FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3228, 520 aa 1>>>pF1KE3228 520 - 520 aa - 520 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1785+/-0.000824; mu= 14.6102+/- 0.050 mean_var=87.1138+/-17.633, 0's: 0 Z-trim(108.2): 15 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.137414 statistics sampled from 10168 (10180) to 10168 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.305), width: 16 Scan time: 1.610 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS7078.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs109|chr10 ( 520) 3488 701.5 6e-202 CCDS86068.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs109|chr10 ( 568) 3402 684.5 8.8e-197 CCDS81439.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs109|chr10 ( 514) 3398 683.7 1.4e-196 CCDS44353.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs109|chr10 ( 500) 3310 666.2 2.4e-191 CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs109|chr10 ( 534) 3309 666.0 3e-191 CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs109|chr1 ( 505) 2292 464.4 1.4e-130 CCDS31003.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs109|chr1 ( 471) 2231 452.3 5.7e-127 CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs109|chr3 ( 469) 2230 452.1 6.5e-127 CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs109|chrX ( 471) 2226 451.3 1.1e-126 CCDS82770.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs109|chr3 ( 462) 2170 440.2 2.5e-123 CCDS65273.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs109|chrX ( 406) 1941 394.8 1e-109 CCDS82769.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs109|chr3 ( 434) 1522 311.7 1.1e-84 >>CCDS7078.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs109|chr10 (520 aa) initn: 3488 init1: 3488 opt: 3488 Z-score: 3739.3 bits: 701.5 E(33420): 6e-202 Smith-Waterman score: 3488; 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99.2% identity (99.6% similar) in 499 aa overlap (22-520:36-534) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPSLPRSCGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYI :. .::::::::::::::::::::::::: CCDS60 QKEGDSQQAGALPLLCQLDTFSPKATVFGVSINPACGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 SKKLTRYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 SKKLTRYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SYLAKEGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 SYLAKEGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKIS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SPDYKDCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 SPDYKDCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHI 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 QSRIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 QSRIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 KDLRVWTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 KDLRVWTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQD 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 KYYYRYPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 KYYYRYPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLK 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 CPLHTVLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 CPLHTVLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPT 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 pF1KE3 KKPRINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS60 KKPRINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 490 500 510 520 530 >>CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs109|chr1 (505 aa) initn: 2311 init1: 2219 opt: 2292 Z-score: 2458.1 bits: 464.4 E(33420): 1.4e-130 Smith-Waterman score: 2292; 74.5% identity (91.9% similar) in 447 aa overlap (31-475:34-480) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPSLPRSCGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLN .:::::.:::.:::::::::.::::::::: CCDS31 ASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 WIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEGGQ ::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..:.:: CCDS31 WIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEENGQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 IAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDCNS :::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . : CCDS31 IAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 AEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYYLM ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.:::::: CCDS31 ENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWTSQ ::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.::::: CCDS31 NIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVWTSQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYPTG :: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: :::: : CCDS31 LKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRYPGG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 ESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVLKL :::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::..:: CCDS31 ESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTIFKL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 TPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRER-SEDAKKGPNPL-MRRNSVTPLASPEPTKKPRINS :::::::.::.: ::::.: :::.. ... :. .:. ::::: :::.: . ..:: CCDS31 TPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRPRNYS 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 pF1KE3 FEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH CCDS31 VGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD 490 500 >>CCDS31003.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs109|chr1 (471 aa) initn: 2249 init1: 2221 opt: 2231 Z-score: 2393.2 bits: 452.3 E(33420): 5.7e-127 Smith-Waterman score: 2231; 74.4% identity (90.9% similar) in 438 aa overlap (31-468:34-470) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPSLPRSCGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLN .:::::.:::.:::::::::.::::::::: CCDS31 ASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 WIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEGGQ ::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..:.:: CCDS31 WIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEENGQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 IAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDCNS :::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . : CCDS31 IAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 AEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYYLM ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.:::::: CCDS31 ENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWTSQ ::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.::::: CCDS31 NIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVWTSQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYPTG :: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: :::: : CCDS31 LKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRYPGG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 ESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVLKL :::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::..:: CCDS31 ESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTIFKL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 TPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSEDAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKKPRINSFE :::::::.::.: ::::.: :::.. : . . :: :.. : : CCDS31 TPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPT-AAETTLAVRRRPSAASLMLPC 430 440 450 460 470 490 500 510 520 pF1KE3 EHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH >>CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs109|chr3 (469 aa) initn: 2203 init1: 1335 opt: 2230 Z-score: 2392.1 bits: 452.1 E(33420): 6.5e-127 Smith-Waterman score: 2230; 70.7% identity (89.3% similar) in 457 aa overlap (2-453:4-458) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MPLELTQSRVQKIWVPVDH-RPSLPRSC--GPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKL : ::::. ..:::.: .. ::.: ..: : .:: ::.:::::::::::::::::: CCDS27 MASPRELTQNPLKKIWMPYSNGRPAL-HACQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISKKL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 TRYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLA :::::::::::. ::::.:::..:: :.:..:: :::::..:.::::::::::::. .:. CCDS27 TRYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVRRFLS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 KEGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDY .:::..::::::::::::: :..:...: .:.::.::.: :: :.:.::..::..:::: CCDS27 EEGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLGSPDY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KDCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRI . .: :: .:::.:: ::: ::. :: : ::::: ::..:::. ..:::: ::::::: CCDS27 VNRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDED-LDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQSRI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLR ::::::::: ::.::::::::.: ::.:::::: ::: ::..::..:..:. .::.:::. CCDS27 VYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFAKSLAQFISDQNIKDLK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 VWTSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYY :::::.: :::::::: .::::::.:::::::::::.:::::.:.:: :.:::.:::: : CCDS27 VWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDNYPLEFALRDQDKYRY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 RYPTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLH ::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::..:::::::: CCDS27 RYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEQLPYLKCPLH 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 TVLKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSE--DAKKGPNPLMRRNSVTPLASPEPTKK ::::::::::::.::::.::: .: :::.: . : .. : CCDS27 TVLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 pF1KE3 PRINSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH >>CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs109|chrX (471 aa) initn: 2203 init1: 1315 opt: 2226 Z-score: 2387.8 bits: 451.3 E(33420): 1.1e-126 Smith-Waterman score: 2226; 70.6% identity (89.5% similar) in 456 aa overlap (4-455:7-460) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPS-LPRSCG---PKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISK ::::.:.::::.: . : : : : :..:::::...::::::::::::: CCDS14 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 KLTRYLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSY ::::::::::.::::::.:.::::::. :..:.:: ::: ::...:::::::::.::..: CCDS14 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAVS-YKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LAKEGGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSP :..: :..::::::::::::: .::.::::. .:.:::::.:.:: ..: :: .::..:: CCDS14 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 DYKDCNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQS :: ::. ....::.::: :::..::::: .. : :: ::..::: :..:::::::::: CCDS14 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 RIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKD : ::::::::: ::.::::::::.: :..:::::::::: :::..: ::..:.. :.... 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