FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3182, 419 aa
1>>>pF1KE3182 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1620+/-0.000791; mu= 10.1716+/- 0.048
mean_var=144.4370+/-29.258, 0's: 0 Z-trim(113.1): 45 B-trim: 125 in 1/53
Lambda= 0.106717
statistics sampled from 13905 (13950) to 13905 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.417), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs109|chr3 ( 419) 2806 443.3 2.1e-124
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs109|chr12 ( 381) 1787 286.4 3.3e-77
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs109|chrX ( 384) 1069 175.8 6.2e-44
CCDS9034.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs109|chr12 ( 235) 558 97.0 2.1e-20
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs109|chr1 ( 482) 484 85.9 9.6e-17
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs109|chr11 ( 625) 484 85.9 1.2e-16
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs109|chr2 ( 314) 479 84.9 1.2e-16
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs109|chr8 ( 303) 477 84.6 1.4e-16
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs109|chr5 ( 367) 478 84.8 1.5e-16
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs109|chr8 ( 394) 477 84.7 1.7e-16
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs109|chr12 ( 665) 462 82.6 1.3e-15
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs109|chr10 ( 384) 425 76.7 4.4e-14
>>CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs109|chr3 (419 aa)
initn: 2806 init1: 2806 opt: 2806 Z-score: 2347.2 bits: 443.3 E(33420): 2.1e-124
Smith-Waterman score: 2806; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKNQLRGPPARAHMSTSGAAAAGGTRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MKNQLRGPPARAHMSTSGAAAAGGTRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QEELEARGGASLLLLDCRPHELFESSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QEELEARGGASLLLLDCRPHELFESSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHAD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KERFATRCKAATVLLYDEATAEWQPEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KERFATRCKAATVLLYDEATAEWQPEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGLGGLRISSDCSDGESDRELPSSATESDGSPVPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGLGGLRISSDCSDGESDRELPSSATESDGSPVPSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 QPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 HWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 VKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
370 380 390 400 410
>>CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs109|chr12 (381 aa)
initn: 1431 init1: 1399 opt: 1787 Z-score: 1499.8 bits: 286.4 E(33420): 3.3e-77
Smith-Waterman score: 1787; 71.9% identity (90.7% similar) in 367 aa overlap (55-419:18-381)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 TRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFE
:.. ::.:.:: :. :::.::::.::.:
CCDS90 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLEL-GNERLLLMDCRPQELYE
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 SSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQ
:::::.:::.::::.:::::.:::::.:... :..::. :: . ::.::::....:.
CCDS90 SSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWN
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 PEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSV
. :. :::::::.::.:.::.:.::.:::.:::.:.: :::::.:.: : ::::: :
CCDS90 ENTGGE-SVLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCS-SSSPPLPV
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 LGLGGLRISSDCS-DGESDREL-PSSATESDGSPVPSSQPAFPVQILPYLYLGCAKDSTN
::::::::::: : : ::: . :.:::.:::::. .:::.:::.:::.:::::::::::
CCDS90 LGLGGLRISSDSSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTN
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARS
:::: ..:::::::::::::: ::..::: :::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS90 LDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARG
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 KKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFE
:.:::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.:: :::::::::::::::::::
CCDS90 KNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFE
290 300 310 320 330 340
390 400 410
pF1KE3 RTLGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
:::::::::::.. ..::::.::.:.:.. ...:.::
CCDS90 RTLGLSSPCDNRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
350 360 370 380
>>CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs109|chrX (384 aa)
initn: 1159 init1: 798 opt: 1069 Z-score: 902.4 bits: 175.8 E(33420): 6.2e-44
Smith-Waterman score: 1262; 56.0% identity (75.4% similar) in 382 aa overlap (55-413:6-381)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 TRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFE
.: ::..:: . ::::::: .::.:
CCDS14 MEGLGRSCLWLRREL-SPPRPRLLLLDCRSRELYE
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KE3 SSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEA-----
:..: :...:.:.:.:::::.:.: .:...:. . : :::::..
