Result of FASTA (omim) for
pF1KE3342
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3342, 987 aa
1>>>pF1KE3342 987 - 987 aa - 987 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9946+/-0.000561; mu= 1.0641+/- 0.034
mean_var=785.7863+/-177.529, 0's: 0 Z-trim(118.3): 1025 B-trim: 1828 in 1/59
Lambda= 0.045753
statistics sampled from 29591 (31021) to 29591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.364), width: 16
Scan time: 14.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 ( 987) 6703 460.0 2.8e-128
NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 3877 273.5 3.9e-72
NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 986) 3708 262.3 8.9e-69
NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r (1055) 3708 262.4 9.2e-69
NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 987) 3707 262.3 9.4e-69
XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 3706 262.2 9.9e-69
XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 980) 3696 261.5 1.5e-68
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 3684 260.7 2.7e-68
NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 3280 234.1 2.9e-60
NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 3280 234.1 2.9e-60
NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 3235 231.1 2.2e-59
XP_016865854 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 989) 3224 230.4 3.7e-59
XP_005248726 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 994) 3222 230.3 4.1e-59
NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 3217 229.9 5.1e-59
XP_005246431 (OMIM: 602188) PREDICTED: ephrin type ( 949) 3176 227.2 3.3e-58
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 3167 226.6 5e-58
XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 3166 226.5 5.3e-58
NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 3147 225.3 1.3e-57
NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 3143 225.1 1.5e-57
XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 3004 215.8 8.4e-55
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 2484 181.5 1.9e-44
XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 2484 181.6 1.9e-44
XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 2484 181.6 1.9e-44
XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 2484 181.6 1.9e-44
NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 922) 2298 169.2 9e-41
XP_016856024 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 965) 2298 169.2 9.2e-41
XP_016856023 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 973) 2298 169.2 9.3e-41
NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A rece ( 976) 2298 169.2 9.3e-41
XP_006710505 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 956) 2291 168.8 1.3e-40
NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 2231 164.8 2e-39
NP_001296121 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r ( 928) 2122 157.6 2.8e-37
XP_011510844 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type ( 394) 2110 156.1 3.3e-37
XP_016863367 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 904) 2084 155.1 1.6e-36
XP_016863369 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 852) 2074 154.4 2.5e-36
XP_016863368 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 869) 1970 147.5 2.9e-34
XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 1960 146.8 4.4e-34
XP_016861699 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1104) 1882 141.9 1.8e-32
XP_005265710 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 874) 1836 138.7 1.3e-31
XP_011530037 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 926) 1836 138.7 1.4e-31
NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 1836 138.7 1.4e-31
NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 1836 138.8 1.4e-31
NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 1836 138.8 1.4e-31
NP_001268696 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1004) 1718 131.0 3.1e-29
XP_011539277 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 600) 1645 125.8 7e-28
XP_011539275 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 1645 126.1 8.6e-28
XP_011539274 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 1645 126.1 8.6e-28
XP_011539272 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 1645 126.1 8.6e-28
XP_011539271 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 1645 126.1 8.6e-28
NP_065387 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor 8 (1005) 1645 126.2 8.9e-28
NP_001092909 (OMIM: 611123) ephrin type-A receptor (1008) 1637 125.6 1.3e-27
>>NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 prec (987 aa)
initn: 6703 init1: 6703 opt: 6703 Z-score: 2424.1 bits: 460.0 E(85289): 2.8e-128
