FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3341, 986 aa
1>>>pF1KE3341 986 - 986 aa - 986 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3030+/-0.00146; mu= -4.5857+/- 0.084
mean_var=338.9343+/-72.632, 0's: 0 Z-trim(105.6): 673 B-trim: 77 in 1/51
Lambda= 0.069665
statistics sampled from 7728 (8519) to 7728 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 4.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 6634 682.7 9.5e-196
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 4441 462.3 2.2e-129
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 4431 461.3 4.3e-129
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 4325 450.7 6.8e-126
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 3815 399.4 1.9e-110
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 3541 371.9 3.6e-102
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 3532 371.0 6.7e-102
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 3532 371.0 7.1e-102
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 3486 366.3 1.7e-100
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 3324 350.1 1.3e-95
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 3280 345.6 2.8e-94
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3 (1130) 2779 295.3 4.5e-79
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 2761 293.5 1.4e-78
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 539) 2304 247.3 6.2e-65
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 2237 240.8 1e-62
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 2092 226.3 2.6e-58
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 2092 226.3 2.6e-58
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 1984 215.4 4.7e-55
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 ( 495) 1805 197.1 7.3e-50
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 1789 195.8 3.7e-49
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 (1008) 1574 174.2 1.2e-42
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 279) 1225 138.6 1.7e-32
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 ( 295) 1088 124.8 2.5e-28
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 (1022) 1069 123.4 2.3e-27
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 ( 729) 981 114.5 8.2e-25
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 789 95.0 4.1e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 789 95.0 4.1e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 789 95.0 4.2e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 789 95.0 4.2e-19
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 761 92.2 3e-18
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 768 93.3 3.6e-18
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 768 93.3 3.6e-18
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 761 92.5 4.9e-18
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 761 92.5 4.9e-18
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 752 91.3 5.6e-18
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 750 91.1 6.4e-18
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 748 90.9 7.5e-18
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 741 90.2 1.2e-17
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 736 89.7 1.6e-17
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 732 89.3 2.1e-17
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 732 89.3 2.2e-17
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 728 88.9 2.8e-17
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 714 87.5 7.8e-17
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 721 88.6 9.5e-17
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 714 87.6 9.5e-17
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 718 88.2 9.7e-17
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 714 87.6 1e-16
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 720 88.5 1e-16
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 714 87.6 1e-16
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 708 86.8 1.1e-16
>>CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 (986 aa)
initn: 6634 init1: 6634 opt: 6634 Z-score: 3627.8 bits: 682.7 E(32554): 9.5e-196
Smith-Waterman score: 6634; 100.0% identity (100.0% similar) in 986 aa overlap (1-986:1-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSIM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 TFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 FYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSEEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 WEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGGRQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 WEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGGRQDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYYE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 GDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEKHLNQGVRTYVDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEKHLNQGVRTYVDPF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 TYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICVAIKTLKAGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 TYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICVAIKTLKAGYT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 IQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 IQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 TRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 TRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 YRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGTESSRPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 YRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGTESSRPNT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 ALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLARIGITAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLARIGITAIT
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KE3 HQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 HQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
970 980
>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016 aa)
initn: 4353 init1: 2045 opt: 4441 Z-score: 2436.5 bits: 462.3 E(32554): 2.2e-129
Smith-Waterman score: 4441; 66.2% identity (85.9% similar) in 986 aa overlap (9-986:40-1016)
10 20 30
pF1KE3 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRS
:..::. .: :. . :.:::.:::::.
CCDS75 GRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLL-LCAALRTLLASPSNEVNLLDSRT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VQGELGWIASPLEGGWEEVSIMDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVY
:.:.::::: : ..::::.. .::. .::.:::::.::: .::::: :.::. :::.:..
