FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3344, 1004 aa 1>>>pF1KE3344 1004 - 1004 aa - 1004 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2280+/-0.00113; mu= 3.4045+/- 0.066 mean_var=289.9254+/-59.860, 0's: 0 Z-trim(109.0): 81 B-trim: 88 in 2/51 Lambda= 0.075324 statistics sampled from 10527 (10579) to 10527 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16 Scan time: 4.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004) 6603 732.6 9.3e-211 CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 ( 740) 4838 540.7 4.1e-153 CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154) 636 84.3 1.6e-15 CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 492) 594 79.3 2.1e-14 CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 536) 594 79.4 2.2e-14 >>CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004 aa) initn: 6603 init1: 6603 opt: 6603 Z-score: 3897.2 bits: 732.6 E(32554): 9.3e-211 Smith-Waterman score: 6603; 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CCDS53 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LMETSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQ-EHLGLAETRAEGLHQLEAD ::. : . . .::.... . :. :: : .::. :. .. ::.: : .. CCDS53 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVE-LLTFQER 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 HSRMKREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRA . .::.: ... :....::. .:...:.. .::..:. : :.:: :. ::..:.. CCDS53 YYKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNK- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 NMVSSCELELQEQSLRTASDQESGDE-----ELNR----LKEENEKLRSLT----FSLAE : :.:: ..:::. .: :. . ::.: :: .:..:.:. :: . CCDS53 -MEEECKLE-RNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPD 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE3 KD-----ILEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKM .: :::.. :: .:::::.::..:.:.: ::. :..: ::::. :. . CCDS53 SDKAILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGK 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 ACQLYREKVNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCE :..:....:... :. :...:::::. .:: :: . :: :.:::. :.:. :: .. : CCDS53 DCEMYKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDE 360 370 380 390 400 410 400 410 pF1KE3 LR--------------TQLRQL--------QAEP----------------PGVLKQEA-- .: ..::.: :. : : . ::: CCDS53 MRIEMVRREACIVNLESKLRRLSKDSNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD 420 430 440 450 460 470 420 430 440 450 460 pF1KE3 -RTREPCPREK---------QRLVRMHAI-CPRDDSDCSLVSSTESQLL------SDLSA : : :... :: . ...: : : :: ... : .: : CCDS53 SSTSEESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAKGHEEEGTDASP 480 490 500 510 520 530 470 480 490 500 510 pF1KE3 TS--SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFG--------EEPWSFSSCLEIPEGDPG .: : ...:: . .: : :..:... .:: : .: : .: ..: : CCDS53 SSCGSLPITNSFTKMQP-PRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHRSTVE-EDNDSG 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 pF1KE3 ALPGAKAGDPHLDYELLDTADLPQLESSLQPVSPGSLDVSESGVLMRR----RPARRILS .. . : . . ... . :: : . . :. . ....:. :: : .. CCDS53 GFDALDLDDDSHERYSFGPSSIHSSSSSHQSEGLDAYDLEQVNLMFRKFSLERPFRPSVT 600 610 620 630 640 650 570 580 590 600 610 pF1KE3 QVTML----------AFQGDALLEQISVIGGNLTGIFIHRVTPGSAADQMALRPGTQIVM .: . ...::.: :....::: : :.: : ::: :.. .:: : :... CCDS53 SVGHVRGPGPSVQHTTLNGDSLTSQLTLLGGNARGSFVHSVKPGSLAEKAGLREGHQLLL 660 670 680 690 700 710 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 VDYEASEPLFKAVLEDTTLEEAVGLLRRVDGFCCLSVKVNTDGYKRLLQDLEAKVATSGD .. .. :. : ::: ..: .: : ::: .::..:..:.: . :::: CCDS53 LEGCIRGERQSVPLDTCTKEEAHWTIQRCSGPVTLHYKVNHEGYRKLVKDMEDGLITSGD 720 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 SFYIRVNLAMEGRAKG-ELQVHCNEVLHVTDTMFQGCGCWHAHRVNSYTMKDTAAHGTIP :::::.:: . .. . ....:..:.:: :::.: : ::. .: .: :::: CCDS53 SFYIRLNLNISSQLDACTMSLKCDDVVHVRDTMYQDRHEWLCARVDPFTDHDLDM-GTIP 780 790 800 810 820 830 740 750 760 pF1KE3 NYSRAQQQLIALIQDMTQQCTV---------------TRKP----SSGGPQ--------- .:::::: :.. .: . .. . : .: :.. :. CCDS53 SYSRAQQLLLVKLQRLMHRGSREEVDGTHHTLRALRNTLQPEEALSTSDPRVSPRLSRAS 840 850 860 870 880 890 770 780 790 800 pF1KE3 ----KLVRIVSMDKAK--------------ASPL----RLSFDRGQLDPSRMEGSSTCFW .:...:: .. : .::: : :.: .: ..: . CCDS53 FLFGQLLQFVSRSENKYKRMNSNERVRIISGSPLGSLARSSLDATKLLTEKQEELDPESE 900 910 920 930 940 950 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 AESCLTLVPYTLVWPHRPARPRPVLLVPRAVGKILSEKLCLLQG---FKKCLAEYLSQEE . :.:.::.:: : ::::..: ...: : ..: : : : .. ....: CCDS53 LGKNLSLIPYSLVRAFYCERRRPVLFTPTVLAKTLVQRLLNSGGAMEFTICKSDIVTRDE 960 970 980 990 1000 1010 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 YEAWSQRGDIIQEGEVSGGRCWVTRHAVESLMEKNTHALLDVQLDSVCTLHRMDIFPIVI . CCDS53 FLRRQKTETIIYSREKNPNAFECIAPANIEAVAAKNKHCLLEAGIGCTRDLIKSNIYPIV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (492 aa) initn: 600 init1: 261 opt: 594 Z-score: 372.0 bits: 79.3 E(32554): 2.1e-14 Smith-Waterman score: 607; 32.1% identity (61.8% similar) in 461 aa overlap (15-458:7-451) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS :.: : ..:. : .. : :::.:::::: ::: :::.:: . CCDS48 MSDYENDDEC-WSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME : :. ..: :::.:. :..: .::::::... :..: ::: .: :: . CCDS48 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM : ::. : . .::..... .:: ... ..: . .. . :: ... :. CCDS48 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQD----LTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS :.: : .:. : :.: .:... .. .:: : : :.:: :. ::. :..:. . CCDS48 KEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE--D 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 pF1KE3 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENEKLRS----LTFSLAEK---------DI .:..: .. .:: : .:. ..: : .:..:. :.. : :. : .. CCDS48 DCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQV 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 LEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREK ::.. .: ..:: .. : :::. .: .: . ::::. :: . ..:... 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