Smith-Waterman score: 6703; 100.0% identity (100.0% similar) in 987 aa overlap (1-987:1-987)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 CDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVPRELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSPSLYCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVPRELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSPSLYCR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSNTIGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSNTIGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 VCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDLTYALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDLTYALR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 CRECRPGGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSSLATGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CRECRPGGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSSLATGPV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 PFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQTQLDESEGWREQLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQTQLDESEGWREQLAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 IAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEYSDKHGQYLIGHGTKVYIDPFTYEDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEYSDKHGQYLIGHGTKVYIDPFTYEDPN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 EAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQRRE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 FLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEENSSDPTYTSSLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEENSSDPTYTSSLGG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 KIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 PPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPASLKIVARENGGASHPLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPASLKIVARENGGASHPLLD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 QRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQISAEDLLRIGVTLAGHQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQISAEDLLRIGVTLAGHQKK
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KE3 ILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
:::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
970 980
>>NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 prec (998 aa)
initn: 2967 init1: 2170 opt: 3877 Z-score: 1416.0 bits: 273.5 E(85289): 3.9e-72
Smith-Waterman score: 3877; 60.1% identity (80.5% similar) in 973 aa overlap (15-977:37-995)
10 20 30 40
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEE
::::::..:: :..: :.. :. .: :::
NP_004 PPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPE-SG-WEE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 LSGLDEEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAG
.:: :: .. .:::.::.: : .: .:::::.. :: . .::. :.::. .: :.:
NP_004 VSGYDEAMNPIRTYQVCNV-RESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIPNIP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 RSCKETFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTL
::::::..::::.:.:.:.: .: ::::::.::::.: .. . .: : :.::.:.
NP_004 GSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDE-SFSRLDA---GRVNTKVR
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 RLGPLSKAGFYLAFQDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETV----PRELVVPVA
.:::::::::::::::::::.:.:.. ::::::. :.... ::::. : ::. .
NP_004 SFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVI-AP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 GSCVVDAVPAPGPSPSLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLS
:.:. .:: . : .::: ::.: :: .:.:: : : : ...:: : :..: .
NP_004 GTCIPNAVEVSVPL-KLYCNGDGEWMV-PVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 GEGSCQPCPANSHSNTIGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLH
::: : ::: ::.... ....: :. ...:: .: . ::: :: ::.:.: .: .::
NP_004 GEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE3 LEWSAPLESGGREDLTYALRCRECRPGG---SCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLR
:::: : . :::.:: : . :..:. .: .:. : .. : : :.: : . :
NP_004 LEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 PDFTYTFEVTALNGVSSLATGPVPFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVP
::::: :.::::. . : . ::.::.. .: : .:. :: :::.:.:: :
NP_004 AHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 RAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGP
. :.:..::::.:: :: .:: .:. . .. : ..: ::. : :.::::::. ::::
NP_004 ERPNGVILDYEMKYFEK-SEGIAST--VTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQ
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 FGQEHHSQTQLDESEG---WREQLALIAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEY
... . .: ... : .::: ::.:.:..:.:.:..:.:.:..::::: .: ..::
NP_004 YSRPAEFETTSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEY
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 SDKHGQYLIGHGTKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRL
..: :: :. : :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_004 TEKLQQY-IAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRL
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 KAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTE
: ::..: ::::::: ::::::::.:::::::::::.::::::::::::.: :::::::
NP_004 KQPGRREVFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTE
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 FMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVC
:::: ::::::::::::::::::::::::::.::.::.::.:::::::::::::::::::
NP_004 FMENCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVC
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 KVSDFGLSRFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVM
::::::::::::.. ::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::
NP_004 KVSDFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVM
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 SFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSAL
:.::::::::::::::::.::::::::: ::::.::::::::: .::: ::.: :.:..:
NP_004 SYGERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTL
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 DKMIRNPASLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFG
::.::: ::::..: ..: :.::::. : :..: .::.:: :::::::.:::..:::.
