Result of FASTA (omim) for
pF1KE2762
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2762, 323 aa
1>>>pF1KE2762 323 - 323 aa - 323 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64369986 residues in 92320 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3765+/-0.000377; mu= 20.5867+/- 0.023
mean_var=53.6723+/-11.354, 0's: 0 Z-trim(112.0): 24 B-trim: 485 in 1/49
Lambda= 0.175065
statistics sampled from 21637 (21657) to 21637 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(92320)
NP_996801 (OMIM: 610862) sphingolipid delta(4)-des ( 323) 2276 582.8 3.4e-166
XP_006720106 (OMIM: 610862) sphingolipid delta(4)- ( 287) 2034 521.7 7.7e-148
NP_003667 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid delta ( 323) 1589 409.3 5.8e-114
XP_016858137 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid de ( 287) 1395 360.3 3e-99
NP_001308471 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid de ( 287) 1395 360.3 3e-99
NP_001308470 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid de ( 288) 1395 360.3 3e-99
>>NP_996801 (OMIM: 610862) sphingolipid delta(4)-desatur (323 aa)
initn: 2276 init1: 2276 opt: 2276 Z-score: 3105.4 bits: 582.8 E(92320): 3.4e-166
Smith-Waterman score: 2276; 99.7% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNSASRSDFEWVYTDQPHTQRRKEILAKYPAIKALMRPDPRLKWAVLVLVLVQMLTCWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_996 MGNSASRSDFEWVYTDQPHTQRRKEILAKYPAIKALMRPDPRLKWAVLVLVLVQMLACWL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VRGLAWRWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 VRGLAWRWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AASFKKYHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 AASFKKYHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AVTRMEVLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 AVTRMEVLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ETYSYYGPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 ETYSYYGPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE2 VFEDSLGPYARVKRVYRLAKDGL
:::::::::::::::::::::::
NP_996 VFEDSLGPYARVKRVYRLAKDGL
310 320
>>XP_006720106 (OMIM: 610862) sphingolipid delta(4)-desa (287 aa)
initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 2775.8 bits: 521.7 E(92320): 7.7e-148
Smith-Waterman score: 2034; 99.7% identity (100.0% similar) in 287 aa overlap (37-323:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RSDFEWVYTDQPHTQRRKEILAKYPAIKALMRPDPRLKWAVLVLVLVQMLTCWLVRGLAW
::::::::::::::::::::.:::::::::
XP_006 MRPDPRLKWAVLVLVLVQMLACWLVRGLAW
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPYAASFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPYAASFKK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPKAVTRME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPKAVTRME
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGHETYSYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGHETYSYY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDFVFEDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDFVFEDSL
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KE2 GPYARVKRVYRLAKDGL
:::::::::::::::::
XP_006 GPYARVKRVYRLAKDGL
280
>>NP_003667 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid delta(4)- (323 aa)
initn: 1589 init1: 1589 opt: 1589 Z-score: 2167.6 bits: 409.3 E(92320): 5.8e-114
Smith-Waterman score: 1589; 65.0% identity (90.4% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNSASRSDFEWVYTDQPHTQRRKEILAKYPAIKALMRPDPRLKWAVLVLVLVQMLTCWL
::. .:: :::::::::::..::.::::::: ::.::.::: : : ....::.:. . ..
NP_003 MGSRVSREDFEWVYTDQPHADRRREILAKYPEIKSLMKPDPNLIWIIIMMVLTQLGAFYI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VRGLAWRWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPY
:. : :.:..: :::::.:.:::.:::::.:.::::::. .: :::...:::::.:.::
NP_003 VKDLDWKWVIFGAYAFGSCINHSMTLAIHEIAHNAAFGNCKAMWNRWFGMFANLPIGIPY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AASFKKYHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPK
. :::.::.:::::::.::.:::.:: .::::::: ::..:..:::.::..::: ..::
NP_003 SISFKRYHMDHHRYLGADGVDVDIPTDFEGWFFCTAFRKFIWVILQPLFYAFRPLFINPK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AVTRMEVLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGH
.: .::.::..:.. :. :. . :.: .::.::.:.::::::::::::.::::::::::
NP_003 PITYLEVINTVAQVTFDILIYYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ETYSYYGPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDF
:::::::::: .::::::: ::::::.::: .:::::::: ::::.::...::.:::.::
NP_003 ETYSYYGPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKSLPLVRKIAAEYYDNLPHYNSWIKVLYDF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE2 VFEDSLGPYARVKRVYRLAKDGL
:..:...::.:.::
NP_003 VMDDTISPYSRMKRHQKGEMVLE
310 320
>>XP_016858137 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid delta( (287 aa)
initn: 1395 init1: 1395 opt: 1395 Z-score: 1903.5 bits: 360.3 E(92320): 3e-99
Smith-Waterman score: 1395; 63.7% identity (90.3% similar) in 278 aa overlap (37-314:1-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RSDFEWVYTDQPHTQRRKEILAKYPAIKALMRPDPRLKWAVLVLVLVQMLTCWLVRGLAW
:.::: : : ....::.:. . ..:. : :
XP_016 MKPDPNLIWIIIMMVLTQLGAFYIVKDLDW
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPYAASFKK
.:..: :::::.:.:::.:::::.:.::::::. .: :::...:::::.:.::. :::.