CCDS14 SARIGGALSVALPALLLRRLRRGSLSVRALLPGPPLQPP-----PPAPVLLYDQGGGRRR
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 --TAEWQPEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPS
:: . : :::: ::::::..: ::::::::..::.: . :::.. . .. :
CCDS14 RGEAEAEAEEWEAESVLGTLLQKLREEGYLAYYLQGGFSRFQAECPHLCETSLAGRAGSS
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 SSP---PTSVLGLGGLRISSDCSDGES--DRELPSSATESDG-SPVPSS-QPAFPVQILP
.: :. :.:::.: ..:::::.:: ::. : . .:.: .: : . . .:::::::
CCDS14 MAPVPGPVPVVGLGSLCLGSDCSDAESEADRDSMSCGLDSEGATPPPVGLRASFPVQILP
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 YLYLGCAKDSTNLDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFF
:::: :.::.::. :.: ::.::::::::::: ::..:.: :::::::::::::::.::
CCDS14 NLYLGSARDSANLESLAKLGIRYILNVTPNLPNFFEKNGDFHYKQIPISDHWSQNLSRFF
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 PEAISFIDEARSKKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDFVKRKKSNISP
:::: ::::: :..::::::::::.::::::::::::::..::::::::.::::::::::
CCDS14 PEAIEFIDEALSQNCGVLVHCLAGVSRSVTVTVAYLMQKLHLSLNDAYDLVKRKKSNISP
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410
pF1KE3 NFNFMGQLLDFERTLGL---------SSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
:::::::::::::.: : :. . ::. .:.:::. . : :
CCDS14 NFNFMGQLLDFERSLRLEERHSQEQGSGGQASAASNPPSFFTTPTSDGAFELAPT
330 340 350 360 370 380
>>CCDS9034.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs109|chr12 (235 aa)
initn: 927 init1: 558 opt: 558 Z-score: 480.1 bits: 97.0 E(33420): 2.1e-20
Smith-Waterman score: 737; 40.8% identity (55.1% similar) in 365 aa overlap (55-419:18-235)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 TRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFE
:.. ::.:.:: :. :::.::::.::.:
CCDS90 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLEL-GNERLLLMDCRPQELYE
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 SSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQ
:::::.:::.::::.:::::.:::::.:... :..::. :: . ::.::::....:.
CCDS90 SSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWN
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 PEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSV
. :. :::::::.::.:.::.:.::.
CCDS90 ENTGGE-SVLGLLLKKLKDEGCRAFYLE--------------------------------
110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 LGLGGLRISSDCSDGESDRELPSSATESDGSPVPSSQPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLD
CCDS90 ------------------------------------------------------------
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 VLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKK
::::.:.
CCDS90 -----------------------------------------------------DEARGKN
140
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 CGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERT
:::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.:: :::::::::::::::::::::
CCDS90 CGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERT
150 160 170 180 190 200
390 400 410
pF1KE3 LGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
:::::::::.. ..::::.::.:.:.. ...:.::
CCDS90 LGLSSPCDNRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
210 220 230
>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs109|chr1 (482 aa)
initn: 540 init1: 476 opt: 484 Z-score: 414.3 bits: 85.9 E(33420): 9.6e-17
Smith-Waterman score: 629; 33.0% identity (62.4% similar) in 364 aa overlap (31-385:129-462)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MKNQLRGPPARAHMSTSGAAAAGGTRAGSEPGAGSGSG-AGTGAGAATGAGAMPCKSAEW
:..: :: .:: :. .: :.
CCDS15 AGTTTTAIGTSTTCPANQMVNNNENTGSLSPSSGVGSPVSGTPKQLASIKIIYPNDLAKK
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 L----QEELEARGGASLLLLDCRPHELFESSHIETAINLAIPG-LMLRRLRKGNLPIRSI
. . .: ..: ...:::: ...:::. :... . :::..:.. . ..
CCDS15 MTKCSKSHLPSQGP---VIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISRRRLQQGKITVLDL
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQPEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGG
: . :. : : . ...::: : : : :.. : ..:..:. .: . :.::
CCDS15 ISCREGKDSFK-RIFSKEIIVYDENTNE--PSRVMPSQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGG
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 FNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGLGGLRISSDCSDGESDRELPSSATESDG
...:. .. . :..... . .: :: .:. ::.
