FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2757, 1761 aa 1>>>pF1KE2757 1761 - 1761 aa - 1761 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7186+/-0.00148; mu= 9.5135+/- 0.089 mean_var=271.8649+/-52.182, 0's: 0 Z-trim(108.4): 153 B-trim: 10 in 1/51 Lambda= 0.077785 statistics sampled from 10209 (10351) to 10209 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16 Scan time: 2.840 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs109|chr7 (1761) 12521 1420.8 0 CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs109|chr7 ( 772) 5126 590.6 7.6e-168 CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs109|chr7 (1786) 4458 516.0 4.9e-145 CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs109|chr3 (1798) 4242 491.8 9.8e-138 CCDS86325.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 ( 605) 1263 156.9 2e-37 CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 ( 628) 1263 157.0 2.1e-37 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VLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQS 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 FALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHSHVLVDSLGLIPQINSLEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS83 FALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHSHVLVDSAAVQWHNLGSLQ 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 FCSKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSS CCDS83 PPPPECKQFSCFSFPSSWDYRHPPPHLANFCIFSRDGVSPHWPGWSQTPDLR 730 740 750 760 770 >>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs109|chr7 (1786 aa) initn: 3854 init1: 1567 opt: 4458 Z-score: 2717.5 bits: 516.0 E(33420): 4.9e-145 Smith-Waterman score: 5146; 41.5% identity (68.7% similar) in 1786 aa overlap (23-1759:30-1785) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR : .:.:.:.:::::.:: .: ..::::: . CCDS57 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 AQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDH . :::.:.:. ..:::::.:. :: .:.:: ::::...: :.: : :::::::... CCDS57 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSG :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::.:::.:.:..: :..::: :: .:::.:..: CCDS57 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 QAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKL . : ::.:::.:::::::: :::....:::.:.::.:::: ::.:. .:::::.:.:: CCDS57 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 HTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHG ::::: :: :. . .:::::.:.:.:::.::: :::::: :.. . .: ::::: CCDS57 HTLGDNLLDSRM-EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEV---EGMVHG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGG .:.:.::: : ::: : ::..: ::::: ..:::..:.:: :: :::::..:::.:. CCDS57 HCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 LSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSD .:::::.:::::: :..:..:.:..:. : . : :: : : ::: :. . ::: :..: CCDS57 VSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 PALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLT-CDVDT . : .:::: :: :::: .:: :: . : ::. ::.::. : :::::..: . :: .: CCDS57 FSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSET 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 GQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVT :.: : ::: ::..: .:::.: : :: :::::.::: .: : ..::: ::::. CCDS57 GHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMI 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 GRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVT ::.:.: :::.:: :. ::::::::. :: :.: .: . . . CCDS57 GRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEAN-------LG-------PGVSIVERQYIQDRIPS 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 pF1KE2 WTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIV-VNPPG---GSEH ::: ::.:: :: :.: ..:::. ... : :.:: : : .. :. :: : . CCDS57 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 CIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHS-HVLVD : .. : .: ..: ..:: :.:.: ..:.. . . : ...: ..: ..:.: CCDS57 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 SLGLIPQINSLENFC---------SKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQVLPGACERLIISM :: :.: .::. : ... . .: . :.: . .. . .:. .:.:. CCDS57 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 SAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRCSTGSYDLGHHGCHPCH :: ::. ..::.: ::::..: :. ::::::.: :::: :.::. :.. .: ::.::. CCDS57 SALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCE 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 CHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGRRCDRCLAGYFGFPSCHPCPCNRFAELCDPETGS :: ::: .. :. ::::: : : .:.::::: :..:::::.:: :: :. ::: :: CCDS57 CHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGE 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 CFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNP--SSGQPCRPCLCPDDPSSNQYFAHSCYQNLWSSDV :.:: .: :.:::::. ::::.: .::. :::: ::: :.:.. ::.::::. . .. CCDS57 CLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQL 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 ICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVTDPESCSRVTGECLRCLH : : :: :..: .:..:..::: :. :::: :.::::.::::.:.. ::.::.::. CCDS57 ACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLY 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 NTQGANCQLCKPGHYGSALNQTCRRCSCHASGVSPMECPPGGGACLCDPVTGACPCLPNV .:.: .::.:. :.::.::.: ::.: :. :. .: .:. : :: .:: : ::::: CCDS57 HTEGEHCQFCRFGYYGDALQQDCRKCVCNYLGTVQEHC--NGSDCQCDKATGQCLCLPNV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 TGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQLTGQCPCKLGYGGKRCSECQEN : ::::: . :.:. : ::. :.:. : . :...:::: : :.::. :::::: CCDS57 IGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQEL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 YYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQRCDRCARGHSQEFPTCLQCH ..::: .: :::. : . : :: .::.: : ::: : :::.:.::.: :: : :: CCDS57 FWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCH 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 LCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVF :: :: :. :.. .. ... : .. . : :. ... .::::. :: . CCDS57 QCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRET-VDSVERKVSEIKDILAQS-- 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 PSGKFLK-VKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQDLKDT----------IERAKNEADLL :... :: . . . ... : ...:.. : : . :.:: .. ..::. : CCDS57 PAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQV-EVK-LSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESL 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 LEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKIN----ETSSTINTSANTRND . ..: . . :..: . ..: ::...: ::...: : .::.. :: :. CCDS57 DNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDR 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE2 LLTILDTLTSKGNLSLERLKQIKIPD-----IQILN-----EKVCGDPGNVPCVPLPCGG . .. . ..... .. .: .. : .: :. : .:: : .. : ::: CCDS57 VEDVM--MERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGG 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE2 ALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAE : .:.::: :::: : .:.. :: :::.. . . . .:. :.... . .:. CCDS57 PNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRAD 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE2 VSKNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHL .:..: .. : . ... :. .:.. .::...::: .... ..:: ::: :: ... CCDS57 EAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEM 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE2 PIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAA-NILLNLD : :.: . :..... . .. .. . :. :: .:: : :.: .. .. : CCDS57 PSTPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTAD 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 KTLNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQR-SGLED . . :..:. .: :...: : .: .. . . :..: . : :.:: : :: CCDS57 MVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELER 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 GLSLLQTKLQRHQDHA--VNAKVQA--ESAQHQAGSLEKEFVE-LKKQYAILQRKTSTTG .. :. : ... .: .. : . .::. .:. :. : :: .. .:: .. CCDS57 NVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESA 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 LTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDLNLSRQAKADQLRILEDQVVA ... :...:.. :. : .....:.. . ::::: .: . . ::..: :: .: . CCDS57 DARR---KAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRS 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1750 1760 pF1KE2 IKNEIVEQEKKYARCYS . ..: .. :. : CCDS57 LLKDISQKVAVYSTCL 1780 >>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs109|chr3 (1798 aa) initn: 3311 init1: 977 opt: 4242 Z-score: 2586.5 bits: 491.8 E(33420): 9.8e-138 Smith-Waterman score: 4920; 39.8% identity (67.1% similar) in 1822 aa overlap (1-1759:14-1797) 10 20 30 40 pF1KE2 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQ------DDCNRGACHPTTGDLLVGRNT . ..: : : :. :. . :: :.::.:.:.:::::::: CCDS27 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRAD 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 QLMASSTCGLSRAQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDRE .: :::::::. : :::.:.:. :.:::.:::: :.. :.:.:: :.::..:: :.:. CCDS27 RLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRR 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 KKWWQSENGLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAK :::::::. :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::::::.:.:..:.:..::. CCDS27 AAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSY 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 DCATSFPNITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLV ::...::.. . . :.::.:.::.::::: :::. .::::.. : .::: ::.:. CCDS27 DCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 TLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMR .::::.:.:.:::::: :: :. . .::::::::..:::.::: :::::: : CCDS27 KITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRR-EIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAP--- 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 GDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRC : ::::: :.:.::: : :::.:.::..: ::::: : ...:::.: :..:. : CCDS27 GAPAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSC 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 HFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDG ::::..:::::..:::::. ::::: :.::. :::.::::: : . :: .: :.::: : CCDS27 HFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 TISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLG . .:: : ::.::::: :.::: :::.: :..:.::. . .::: .: :::. :.:: : CCDS27 SQDGGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARG 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 SLPFLT-CDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSP ..: : :: ..:.: : ::: :..: :.:::.. : :: :::::.::: . :. CCDS27 TVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDE 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 KNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHV .:::.:: :..:: : . :::: :. ..:::. : :: .. : CCDS27 GTGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAED-------------TRGQ--VLDV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 VLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWT-VQIV : .::. .::: ::.:. : :.: : ..: .:. . .. : : .:. .... CCDS27 VERLVTPGETPSWTGSGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELI 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 VNPPGGSE------HCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSID---VYF :. :: : .:: ... :. : : : ...:.:.:::: ..:.. : CCDS27 VQRPGPVPAHSLCGHLVPK--DDRIQGTLQPHA-RYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRT 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 SQPLQGES-HAHSHVLVDSLGLIPQINSLENFCS--------KQDLDEYQLHNCVEIASA . : :. .. .:.::: :.:.. :: : . . ...:: :. . : CCDS27 GGSAQPETPYSGPGLLIDSLVLLPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSK 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 MGPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDR .:. :: :.::.:. ...::. :.:.::::..: :. :::: ::: :::: :: CCDS27 TSPS---EACAPLLISLSTLIYNGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDL 760 770 780 790 800 810 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 CSTGSYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGRRCDRCLAGYFGFPSCH :. : : .: ::. :.: .:. ...:....::: :. . : ::::: : .:::::. CCDS27 CAPGYYGFGPTGCQACQCSHEGALSSLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCR 820 830 840 850 860 870 870 880 890 900 910 pF1KE2 PCPCNRFAELCDPETGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPS--SGQPCRPCLCPDDPSS :: :: :. :. .::.:..: : :..::::: :..:.: : :::: ::. :.: CCDS27 PCVCNGHADECNTHTGACLGCRDHTGGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGS 880 890 900 910 920 930 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 NQYFAHSCYQNLWSSDVICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVT ...:: ::.:. .:....:.: :::: .: :. : .:.: :. :: : :..::: CCDS27 QRHFATSCHQDEYSQQIVCHCRAGYTGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPM 940 950 960 970 980 990 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE2 DPESCSRVTGECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSALNQTCRRCSCHASGVSPMECPPGGG ::..:. ::.::::::.:.: .: :::: .:.: :.:.::.:. :..:..:: . CCDS27 DPDACDPHTGQCLRCLHHTEGPHCAHCKPGFHGQAARQSCHRCTCNLLGTNPQQCP-SPD 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE2 ACLCDPVTGACPCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQLTGQC : ::: .: ::::::: : .::::: ..:::. :.::: : : : ... :...:::: CCDS27 QCHCDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCAPNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQC 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 PCKLGYGGKRCSECQENYYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQRCD :. :.::. :::::: ..::: .: :::. : . : : :: : :: :::: ::: CCDS27 HCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQCHACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCD 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 RCARGHSQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKD .:::: : ::.: :: :: .::.....:. .: : . : ... . .: . :..: CCDS27 QCARGFSGIFPACHPCHACFGDWDRVVQDLAARTQRLEQRAQELQ-QTGVLGAFESSFWH 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 LRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVY-EFQDLKDT---- .. ... .. :. ... .. . . .::.: . .:.: . .. :..: CCDS27 MQEKLGIVQGIVGARNTSAASTAQLVEATEELRREIGEATEHLTQLEADLTDVQDENFNA 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 ------IERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKINET .:: . .: :..:....:: . .... . ..:.. . :. ::.. : . CCDS27 NHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDL---LKHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEAERRANTS 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 S----STINTSANTRNDLLTILDT----LTSK--------GNLSLERLKQIKIPDIQILN . : ...::..:. ...:. ..:: :.:: . . ... :: : CCDS27 ALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFNSKHMANQRALGKLS-AHTHTLSLTDI---N 1360 1370 1380 1390 1400 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 EKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNL : ::: ::..::. ::::: : . :. .: : .:.:. . . :: .:..... .. CCDS27 ELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGLSCNGAAATADLALGRARHTQAELQRA 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 DKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEE . .. ... .:: ... : .: . :.: .. ..... .:..::.:: .: CCDS27 LAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANASRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQE 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 NVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKL .. :..:: ::. ::.. .: .... : .... : . : .. :..: CCDS27 GADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIAERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQL 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KE2 LVKAKAAEKAANILLNLDKTLNQ-LQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQT : :. :.. :. . .:.. :..:: .:: :...: .:. .... :.... CCDS27 LQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGIAQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERM 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE2 REMKSELELAKQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDH--AVNAKVQAESAQHQAGSLEKEFV-E . : : .:. :.: : ::.: . : .:. : ::: .: :. . CCDS27 AGAERALSSAGERARQLDAL-LEALKLKRAGNSLAASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGP 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 LKKQY----AILQRKTSTTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDL : :: :. .::.. :. . ....::.: :. : .. :..:. .:: .. CCDS27 LGDQYQTVKALAERKAQ--GVLA-AQARAEQLRDEARDLLQAAQDKLQRLQELEGTYEEN 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 NLSRQAKADQLRILEDQVVAIKNEIVEQEKKYARCYS . . ..:: :: :: .. .. . : : . : : CCDS27 ERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQVQIYNTCQ 1770 1780 1790 >>CCDS86325.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 (605 aa) initn: 1153 init1: 382 opt: 1263 Z-score: 785.5 bits: 156.9 E(33420): 2e-37 Smith-Waterman score: 1280; 41.8% identity (67.5% similar) in 467 aa overlap (23-476:30-463) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR :.. ::.: :.: .:: .: :..::: . CCDS86 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEK-ACNPRMGNLALGR--KLWADTTCGQNA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 AQKYCILSY---LEGEQ-KCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSEN .. ::. : : .: :: :.. .:. . :.. . ::. : :::: . CCDS86 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAH-LPSAMADS----SFRFPR--TWWQSAE 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 GLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPN . . .:.::::: : :.:::. ::. :::::...:: :.:..:: .:::: .:...: CCDS86 DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 ITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRIN . .:. .: ::::. : :::::..:.:.: .. ::::: .:. . .::::.. CCDS86 EDDVVKKGA---ICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 FTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYY--YALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSP . : .. : . . ... ::.:..::.:::::::::..: :.. .: . CCDS86 LLKRQSCP---CQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRP--VKA 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 PG---MVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQD---NACRSCSCNSHSSRC :: ::::.:.:.::: : .:..: ...: ::. ::: . : ::.:.::.:.. : CCDS86 PGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWE-AADGKTGAPNECRTCKCNGHADTC 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 HFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDG :::.... :::. :::::.:::::::::.:.::.: :::: . .: : :: :: : : : CCDS86 HFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 T-ISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPL . . . :. ::. :.: :: .: : .::.: ...:.. ::.:::: CCDS86 SAVLPANSVTFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG---DYGCRPCDCA-- 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 GSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSP :: :: ::.:. CCDS86 GS-----CDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSVLKI 460 470 480 490 500 >>CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 (628 aa) initn: 1153 init1: 382 opt: 1263 Z-score: 785.3 bits: 157.0 E(33420): 2.1e-37 Smith-Waterman score: 1280; 41.8% identity (67.5% similar) in 467 aa overlap (23-476:30-463) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR :.. ::.: :.: .:: .: :..::: . CCDS90 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEK-ACNPRMGNLALGR--KLWADTTCGQNA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 AQKYCILSY---LEGEQ-KCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSEN .. ::. : : .: :: :.. .:. . :.. . ::. : :::: . CCDS90 