FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2742, 1361 aa 1>>>pF1KE2742 1361 - 1361 aa - 1361 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4667+/-0.0011; mu= 21.5116+/- 0.066 mean_var=61.3513+/-12.052, 0's: 0 Z-trim(101.7): 32 B-trim: 3 in 1/49 Lambda= 0.163743 statistics sampled from 6690 (6716) to 6690 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16 Scan time: 2.250 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS10315.1 CEMIP gene_id:57214|Hs109|chr15 (1361) 9456 2243.4 0 CCDS6638.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9 (1383) 3076 736.2 1.5e-211 CCDS47979.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9 (1320) 2846 681.9 3.3e-195 >>CCDS10315.1 CEMIP gene_id:57214|Hs109|chr15 (1361 aa) initn: 9456 init1: 9456 opt: 9456 Z-score: 12057.1 bits: 2243.4 E(33420): 0 Smith-Waterman score: 9456; 100.0% identity (100.0% similar) in 1361 aa 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CCDS66 LPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIGFLMKNSWQITPRNNISLVK 860 870 880 890 900 910 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 FEDVPITSRVFFGEPGPWFNQLDMDGDKTSVFHDVDGSVSEYPGSYLTKNDNWLVRHPDC : .. ::::.:::::.. .:::::.:.:::.::::. : .:. . ::.:.:::.: CCDS66 F-GPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGYKDAYVGRMDNYLIRHPSC 920 930 940 950 960 970 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 INVPDWRGAICSGCYAQMYIQAYKTSNLRMKIIKNDFPSHPLYLEGALTRSTHYQQYQPV .:: : ..:::: :::.:.:...:.:: : : ....::.:. :.: ..... . ::::: CCDS66 VNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPMVLRG-INQKAAFPQYQPV 980 990 1000 1010 1020 1030 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 VTLQKGYTIHWDQTAPAELAIWLINFNKGDWIRVGLCYPRGTTFSILSDVHNRLLKQTSK : :.:::::::. :: ..:.::::.:::::::::: .:.:.. .: . :: CCDS66 VMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTSFQVTFGYLQRQNGSLSK 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 TGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFLKLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKA . . ........ :. .:.: ..::::: :::...:. ..:: .::::.::.: CCDS66 IEEYEPVHSLEELQRKQSERK-FYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHGHSYCSSQGCERVKIQA 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 LIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLFG-------SQLK-TKD-H--FLEVKM . .:.: : :::.. .. : :: : : :. :.: : .: :.. CCDS66 -ATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQVVFTSDPHKSYLPVQF 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 ESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQG--RVVSHTSFRNSILQGIP .: . . .: . : :.: . :. ..:.: . :.. .: : : . CCDS66 QSPDKAETQR-GDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLTEKTVFP---LADVS 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 WQLFNYVAT-IPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKL--KEQMAFVGFKGS .. .:. : :: ::::....:. ... ...: :: . .: : . :.::.:. CCDS66 -RIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGE-IKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGSTIFLGFSGN 1280 1290 1300 1310 1320 1340 1350 1360 pF1KE2 FRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL :.: :. : CCDS66 FKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQASKAH 1330 1340 1350 1360 1370 1380 >>CCDS47979.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9 (1320 aa) initn: 1916 init1: 1300 opt: 2846 Z-score: 3618.4 bits: 681.9 E(33420): 3.3e-195 Smith-Waterman score: 3294; 40.4% identity (65.8% similar) in 1358 aa overlap (6-1338:80-1274) 10 20 30 pF1KE2 MGAAGRQDFLFKAMLTISW-LTLTCFPGATSTVAA .. :. :. ..:. ..:. . : .: : CCDS47 TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 pF1KE2 --GCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQGKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVI---KDHD .::::.:.:. :.::.:. ..: : .: : :::.:::.:: :..:: ::. :: . CCDS47 DENCPDQNPRLRNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGS 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 EPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNFTIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGG . :.:::..:::..:: :: :. : .... :: :::..::: . : .: :.::: :: CCDS47 RNITLRTHYILIQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEG-ESMPTFGKKFIGVEAGG 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 ALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFFERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDT .::::: .: :::.: .::. .:. :.: ::.... ::. :.::: .. ...:.:::: CCDS47 TLELHGARKASWTLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFS-RGLNVRVIDQDTAKILESERFDT 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 YRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEGSRNL-DDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHP .. ..::.:: ..: :::...::.: ....: . . . .:::. . ::.:. CCDS47 HEYRNESRRLQEFLRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQA 290 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 WSFLTVKGNPSSSVEDHIE-YHGHRGSAAARVFKLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTE :... : . :.: .. .. :..: ... : . . : : :. :.:. :::.... CCDS47 WALVGVIDGGSTSCNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEET---- 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 WFDHDKVSQTKGGEKISDLWKAHPGKICNRPIDIQATTMDGVNLSTEVVYKKGQDYRFAC CCDS47 ------------------------------------------------------------ 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 YDRGRACRSYRVRFLCGKPVRPKLTVTIDTNVNSTILNLEDNVQSWKPGDTLVIASTDYS CCDS47 ------------------------------------------------------------ 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 MYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGEEIDGVDMRAEVGLLSRNIIVMGEMEDK :..::.:: :::::::::::.:.:::...::.::. 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CCDS47 -ATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQVVFTSDPHKSYLPVQF 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 ESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQG--RVVSHTSFRNSILQGIP .: . . .: . : :.: . :. ..:.: . :.. .: : : . CCDS47 QSPDKAETQR-GDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLTEKTVFP---LADVS 1160 1170 1180 1190 1200 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 WQLFNYVAT-IPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKL--KEQMAFVGFKGS .. .:. : :: ::::....:. ... ...: :: . .: : . :.::.:. 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