Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3342
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3342, 987 aa
1>>>pF1KE3342 987 - 987 aa - 987 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8002+/-0.00112; mu= 4.7206+/- 0.065
mean_var=319.7994+/-68.790, 0's: 0 Z-trim(110.8): 622 B-trim: 135 in 1/52
Lambda= 0.071719
statistics sampled from 11156 (11902) to 11156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.366), width: 16
Scan time: 4.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 6703 709.0 1.2e-203
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 3877 416.6 1.3e-115
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 3708 399.1 2.3e-110
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 3708 399.1 2.4e-110
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 3707 399.0 2.5e-110
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 3684 396.6 1.3e-109
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 3280 354.8 5e-97
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 3167 343.1 1.6e-93
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 3147 341.0 7.1e-93
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 3143 340.6 9.4e-93
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 2484 272.4 3.1e-72
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 2298 253.2 1.9e-66
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 2231 246.3 2.4e-64
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 1836 205.4 4.9e-52
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 1836 205.4 4.9e-52
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 1718 193.2 2.3e-48
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 1645 185.6 4.3e-46
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 (1008) 1637 184.8 7.6e-46
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 539) 1303 149.9 1.3e-35
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3 (1130) 1290 149.0 5.2e-35
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 (1022) 1177 137.2 1.6e-31
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 ( 729) 1154 134.7 6.8e-31
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 ( 495) 1047 123.4 1.2e-27
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 766 94.7 1e-18
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 766 94.7 1.1e-18
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 743 92.3 5.5e-18
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 745 92.7 5.6e-18
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 745 92.7 5.6e-18
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1225) 743 92.4 6e-18
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240) 743 92.4 6.1e-18
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255) 743 92.4 6.1e-18
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 721 90.2 3.1e-17
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 717 89.8 4.2e-17
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 708 88.3 4.4e-17
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 708 88.3 4.4e-17
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 712 89.2 5.3e-17
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 712 89.2 5.3e-17
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 697 86.9 6.9e-17
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 695 86.9 1e-16
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 695 86.9 1e-16
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 697 87.3 1.1e-16
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 695 87.0 1.1e-16
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 695 87.0 1.1e-16
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 695 87.0 1.1e-16
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 693 86.8 1.2e-16
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 693 86.8 1.2e-16
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 693 86.8 1.3e-16
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 693 86.8 1.3e-16
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 279) 687 85.8 1.3e-16
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 695 87.2 1.5e-16
>>CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 (987 aa)
initn: 6703 init1: 6703 opt: 6703 Z-score: 3769.5 bits: 709.0 E(32554): 1.2e-203
Smith-Waterman score: 6703; 100.0% identity (100.0% similar) in 987 aa overlap (1-987:1-987)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 CDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVPRELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSPSLYCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVPRELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSPSLYCR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSNTIGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSNTIGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 VCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDLTYALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDLTYALR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 CRECRPGGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSSLATGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CRECRPGGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSSLATGPV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQTQLDESEGWREQLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQTQLDESEGWREQLAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 IAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEYSDKHGQYLIGHGTKVYIDPFTYEDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEYSDKHGQYLIGHGTKVYIDPFTYEDPN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 EAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQRRE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 FLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEENSSDPTYTSSLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEENSSDPTYTSSLGG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 KIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 PPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPASLKIVARENGGASHPLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPASLKIVARENGGASHPLLD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 QRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQISAEDLLRIGVTLAGHQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQISAEDLLRIGVTLAGHQKK
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KE3 ILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
970 980
>>CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 (998 aa)
initn: 2967 init1: 2170 opt: 3877 Z-score: 2189.2 bits: 416.6 E(32554): 1.3e-115
Smith-Waterman score: 3877; 60.1% identity (80.5% similar) in 973 aa overlap (15-977:37-995)
10 20 30 40
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEE
::::::..:: :..: :.. :. .: :::
CCDS32 PPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPE-SG-WEE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 LSGLDEEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAG
.:: :: .. .:::.::.: : .: .:::::.. :: . .::. :.::. .: :.:
CCDS32 VSGYDEAMNPIRTYQVCNV-RESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIPNIP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 RSCKETFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTL
::::::..::::.:.:.:.: .: ::::::.::::.: .. . .: : :.::.:.
