Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3300
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3300, 2555 aa
1>>>pF1KE3300 2555 - 2555 aa - 2555 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8361+/-0.00166; mu= -2.1274+/- 0.100
mean_var=571.3297+/-113.296, 0's: 0 Z-trim(111.9): 261 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.053658
statistics sampled from 12497 (12745) to 12497 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 7.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 18971 1486.4 0
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 6853 548.3 1.8e-154
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 5428 437.9 2.8e-121
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 2659 223.5 8.7e-57
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 1663 146.6 1.9e-33
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 1663 146.6 1.9e-33
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 1509 134.2 4e-30
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 1494 133.5 1.5e-29
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 1259 114.9 2.6e-24
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 1247 114.0 5.1e-24
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 1091 101.7 1.8e-20
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1406) 1091 101.9 2.4e-20
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2 ( 737) 1013 95.6 1e-18
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1382) 1014 96.0 1.5e-18
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 1001 94.6 2e-18
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 945 90.3 3.8e-17
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 959 92.2 5.2e-17
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 896 87.2 1.3e-15
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9 (1285) 885 85.9 1.4e-15
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1557) 857 83.9 7.3e-15
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1587) 857 83.9 7.4e-15
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1624) 857 83.9 7.5e-15
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 776 77.6 5.6e-13
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 760 76.2 1e-12
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 740 74.8 3.8e-12
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 739 74.7 3.8e-12
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 731 74.1 6.2e-12
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 731 74.1 6.2e-12
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 731 74.1 6.2e-12
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1294) 728 73.8 6.6e-12
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 723 73.5 9.5e-12
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 587) 678 69.5 5.8e-11
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 618) 678 69.5 6e-11
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 693 71.5 7e-11
>>CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555 aa)
initn: 18971 init1: 18971 opt: 18971 Z-score: 7956.2 bits: 1486.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 18971; 100.0% identity (100.0% similar) in 2555 aa overlap (1-2555:1-2555)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKCEAANGTEACVCGGAFVGPRCQDP
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CCDS43 MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKCEAANGTEACVCGGAFVGPRCQDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACLTNPCRNGGTCDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACLTNPCRNGGTCDLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQ
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CCDS43 HECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCE
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CCDS43 LMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 CPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 GYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 AKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKID
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 GYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNEC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 NSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 EGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 GGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 GRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 TDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 DVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 YRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 YCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 LPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 GERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKGKPCKNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKGKPCKNGG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 TCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 PECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 PPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 SDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 CAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQQMIFPYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQQMIFPYY
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 GREEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVRGSIVYLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GREEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVRGSIVYLEI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 DNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPAQLHFMYVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPAQLHFMYVA
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE3 AAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVSEASKKKRREPLGEDSVGLKPLKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVSEASKKKRREPLGEDSVGLKPLKNA
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE3 SDGALMDDNQNEWGDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHLDAADLRMSAMAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDGALMDDNQNEWGDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHLDAADLRMSAMAP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE3 TPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDAPAVISDFIYQGASL
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CCDS43 TPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDAPAVISDFIYQGASL
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE3 HNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVSADAQGVFQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVSADAQGVFQIL
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE3 IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVDDLGKSALHWAAAVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVDDLGKSALHWAAAVNN
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE3 VDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDI
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE3 AQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGYLGSLKPGVQGKKVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGYLGSLKPGVQGKKVRK
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE3 PSSKGLACGSKEAKDLKARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSPVDSLESPHGYLSDVASPPLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSSKGLACGSKEAKDLKARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSPVDSLESPHGYLSDVASPPLLP
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE3 SPFQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGHLNVAAKPEMAALGGGGRLAFETGPPRLSHLPVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPFQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGHLNVAAKPEMAALGGGGRLAFETGPPRLSHLPVAS
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE3 GTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSGMVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSGMVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAP
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE3 SLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQPHLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQPHLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPA
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE3 NIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSGEPSQADVQPLGPSSLAVHTILPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSGEPSQADVQPLGPSSLAVHTILPQE
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
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CCDS90 -PTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASS
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CCDS90 NAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHS-ASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRG
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pF1KE3 PEAFK
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CCDS12 ---EAACLCPPGWVGERC--QLEDPCHSGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPD
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pF1KE3 CQQADPCASNPCANGGQC-LPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVNECG-QKPGLCRHGGTC
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CCDS12 CSLPDPCLSSPCAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEP--CRHGGTC
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CCDS12 LNTPGSFRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCE
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pF1KE3 ENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNT
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CCDS12 VNVDDCPGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNT
240 250 260 270 280 290
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CCDS12 LGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDA
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:.::::.: . ::::::::.:::::: :.:: ::.:::::::.::::::: :.:.:: ::
CCDS12 CVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHLGRCVNTQGS
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CCDS12 FLCQCGRGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQ
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CCDS12 SSPCVNGGVCKDRVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCA
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:::::::::::.:...:::::::::::...:::::::::::::::.::.::::::::.::
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. . ::: .: .:. . . : : .: : . :: .: :: .: :
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pF1KE3 GVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSP
: :::.:.: : :.::.: ::: :
CCDS34 GQNCSKELDACQSQPCHNHGTCTPKP----------------------------------
970 980
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE3 KCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECR
::. :.::::::: ::::::.:::..:: :: : . .: :.:.:
CCDS34 ------------GGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCL
990 1000 1010 1020 1030
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE3 AGHTGRRCESVINGCKGKPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLR
::::. :: :. :...:: .:::: ..... ::::.:: :::: :: . : .:: .
