Result of FASTA (ccds) for pF1KE2742
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2742, 1361 aa
  1>>>pF1KE2742     1361 - 1361 aa - 1361 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4667+/-0.0011; mu= 21.5116+/- 0.066
 mean_var=61.3513+/-12.052, 0's: 0 Z-trim(101.7): 32  B-trim: 3 in 1/49
 Lambda= 0.163743
 statistics sampled from 6690 (6716) to 6690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.201), width:  16
 Scan time:  2.250

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS10315.1 CEMIP gene_id:57214|Hs109|chr15        (1361) 9456 2243.4       0
CCDS6638.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9         (1383) 3076 736.2 1.5e-211
CCDS47979.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9        (1320) 2846 681.9 3.3e-195


>>CCDS10315.1 CEMIP gene_id:57214|Hs109|chr15             (1361 aa)
 initn: 9456 init1: 9456 opt: 9456  Z-score: 12057.1  bits: 2243.4 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 9456; 100.0% identity (100.0% similar) in 1361 aa overlap (1-1361:1-1361)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGAAGRQDFLFKAMLTISWLTLTCFPGATSTVAAGCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGAAGRQDFLFKAMLTISWLTLTCFPGATSTVAAGCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 GKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVIKDHDEPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVIKDHDEPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 TIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGGALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGGALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDTYRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDTYRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 SRNLDDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHPWSFLTVKGNPSSSVEDHIEYHGHRGSAAARVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SRNLDDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHPWSFLTVKGNPSSSVEDHIEYHGHRGSAAARVF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 KLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTEWFDHDKVSQTKGGEKISDLWKAHPGKICNRPID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTEWFDHDKVSQTKGGEKISDLWKAHPGKICNRPID
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 IQATTMDGVNLSTEVVYKKGQDYRFACYDRGRACRSYRVRFLCGKPVRPKLTVTIDTNVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IQATTMDGVNLSTEVVYKKGQDYRFACYDRGRACRSYRVRFLCGKPVRPKLTVTIDTNVN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 STILNLEDNVQSWKPGDTLVIASTDYSMYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STILNLEDNVQSWKPGDTLVIASTDYSMYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 EIDGVDMRAEVGLLSRNIIVMGEMEDKCYPYRNHICNFFDFDTFGGHIKFALGFKAAHLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EIDGVDMRAEVGLLSRNIIVMGEMEDKCYPYRNHICNFFDFDTFGGHIKFALGFKAAHLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 GTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDERGGYDPPTYIRDLSIHHTFSRCVTVHGSNGLLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDERGGYDPPTYIRDLSIHHTFSRCVTVHGSNGLLI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 KDVVGYNSLGHCFFTEDGPEERNTFDHCLGLLVKSGTLLPSDRDSKMCKMITEDSYPGYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KDVVGYNSLGHCFFTEDGPEERNTFDHCLGLLVKSGTLLPSDRDSKMCKMITEDSYPGYI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 PKPRQDCNAVSTFWMANPNNNLINCAAAGSEETGFWFIFHHVPTGPSVGMYSPGYSEHIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PKPRQDCNAVSTFWMANPNNNLINCAAAGSEETGFWFIFHHVPTGPSVGMYSPGYSEHIP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 LGKFYNNRAHSNYRAGMIIDNGVKTTEASAKDKRPFLSIISARYSPHQDADPLKPREPAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGKFYNNRAHSNYRAGMIIDNGVKTTEASAKDKRPFLSIISARYSPHQDADPLKPREPAI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 IRHFIAYKNQDHGAWLRGGDVWLDSCRFADNGIGLTLASGGTFPYDDGSKQEIKNSLFVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IRHFIAYKNQDHGAWLRGGDVWLDSCRFADNGIGLTLASGGTFPYDDGSKQEIKNSLFVG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 ESGNVGTEMMDNRIWGPGGLDHSGRTLPIGQNFPIRGIQLYDGPINIQNCTFRKFVALEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESGNVGTEMMDNRIWGPGGLDHSGRTLPIGQNFPIRGIQLYDGPINIQNCTFRKFVALEG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 RHTSALAFRLNNAWQSCPHNNVTGIAFEDVPITSRVFFGEPGPWFNQLDMDGDKTSVFHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RHTSALAFRLNNAWQSCPHNNVTGIAFEDVPITSRVFFGEPGPWFNQLDMDGDKTSVFHD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 VDGSVSEYPGSYLTKNDNWLVRHPDCINVPDWRGAICSGCYAQMYIQAYKTSNLRMKIIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDGSVSEYPGSYLTKNDNWLVRHPDCINVPDWRGAICSGCYAQMYIQAYKTSNLRMKIIK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 NDFPSHPLYLEGALTRSTHYQQYQPVVTLQKGYTIHWDQTAPAELAIWLINFNKGDWIRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NDFPSHPLYLEGALTRSTHYQQYQPVVTLQKGYTIHWDQTAPAELAIWLINFNKGDWIRV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 GLCYPRGTTFSILSDVHNRLLKQTSKTGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLCYPRGTTFSILSDVHNRLLKQTSKTGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 KLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKALIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKALIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLF
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 GSQLKTKDHFLEVKMESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQGRVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSQLKTKDHFLEVKMESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQGRVVS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 HTSFRNSILQGIPWQLFNYVATIPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HTSFRNSILQGIPWQLFNYVATIPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKLKE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360 
pF1KE2 QMAFVGFKGSFRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QMAFVGFKGSFRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL
             1330      1340      1350      1360 