CCDS32 GSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDE-SFSRLDA---GRVNTKVR
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 RLGPLSKAGFYLAFQDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETV----PRELVVPVA
.:::::::::::::::::::.:.:.. ::::::. :.... ::::. : ::. .
CCDS32 SFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVI-AP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 GSCVVDAVPAPGPSPSLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLS
:.:. .:: . : .::: ::.: :: .:.:: : : : ...:: : :..: .
CCDS32 GTCIPNAVEVSVPL-KLYCNGDGEWMV-PVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GEGSCQPCPANSHSNTIGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLH
::: : ::: ::.... ....: :. ...:: .: . ::: :: ::.:.: .: .::
CCDS32 GEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE3 LEWSAPLESGGREDLTYALRCRECRPGG---SCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLR
:::: : . :::.:: : . :..:. .: .:. : .. : : :.: : . :
CCDS32 LEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 PDFTYTFEVTALNGVSSLATGPVPFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVP
::::: :.::::. . : . ::.::.. .: : .:. :: :::.:.:: :
CCDS32 AHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 RAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGP
. :.:..::::.:: :: .:: .:. . .. : ..: ::. : :.::::::. ::::
CCDS32 ERPNGVILDYEMKYFEK-SEGIAST--VTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQ
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 FGQEHHSQTQLDESEG---WREQLALIAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEY
... . .: ... : .::: ::.:.:..:.:.:..:.:.:..::::: .: ..::
CCDS32 YSRPAEFETTSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEY
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 SDKHGQYLIGHGTKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRL
..: :: :. : :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS32 TEKLQQY-IAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRL
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 KAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTE
: ::..: ::::::: ::::::::.:::::::::::.::::::::::::.: :::::::
CCDS32 KQPGRREVFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTE
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 FMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVC
:::: ::::::::::::::::::::::::::.::.::.::.:::::::::::::::::::
CCDS32 FMENCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVC
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 KVSDFGLSRFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVM
::::::::::::.. ::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS32 KVSDFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVM
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 SFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSAL
:.::::::::::::::::.::::::::: ::::.::::::::: .::: ::.: :.:..:
CCDS32 SYGERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTL
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 DKMIRNPASLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFG
::.::: ::::..: ..: :.::::. : :..: .::.:: :::::::.:::..:::.
CCDS32 DKLIRNAASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFA
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980
pF1KE3 SFELVSQISAEDLLRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
::.::.:..:::::::::::::::::::.:.: :. : . :
CCDS32 SFDLVAQMTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
960 970 980 990
>>CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (986 aa)
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Smith-Waterman score: 3708; 56.0% identity (78.7% similar) in 985 aa overlap (1-971:1-977)
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CCDS23 YQTSIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTP
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CCDS23 DILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
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CCDS46 QVCNVFE-PNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETFNLYYYET
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 DADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAF
:. :: . : : ::.::::.::.. . . :::... .:::.. ::::::
CCDS46 DSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 QDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVP---RELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSP
:: ::::.:::...:.::: ... :.. ::::. .: . :.:. .: . :
CCDS46 QDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPI-
180 190 200 210 220 230
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pF1KE3 SLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSN
.::: ::.: :. :.: ::.: :... :.:: :::: . .:. ::.::.:
CCDS46 KLYCNGDGEWMV-PIGRCTCKPGYEP-ENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSP
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 TIGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDL
. .: .: ::.::.:: :: . ::. ::.::.:.: .: .:. ::: : :.:::.:.
CCDS46 AEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 TYALRCRECRPGG-SCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSS
:: . :..:: ::. : .. : : :.: : . .: :::.. :.:::::
CCDS46 TYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSS
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pF1KE3 LATGPVPFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEK
. : ::.::.. .: .: .. . .. :..:.: :. :.: .::::..:.::
CCDS46 KSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEK
420 430 440 450 460 470
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pF1KE3 -GAEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQTQLDE---
: ::. ... : :.. ::. : :.::::::. :::: :. . :: :.