CCDS34 PGHTGQWCEVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHH
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE3 CLNGGTCISGPRS---PTCLCLGPFTGPECQFP-ASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSE--SP
: .:: :. .:. : : ::. . ::.: : : . : .:: .:.: :. .:
CCDS34 CHHGGLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGP
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE3 FYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDIPPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNH
.:: :: . : :. :. : :. .:. .:. :..
CCDS34 GFRCSCPHSSPGPRCQK-----PGAKG----------------CEGRSGDGACDAGCSGP
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pF1KE3 ACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYFSDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNP
. .::::::::. ::::.: . .:: : ::.: ::.: :::::.::. . :.:
CCDS34 GGNWDGGDCSLGVPDPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDCETPPA-CTP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KE3 LYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLDCAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSF
:::::.::: .:::..:::.::: ::: :: . . . .:...:.. : : .. :
CCDS34 AYDQYCHDHFHNGHCEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPALDQQLF
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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. : :: .:.... ..: :..:..:: : :: : .. : .:
CCDS34 ALARVLSLTLRVGLWVRKDRDGRDMVYPY----------PGARAEEKLGGTRDPTYQERA
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pF1KE3 SLLPGGSEGGRRRRELDPMDVRGSIVYLEIDNRQCV--QASSQCFQSATDVAAFLGALAS
. : . :. : : ... : .: . .: .: . .:.: . . ::.:.:.
CCDS34 A--PQTQPLGK---ETDSLSA-GFVVVMGVDLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAA
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.:.:. .: . ::. .. :: :: . . . .: :.:. .: ..:. :.:::.
CCDS34 VGALEPLLPGPLLAVHPHAGTAPPANQLPWPVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRRE
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:: ::.: :: .... ..:: ::::::.::: :: . ::..: .. .: :.:
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... . . . :. . .: : ..:: :::: : . . :...
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::::: :::: : : : ...:. . : .. :: . .: :::: ::::
CCDS34 RGPDGVTPLMSAVCCGE-VQSGTFQGAWLGCPEPWEPLLDGGACPQAHTVGTGETPLHLA
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pF1KE3 ARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVSADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDG
::.:: ::.:::::.:. : : :::::::::.:::. : :.:.:.: : .::: .::
CCDS34 ARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRTPLHAAVAADAREVCQLLLRSRQTAVDARTEDG
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2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KE3 TTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVDDLGKSALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKD
::::.:::::::: ..:.:: ..:::.: : ::.::::::::::. :: ::. ::.::
CCDS34 TTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGARDKWGKTALHWAAAVNNARAARSLLQAGADKD
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pF1KE3 MQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLLD-
:.:::.::::::::::. :.:..:: : :.. :. : :.:..: : :.. ::.
CCDS34 AQDNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGLGAARELRDQAGLAPADVAHQRNHWDLLTLLEG
1770 1780 1790 1800 1810 1820
2120 2130 2140 2150 2160 2170
pF1KE3 ----EYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGYLGSLKPGVQGKKVRKPSSKGLACGS
: .: ...:. . :.: . :.: :. : . .. : :: .
CCDS34 AGPPEARHKATPGREAGPFPRARTVSVSV-PPHG--GGALPRCRTLSAGAGPRGGGACLQ
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. . :: :: : : . :: : . .:.: . . . .: :. ..
CCDS34 ARTWSVDLAAR------GGGAYSHCRS-LSGVGAGGGPTPRGRRFSAGMRGPRPNPAIMR
1880 1890 1900 1910 1920 1930
2230 2240 2250 2260 2270
pF1KE3 QSPSVPLNH-----LPGMPDTHLGIGHLNVAAK-----PEMAALGGGGRLAFETGPPRLS
.: .. : ...: . :.. : .. : .. ::: :.
