Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3196
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3196, 470 aa
1>>>pF1KE3196 470 - 470 aa - 470 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6426+/-0.000749; mu= 13.8117+/- 0.045
mean_var=138.1086+/-27.387, 0's: 0 Z-trim(113.3): 17 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.109135
statistics sampled from 14151 (14164) to 14151 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 1.700
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS11744.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 ( 470) 3206 516.0 3.5e-146
CCDS45785.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 ( 384) 2611 422.2 4.7e-118
CCDS59297.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 ( 398) 2586 418.3 7.4e-117
CCDS59404.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 595) 851 145.3 1.7e-34
CCDS59405.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 618) 851 145.3 1.8e-34
CCDS12727.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 654) 851 145.3 1.8e-34
CCDS74414.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 448) 730 126.1 7.5e-29
>>CCDS11744.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 (470 aa)
initn: 3206 init1: 3206 opt: 3206 Z-score: 2738.2 bits: 516.0 E(33420): 3.5e-146
Smith-Waterman score: 3206; 100.0% identity (100.0% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSAQVLGFLRSWTPLPLAAPRGPAAAGNDAGAPAATAPGGEGEPHSRPCDARLGSTDKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSAQVLGFLRSWTPLPLAAPRGPAAAGNDAGAPAATAPGGEGEPHSRPCDARLGSTDKEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KAGAAATGSAPTAPGTPWQREPRVEVMDPAGGPRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KAGAAATGSAPTAPGTPWQREPRVEVMDPAGGPRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 VGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 APMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE3 KGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVSGCVEPPPSWKPQQMPPPEEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVSGCVEPPPSWKPQQMPPPEEPL
430 440 450 460 470
>>CCDS45785.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 (384 aa)
initn: 2611 init1: 2611 opt: 2611 Z-score: 2233.1 bits: 422.2 E(33420): 4.7e-118
Smith-Waterman score: 2611; 100.0% identity (100.0% similar) in 384 aa overlap (87-470:1-384)
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 DKELKAGAAATGSAPTAPGTPWQREPRVEVMDPAGGPRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDPAGGPRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKA
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LQLFRSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQLFRSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNG
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LMERPDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LMERPDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NLLSLHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLLSLHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGS
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 EMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 PKDGKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVSGCVEPPPSWKPQQMPPPEEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PKDGKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVSGCVEPPPSWKPQQMPPPEEPL
340 350 360 370 380
>>CCDS59297.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 (398 aa)
initn: 2586 init1: 2586 opt: 2586 Z-score: 2211.6 bits: 418.3 E(33420): 7.4e-117
Smith-Waterman score: 2586; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (90-470:18-398)
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LKAGAAATGSAPTAPGTPWQREPRVEVMDPAGGPRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDPVVGCGRGLFGFVFSAGGPRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQL
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 FRSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FRSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLME
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RPDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RPDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLL
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SLHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYL
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 PVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMF
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 AAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKD
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 GKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVSGCVEPPPSWKPQQMPPPEEPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVSGCVEPPPSWKPQQMPPPEEPL
350 360 370 380 390
>>CCDS59404.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 (595 aa)
initn: 1166 init1: 827 opt: 851 Z-score: 733.0 bits: 145.3 E(33420): 1.7e-34
Smith-Waterman score: 859; 44.6% identity (68.5% similar) in 336 aa overlap (14-332:22-350)
10 20 30 40
pF1KE3 MSAQVLGFLRSWTPLPLAAPRG---PAAAGNDAGAPAATAPGGEGE------
: : : ::: : : . . . .:. .
CCDS59 MNGHLEAEEQQDQALHIQRLRPKPEARPRGGLVPLAEVSGCCTLRSRSPSDSAAYFCIYT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE3 -PHSRPCDARLGSTDKELKAGAAATGSAPTAPGTPWQREPRVEVMD---PAGG---PRGV
:..: :: .: . ..: .::: : . : . :. : : .
CCDS59 YPRGRR-GARRRAT-RTFRADGAATYEENRAEAQRWATALTCLLRGLPLPGDGEITP-DL
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLFRSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELG
:::: :.:.:.:: ::.: : : ..:: :...:: .::.:. :::.:::::::.. :.
CCDS59 LPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELVQGLSLS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVT
.::..:..:::::.:::.:::..::::: :.. :. :: :::::::...:...:.: .
CCDS59 EWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGILPCGSGNALAGAVNQHGGFEPAL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 NEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLSLHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEM
. ::: ::.::::: :..:::. ::: : :: ::.::::..:::..::..: ::
CCDS59 GLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWGFVSDVDIQSERFRALGSA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 RFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGP-VDAHLVPLEEPVPSHW
:::::: : ::.:.::::::.:::. . ::::. ... : . ..:. .:.:
CCDS59 RFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPA----TVEPASPTPAHSLPRAKSELTLTPDPAPPMA
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKG
CCDS59 HSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWGGAGDAPLSPDPLLS
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 417 init1: 353 opt: 423 Z-score: 368.8 bits: 77.9 E(33420): 3.3e-14
Smith-Waterman score: 423; 45.4% identity (66.3% similar) in 163 aa overlap (300-460:445-595)
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 YRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEE
: .:::..: :: : : ::
CCDS59 PPGSPKAALHSPVSEGAPVIPPSSGLPLPTPDARVGAST--------CGPPDHLLPPLGT
420 430 440 450 460
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 PVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLF
:.: : :. . ::::.::. ::::... ::: .: :..:: .::.:.::: :::::
CCDS59 PLPPDW-VTLEGDFVLMLAISPSHLGADLVAAPHARFDDGLVHLCWVRSGISRAALLRLF
470 480 490 500 510 520
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 LAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKDGKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVS
::::.: :. :: : :. . :::::: .::..:::: . .:.:.::. ...