CCDS75 VMGDLGWIAFP-KNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 IEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVD
::.:::::::::::: .::::::::.::.:::... : :.:::..::::::::::::..:
CCDS75 IELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 IGDRIMKLNTEIRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTI
.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: .::.:: :::::
CCDS75 LGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 TGADTSSLVEVRGSCVNNSEEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKI
::::.:.:.:: :::::.: . :::.:.:.::::::::.:.:.::.::..: ::.:.
CCDS75 TGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 GYYKALSTDATCAKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISN
:..:: .:.:::::::. :..:::.:.. .:: ..: .: :::::::: : :::
CCDS75 GFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISN
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 VNETSVNLEWSSPQNTGGRQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKV
:::::: ::: : .::::.:.:: ..::::.. . :. ::. :.: :.:.:::.:.:
CCDS75 VNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNS-HAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSV
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 SITDLLAHTNYTFEIWAVNGVSKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVA
..:::::::::::: :::::: .:. : :::.::::::::: .. :. .... :..
CCDS75 MMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSIS
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 LAWLEPDRPNGVILEYEVKYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTA
:.: :::::::.:::::.::.:::: : :: :... . .::.: . :::..:::::
CCDS75 LSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQ-ETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 AGYGDFSEPLEVTTNTVPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSK
:::: ::. .: :. : .: .. :. :::. .:.:....:... .: :: :::
CCDS75 AGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVL-LSGRRCGYSK
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 AKQEADEEK-HLNQG------VRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGE
:::. .::: :...: ::::.:: :::::::::.::::::.:::: ::.:::.::
CCDS75 AKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGE
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 FGEVCSGRLKVPGKREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTK
::::::::::.:::::. :::::::.:::.:::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS75 FGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTK
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 CKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARN
:::::.::::::::::.::.::::.:::::::::::::..::::::::.::::::::::
CCDS75 SKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARN
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 ILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYG
::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS75 ILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYG
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 IVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKF
::::::.::::::::.:.:::::::.::::::: ::::: ::.:::::::::::..::::
CCDS75 IVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKF
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 GQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFS-AVVSVGDWLQAIKMDRYKD
.::::::::::::.::: . : : .. :: :: : : :::.::.:::: :: .
CCDS75 DEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSN-LLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTE
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980
pF1KE3 NFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
: ::....::..:. ::: :.:.: . ::.::..:.: :..:. ..: :::.
CCDS75 IFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQL--VNG-MVPL
970 980 990 1000 1010
>>CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015 aa)
initn: 4278 init1: 2045 opt: 4431 Z-score: 2431.0 bits: 461.3 E(32554): 4.3e-129
Smith-Waterman score: 4431; 66.2% identity (86.0% similar) in 986 aa overlap (9-986:40-1015)
10 20 30
pF1KE3 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRS
:..::. .: :. . :.:::.:::::.
CCDS35 GRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLL-LCAALRTLLASPSNEVNLLDSRT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VQGELGWIASPLEGGWEEVSIMDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVY
:.:.::::: : ..::::.. .::. .::.:::::.::: .::::: :.::. :::.:..
CCDS35 VMGDLGWIAFP-KNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 IEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVD
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CCDS35 IELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 IGDRIMKLNTEIRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTI
.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: .::.:: :::::
CCDS35 LGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 TGADTSSLVEVRGSCVNNSEEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKI
::::.:.:.:: :::::.: . :::.:.:.::::::::.:.:.::.::..: ::.:.
CCDS35 TGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 GYYKALSTDATCAKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISN
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CCDS35 GFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISN
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 VNETSVNLEWSSPQNTGGRQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKV
:::::: ::: : .::::.:.:: ..::::.. . :. ::. :.: :.:.:::.:.:
CCDS35 VNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNS-HAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSV
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 SITDLLAHTNYTFEIWAVNGVSKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVA
..:::::::::::: :::::: .:. : :::.::::::::: .. :. .... :..