CCDS34 GRYGVAAGRGGRVSTDDWPCDWVALGACGSASNIPIPPPCLTPSPERGSPQLDCGPPALQ
1940 1950 1960 1970 1980 1990
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pF1KE3 HLPVASGTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSGMVPNQYNPLRGSVAPGP
..:. .:
CCDS34 EMPINQGGEGKK
2000
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:: . :: . .. :. . : : : . :... : :: .: .
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. : : .:. :. : .::::..::.:.::.: :::.:: :. :
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.:.: ::: :..:: . :.: . : ::. : : .:: : . . :..:. . .::
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.::::.. : : ..: : :: :.:: .: .:.::: ::: :. :.... . :.:::
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: :::. :. : :. .:::...:: : :.: . : ::::.. ::
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: : : : : .....: :.::..::.:.:.:.::...::.:.::: : : : : :
CCDS47 SCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFCNCEPE
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:: : : .::.:. .::. . : .::.: : ::..: ::.:: .:: :.::.. :
CCDS47 YHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEPCLHDG
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.: : . :.: :. :: : .:.:: :.: :::::. : : . . : :.: :.. :
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pF1KE3 EVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQN
.. . :. :: : : :..: ..:.:.:: :. : :: .:..:.
CCDS47 KIKINDCTSIPCMNEGFCQKSA--HGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNCA------------
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: .... : ::: :.:: . .: : ::::: : ::: .
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::::.:.:: .::.: : ...:.: : :.:: ::::. .: .:: . :... .
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:::: ::: . : : : : : : : :: :
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..::
CCDS47 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
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pF1KE3 SYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVTHECACLPGFTG---QNCEEN
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CCDS78 IPGCTKNPCWFLKNVYLIHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGEKCQGV
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CCDS78 IDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGCSCLSE
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CCDS78 EDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGRLCVVN
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pF1KE3 -DACISNPC-NEGSNCDTNPVNGKAICTCPSG---YTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGK
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CCDS78 VDYCLGNHSISVHGLCLALSHN----CNC-SGLQRYERNICEIDTEDCK--SASCKNGTT
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CCDS78 SCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFCNCEPE
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CCDS78 VCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEYPCSCDADGTSTQC
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CCDS78 KIKINDCTSIPCMNEGFCQKSA--HGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNCA------------
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pF1KE3 THGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAF-CDCLPGFRGTFCEED
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CCDS78 ------------------EPELNSV---ICLNGGICVDGPGHTFDCRCLPGFSGQFCEIN
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CCDS78 INECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVHE-LCMENEPGS
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CCDS78 TCLCTPGF--------------MTCSIGLLCGDEIRRITCLTPIFQRTDPISTQTYTIPP
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CCDS78 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
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pF1KE3 GTCLDKIDG-YECACEPGYTGSMCNINIDECAGNP--CHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYH
: : .. .. : : .. . .:.::: .: : :: ::. ... : : ::.
CCDS34 --CPAKNSAEFHGLCSSGVGITVDGRDINECALDPDICANG-ICENLRGSYRCNCNSGYE
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710 720 730 740 750
pF1KE3 -DPT---CLSEVNECNSNP--CVHGACRDSLNGYKCDCDPGW----SGTNCDINNNECES
: . :. ...:: : : .: ::.. ..:.: : ::. .:. . :::::
CCDS34 PDASGRNCI-DIDECLVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPPGYVFRTETETCE-DINECES
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pF1KE3 NPCVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLL
::::::. :.. ... : : : . .:.. : .. .::: .. .:. .
CCDS34 NPCVNGA-CRNNLGSFNCECSPG--SKLSSTGLI-CIDSL---KGTCWLNIQDSRCE--V
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pF1KE3 PYTGATCEVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGW---QGQTCEVDINECVLS
.::: . :: :. :.. : .. .:: : .: ::: :.::: .
CCDS34 NINGATLKS--ECCATLGAAWGSPCERCE----LDTACPRGLARIKGVTCE-DVNECEVF
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880 890 900 910 920 930
pF1KE3 P--CRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYS----GRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAF
: : .: : :..:...:.: : . :: : : : . :. . . :.
