Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3316
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3316, 878 aa
1>>>pF1KE3316 878 - 878 aa - 878 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0685+/-0.00107; mu= 0.1347+/- 0.064
mean_var=299.4070+/-63.967, 0's: 0 Z-trim(114.4): 627 B-trim: 532 in 1/49
Lambda= 0.074121
statistics sampled from 14290 (15003) to 14290 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.461), width: 16
Scan time: 4.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12689.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 ( 878) 5958 651.3 2.2e-186
CCDS59401.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 ( 721) 4872 535.1 1.7e-151
CCDS9637.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 ( 912) 2605 292.8 1.9e-78
CCDS81796.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 ( 920) 2605 292.8 1.9e-78
CCDS1789.1 PRKD3 gene_id:23683|Hs108|chr2 ( 890) 2516 283.2 1.4e-75
CCDS13843.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 ( 543) 628 81.2 5.7e-15
CCDS33629.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 ( 586) 628 81.2 6e-15
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 616 79.7 1e-14
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 616 79.8 1.1e-14
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 610 79.3 2.5e-14
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 603 78.4 2.7e-14
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 766) 595 77.8 8.5e-14
CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 783) 595 77.8 8.6e-14
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 586 76.6 1.2e-13
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 567 74.6 4.4e-13
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 562 74.0 5.6e-13
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 557 73.5 9.9e-13
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 549 72.6 1.7e-12
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 547 72.5 2.1e-12
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 547 72.5 2.1e-12
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 547 72.5 2.1e-12
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 547 72.5 2.1e-12
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 547 72.5 2.2e-12
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 547 72.5 2.2e-12
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 543 72.0 2.6e-12
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 543 72.0 2.6e-12
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 541 71.8 3.4e-12
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 541 71.9 3.5e-12
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 543 72.2 3.9e-12
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 543 72.2 3.9e-12
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 537 71.4 4.5e-12
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 537 71.4 4.7e-12
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 537 71.4 4.8e-12
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 537 71.5 4.9e-12
CCDS5470.1 STK17A gene_id:9263|Hs108|chr7 ( 414) 533 70.9 5.3e-12
CCDS48094.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 897) 540 71.9 5.6e-12
CCDS48095.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 898) 540 71.9 5.6e-12
CCDS14257.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 921) 540 72.0 5.7e-12
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 531 70.8 6.9e-12
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 531 70.8 7e-12
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 526 70.2 9.6e-12
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 535 71.6 1.2e-11
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 526 70.4 1.4e-11
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 521 69.7 1.6e-11
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 515 68.9 1.8e-11
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 515 68.9 1.8e-11
CCDS11213.1 ULK2 gene_id:9706|Hs108|chr17 (1036) 525 70.4 1.9e-11
CCDS2315.1 STK17B gene_id:9262|Hs108|chr2 ( 372) 514 68.8 2e-11
CCDS34330.1 MYLK4 gene_id:340156|Hs108|chr6 ( 388) 513 68.8 2.2e-11
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 511 68.6 2.9e-11
>>CCDS12689.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 (878 aa)
initn: 5958 init1: 5958 opt: 5958 Z-score: 3459.8 bits: 651.3 E(32554): 2.2e-186
Smith-Waterman score: 5958; 100.0% identity (100.0% similar) in 878 aa overlap (1-878:1-878)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MATAPSYPAGLPGSPGPGSPPPPGGLELQSPPPLLPQIPAPGSGVSFHIQIGLTREFVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MATAPSYPAGLPGSPGPGSPPPPGGLELQSPPPLLPQIPAPGSGVSFHIQIGLTREFVLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PAASELAHVKQLACSIVDQKFPECGFYGLYDKILLFKHDPTSANLLQLVRSSGDIQEGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PAASELAHVKQLACSIVDQKFPECGFYGLYDKILLFKHDPTSANLLQLVRSSGDIQEGDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VEVVLSASATFEDFQIRPHALTVHSYRAPAFCDHCGEMLFGLVRQGLKCDGCGLNYHKRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VEVVLSASATFEDFQIRPHALTVHSYRAPAFCDHCGEMLFGLVRQGLKCDGCGLNYHKRC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AFSIPNNCSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTAEELSRSTTELLPRRPPSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AFSIPNNCSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTAEELSRSTTELLPRRPPSSSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SSASSYTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTVCQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSASSYTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTVCQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NCHKRCATRVPNDCLGEALINGDVPMEEATDFSEADKSALMDESEDSGVIPGSHSENALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NCHKRCATRVPNDCLGEALINGDVPMEEATDFSEADKSALMDESEDSGVIPGSHSENALH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 ASEEEEGEGGKAQSSLGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASEEEEGEGGKAQSSLGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LDCKCITLFQNNTTNRYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDCKCITLFQNNTTNRYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 MPGGTPGGPSGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MPGGTPGGPSGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 ENVDIATVYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ENVDIATVYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ILQSLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ILQSLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 ALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 EVLLNQGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EVLLNQGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 IDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE3 AAEHPLPGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAEHPLPGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
850 860 870
>>CCDS59401.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 (721 aa)
initn: 4872 init1: 4872 opt: 4872 Z-score: 2833.3 bits: 535.1 E(32554): 1.7e-151
Smith-Waterman score: 4872; 100.0% identity (100.0% similar) in 721 aa overlap (158-878:1-721)
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SATFEDFQIRPHALTVHSYRAPAFCDHCGEMLFGLVRQGLKCDGCGLNYHKRCAFSIPNN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MLFGLVRQGLKCDGCGLNYHKRCAFSIPNN
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 CSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTAEELSRSTTELLPRRPPSSSSSSSASSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTAEELSRSTTELLPRRPPSSSSSSSASSYT
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 GRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTVCQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKRCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTVCQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKRCA
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TRVPNDCLGEALINGDVPMEEATDFSEADKSALMDESEDSGVIPGSHSENALHASEEEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TRVPNDCLGEALINGDVPMEEATDFSEADKSALMDESEDSGVIPGSHSENALHASEEEEG
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EGGKAQSSLGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWRLDCKCIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EGGKAQSSLGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWRLDCKCIT
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LFQNNTTNRYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGEMPGGTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LFQNNTTNRYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGEMPGGTPG
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 GPSGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQENVDIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GPSGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQENVDIAT
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 VYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRH
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 PGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHF
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 KNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQG
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 YNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGAIDLINNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGAIDLINNL
580 590 600 610 620 630
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFAAEHPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFAAEHPLP
640 650 660 670 680 690
850 860 870
pF1KE3 GSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
700 710 720
>>CCDS9637.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 (912 aa)
initn: 4046 init1: 2056 opt: 2605 Z-score: 1521.8 bits: 292.8 E(32554): 1.9e-78
Smith-Waterman score: 4081; 68.4% identity (83.8% similar) in 914 aa overlap (2-878:19-912)
10 20 30 40
pF1KE3 MATAPSYPAGLPGSPGPGSPPPPGGLELQSPPPLLPQIPAPGS
:.: . : .::: ::: : :.: . :: .
CCDS96 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGS-GPG------------PAPFLAPVAAPVG
10 20 30 40
50 60 70 80 90
pF1KE3 GVSFHIQIGLTREFVLLPAASE----LAHVKQLACSIVDQKFPECGFYGLYDKILLFKHD
:.:::.::::.:: ::: : ::::...::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS96 GISFHLQIGLSREPVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFRHD
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 PTSANLLQLVRSSGDIQEGDLVEVVLSASATFEDFQIRPHALTVHSYRAPAFCDHCGEML
::: :.::::....:::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS96 PTSENILQLVKAASDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEML
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 FGLVRQGLKCDGCGLNYHKRCAFSIPNNCSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTA
.:::::::::.::::::::::::.:::::::.:.::::..::.. ..: ...: .
CCDS96 WGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 EE--LSRSTTELLPRRPPSSSSSSSASSYTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTV
.: :..: .: . : :.:.: : ::::.:::.:.:::::::::.:::::::::
CCDS96 DEPLLQKSPSESFIGREKRSNSQS----YIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE3 CQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKRCATRVPNDCLGEALINGD---------VPMEE
:: ::::::::::::::::::.:::::::: .:::.::::. :::: : :::
CCDS96 CQYCKKLLKGLFRQGLQCKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEE
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370
pF1KE3 ATDFSEADK-SALMDESEDSGVIPGSHSENALHASEEEEGEGGK------------AQSS
..: ..... :.:::. :.. : . .: :. ... :: . :.