XP_016 KWVIFGAYAFGSCINHSMTLAIHEIAHNAAFGNCKAMWNRWFGMFANLPIGIPYSISFKR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPKAVTRME
::.:::::::.::.:::.:: .::::::: ::..:..:::.::..::: ..:: .: .:
XP_016 YHMDHHRYLGADGVDVDIPTDFEGWFFCTAFRKFIWVILQPLFYAFRPLFINPKPITYLE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGHETYSYY
:.::..:.. :. :. . :.: .::.::.:.::::::::::::.::::::::::::::::
XP_016 VINTVAQVTFDILIYYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGHETYSYY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDFVFEDSL
:::: .::::::: ::::::.::: .:::::::: ::::.::...::.:::.:::..:..
XP_016 GPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKSLPLVRKIAAEYYDNLPHYNSWIKVLYDFVMDDTI
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KE2 GPYARVKRVYRLAKDGL
.::.:.::
XP_016 SPYSRMKRHQKGEMVLE
280
>>NP_001308471 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid delta( (287 aa)
initn: 1395 init1: 1395 opt: 1395 Z-score: 1903.5 bits: 360.3 E(92320): 3e-99
Smith-Waterman score: 1395; 63.7% identity (90.3% similar) in 278 aa overlap (37-314:1-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RSDFEWVYTDQPHTQRRKEILAKYPAIKALMRPDPRLKWAVLVLVLVQMLTCWLVRGLAW
:.::: : : ....::.:. . ..:. : :
NP_001 MKPDPNLIWIIIMMVLTQLGAFYIVKDLDW
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPYAASFKK
.:..: :::::.:.:::.:::::.:.::::::. .: :::...:::::.:.::. :::.
NP_001 KWVIFGAYAFGSCINHSMTLAIHEIAHNAAFGNCKAMWNRWFGMFANLPIGIPYSISFKR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPKAVTRME
::.:::::::.::.:::.:: .::::::: ::..:..:::.::..::: ..:: .: .:
NP_001 YHMDHHRYLGADGVDVDIPTDFEGWFFCTAFRKFIWVILQPLFYAFRPLFINPKPITYLE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGHETYSYY
:.::..:.. :. :. . :.: .::.::.:.::::::::::::.::::::::::::::::
NP_001 VINTVAQVTFDILIYYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGHETYSYY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDFVFEDSL
:::: .::::::: ::::::.::: .:::::::: ::::.::...::.:::.:::..:..
NP_001 GPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKSLPLVRKIAAEYYDNLPHYNSWIKVLYDFVMDDTI
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KE2 GPYARVKRVYRLAKDGL
.::.:.::
NP_001 SPYSRMKRHQKGEMVLE
280
>>NP_001308470 (OMIM: 615843,618404) sphingolipid delta( (288 aa)
initn: 1395 init1: 1395 opt: 1395 Z-score: 1903.5 bits: 360.3 E(92320): 3e-99
Smith-Waterman score: 1395; 65.1% identity (89.5% similar) in 275 aa overlap (1-275:1-275)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNSASRSDFEWVYTDQPHTQRRKEILAKYPAIKALMRPDPRLKWAVLVLVLVQMLTCWL
::. .:: :::::::::::..::.::::::: ::.::.::: : : ....::.:. . ..
NP_001 MGSRVSREDFEWVYTDQPHADRRREILAKYPEIKSLMKPDPNLIWIIIMMVLTQLGAFYI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VRGLAWRWLLFWAYAFGGCVNHSLTLAIHDISHNAAFGTGRAARNRWLAVFANLPVGVPY
:. : :.:..: :::::.:.:::.:::::.:.::::::. .: :::...:::::.:.::
NP_001 VKDLDWKWVIFGAYAFGSCINHSMTLAIHEIAHNAAFGNCKAMWNRWFGMFANLPIGIPY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AASFKKYHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRLEGWFFCTPARKLLWLVLQPFFYSLRPLCVHPK
. :::.::.:::::::.::.:::.:: .::::::: ::..:..:::.::..::: ..::
NP_001 SISFKRYHMDHHRYLGADGVDVDIPTDFEGWFFCTAFRKFIWVILQPLFYAFRPLFINPK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AVTRMEVLNTLVQLAADLAIFALWGLKPVVYLLASSFLGLGLHPISGHFVAEHYMFLKGH
.: .::.::..:.. :. :. . :.: .::.::.:.::::::::::::.::::::::::
NP_001 PITYLEVINTVAQVTFDILIYYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ETYSYYGPLNWITFNVGYHVEHHDFPSIPGYNLPLVRKIAPEYYDHLPQHHSWVKVLWDF
:::::::::: .::::::: ::::::.::: .:::
NP_001 ETYSYYGPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKSLPLSWSFLDGCSGSHL
250 260 270 280
310 320
pF1KE2 VFEDSLGPYARVKRVYRLAKDGL
323 residues in 1 query sequences
64369986 residues in 92320 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Oct 3 17:23:51 2019 done: Thu Oct 3 17:23:51 2019
Total Scan time: 3.340 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]