CCDS34 PGVCPNG-RCVNSKGSFHCECPEGLTLDGTGRVCL----DIRMEQCYLKWDEDECIHP--
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pF1KE3 CDCLPG-FRGTFCEEDINECASDPCRNGANCTDC----VDSYTCTCP--AGFSGI-HCEN
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CCDS34 ---VPGKFRMDAC------CCAVGAAWGTECEECPKPGTKEYETLCPRGAGFANRGDVLT
1020 1030 1040 1050 1060
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 NTP---DCTESSCFNG----GTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQH---DVNECDSQPCLH
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CCDS34 GRPFYKDINECKAFPGMCTYGKCRNTIGSFKCRCNSGFALDMEERNCTDIDECRISPDLC
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pF1KE3 G-GTCQDGCGSYRCTCPQGY-TG----PNCQNLVHWCDSSP--CKNGGKCWQTHTQYRCE
: : : . ::..: : .:: .: ::.. . :. .: :. :: : .:. ...:.
CCDS34 GSGICVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMD-IDECERNPLLCR-GGTCVNTEGSFQCD
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pF1KE3 CPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCED
:: :
CCDS34 CPLGHELSPSREDCVDINECSLSDNLCRNGKCVNMIGTYQCSCNPGYQATPDRQGCTDID
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CCDS99 LHGGCTVPG----ECRCSYGWQGRFC----DECVPYPG-CVHG-SCVEP---WQCNCETN
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CCDS99 WGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCAN
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CCDS99 GGSCHEVPSGFE--CHCPSGWSGPTCALDIDECA--SNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQ
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CCDS99 WVGATCQLDVNDC-RGQCQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGG
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: : . :.:.:: ::.: ::. ::: : .::.:::.: . . : :.: . . : .:
CCDS99 LCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNC
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: : .:: :.:. :: .. . :: .. ..: ::: ::.
CCDS99 SV------PREPCPGGACRVIDGCGSDAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQP---GGN---
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. :.: .: :: :. :.::: ..:: ..:::.:..:...: : :. : .:. :
CCDS99 ----FSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNP
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..: .:::. : : : .: : : : .:.. :: :. .:.. : .:. : :: . ..
CCDS99 NDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFR
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: : :::.:..: . .:. : ::::::::: ... : ::.:. : .: : :.:
CCDS99 CACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNP
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pF1KE3 NPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVC
:: : : :.: : ..:.: ::
CCDS99 LPCYNGGICVDGVNWFRCEC----------------AP----------------------
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:. : :...:.:: ::: .::.: . .:::: : : .: :. : .: :
CCDS99 --GFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSR
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pF1KE3 PNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCP
.: .:.: .. :. : :: : : : . :. :: ... .. . ::
CCDS99 GTPFPHGSSWVEDCNS--CRCLDGRRD--CSK--VWCGWKPCLLAGQ----PEALSAQCP
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: .: ...: .: . : : : .. : :: : . : . . . . .
CCDS99 LG---QRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHV
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pF1KE3 LHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWT
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CCDS99 PQGTTVGAICSGIR-SLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSL
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CCDS99 IQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACVVL
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CCDS99 WKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKF-CRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWM
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CCDS99 GKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFC----DECVPYPGCVHGSC---VE
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CCDS99 PWQCNCETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEH
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CCDS99 ACTSNPCANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFEC
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::: . :: ..:::...::... .:.. ..:: ::: :::.: :: :: :.:...
CCDS99 ICPEQWVGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQ-
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pF1KE3 CVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPY
: .::::::...:: :.: .::.: .:. . .::::.:: . : : : . :..:.: .
CCDS99 CQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGF
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CCDS99 SGPLCEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEG--DYYCACPDDFGGKNCSVPRE-----PCPGG
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pF1KE3 ASCQNTHGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAF-CDCLPGFRGT
: :. : : .:: : . : :. : :.. . : : : :: ::
CCDS99 A-CRVIDG---CGSDAG-PGMPGTAASGVCGPH-----GRCVSQPGGNFSCICDSGFTGT
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pF1KE3 FCEEDINECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVD
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CCDS99 YCHENIDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYD
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CCDS99 LVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAK
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pF1KE3 HW-CDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHG
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CCDS99 NSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLP----------CYNG
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pF1KE3 GLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVN
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CCDS99 GICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPR
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pF1KE3 CSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCF
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CCDS99 CQEVIG--FGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDC----NSCRCLDGRRDCSKVW--CGWKP-CL
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CCDS99 LAG----QPEALSAQCP---LGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWG--ECGAEEPPSTPCLPRS
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pF1KE3 GHTGRRC---------ESVINGCK-GKPCKNGGTCAVASNTARG--FICKCPAGFEGATC
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CCDS99 GHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASA
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pF1KE3 ENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTGPECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEP
. : . . : : .. :.:
CCDS99 VEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLL
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2555 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 17:23:26 2016 done: Tue Nov 8 17:23:28 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]