CCDS46 EHNEFNSSMA--RSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYK
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pF1KE3 SEGWREQLALIAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEYSDKHGQYLIGHGT---
:: :::: ::::.:..:::.:. .......: ::.. ..:: :::: .: :.:.
CCDS46 SE-LREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGM
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pF1KE3 KVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIK
:.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: .:::: :::.: ::::
CCDS46 KIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIK
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 TLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRL
:::.::.:.:::.:::::::::::.::::::::::::.: ::::.::::::::::::::
CCDS46 TLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQ
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pF1KE3 NDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEE
::::::::::::::::::.::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::.:..
CCDS46 NDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQD
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770 780 790 800 810 820
pF1KE3 NSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQ
..::::::::::::::.:::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQ
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pF1KE3 DVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPASLKIV
::::::::::::::: :::..::::::::::::::.:::: ..:..:::::::::::: :
CCDS46 DVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTV
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pF1KE3 ARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQISAEDL
: .. :.::::. : ..:: .: .:: :::: .:..:: .::: :..::.:...:::
CCDS46 ATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDL
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pF1KE3 LRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
::::.:::::::::: :.. :. :
CCDS46 LRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
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: : :::... ..: :.. : ..: :::.:
CCDS24 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASP-LEGGWEEVSI
10 20 30 40 50
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pF1KE3 LDEEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSC
.::.. .:::.::.:.. :.: .:::: :. :.:: .:: ..::. .: ::: . .:
CCDS24 MDEKNTPIRTYQVCNVME-PSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTC
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pF1KE3 KETFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLG
::::...::::: : . :: ..:.::.::.. . .. :.:.. .:
CCDS24 KETFNLYYYESDNDKERFIR----ENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVG
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:::: :::::::: :::.::.:...::::: . ::..::.:. .: : ::::
CCDS24 PLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCV
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pF1KE3 VDAVPAPGPSPSLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGS
.. :..:: ::.: :. .: : : : : .:.:: : .: :: ...
CCDS24 NNS--EEKDVPKMYCGADGEWLV-PIGNCLCNAGHEERSG--ECQACKIGYYKALSTDAT
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: :: .:.: :.. : : :.::: .: . ::: ::::: ...: .: .:..::::
CCDS24 CAKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWS
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pF1KE3 APLESGGREDLTYALRCRECRPG--GSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTY
.: ..:::.:..: . :..: : ..: :::. . . : : : . : .:
CCDS24 SPQNTGGRQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNY
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:::. :.::::. .: :.:::.. .: ... ... . . :..::: : :.:
CCDS24 TFEIWAVNGVSKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNG
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..:.:::::.:: .. : :...:. ....::. .::. .::::. :::: :..
CCDS24 VILEYEVKYYEKD-QNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPL
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. :. : .: . :.. : : :...:....: . :..:. .:. .
CCDS24 EVTTNTVPSRIIGDGANSTVLLVS---VSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADE
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..: ..:...:.:::::::::.::::::::::.: .:::.:::.::::::: ::::.::
CCDS24 EKHL-NQGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPG
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:.: ::::::::.:::..:::.:::::::::::.:::::.::::::. ::::.::.:::
CCDS24 KREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMEN
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pF1KE3 GALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSD
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CCDS24 GSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSD
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pF1KE3 FGLSRFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGE
::.:: ::.. . .::. :::::::::::::::.::::::::.::::::::::::.::
CCDS24 FGMSRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGE
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pF1KE3 RPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMI
::::::::::::.:::. :::::: ::: .:::::::::::.:. ::.: :.:. :::.:
CCDS24 RPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLI
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pF1KE3 RNPASLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFEL
::: ::: .. :.. . ::: .:..:: :::.::.:::: ::...:.:::. ..:
CCDS24 RNPNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEA
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pF1KE3 VSQISAEDLLRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
: ... ::: :::.: ::.:::.::: :..: .