>>CCDS6638.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9              (1383 aa)
 initn: 1916 init1: 1300 opt: 3076  Z-score: 3911.7  bits: 736.2 E(33420): 1.5e-211
Smith-Waterman score: 3667; 43.3% identity (69.6% similar) in 1358 aa overlap (6-1338:80-1337)

                                        10         20        30    
pF1KE2                          MGAAGRQDFLFKAMLTISW-LTLTCFPGATSTVAA
                                     .. :.  :. ..:. ..:. . : .:  : 
CCDS66 TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP
      50        60        70        80        90       100         

             40        50        60        70        80            
pF1KE2 --GCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQGKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVI---KDHD
         .::::.:.:. :.::.:. ..: : .:  : :::.:::.:: :..:: ::.   :: .
CCDS66 DENCPDQNPRLRNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGS
     110       120       130       140       150       160         

      90       100       110       120       130       140         
pF1KE2 EPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNFTIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGG
       . :.:::..:::..:: :: :.  : .... :: :::..::: .  : .: :.:::  ::
CCDS66 RNITLRTHYILIQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEG-ESMPTFGKKFIGVEAGG
     170       180       190       200       210        220        

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE2 ALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFFERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDT
       .::::: .: :::.: .::. .:.  :.: ::.... ::. :.:::  .. ...:.::::
CCDS66 TLELHGARKASWTLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFS-RGLNVRVIDQDTAKILESERFDT
      230       240       250       260        270       280       

     210       220       230       240        250       260        
pF1KE2 YRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEGSRNL-DDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHP
       .. ..::.:: ..:     :::...::.: ....: .   .  . .:::. .  ::.:. 
CCDS66 HEYRNESRRLQEFLRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQA
       290       300       310       320       330       340       

      270       280        290       300       310       320       
pF1KE2 WSFLTVKGNPSSSVEDHIE-YHGHRGSAAARVFKLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTE
       :... :  . :.: .. .. :..: ... : . . : :  :. :.:.  :::..      
CCDS66 WALVGVIDGGSTSCNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIE------
       350       360       370       380       390       400       

       330       340       350       360       370       380       
pF1KE2 WFDHDKVSQTKGGEKISDLWKAHPGKICNRPIDIQATTMDGVNLSTEVVYKKGQDYRFAC
                                               ::.::               
CCDS66 ----------------------------------------GVSLS---------------
                                                                   

       390       400       410       420       430       440       
pF1KE2 YDRGRACRSYRVRFLCGKPVRPKLTVTIDTNVNSTILNLEDNVQSWKPGDTLVIASTDYS
               ..::.                  :... ::: :.:.:::::: .:.::::::
CCDS66 --------GFRVEV-----------------VDGVKLNLLDDVSSWKPGDQIVVASTDYS
                410                        420       430       440 

