FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2747, 866 aa 1>>>pF1KE2747 866 - 866 aa - 866 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 65638526 residues in 92875 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7078+/-0.000384; mu= 18.3472+/- 0.024 mean_var=71.7724+/-14.616, 0's: 0 Z-trim(112.4): 54 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.151389 statistics sampled from 22245 (22298) to 22245 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 5.660 The best scores are: opt bits E(92875) NP_776297 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 866) 5828 1282.9 0 XP_011529888 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 831) 5487 1208.4 0 XP_005262783 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 839) 5487 1208.4 0 NP_001820 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 818) 5374 1183.7 0 NP_001230303 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 5033 1109.2 0 NP_001821 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exchang ( 760) 4118 909.4 0 NP_001121371 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 4085 902.2 0 NP_001121370 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 4085 902.2 0 XP_016884747 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 4078 900.6 0 XP_016884746 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 4078 900.6 0 NP_001269092 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 766) 3994 882.3 0 NP_000075 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31046 ( 746) 3954 873.5 0 NP_001243873 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exch ( 666) 3673 812.1 0 NP_001230301 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 3087 684.2 7e-196 XP_011510703 (OMIM: 600570,605635,607628,615651) c ( 835) 675 157.4 2.8e-37 XP_006713552 (OMIM: 600570,605635,607628,615651) c ( 863) 675 157.4 2.9e-37 NP_001164560 (OMIM: 600570,605635,607628,615651) c ( 869) 675 157.4 2.9e-37 NP_004357 (OMIM: 600570,605635,607628,615651) chlo ( 898) 675 157.4 3e-37 NP_000074 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ch ( 988) 675 157.4 3.3e-37 NP_001164559 (OMIM: 600570,605635,607628,615651) c ( 854) 674 157.2 3.3e-37 NP_000076 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ch ( 687) 530 125.7 8.1e-28 NP_001036169 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 686) 513 122.0 1.1e-26 NP_004061 (OMIM: 602024,613090) chloride channel p ( 687) 513 122.0 1.1e-26 NP_001164558 (OMIM: 600570,605635,607628,615651) c ( 881) 507 120.7 3.3e-26 NP_001244068 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 644) 495 118.0 1.5e-25 XP_011520656 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl( ( 747) 464 111.3 1.9e-23 NP_001107803 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl( ( 781) 464 111.3 2e-23 NP_001278 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl(-) ( 805) 464 111.3 2e-23 XP_016867229 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ( 838) 424 102.6 9e-21 XP_016867228 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ( 846) 325 80.9 2.9e-14 NP_001159417 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ( 517) 309 77.4 2.2e-13 XP_006713553 (OMIM: 600570,605635,607628,615651) c ( 512) 296 74.5 1.5e-12 XP_011514084 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ( 570) 291 73.4 3.6e-12 NP_001243888 (OMIM: 602726) chloride transport pro ( 847) 213 56.5 6.8e-07 NP_001277 (OMIM: 602726) chloride transport protei ( 869) 213 56.5 6.9e-07 >>NP_776297 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange transport (866 aa) initn: 5828 init1: 5828 opt: 5828 Z-score: 6873.1 bits: 1282.9 E(92875): 0 Smith-Waterman score: 5828; 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NP_001 HTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 AADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYI :.:::::::::.::::.::.:::::: :::::::.::::: :. :.::...:.:: ..:: NP_001 AVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYI 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTIT .::.:::.::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: NP_001 LNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVT 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 LVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGA :::.:.::::::::::::::::::::.:: :: ::: ::.:.:::::::.:::::::::: NP_001 LVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGA 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLF :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::. NP_001 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMA 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 ELFPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIIVAAITAVIAFPNPYT ::::::::::::::::..::: :::::::::.:..:::::::::.:.::::.::.::::: NP_001 ELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYT 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 RLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGIGVYSAIWQLCLALI : .:::::.:::.::: ::::.:::: :: : .. ::::::::::.:::.:.::: :::: NP_001 RQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALI 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 FKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFIFKEWCEVGADC :::..:.::::.:.::::::::::.::::::.:::.::::::.::::.::..::. :::: NP_001 FKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADC 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 ITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREG .:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::..:::::.::::.:: NP_001 VTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEG 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 IYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETS ::::::.::::::::.:.:::: :::.:::::::..:::.:::::.:::.:.:..:.::. NP_001 IYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETD 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 YNGFPVIMSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRP ::::::..:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.: NP_001 YNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHP 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 LKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQLK :::: ::..:::::::::::: ::::::::::::::::..: .:::::::..:.:. :. 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NP_001 --NGGGIGSSNRIMDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWAL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDIAADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNE .:. ::.::::.. : :: ::.:::::::.: :::::::::: ...:.:::.:::.:.. NP_001 IHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 TTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACG .:::::::::.:..:..:::. :: .::.::.::..::: :::::::::::::::::: NP_001 VTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSY ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::. . 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NP_001 KPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIEN 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 ARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKL :::::.:.:..: . :..:.: :: .: ::::.:::.::::::: ::::::::::::: NP_001 ARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKL 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 GLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQLKQHVEPLAPPWHYNKKRYPPAYGPDGKPRPR ::::::::::: .:::::::..:.:. :. 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NP_001 IHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 TTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACG .:::::::::.:..:..:::. :: .::.::.::..::: :::::::::::::::::: NP_001 VTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSY ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::. . 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NP_001 KPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIEN 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 ARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKL :::::.:.:..: . :..:.: :: .: ::::.:::.::::::: ::::::::::::: NP_001 ARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKL 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 GLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQLKQHVEPLAPPWHYNKKRYPPAYGPDGKPRPR ::::::::::: .:::::::..:.:. :. NP_001 GLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN 780 790 800 810 >>XP_016884747 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,310468 (820 aa) initn: 4089 init1: 2302 opt: 4078 Z-score: 4807.8 bits: 900.6 E(92875): 0 Smith-Waterman score: 4078; 72.7% identity (92.1% similar) in 801 aa overlap (8-807:10-809) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MESEQLFHRGYYRNSYNSITSASSDEELLDGAGVIMDFQTSEDDNLLDGDTA-VGTHY .::. ..:..:. ..::::.:.: .. :::. .: :: ... . . 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