FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2742, 1361 aa 1>>>pF1KE2742 1361 - 1361 aa - 1361 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 65951994 residues in 93482 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2626+/-0.000435; mu= 22.7661+/- 0.027 mean_var=64.5595+/-13.065, 0's: 0 Z-trim(108.9): 111 B-trim: 152 in 1/51 Lambda= 0.159622 statistics sampled from 17662 (17776) to 17662 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 8.210 The best scores are: opt bits E(93482) NP_001280227 (OMIM: 608366) cell migration-inducin (1361) 9456 2187.7 0 NP_001280233 (OMIM: 608366) cell migration-inducin (1361) 9456 2187.7 0 NP_061159 (OMIM: 608366) cell migration-inducing a (1361) 9456 2187.7 0 XP_024305769 (OMIM: 608366) cell migration-inducin (1396) 9456 2187.7 0 NP_037522 (OMIM: 605835) cell surface hyaluronidas (1383) 3076 718.4 9.5e-206 XP_005251926 (OMIM: 605835) cell surface hyaluroni (1383) 3076 718.4 9.5e-206 NP_001129292 (OMIM: 605835) cell surface hyaluroni (1320) 2846 665.4 8e-190 NP_001336713 (OMIM: 605835) cell surface hyaluroni ( 745) 2031 477.6 1.6e-133 XP_016869463 (OMIM: 607843) fibrocystin-L isoform (3045) 249 67.6 1.7e-09 XP_016869462 (OMIM: 607843) fibrocystin-L isoform (3259) 249 67.6 1.8e-09 XP_016869461 (OMIM: 607843) fibrocystin-L isoform (4152) 249 67.7 2.3e-09 XP_016869460 (OMIM: 607843) fibrocystin-L isoform (4199) 249 67.7 2.3e-09 XP_016869459 (OMIM: 607843) fibrocystin-L isoform (4215) 249 67.7 2.3e-09 XP_011515673 (OMIM: 607843) fibrocystin-L isoform (4243) 249 67.7 2.3e-09 NP_803875 (OMIM: 607843) fibrocystin-L precursor [ (4243) 249 67.7 2.3e-09 XP_016869458 (OMIM: 607843) fibrocystin-L isoform (4253) 249 67.7 2.3e-09 NP_001277058 (OMIM: 253280,606822,613151,613157,61 ( 638) 226 61.9 1.8e-08 XP_011540062 (OMIM: 253280,606822,613151,613157,61 ( 638) 226 61.9 1.8e-08 NP_060209 (OMIM: 253280,606822,613151,613157,61712 ( 660) 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XP_005 -ATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQVVFTSDPHKSYLPVQF 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 ESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQG--RVVSHTSFRNSILQGIP .: . . .: . : :.: . :. ..:.: . :.. .: : : . XP_005 QSPDKAETQR-GDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLTEKTVFP---LADVS 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 WQLFNYVAT-IPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKL--KEQMAFVGFKGS .. .:. : :: ::::....:. ... ...: :: . .: : . :.::.:. 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