CCDS96 GSDDNDSERNSGLMDDMEEAMV---QDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPST
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 LGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWRLDCKCITLFQNNTTN
. ::::::::::.:: :::::...:::.:::..::::::::::::: ::::::::.: .
CCDS96 SNNIPLMRVVQSVKHTKRKSSTVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGS
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KE3 RYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGEM---PGG-TPGGP--
::::::::::::..: ... .:.: :.:::::::.:::..:.::: :.. .:..
CCDS96 RYYKEIPLSEILSLEPVKTSALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVL
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 -SGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQENVDIATV
:: ::..:: :: ::..:::::: . . . : ::. :.:::::: ::::::::.::
CCDS96 TSGVGADVARMWEIAIQHALMPVIPKGSSVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTV
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 YQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRHP
:::::::::::::::.::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:.::
CCDS96 YQIFPDEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHP
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHFK
:.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::
CCDS96 GVVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFK
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 NIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::
CCDS96 NIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGY
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 NRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGAIDLINNLL
::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::: .::..:: :::::::::
CCDS96 NRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLL
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790 800 810 820 830 840
pF1KE3 QVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFAAEHPL--
::::::::::::.:::::::.::::::::::: :.::::::::::: :::..:.:. :
CCDS96 QVKMRKRYSVDKTLSHPWLQDYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQY
830 840 850 860 870 880
850 860 870
pF1KE3 PGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
: . . . . . .. .:..:.::.:.:
CCDS96 PTHLINPSASHSDTPETEETEMKALGERVSIL
890 900 910
>>CCDS81796.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 (920 aa)
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10 20 30 40
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:.: . : .::: ::: : :.: . :: .
CCDS81 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGS-GPG------------PAPFLAPVAAPVG
10 20 30 40
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pF1KE3 GVSFHIQIGLTREFVLLPAASE----LAHVKQLACSIVDQKFPECGFYGLYDKILLFKHD
:.:::.::::.:: ::: : ::::...::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS81 GISFHLQIGLSREPVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFRHD
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100 110 120 130 140 150
pF1KE3 PTSANLLQLVRSSGDIQEGDLVEVVLSASATFEDFQIRPHALTVHSYRAPAFCDHCGEML
::: :.::::....:::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS81 PTSENILQLVKAASDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEML
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 FGLVRQGLKCDGCGLNYHKRCAFSIPNNCSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSE-SLPCT
.:::::::::.::::::::::::.:::::::.:.::::..::.. ..: ...: :
CCDS81 WGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 AEELSRSTTELLPRRPPSSS-----SSSSASSYTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYT
: : .. . .. :: : . :...:: ::::.:::.:.:::::::::.:::::
CCDS81 DEPLLSPVSPGFEQKSPSESFIGREKRSNSQSYIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYT
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE3 RPTVCQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKRCATRVPNDCLGEALINGD---------V
:::::: ::::::::::::::::::.:::::::: .:::.::::. :::: :
CCDS81 RPTVCQYCKKLLKGLFRQGLQCKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDV
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370
pF1KE3 PMEEATDFSEADK-SALMDESEDSGVIPGSHSENALHASEEEEGEGGK------------
:::..: ..... :.:::. :.. : . .: :. ... ::
CCDS81 VMEEGSDDNDSERNSGLMDDMEEAMV---QDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTI
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 AQSSLGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWRLDCKCITLFQN
. :. . ::::::::::.:: :::::...:::.:::..::::::::::::: ::::::::
CCDS81 SPSTSNNIPLMRVVQSVKHTKRKSSTVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQN
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KE3 NTTNRYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGEM---PGG-TPG
.: .::::::::::::..: ... .:.: :.:::::::.:::..:.::: :.. .:.
CCDS81 DTGSRYYKEIPLSEILSLEPVKTSALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPN
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 GP---SGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQENVD
. :: ::..:: :: ::..:::::: . . . : ::. :.:::::: :::::::
CCDS81 NSVLTSGVGADVARMWEIAIQHALMPVIPKGSSVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVD
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 IATVYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQS
:.:::::::::::::::::.::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.