CCDS15 LSSFKQNHENLCDNSLQLQECRE-------VG-GGASAASSL--------LPQ-------
280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SPVPSS---QPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEF
:.:.. . : . :::.:.:: .:. .::.. . .: :..::: .:: . : :
CCDS15 -PIPTTPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLF
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 TYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMN
.::..: .: .::: :.: ::. ::.::.. :.:.:: ::.:::.:...::::..
CCDS15 NYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTR
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 LSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLF
....::: ::: :. ::::.:::::::.::. :
CCDS15 MTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PLNTLEST
>>CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs109|chr11 (625 aa)
initn: 526 init1: 348 opt: 484 Z-score: 412.7 bits: 85.9 E(33420): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 569; 35.5% identity (61.7% similar) in 324 aa overlap (67-387:21-302)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGG-ASLLLLDCRPHELFESSHIETAINLA
::: .. :..: : ..: :. ...:.
CCDS77 MAGDRLPRKVMDAKKLASLLRGGPGGPLVIDSRSFVEYNSWHVLSSVNIC
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 IPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQPEPGAPASVLG
:. :::..:.. : .: : .. :: . :..::..: . : : :.
CCDS77 CSKLVKRRLQQGKVTIAELIQPAARSQVEAT--EPQDVVVYDQSTRD--ASVLAADSFLS
60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LLLQKLRDDGC--QAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGLGGLRIS
.::.:: ::: .. : ::: :.. . :: ..:.. : : .:
CCDS77 ILLSKL--DGCFDSVAILTGGFATFSSCFPGLCE------GKPAALLPMS--------LS
110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 SDCSDGESDRELPSSATESDGSPVPSSQPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLDVLGKYGIKY
. : :::: . .:::.:::: :: : :.. . ::.:
CCDS77 QPCL------------------PVPSVGLT---RILPHLYLGSQKDVLNKDLMTQNGISY
160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 ILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKKCGVLVHCLA
.::.. . :. . : . ..::.:.. ..: .. ..: :::.:. ..: :.:::::
CCDS77 VLNASNSCPKP-DFICESRFMRVPINDNYCEKLLPWLDKSIEFIDKAKLSSCQVIVHCLA
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 GISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDN
:::::.:...::.:. :..: .::: ::: .. .:::::::.::::..::.: :
CCDS77 GISRSATIAIAYIMKTMGMSSDDAYRFVKDRRPSISPNFNFLGQLLEYERSLKLLAALQG
250 260 270 280 290 300
400 410
pF1KE3 HASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
CCDS77 DPGTPSGTPEPPPSPAAGAPLPRLPPPTSESAATGNAAAREGGLSAGGEPPAPPTPPATS
310 320 330 340 350 360
>>CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs109|chr2 (314 aa)
initn: 587 init1: 339 opt: 479 Z-score: 412.6 bits: 84.9 E(33420): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 599; 37.4% identity (61.7% similar) in 321 aa overlap (65-382:20-308)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFESSHIETAINL
. : . ::::::: : :...: .
CCDS20 MGLEAARELECAALGTLLRDPREAERTLLLDCRPFLAFCRRHVRAARPV
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 AIPGLMLRRLRKGNLPIRS-IIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQP-EPGAPAS
.:. :: : . . ..:..: . :.. : . : ... ::..: .: .::
CCDS20 PWNALLRRRARGPPAAVLACLLPDRALRTRLV-RGELARAVVLDEGSASVAELRPDSPAH
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 VL-GLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGLGGLR
:: . ::.. : .:.:.:::. :: : .. : . . :::.
CCDS20 VLLAALLHETRAGPTAVYFLRGGFDGFQG-----CCPDLCSEAPAPALPPTG--------
110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 ISSDCSDGESDRELPSSATESDGSPVPSSQPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLDVLGKYGI
:. ...:: : .: . . ::.:::::.:: . :..:. : ::
CCDS20 ----------DK-----TSRSD-SRAPVYDQGGPVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLQACGI
160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 KYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKKCGVLVHC
.:::. . :: :: : : ::.::. :. ..: .: :::.::: .... :::::
CCDS20 TAVLNVSASCPNHFE--GLFRYKSIPVEDNQMVEISAWFQEAIGFIDWVKNSGGRVLVHC
200 210 220 230 240 250
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CCDS60 -SGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVRC-NTIVRRRAKGSVSLEQILPAEEEVRARLR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]