLANLTGLPPKDRDGHRAAGL 230 240 250 260 270 280 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 APPGPEAFSGEPFNLHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNS : :. . . ::. :.: ::: :...: :. :::::.::::::::::. CCDS24 RYPEPDMVD--------ILNRTGHQLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA 290 300 310 320 330 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFID : : : . :: :.::::::::::.::::.: ::.::::::::.::::::.:::.: CCDS24 --DPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIH 340 350 360 370 380 390 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTM--DSDLDFFDSYSITACRIDCETR ::::::.:::::::.:::::: ::: :::.:.: . . .:. ...::..:::. :: . CCDS24 QLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKE 400 410 420 430 440 450 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 YLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELS ... :.::::::: :. :: : : : ::::::::::.: CCDS24 AVLQRCHCRMVHMP-DSLGGGPE------GP------------CFCPTPCNLTRYGKEIS 460 470 480 490 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 MVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGG ::.::...::.:::.:.:..: :: ::.::::.:::.:. :..::. :: ...::::.:: CCDS24 MVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGG 500 510 520 530 540 550 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 QMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPC ::::::::::::.::..:: ::: .: : . : :.:. .:.:...:...:: CCDS24 QMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPC 560 570 580 590 600 610 540 550 560 pF1KE2 ESLRGHPAGMTYAANILPHH-----PARGTFEDFTC : ::. : ....::.: : : ::::.: CCDS24 PS-RGRVEG-GGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC 620 630 640 562 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Jun 2 11:44:48 2017 done: Fri Jun 2 11:44:49 2017 Total Scan time: 2.660 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]