CCDS24 VVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
950 960 970 980
>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 (983 aa)
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10 20 30 40
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGL
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pF1KE3 DEEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCK
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CCDS29 DEHYTPIRTYQVCNVMDH-SQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCK
60 70 80 90 100 110
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pF1KE3 ETFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGP
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CCDS29 ETFNLYYMESDDDHGVKFR----EHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGP
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pF1KE3 LSKAGFYLAFQDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVP--RELVVPVAGSCVVD
..: :::::::: :::.::.:.....::: . ::. ::.::: . .: : :::: .
CCDS29 VNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 AVPAPGPSPSLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQ
. : : .:: .:.: :. ::: :.: : . :.:: : .: :.:. .:
CCDS29 S-KEEDP-PRMYCSTEGEWLV-PIGKCSCNAGYE--ERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCA
240 250 260 270 280
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pF1KE3 PCPANSHSNTIGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAP
:: .: .. :: :.:. .:::: :: . :: :::.::.:.: .: .:. :.:: :
CCDS29 KCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWP
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pF1KE3 LESGGREDLTYALRCRECRPG-GSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFE
:..:::.:.:. . :..: . .: ::. .. : : :.. :.: : .::::
CCDS29 LDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFE
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pF1KE3 VTALNGVSSLATGPVPFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVL
. :.:::: :.. : : :..::.. .: : :. :.: .:.::.: :. :.: .:
CCDS29 IDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIIL
410 420 430 440 450 460
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pF1KE3 DYEVKYHEKGAEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQ
::::::.:: : .: .:.. . . . .:: . :. :.:::. :::: ... . .
CCDS29 DYEVKYYEK-QEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFE
470 480 490 500 510 520
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pF1KE3 TQLDESE--GWREQLALIAGTAVVGVVLVLVVIVVAV--LCLRKQSNGREAEYSDKHGQY
:. : : :...:: .:.:...:. ::: : . .: :...: . . . .
CCDS29 TSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGH
530 540 550 560 570 580
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pF1KE3 LIGHGTKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKE
: : ..:.:: :::::..::.:::::.:.. ..:..:.::::::::: :::: :.:::
CCDS29 LKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKE
590 600 610 620 630 640
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pF1KE3 SCVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGAL
::::::: ::::.:::.::.::::::::.::::::::::::.: ::::.::.::::.:
CCDS29 ISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSL
650 660 670 680 690 700
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pF1KE3 DSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGL
::::: .:.::::::::::::::::::.::..:.::::::::::::.:::::::::::::
CCDS29 DSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGL
710 720 730 740 750 760
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pF1KE3 SRFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPY
:: ::.. . .::. :::::::::.:::::.::::::::.::::::.:::::.:::::
CCDS29 SRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPY
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 WDMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNP
:.:::::::.:... :::::: :::..:.:::::::::::: ::.: :.:: :::.::::
CCDS29 WEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNP
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 ASLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQ
.::::.. . :. :::: . ..: ..:.:: .. .. .: :... ..: . ...
CCDS29 GSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAK
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980
pF1KE3 ISAEDLLRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
::..:. ..:::..: ::::..:.. ...:.: :
CCDS29 ISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
950 960 970 980
>>CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015 aa)
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10 20 30
pF1KE3 MELRVLLCWAS---LAAALEET-LLNTKLETADL
.::: : ::. .:. ::... .::
CCDS35 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNEVNLLDSRTVMGDL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 KWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATL
:..::. .: :::.. .::. ..::.:: :.. .: .:: :.:. .:: ... :
CCDS35 GWIAFPK-NG-WEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQ-NQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 RFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKR
.::. .: ::: . .:::::...:.::: ... . :: :::.::.::.. .
CCDS35 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIK----ENQYIKIDTIAADESFTEL
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 PGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPET
.. . :.:... .::::: :::::::: :::.::.:....:::: ... .:. ::.:
CCDS35 DLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDT
190 200 210 220 230 240
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10 20 30
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]