NP_004 DKLIRNAASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFA
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initn: 3689 init1: 3689 opt: 3706 Z-score: 1354.9 bits: 262.2 E(85289): 9.9e-69
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEV
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 CDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 DTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVPRELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSPSLYCR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSNTIGSA
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDLTYALR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CRECRPGGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSSLATGPV
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::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PFEPVNVTTDREVKGQSYHAQGFPVSLPLTVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HSQTQLDESEGWREQLALIAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEYSDKHGQYL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IGHGTKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKES
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pF1KE3 CVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALD
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710 720 730 740 750 760
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
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pF1KE3 RFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFLEENSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYW
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pF1KE3 DMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPA
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890 900 910 920 930 940
pF1KE3 SLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLKIVARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQI
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pF1KE3 SAEDLLRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAEDLLRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
970 980 990 1000
>>XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephrin t (980 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTYEV
:::::... ::.: :.. : .: :::.:: ::.....:::.:
XP_006 MAGYERHGRRWLEETLMDSTTATAELGWMVHPP-SG-WEEVSGYDENMNTIRTYQV
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pF1KE3 CDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYESDA
:.: .. .: .:::: .. :::: .... ..:.. .: :.: . ::::::...:::.:
XP_006 CNVFES-SQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
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pF1KE3 DTATALTPAWMENPYIKVDTVAA-EHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQ
:.:: : :::::..::::.:: : ... :... :.:... .::.:..:::::::
XP_006 DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVM-KINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQ
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pF1KE3 DQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVP---RELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSPS
: :.::.:.....::.:: .. : . : ::. .: . :::...: . : .
XP_006 DYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPI-K
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pF1KE3 LYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSNT
::: ::.: :. : : ::::.:..: ::.: .:::: .:. .: :: ::....
XP_006 LYCNGDGEWLV-PIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTS
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 IGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDLT
:.. : :: ::.:: :: :::: ::::..:.: .: .:: :::. : .:::::::.
XP_006 EGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLV
300 310 320 330 340 350
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pF1KE3 YALRCRECRPG-GSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSSL
: . :. : : :.:. :: .. . : :.:: . . : ::::. :.:::..
XP_006 YNIICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 ATGPVPFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEKG
. : ::.::.. .: ::: .. . . .:..:.:. : :.:..::::..:.::
XP_006 SPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEK-
420 430 440 450 460
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pF1KE3 AEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQTQLDESE---
. .. .:. : . ..::: :: :. :::::. :::: .. . . :: . :.:
XP_006 ELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQT-MTEAEYQT
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pF1KE3 GWREQLALIAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGR-EAEYSDKHGQYLIGH---GTK
. .:.: :: :....:.:....:.:.:..: :... : ..::.:: .: :: : :
XP_006 SIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMK
530 540 550 560 570 580
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pF1KE3 VYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIKT
.::::::::::::::::::::::.: ::::.::::::::::: :.:: :::.: :::::
XP_006 IYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKT
590 600 610 620 630 640
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pF1KE3 LKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRLN
::.::::.:::.:::::::::::.:::.:.::::::.: ::::.:::::::.:::::: :
XP_006 LKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQN
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pF1KE3 DGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEEN
:::::::::::::::::.::.:::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::..
XP_006 DGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDD
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pF1KE3 SSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQD
.:::::::.::::::::::::::: .::::::::.::::::::::::.::::::::.:::
XP_006 TSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQD
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pF1KE3 VINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPASLKIVA
:::::::::::::: :::..:::::::::::::: ::.: :.:..:::::::: ::: .:
XP_006 VINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMA
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pF1KE3 RENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQISAEDLL
..: . ::::. : :..:..: :::.:::::.:.:::: ::: ::..:::. ::.:
XP_006 PLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDIL
890 900 910 920 930 940
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pF1KE3 RIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
:.:::::::::::: :.: :..:
XP_006 RVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
950 960 970 980
>>NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 prec (984 aa)
initn: 3456 init1: 2117 opt: 3684 Z-score: 1347.2 bits: 260.7 E(85289): 2.7e-68
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSGLDEEQHSVRTY
.. .:: :: .::.::::..:. ::.: :.. : ..: :::.:: ::. ...:::
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10 20 30 40 50
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pF1KE3 EVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSCKETFTVFYYES
.::.: . :.: .:: : .. :::: ..:. .:::. .: ::: . ::::::...:::.