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pF1KE2 MYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGEEIDGVDMRAEVGLLSRNIIVMGEMEDK
       ::::::: .:::  :.  ::::   :..::.:: :::::::::::.:.:::...::.::.
CCDS66 MYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVDMRAEVGILTRNIVIQGEVEDS
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pF1KE2 CYPYRNHICNFFDFDTFGGHIKFALGFKAAHLEGTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDE
       ::   .. :.:::.::::::: .  .: ..::  .:::::::: .:.::.:::: :::: 
CCDS66 CYA--ENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMGQQQMGRYPVHFHLCGDVDY
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pF1KE2 RGGYDPPTYIRDLSIHHTFSRCVTVHGSNGLLIKDVVGYNSLGHCFFTEDGPEERNTFDH
       .:::   :..  :::::.::::.::::.:::::::..:...:::::: ::: :.:::. :
CCDS66 KGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDTLGHCFFLEDGIEQRNTLFH
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        ::::.: :::::.::...::  . .  . .::: :  :: ::::::.:.::::::: ::
CCDS66 NLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCMAVSTFWIAHPNNNLINNAA
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       :::...:.:..::. ::: : :.   .  :  ::: :::::.:::..::..::.:::::.
CCDS66 AGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNRVHSNFKAGLFIDKGVKTTN
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       .:: : : .: .  :::. :::::.: :::  :.: ..::.::.:.:::.::::. ... 
CCDS66 SSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAFKNNDNGAWVRGGDIIVQNS
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        :::::::::.:: :.:: :.::.::...::::::: : : .  .:.  : ::.:.. ::
CCDS66 AFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGFQGGQNKYVGTGGIDQKPRT
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       :: ...:::::.:.:::::..   ::.:.:    :..::..: ..:.::  :.::.. . 
CCDS66 LPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIGFLMKNSWQITPRNNISLVK
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CCDS66 F-GPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGYKDAYVGRMDNYLIRHPSC
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CCDS66 VNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPMVLRG-INQKAAFPQYQPV
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CCDS66 VMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTSFQVTFGYLQRQNGSLSK
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pF1KE2 TGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFLKLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKA
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CCDS66 IEEYEPVHSLEELQRKQSERK-FYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHGHSYCSSQGCERVKIQA
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pF1KE2 LIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLFG-------SQLK-TKD-H--FLEVKM
           .  .:.: : :::.. ..  :   ::  : :        :.  :.: :  .: :..
CCDS66 -ATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQVVFTSDPHKSYLPVQF
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pF1KE2 ESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQG--RVVSHTSFRNSILQGIP
       .:  .   .  .: . : :.:  .     :. ..:.:  .   :.. .: :    :  . 
CCDS66 QSPDKAETQR-GDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLTEKTVFP---LADVS
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pF1KE2 WQLFNYVAT-IPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKL--KEQMAFVGFKGS
        .. .:. : ::  ::::....:. ...   ...:  ::  .  .:  : .  :.::.:.
CCDS66 -RIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGE-IKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGSTIFLGFSGN
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pF1KE2 FRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL                       
       :.: :. :                                              
CCDS66 FKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQASKAH
    1330      1340      1350      1360      1370      1380   

>>CCDS47979.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9             (1320 aa)
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CCDS47 TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP
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         .::::.:.:. :.::.:. ..: : .:  : :::.:::.:: :..:: ::.   :: .
CCDS47 DENCPDQNPRLRNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGS
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       . :.:::..:::..:: :: :.  : .... :: :::..::: .  : .: :.:::  ::
CCDS47 RNITLRTHYILIQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEG-ESMPTFGKKFIGVEAGG
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pF1KE2 ALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFFERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDT
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CCDS47 TLELHGARKASWTLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFS-RGLNVRVIDQDTAKILESERFDT
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pF1KE2 YRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEGSRNL-DDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHP
       .. ..::.:: ..:     :::...::.: ....: .   .  . .:::. .  ::.:. 
CCDS47 HEYRNESRRLQEFLRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQA
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pF1KE2 WSFLTVKGNPSSSVEDHIE-YHGHRGSAAARVFKLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTE
       :... :  . :.: .. .. :..: ... : . . : :  :. :.:.  :::....    
CCDS47 WALVGVIDGGSTSCNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEET----
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CCDS47 ------------------------------------------------------------
                                                                   

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CCDS47 ------------------------------------------------------------
                                                                   

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pF1KE2 MYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGEEIDGVDMRAEVGLLSRNIIVMGEMEDK
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CCDS47 -------------------------PQFLHMGEIIDGVDMRAEVGILTRNIVIQGEVEDS
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pF1KE2 CYPYRNHICNFFDFDTFGGHIKFALGFKAAHLEGTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDE
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CCDS47 CYA--ENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMGQQQMGRYPVHFHLCGDVDY
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CCDS47 KGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDTLGHCFFLEDGIEQRNTLFH
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CCDS47 NLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCMAVSTFWIAHPNNNLINNAA
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CCDS47 AGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNRVHSNFKAGLFIDKGVKTTN
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pF1KE2 ASAKDKRPFLSI-ISARYSPHQDADPLKPREPAIIRHFIAYKNQDHGAWLRGGDVWLDSC
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CCDS47 SSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAFKNNDNGAWVRGGDIIVQNS
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CCDS47 AFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGFQGGQNKYVGTGGIDQKPRT
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