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAH-LPSAMADS----SFRFPR--TWWQSAE 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 GLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPN . . .:.::::: : :.:::. ::. :::::...:: :.:..:: .:::: .:...: CCDS90 DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 ITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRIN . .:. .: ::::. : :::::..:.:.: .. ::::: .:. . .::::.. CCDS90 EDDVVKKGA---ICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 FTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYY--YALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSP . : .. : . . ... ::.:..::.:::::::::..: :.. .: . CCDS90 LLKRQSCP---CQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRP--VKA 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 PG---MVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQD---NACRSCSCNSHSSRC :: ::::.:.:.::: : .:..: ...: ::. ::: . : ::.:.::.:.. : CCDS90 PGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWE-AADGKTGAPNECRTCKCNGHADTC 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 HFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDG :::.... :::. :::::.:::::::::.:.::.: :::: . .: : :: :: : : : CCDS90 HFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 T-ISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPL . . . :. ::. :.: :: .: : .::.: ...:.. ::.:::: CCDS90 SAVLPANSVTFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG---DYGCRPCDCA-- 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 GSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSP :: :: ::.:. CCDS90 GS-----CDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCE 460 470 480 490 500 >>CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs109|chr1 (1172 aa) initn: 1665 init1: 505 opt: 1251 Z-score: 774.7 bits: 155.9 E(33420): 8.1e-37 Smith-Waterman score: 1609; 43.4% identity (67.4% similar) in 525 aa overlap (19-540:17-515) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSRAQKYCIL ::. :.::::.: .:::::::. : :::::::.. . :: CCDS14 MRPFFLLCFALPGLLHAQQACSRGACYPPVGDLLVGRTRFLRASSTCGLTKPETYCT- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 SYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDHVSIRLDL .: : ..:: :::: :.. : :: .::: : : : ::::.: .. ::..::: CCDS14 QYGEWQMKCCKCDSRQPHNYY----SHRVENVASSSGPMR---WWQSQNDVNPVSLQLDL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 EALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSGQAQGVGD . :....... :. ::.::.:::.:.:..:.:..:.: ::...:: . .:. :. : CCDS14 DRRFQLQEVMMEFQGPMPAGMLIERSSDFGKTWRVYQYLAADCTSTFPRVRQGRPQSWQD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 IVCDSKYSDIEPST---GGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLG . :.: . .:.. ::.: :...: : : ::.. .::::.:::.: CCDS14 VRCQSLPQ--RPNARLNGGKVQLNLMDLVSGIPATQSQKIQEVGEITNLRVNFTRL---- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 DALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHGQCVC : . .: . :::. .. ..:::::.:::..: : . : .:: ::: CCDS14 -APVPQRGYHP-PSAYYAVSQLRLQGSCFCHGHADRCAPKPGASAGP-STAVQVHDVCVC 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGGLSGG :::: ::::::: :... ::::: . . :. :.::.:: :::: ... :: : :: CCDS14 QHNTAGPNCERCAPFYNNRPWRPAEGQDAHECQRCDCNGHSETCHFDPAVFAASQGAYGG 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 VCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSDPALG ::..:. .:::..:.::. ..:. : .:: :::::::.. :. : :: CCDS14 VCDNCRDHTEGKNCERCQLHYFRNRRPGASIQETCISCECDPDGAVPGAPC----DP--- 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLC :.:::.:::.:.: .:: :::. ::. ..: ::. :::: ::: . :: ..:.::: CCDS14 -VTGQCVCKEHVQGERCDLCKPGFTGLTYANPQGCHRCDCNILGSRRDMPCDEESGRCLC 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 LSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVTGRSCS : :.: .:..:. .: :.. .:: :: :: .. : :. .::: :: : :: CCDS14 LPNVVGPKCDQCAPYHWKLASG-QGCEPCACDPHNSLSPQCNQFTGQCPCREGFGGLMCS 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 EPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPG : CCDS14 AAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCDKASGRCLCRPGLTGPRCDQCQRGYC 520 530 540 550 560 570 >-- initn: 387 init1: 292 opt: 757 Z-score: 475.1 bits: 100.5 E(33420): 3.9e-20 Smith-Waterman score: 757; 23.2% identity (58.4% similar) in 663 aa overlap (1112-1759:518-1171) 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 CDPRTSQSSHCDQLTGQCPCKLGYGGKRCSECQENYYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICD .: . ::: : :::. ::. : :: CCDS14 SLSPQCNQFTGQCPCREGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCD 490 500 510 520 530 540 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE2 PDTGMCRCREGVSGQRCDRCARGHSQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSLSKAVQ-GLMRLA .: : :: :..: :::.: ::. ...:.:. :: ::. .: . .:.. : .: : CCDS14 KASGRCLCRPGLTGPRCDQCQRGYCNRYPVCVACHPCFQTYDADLR--EQALRFGRLRNA 550 560 570 580 590 600 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 A-------NMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRR . ..::. . . .: .... .:. .:. :. . .: . :.:: CCDS14 TASLWSGPGLEDRGLASRILDA-----KSKIEQIRAVLSSPAVTEQEVAQVASAILSLRR 610 620 630 640 650 660 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 QIMQLNEQLKAVYEFQDLKDTIERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKK .. :. .: : .: .: . :: :.. . .. .:. . . . .. CCDS14 TLQGLQLDLPLEEETLSLPRDLESLDRSFNGLLTMYQRKREQFEKISSADPSGAFRMLST 670 680 690 700 710 720 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 YYHISSSAEKKINETSSTINTSANTRNDLLTILDTLTSKGN-----LSLERLKQIKIPDI :. :..: ......: .. ..: . .. . :. : ::.. ..::. CCDS14 AYEQSAQAAQQVSDSSRLLDQLRDSRREAERLVRQAGGGGGTGSPKLVALRLEMSSLPDL 730 740 750 760 770 780 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE2 QILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSI .:.::. .. :.:. : : :: .: : : :.: : . .:. : .. CCDS14 TPTFNKLCGNSRQMACTPISCPGELCPQDNG-TAC-GSRCRGVLPRAGGAFLMAGQVAEQ 790 800 810 820 830 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE2 IRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNF .:... :.. ...:.. :.: ...: .:. ... :.: . . . :.:..:..: CCDS14 LRGFNAQLQRTRQMIRAAEESASQIQSSAQRLETQVSASRSQMEEDVRRTRLLIQQVRDF 840 850 860 870 880 890 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE2 LLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADG : . .. :..:...:: . :: : .. ... .:: . .. ... CCDS14 LTDPDTDAATIQEVSEAVLALWLPTDSATVLQKMNEIQAIAARLPNVDLVLSQTKQDIAR 900 910 920 930 940 950 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE2 AQKLLVKAKAAE-KAANILLNLDKTLNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQA :..: ..:. :. .: . ... ....:.:. .. .:..:. . .. :. : .. CCDS14 ARRLQAEAEEARSRAHAVEGQVEDVVGNLRQGTVALQEAQDTMQGTSRSLRLIQDRVAEV 960 970 980 990 1000 1010 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE2 ENQTREMKSELE-LAKQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDHAVNAKVQAESAQHQAGSLEKEF .. : .. . ..:: . . . :. . ... .::.:. ::.:..:: : .. : CCDS14 QQVLRPAEKLVTSMTKQLGDFWTRMEELRHQARQQGAEAVQAQQLAEGASEQALSAQEGF 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 VELKKQYAILQRKTSTTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDLNL ..:..:: :. . . ... : ......: ::.: :.: . :. :.: .. . CCDS14 ERIKQKYAELKDRLGQSSMLGEQGARIQSVKTEAEELFGETMEMMDRMKDMELELLRGSQ 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 SRQAKADQLRILEDQVVAIKNEIVEQEKKYARCYS . . .. .: :: .: :...: . :: : CCDS14 AIMLRSADLTGLEKRVEQIRDHINGRVLYYATCK 1140 1150 1160 1170 >>CCDS86324.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 (591 aa) initn: 1153 init1: 382 opt: 1232 Z-score: 766.8 bits: 153.5 E(33420): 2.2e-36 Smith-Waterman score: 1249; 41.8% identity (67.4% similar) in 457 aa overlap (33-476:2-426) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 FQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSRAQKYCILSY :.: .:: .: :..::: . .. ::. : CCDS86 MGNLALGR--KLWADTTCGQNATELYCFYSE 10 20 70 80 90 100 110 pF1KE2 ---LEGEQ-KCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDHVSIRL : .: :: :.. .:. . :.. . ::. : :::: . . . .:.: CCDS86 NTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAH-LPSAMADS----SFRFPRT--WWQSAEDVHREKIQL 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSGQAQGV :::: : :.:::. ::. :::::...:: :.:..:: .:::: .:...: . .:. CCDS86 DLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGA 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLGD .: ::::. : :::::..:.:.: .. ::::: .:. . .::::... : .. CCDS86 ---ICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCP- 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 ALLGRRQNDSLDKYY--YALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPG---MVHG : . . ... ::.:..::.:::::::::..: :.. .: . :: :::: CCDS86 --CQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRP--VKAPGTFHMVHG 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQD---NACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLA .:.:.::: : .:..: ...: ::. ::: . : ::.:.::.:.. ::::.... : CCDS86 KCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWE-AADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEA 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 pF1KE2 SGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGT-ISGGICV ::. :::::.:::::::::.:.::.: :::: . .: : :: :: : : :. . . : CCDS86 SGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSV 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLTCD . ::. :.: :: .: : .::.: ...:.. ::.:::: :: :: CCDS86 TFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG---DYGCRPCDCA--GS-----CD 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 VDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRP ::.:. CCDS86 PITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNA 420 430 440 450 460 470 >>CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs109|chr1 (1609 aa) initn: 1089 init1: 448 opt: 1185 Z-score: 733.0 bits: 148.6 E(33420): 1.7e-34 Smith-Waterman score: 2031; 27.0% identity (53.6% similar) in 1794 aa overlap (19-1747:36-1588) 10 20 30 40 pF1KE2 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDC-NRGA----CHPTTGDLLVGRNTQL :.:.: ..:. : : . .. :. . CCDS13 RAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVN--AAFNVTV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 MASSTCGLSRAQKYCILSYLEGEQK-CFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREK .:..::: . ..::. . . : : : .::. ::. . ..... . . CCDS13 VATNTCG-TPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDA-------GQPHLQHGAAFLTDYNNQADT 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KE2 KWWQSEN---GLDH---VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVF ::::.. :... ... : : : .... : :.: :: .. . . : : . CCDS13 TWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPY 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 KYFAKDCATSFPNITSGQAQGVGD---IVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLD--PS-FEIE .:.. .: ... . . : . :: .: ...::: : :::.:....:. :: .... CCDS13 QYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFD 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KE2 NPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDS--LDKYYYALYEMIVRGSCFCN : :: .:. :: :..:.....:.:.:: .. :: : .::::. .. : : : :: CCDS13 N--SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVF----NDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCN 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 GHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNA :::::: :... :. .: : :.::: : .::.: ::.: ::: :. . . CCDS13 GHASEC-----MKNE-FDK--LV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASE 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 CRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISD : :.::..:..:.:: : ..: :: : .:: ::.: ::.::: :.: ... CCDS13 CLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTG--HGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR-----LGN 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 PYACIPCECDPDGTISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATD :: :.:.: :..: : :. :.: :: .: : :::.:.:. ..:. . CCDS13 NEACSSCHCSPVGSLSTQ-CDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEA- 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 PLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGL-GNHLHGCSPCD ::.::.:.: ::. :...::.:.: . : : .::.: :...: ... .::.:: CCDS13 --GCRPCSCDPSGSID--ECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCF 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 CDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPL : .: .:.::. : . . . . :. . : .. : .: . CCDS13 C-FG--HSSVCTNAVGY---SVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEWSSERQDIAVI 500 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 GSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLP-GAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHY .. : : .. :. . : .:: : .: :. : :: . CCDS13 SDSYF---PRYFIA--------PAKFLG---KQVLSYGQNLSFS-----FRVD-----RR 560 570 580 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 ETQ-SAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYS .:. :: : .: .: . .: : .. .:. :. : . . . :. ..: CCDS13 DTRLSAED-----LVLEGAGLRVSVP--LIAQGNSY--PSETTVKYV---FRLHEATDYP 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 IDVYFSQPLQGESHAHSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQ .. :.. .. :...: : .: . . : ::. : .::: : CCDS13 WRPALT-PFEFQK------LLNNLTSI-KIRGTYSERSAGYLDD------VTLASAR-PG 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 VLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRCSTG ::. . : : : : : ::: :. : .: CCDS13 --PGVPATWVES-----------CTC-PVG--------YGGQF----------CEMCLSG 680 690 700 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 SYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGRRCDRCLAGYFGFPSCHPCPC ..: : : : : : : : CCDS13 YR-----------------RET---------PNLGPYS--------------P-CVLCAC 710 720 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 NRFAELCDPETGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPSSG--QPCRPCLCPDDPSSNQYF : .: :::::: : :: :.: .::.: :::::. ..: . :.:: :: CCDS13 NGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPG-------- 730 740 750 760 770 930 940 950 960 970 pF1KE2 AHSCYQNLWSSDVIC-NCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAP---CQPCACNNNIDVT . :: ...:.: :: : :: .: :. :..:.: ..: :. : :..::: . CCDS13 GSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDPN 780 790 800 810 820 830 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE2 DPESCSRVTGECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSALNQT----CRRCSCHASGVSPMECP .:.:.:::::.:..:: : :. :: : .:. : . :. :.:. :. .. CCDS13 AVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQSS 840 850 860 870 880 890 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE2 PGGGACLCDPVTGACPCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQL :.:::: : :::.::: : : :..:: :.::. ::: : ...:: CCDS13 -------CNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIR 900 910 920 930 940 950 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 TGQCPCKLGYGGKRCSECQENYYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSG :::: :. : :..: .:. :..: : : ::::. :. . : : : :.:::: : CCDS13 TGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDD-GRCECREGFVG 960 970 980 990 1000 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 QRCDRCARGH--SQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVC .:::.: ... .. .: : .: :. ... .: : : ::. : : CCDS13 NRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEM--VT 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 EADFKD-LRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNEQLKA-VYEFQDL . :.: :. :. .:.. ::: ... .....:. :.. . ..:.. CCDS13 DQAFEDRLKEAEREVMDLLREA-------QDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNI 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 KDTIERAKNEADLL---LEDLQEEIDLQSSVLN-ASIADSSENIKKYYHISSSAEKKI-- ..:::.. : :. .:. .. :.. : :. :..: .. .. . .. . . CCDS13 RNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 NETSSTINTSANTRNDLLTIL----DTLTSKGNLSLERL--KQIKIPDIQILNEKVCGDP .:. . . . .:.. . :: : :: :. : .. .:. ::.: . CCDS13 EEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKY--EQ 1190 1200 1210 1220 1230 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 GNVPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGL .. : .: . :.. . : .. .. : . .... :.... .. CCDS13 AKNISQDLEKQAA-----RVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSET----LENEANNI 1240 1250 1260 1270 1280 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE2 KNQIESISEQAEVSKNNALQLREKL-G------NIRNQSDSEEENINLFIKKV---KNFL : . :.. . . . .. .::: . : :. ... .:... . .. .. : . CCDS13 KMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALA 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE2 LEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGA : .: . :: .:. .: .. ..:. . .. .. .. ::.. : CCDS13 EEAAKKGRDTLQEANDILN-NLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREA 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE2 QKLLVKAKA-AEKAANILLNLDKTLNQLQQ-AQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQA :. : .: : : .: : . .. . .:. : :...:. :. :..: . ..: . CCDS13 QQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTF----AEVTDLDNEVNNM 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE2 ENQTREMKSELELAKQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDHAVNAKVQAESAQHQAGSLEKEFV .: .: .: :: .... .. . . : :. .::. .:.... :: . . CCDS13 LKQLQE--AEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINAR----KAKNSVTSLLSIIN 1470 1480 1490 1500 1510 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 ELKKQYAILQRKTSTTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDL-NL .: .: . : : . .: : ... :: ...::.::..:: : CCDS13 DLLEQLG--QLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEM------------KVSDLDRKVSDLENE 1520 1530 1540 1550 1560 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 SRQAKA---DQLRILEDQVVAIKNEIVEQEKKYARCYS ... .: : : .:. . :.: CCDS13 AKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP 1570 1580 1590 1600 >>CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs109|chr9 (1575 aa) initn: 893 init1: 411 opt: 1084 Z-score: 671.9 bits: 137.3 E(33420): 4.3e-31 Smith-Waterman score: 1879; 27.3% identity (51.0% similar) in 1764 aa overlap (23-1704:25-1551) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGA-----CHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR : :: : :. . :: .: :: ::: : CCDS69 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQ--ASHTCG-SP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 AQKYCILSYLEGE-QKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSEN--- . .: : .: ::. .:. : . ...:. . :. :::: . CCDS69 PEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAA-------DPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAF 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 GLDH---VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATS :... :.: : : ...... : :.: :: .. . . . :. ..... .: . CCDS69 GVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSASCQKT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 FPNITSGQAQGVGD----IVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLD--PS-FEIENPYSPYIQD . :: :. : :..::: : .::.:....:. :: ...:. :: .:. CCDS69 YGR-PEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEE--SPGLQE 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LVTLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQK :: :.: :.. .:.:.:: .. .. :..::::. .. : : : :::::::: : CCDS69 WVTSTELLISLDRLNTFGDDIF--KDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGP--- 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 MRGDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSS :: :.. : ::::: : .:::: :::: :: .. . : :.:...: CCDS69 ---DV---AGQL--ACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSE 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 RCHFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYR-DPLKTISDPYACIPCECD .: :: . ..: :: :. :. .: : ::.::. ::. :: . : ::.:. 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