CCDS81 ISTVYQIFPDEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQN
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 LRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRH
:.:::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::
CCDS81 LHHPGVVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRH
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670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLR
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 NQGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGAIDLI
:.::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::: .::..:: :::::
CCDS81 NKGYNRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLI
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 NNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFAAEH
::::::::::::::::.:::::::.::::::::::: :.::::::::::: :::..:.:.
CCDS81 NNLLQVKMRKRYSVDKTLSHPWLQDYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQ
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850 860 870
pF1KE3 PL--PGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
: : . . . . . .. .:..:.::.:.:
CCDS81 GLQYPTHLINPSASHSDTPETEETEMKALGERVSIL
890 900 910 920
>>CCDS1789.1 PRKD3 gene_id:23683|Hs108|chr2 (890 aa)
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10 20 30 40
pF1KE3 MATAPSYPAGLPGSPGPGSPPPPG-GLELQSPPPLLPQIPAP-GS--G
:: ::.. .: : : : . .:.. :.. ::
CCDS17 MSANNSPPSAQKSVLPTAIPAVLPAA-SPCSSPKTGLSARLSNGSFSAPSLTNSRGSVHT
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pF1KE3 VSFHIQIGLTREFVLLPAAS-ELAHVKQLACSIVDQKFPECGFYGLYDKILLFKHDPTSA
::: .::::::: : . : :. ::.:.:::: ::::::::.:.:::::::.:: .:
CCDS17 VSFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSE
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110 120 130 140 150 160
pF1KE3 NLLQLVRSSGDIQEGDLVEVVLSASATFEDFQIRPHALTVHSYRAPAFCDHCGEMLFGLV
:.:::. :. .:.::::::::::: :: ::::::::.: ::::.::.:::.:::::.:::
CCDS17 NILQLITSADEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLV
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170 180 190 200 210 220
pF1KE3 RQGLKCDGCGLNYHKRCAFSIPNNCSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTAEELS
::::::.::::::::::::.:::::::.::::::..:: . : : : : ..
CCDS17 RQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGP-----GLSVPRPLQPEYVA
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230 240 250 260 270 280
pF1KE3 RSTTELLPRRPPSSSSSSSASSYTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTVCQACKK
. : .. ::. :..:::: ..::.. .::::::: .:::::::.:: ::.
CCDS17 LPSEESHVHQEPSKR----IPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKR
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290 300 310 320 330
pF1KE3 LLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKRCATRVPNDCLGEALING---------DVPMEEATDFSE
:::::::::.::::::::::::::..:: :::::. .:: :.::. .. .
CCDS17 LLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDNNDIN
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340 350 360 370 380 390
pF1KE3 ADKSALMDESEDSGVIPGSH---SENALHASEEEEGEGGKAQSSLGYIPLMRVVQSVRHT
.:.: .:..:. . . . . : . ..::. . :. . :::::::::..::
CCDS17 SDSSRGLDDTEEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHT
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 TRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWRLDCKCITLFQNNTTNRYYKEIPLSEILTVES
::::: ..:::.:::...:.:::::::::: ::.:::::.. ..::::::::::: . :
CCDS17 KRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRISS
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE3 AQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGEMPGGTPGGP----SGQGAEAARGWETAIRQA
..:. . :.:::::::.: . .::::: : . .: .: : ..:..:: :::::
CCDS17 PRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQA
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LMPVILQDAP-SAPGHAP-HRQASLSISVSNSQIQENVDIATVYQIFPDEVLGSGQFGVV
:::: : . ..::.. :.. : :::::: ::::::::.:::::: ::::::::::.:
CCDS17 LMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVDISTVYQIFADEVLGSGQFGIV
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 YGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRHPGIVNLECMFETPEKVFV
:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.:::
CCDS17 YGGKHRKTGRDVAIKVIDKMRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGIVNLECMFETPERVFV
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 VMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASA
::::::::::::::::::.:::::.:::..::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS17 VMEKLHGDMLEMILSSEKSRLPERITKFMVTQILVALRNLHFKNIVHCDLKPENVLLASA
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 DPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQGYNRSLDMWSVGVIMYVSL
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..::::::::::::::.::::
CCDS17 EPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRSKGYNRSLDMWSVGVIIYVSL
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750 760 770 780 790 800
pF1KE3 SGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHP
:::::::::::::::::::::::: .:: .::. ::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPNPWREISGEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHP
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 WLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFAAEHPLPGSGLPTDRDLGGACPPQD
:::.:::::::::.: ..::::::::::::::: : : :
CCDS17 WLQDYQTWLDLREFETRIGERYITHESDDARWEIHAYTHNLVYPKHFIMAPNPDDMEEDP
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870
pF1KE3 HDMQGLAERISVL
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pF1KE3 WETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQI----QENVDIATVY-QIFPD
...:.: ... . .:: .:: . . :
CCDS13 YIEDHSGNGTFVNTELVGKGKRRPLNNNSEIALSLSRNKVFVFFDLTVDDQSVYPKALRD
160 170 180 190 200 210
560 570 580 590 600
pF1KE3 E-----VLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFP--TKQESQ----LRNEVAILQ
: .:::: : : . .::: . ::.:.:.: .: . .:.. ...:. ::.
CCDS13 EYIMSKTLGSGACGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKRKFAIGSAREADPALNVETEIEILK
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pF1KE3 SLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHG-DMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVAL
.: :: :.... .:.. : ..:.: ..: .... ..... :: : :. . :.:.:.
CCDS13 KLNHPCIIKIKNFFDA-EDYYIVLELMEGGELFDKVVGNK--RLKEATCKLYFYQMLLAV
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pF1KE3 RHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEV
..:: ..:.: :::::::::.: . .:. ::: ..:.:: :. :.. :::.::::::
CCDS13 QYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEV
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pF1KE3 LLN---QGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDE---DINDQIQNAAFMYPASPWSHI
:.. ::::..: ::.:::... ::: ::.: . ...::: .. . . :...
CCDS13 LVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEV
400 410 420 430 440 450
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pF1KE3 SAGAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDAR
: :.::...:: : . :......: :::::. . ...: .. .:
CCDS13 SEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQVLAQP
460 470 480 490 500 510
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pF1KE3 WEQFAAEHPLPGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
CCDS13 STSRKRPREGEAEGAETTKRPAVCAAVL
520 530 540
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initn: 573 init1: 265 opt: 628 Z-score: 381.8 bits: 81.2 E(32554): 6e-15
Smith-Waterman score: 632; 35.1% identity (69.9% similar) in 319 aa overlap (530-825:232-547)
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 WETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQI----QENVDIATVY-QIFPD
...:.: ... . .:: .:: . . :
CCDS33 YIEDHSGNGTFVNTELVGKGKRRPLNNNSEIALSLSRNKVFVFFDLTVDDQSVYPKALRD
210 220 230 240 250 260
560 570 580 590 600
pF1KE3 E-----VLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFP--TKQESQ----LRNEVAILQ
: .:::: : : . .::: . ::.:.:.: .: . .:.. ...:. ::.
CCDS33 EYIMSKTLGSGACGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKRKFAIGSAREADPALNVETEIEILK
270 280 290 300 310 320
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHG-DMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVAL
.: :: :.... .:.. : ..:.: ..: .... ..... :: : :. . :.:.:.
CCDS33 KLNHPCIIKIKNFFDA-EDYYIVLELMEGGELFDKVVGNK--RLKEATCKLYFYQMLLAV
330 340 350 360 370
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 RHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEV
..:: ..:.: :::::::::.: . .:. ::: ..:.:: :. :.. :::.::::::
CCDS33 QYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEV
380 390 400 410 420 430
730 740 750 760 770
pF1KE3 LLN---QGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDE---DINDQIQNAAFMYPASPWSHI
:.. ::::..: ::.:::... ::: ::.: . ...::: .. . . :...
CCDS33 LVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEV
440 450 460 470 480 490
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pF1KE3 SAGAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDAR
: :.::...:: : . :......: :::::. . ...: .. .:
CCDS33 SEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQVLAQP
500 510 520 530 540 550
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pF1KE3 WEQFAAEHPLPGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
CCDS33 STSRKRPREGEAEGAETTKRPAVCAAVL
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>>CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 (357 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]