NP_004 QVCNVFE-PNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETFNLYYYET
60 70 80 90 100 110
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pF1KE3 DADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLGPLSKAGFYLAF
:. :: . : : ::.::::.::.. . . :::... .:::.. ::::::
NP_004 DSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE3 QDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTVNLTRFPETVP---RELVVPVAGSCVVDAVPAPGPSP
:: ::::.:::...:.::: ... :.. ::::. .: . :.:. .: . :
NP_004 QDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPI-
180 190 200 210 220 230
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pF1KE3 SLYCREDGQWAEQPVTGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSN
.::: ::.: :. :.: ::.: :... :.:: :::: . .:. ::.::.:
NP_004 KLYCNGDGEWMV-PIGRCTCKPGYEP-ENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSP
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 TIGSAVCQCRVGYFRARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDL
. .: .: ::.::.:: :: . ::. ::.::.:.: .: .:. ::: : :.:::.:.
NP_004 AEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDV
300 310 320 330 340 350
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pF1KE3 TYALRCRECRPGG-SCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSS
:: . :..:: ::. : .. : : :.: : . .: :::.. :.:::::
NP_004 TYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSS
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 LATGPVPFEPVNVTTDREVPPAVSDIRVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEK
. : ::.::.. .: .: .. . .. :..:.: :. :.: .::::..:.::
NP_004 KSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEK
420 430 440 450 460 470
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pF1KE3 -GAEGPSSVRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQTQLDE---
: ::. ... : :.. ::. : :.::::::. :::: :. . :: :.
NP_004 EHNEFNSSMA--RSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYK
480 490 500 510 520 530
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:: :::: ::::.:..:::.:. .......: ::.. ..:: :::: .: :.:.
NP_004 SE-LREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGM
540 550 560 570 580 590
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pF1KE3 KVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIK
:.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: .:::: :::.: ::::
NP_004 KIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIK
600 610 620 630 640 650
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pF1KE3 TLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRL
:::.::.:.:::.:::::::::::.::::::::::::.: ::::.::::::::::::::
NP_004 TLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQ
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pF1KE3 NDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEE
::::::::::::::::::.::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::.:..
NP_004 NDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQD
720 730 740 750 760 770
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pF1KE3 NSSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDAWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQ
..::::::::::::::.:::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_004 DTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQ
780 790 800 810 820 830
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pF1KE3 DVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQVVSALDKMIRNPASLKIV
::::::::::::::: :::..::::::::::::::.:::: ..:..:::::::::::: :
NP_004 DVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTV
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 ARENGGASHPLLDQRQPHYSAFGSVGEWLRAIKMGRYEESFAAAGFGSFELVSQISAEDL
: .. :.::::. : ..:: .: .:: :::: .:..:: .::: :..::.:...:::
NP_004 ATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDL
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980
pF1KE3 LRIGVTLAGHQKKILASVQHMKSQAKPGTPGGTGGPAPQY
::::.:::::::::: :.. :. :
NP_004 LRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
960 970 980
>>NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 isof (986 aa)
initn: 2663 init1: 1082 opt: 3280 Z-score: 1203.0 bits: 234.1 E(85289): 2.9e-60
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10 20 30 40
pF1KE3 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEELSG
: : :::... ..: :.. : ..: :::.:
NP_004 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASP-LEGGWEEVSI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 LDEEQHSVRTYEVCDVQRAPGQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSLPRAGRSC
.::.. .:::.::.:.. :.: .:::: :. :.:: .:: ..::. .: ::: . .:
NP_004 MDEKNTPIRTYQVCNVME-PSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTC
60 70 80 90 100 110
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pF1KE3 KETFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHLTRKRPGAEATGKVNVKTLRLG
::::...::::: : . :: ..:.::.::.. . .. :.:.. .:
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