CCDS35 MMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSIS
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 LAWLEPDRPNGVILEYEVKYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTA
:.: :::::::.:::::.::.:::: : :: :... . .::.: . :::..:::::
CCDS35 LSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQ-ETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 AGYGDFSEPLEVTTNTVPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSK
:::: ::. .: :. : . .: .. :. :::. .:.:....:... .: :: :::
CCDS35 AGYGVFSRRFEFETTPVFA-ASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVL-LSGRRCGYSK
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 AKQEADEEK-HLNQG------VRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGE
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CCDS35 AKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGE
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 FGEVCSGRLKVPGKREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTK
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CCDS35 FGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTK
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 CKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARN
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CCDS35 SKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARN
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 ILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYG
::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS35 ILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYG
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 IVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKF
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CCDS35 IVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKF
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 GQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFS-AVVSVGDWLQAIKMDRYKD
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CCDS35 DEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSN-LLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTE
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980
pF1KE3 NFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
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CCDS35 IFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQL--VNG-MVPL
970 980 990 1000 1010
>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 (983 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSI
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CCDS29 MDCQLSILLLLSC--SVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHG-WEEISG
10 20 30 40 50
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pF1KE3 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
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CCDS29 VDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 ETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKK
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CCDS29 ETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSEE
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CCDS29 GFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-MDSQSLVEVRGSCVNNSKE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYS
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CCDS29 EDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSST
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 VWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGGRQD
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CCDS29 QEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKD
300 310 320 330 340 350
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pF1KE3 ISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGV
...:..::::: . ..:.::. .:.. :.: :: .: :..::::::::::::: :::::
CCDS29 VTFNIICKKCGW-NIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGV
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 SKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYY
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CCDS29 SELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 EKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRI
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CCDS29 EKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETS--PDSF
480 490 500 510 520 530
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pF1KE3 IGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEK------HLN-QG
.: .: :.....:..:..... .. .:. : : :.:. :::.. ::. :
CCDS29 SISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGY-KSKHGADEKRLHFGNGHLKLPG
540 550 560 570 580 590
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pF1KE3 VRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICVAI
.:::::: :::::.:::.:::::.::. :.:.::.:.::::::::::::.:.:.:: :::
CCDS29 LRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAI
600 610 620 630 640 650
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pF1KE3 KTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLR
::::.:::.:::::::.::::::::::::::.::::::: :::::.::::::::::.:::
CCDS29 KTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLR
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 KNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLE
:.:..:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::.::::::::::::.:::::
CCDS29 KHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLE
720 730 740 750 760 770
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pF1KE3 DDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQD
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::
CCDS29 DDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 VIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTG
::::..:::::::::::: ::.:::::::::.:..:::: :::..::::::::.:::
CCDS29 VIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIIT
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 TESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLA
. ..::.. ::: :. .... ..::::... . :. ::.. :.. ....... .:.
CCDS29 SAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMK
900 910 920 930 940 950
960 970 980
pF1KE3 RIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
..:.:.. :.::.::..:..::
CCDS29 KVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
960 970 980
>>CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 (998 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEV
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CCDS32 PPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHP-ESGWEEV
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 SIMDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGT
: .:: .:::::::::: : :::::::: .: :. .::::.:.:::.:::::.:.. :.
CCDS32 SGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIPNIPGS
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 CKETFNLYYYESDND----KERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDV
:::::::.:::.:.: . : :: .::.:::: ::::...: : ..::..:.