CCDS59 LAMERGSHFSLGCPQLGYAAARAFRLEPLTPRGVLTVDGEQVEYGPLQAQMHPGIGTLLT
530 540 550 560 570 580
450 460 470
pF1KE3 GCVEPP--PSWKPQQMPPPEEPL
: :: :. .:
CCDS59 G---PPGCPGREP
590
>>CCDS59405.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 (618 aa)
initn: 1166 init1: 827 opt: 851 Z-score: 732.8 bits: 145.3 E(33420): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 865; 43.8% identity (68.2% similar) in 349 aa overlap (1-332:33-373)
10 20
pF1KE3 MSAQVLGFLRSWTPLPLAAPRG---PAAAG
...:.: . : : : : ::: : :
CCDS59 PPPPPLAASTPLLHGEFGSYPARGPRFALTLTSQALHIQR-LRPKPEARPRGGLVPLAEV
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 NDAGAPAATAPGGEGE-------PHSRPCDARLGSTDKELKAGAAATGSAPTAPGTPWQR
. . . .:. . :..: :: .: . ..: .::: : . :
CCDS59 SGCCTLRSRSPSDSAAYFCIYTYPRGRR-GARRRAT-RTFRADGAATYEENRAEAQRWAT
70 80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KE3 EPRVEVMD---PAGG---PRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLFRSHVQPLLAEAEIS
. :. : : .:::: :.:.:.:: ::.: : : ..:: :...:: .:
CCDS59 ALTCLLRGLPLPGDGEITP-DLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLS
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQKPLCSL
:.:. :::.:::::::.. :..::..:..:::::.:::.:::..::::: :.. :. :
CCDS59 FNLIQTERQNHARELVQGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGIL
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 PAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLSLHTASGLRLFSVLS
: :::::::...:...:.: . . ::: ::.::::: :..:::. ::: : :: ::
CCDS59 PCGSGNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLS
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVV
.::::..:::..::..: :: :::::: : ::.:.::::::.:::. . ::::.
CCDS59 VAWGFVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPA----TVEPASPTP
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 VQQGP-VDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHL
... : . ..:. .:.:
CCDS59 AHSLPRAKSELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGG
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 417 init1: 353 opt: 423 Z-score: 368.6 bits: 77.9 E(33420): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 423; 45.4% identity (66.3% similar) in 163 aa overlap (300-460:468-618)
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 YRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEE
: .:::..: :: : : ::
CCDS59 PPGSPKAALHSPVSEGAPVIPPSSGLPLPTPDARVGAST--------CGPPDHLLPPLGT
440 450 460 470 480
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 PVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLF
:.: : :. . ::::.::. ::::... ::: .: :..:: .::.:.::: :::::
CCDS59 PLPPDW-VTLEGDFVLMLAISPSHLGADLVAAPHARFDDGLVHLCWVRSGISRAALLRLF
490 500 510 520 530 540
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 LAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKDGKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVS
::::.: :. :: : :. . :::::: .::..:::: . .:.:.::. ...
CCDS59 LAMERGSHFSLGCPQLGYAAARAFRLEPLTPRGVLTVDGEQVEYGPLQAQMHPGIGTLLT
550 560 570 580 590 600
450 460 470
pF1KE3 GCVEPP--PSWKPQQMPPPEEPL
: :: :. .:
CCDS59 G---PPGCPGREP
610
>>CCDS12727.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 (654 aa)
initn: 1190 init1: 827 opt: 851 Z-score: 732.4 bits: 145.3 E(33420): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 865; 43.8% identity (68.2% similar) in 349 aa overlap (1-332:69-409)
10 20
pF1KE3 MSAQVLGFLRSWTPLPLAAPRG---PAAAG
...:.: . : : : : ::: : :
CCDS12 PPPPPLAASTPLLHGEFGSYPARGPRFALTLTSQALHIQR-LRPKPEARPRGGLVPLAEV
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 NDAGAPAATAPGGEGE-------PHSRPCDARLGSTDKELKAGAAATGSAPTAPGTPWQR
. . . .:. . :..: :: .: . ..: .::: : . :
CCDS12 SGCCTLRSRSPSDSAAYFCIYTYPRGRR-GARRRAT-RTFRADGAATYEENRAEAQRWAT
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130
pF1KE3 EPRVEVMD---PAGG---PRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLFRSHVQPLLAEAEIS
. :. : : .:::: :.:.:.:: ::.: : : ..:: :...:: .:
CCDS12 ALTCLLRGLPLPGDGEITP-DLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLS
160 170 180 190 200 210
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQKPLCSL
:.:. :::.:::::::.. :..::..:..:::::.:::.:::..::::: :.. :. :
CCDS12 FNLIQTERQNHARELVQGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGIL
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: :::::::...:...:.: . . ::: ::.::::: :..:::. ::: : :: ::
CCDS12 PCGSGNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLS
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CCDS12 VAWGFVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPA----TVEPASPTP
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pF1KE3 VQQGP-VDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHL
... : . ..:. .:.:
CCDS12 AHSLPRAKSELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGG
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>--
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: .:::..: :: : : ::
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: :: :. .:
CCDS12 G---PPGCPGREP
650
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CCDS74 EWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGILPCGSGNALAGAVNQHGGFEPAL
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>--
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CCDS74 PLPPDW-VTLEGDFVLMLAISPSHLGADLVAAPHARFDDGLVHLCWVRSGISRAALLRLF
320 330 340 350 360 370
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CCDS74 G---PPGCPGREP
440
470 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]