CCDS32 CKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAG----RVNTKVRSF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSC
::::: :::::::: :::..:.:::.::::: :. ..: ::.:.:::. .::: . :.:
CCDS32 GPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVIAPGTC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VNNSEEKDVP-KMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEE--RSGECQACKIGYYKALSTDATC
. :. : .:: :.::..::::.::.: : : .::: . ..:. : : ::: . .. :
CCDS32 IPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQGEGPC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSS
:::.: .. .:. ::: .:.:::.:.:. :: :: : ..::::::::. ::::
CCDS32 LPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLILEWSE
310 320 330 340 350 360
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pF1KE3 PQNTGGRQDISYNVVCKKC-GAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNY
:.. :::.:. :::.:::: ::: : : : ..:...:.: :: .: :. ::::: :
CCDS32 PRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLLAHTRY
370 380 390 400 410 420
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pF1KE3 TFEIWAVNGVSKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNG
:::. :::::: .: : . ..:..:::::::: . .. . . :..:.: :.::::
CCDS32 TFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPPERPNG
430 440 450 460 470 480
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pF1KE3 VILEYEVKYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLE
:::.::.::.::... : : . .... :: : . :: .:::::.::::..:.: :
CCDS32 VILDYEMKYFEKSEGIAS--TVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQYSRPAE
490 500 510 520 530
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pF1KE3 VTTNTVPSRIIGDGANSTV----LLV--SVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEA
:.. : :.::.. :.: ...: : .:.... :.: :.. . : ..
CCDS32 FETTS--ER--GSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEYTE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 DEEKHLNQGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVP
.... :...:.:::::::::.::::::::::.::.:::.:::.::::::: :::: :
CCDS32 KLQQYIAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKQP
600 610 620 630 640 650
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pF1KE3 GKREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYME
:.::. :::::::.:::..:::::::::::::::::::::.::::::: .::::.::.::
CCDS32 GRREVFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTEFME
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 NGSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVS
: .::.::: :::.:::::::::::::..::::::.:.::::::::::::::::::::::
CCDS32 NCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVS
720 730 740 750 760 770
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pF1KE3 DFGMSRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYG
:::.:: ::::: . .::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYG
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 ERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKL
:::::::::::::.:.:. :::::::::: :::::::::: ..:. ::::.:::: ::::
CCDS32 ERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKL
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 IRNPNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLE
::: ::: .. .: . ::: . :.... ..:::::.:::: :::..:..::.....
CCDS32 IRNAASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFASFD
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980
pF1KE3 AVVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
:.... ::: :::.: ::.:::::.: :: ::.:
CCDS32 LVAQMTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
960 970 980 990
>>CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (987 aa)
initn: 3912 init1: 1079 opt: 3541 Z-score: 1947.8 bits: 371.9 E(32554): 3.6e-102
Smith-Waterman score: 3975; 59.7% identity (82.5% similar) in 970 aa overlap (28-980:18-983)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSIM
: : ::.:: .. .::::.. : .:::::: .
CCDS23 MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHP-PSGWEEVSGY
10 20 30 40
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pF1KE3 DEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKE
::. . :::::::::.: :::::::: .: :.::.:...:.::..:::.:.:.: :.:::
CCDS23 DENMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKE
50 60 70 80 90 100
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pF1KE3 TFNLYYYESDNDK--ERFIR--ENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPL
::::::::.: :. . : :: .::.:::::::::.:::.: :.::.:::.:. ::.
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pF1KE3 SKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNN
:..:::::::: :.:..:..:::::.::: ..: : : .:..::...::: .::::. :
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.:::.:. ::..::.::.: . : ::..:.:.:.: :: .. :.::::::.:::::
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:.. :.. :.:::::::::.:::::::::: ::.:::.:::.:::::::::.::.:::
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:.:: :::: . .::. :::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGER
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pF1KE3 SKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNN
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pF1KE3 SEEKDVP-KMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHE--ERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKC
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pF1KE3 PPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQN
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CCDS81 PINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRD
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pF1KE3 TGGRQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEI
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CCDS81 LSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERP
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CCDS81 YWDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRN
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pF1KE3 PNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVV
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CCDS81 PNSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVS
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CCDS81 QMMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEGQPLARRPRATGRTKRCQPRD
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CCDS81 VTKKTCNSNDGKKKGMGKKKTDPGRGREIQGIFFKEDSHKESNDCSCGG
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CCDS46 MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANP-ASGWEEVSGY
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