Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3359
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3359, 1061 aa
1>>>pF1KE3359 1061 - 1061 aa - 1061 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9254+/-0.00129; mu= 8.0029+/- 0.074
mean_var=209.9294+/-47.295, 0's: 0 Z-trim(106.4): 226 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.088519
statistics sampled from 8707 (8966) to 8707 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 5.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1051.1 NPR1 gene_id:4881|Hs108|chr1 (1061) 7100 921.4 0
CCDS6590.1 NPR2 gene_id:4882|Hs108|chr9 (1047) 4181 548.7 2.5e-155
CCDS11127.1 GUCY2D gene_id:3000|Hs108|chr17 (1103) 1656 226.2 3e-58
CCDS14545.1 GUCY2F gene_id:2986|Hs108|chrX (1108) 1638 223.9 1.5e-57
CCDS8664.1 GUCY2C gene_id:2984|Hs108|chr12 (1073) 1422 196.3 2.9e-49
CCDS8335.1 GUCY1A2 gene_id:2977|Hs108|chr11 ( 732) 601 91.3 8.2e-18
CCDS34085.1 GUCY1A3 gene_id:2982|Hs108|chr4 ( 690) 586 89.4 3e-17
CCDS77978.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 551) 573 87.6 8e-17
CCDS77977.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 599) 573 87.7 8.5e-17
CCDS47154.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 619) 573 87.7 8.7e-17
CCDS77975.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 641) 573 87.7 8.9e-17
CCDS54812.1 GUCY1A3 gene_id:2982|Hs108|chr4 ( 624) 565 86.6 1.8e-16
CCDS75203.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 594) 539 83.3 1.7e-15
CCDS47196.1 NPR3 gene_id:4883|Hs108|chr5 ( 540) 478 75.5 3.6e-13
CCDS56357.1 NPR3 gene_id:4883|Hs108|chr5 ( 541) 477 75.3 3.9e-13
CCDS56356.1 NPR3 gene_id:4883|Hs108|chr5 ( 324) 468 74.0 6e-13
CCDS77976.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 586) 436 70.1 1.5e-11
>>CCDS1051.1 NPR1 gene_id:4881|Hs108|chr1 (1061 aa)
initn: 7100 init1: 7100 opt: 7100 Z-score: 4916.7 bits: 921.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7100; 100.0% identity (100.0% similar) in 1061 aa overlap (1-1061:1-1061)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPGPRRPAGSRLRLLLLLLLPPLLLLLRGSHAGNLTVAVVLPLANTSYPWSWARVGPAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MPGPRRPAGSRLRLLLLLLLPPLLLLLRGSHAGNLTVAVVLPLANTSYPWSWARVGPAVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LALAQVKARPDLLPGWTVRTVLGSSENALGVCSDTAAPLAAVDLKWEHNPAVFLGPGCVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LALAQVKARPDLLPGWTVRTVLGSSENALGVCSDTAAPLAAVDLKWEHNPAVFLGPGCVY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AAAPVGRFTAHWRVPLLTAGAPALGFGVKDEYALTTRAGPSYAKLGDFVAALHRRLGWER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAAPVGRFTAHWRVPLLTAGAPALGFGVKDEYALTTRAGPSYAKLGDFVAALHRRLGWER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QALMLYAYRPGDEEHCFFLVEGLFMRVRDRLNITVDHLEFAEDDLSHYTRLLRTMPRKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QALMLYAYRPGDEEHCFFLVEGLFMRVRDRLNITVDHLEFAEDDLSHYTRLLRTMPRKGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VIYICSSPDAFRTLMLLALEAGLCGEDYVFFHLDIFGQSLQGGQGPAPRRPWERGDGQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VIYICSSPDAFRTLMLLALEAGLCGEDYVFFHLDIFGQSLQGGQGPAPRRPWERGDGQDV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 SARQAFQAAKIITYKDPDNPEYLEFLKQLKHLAYEQFNFTMEDGLVNTIPASFHDGLLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SARQAFQAAKIITYKDPDNPEYLEFLKQLKHLAYEQFNFTMEDGLVNTIPASFHDGLLLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 IQAVTETLAHGGTVTDGENITQRMWNRSFQGVTGYLKIDSSGDRETDFSLWDMDPENGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IQAVTETLAHGGTVTDGENITQRMWNRSFQGVTGYLKIDSSGDRETDFSLWDMDPENGAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RVVLNYNGTSQELVAVSGRKLNWPLGYPPPDIPKCGFDNEDPACNQDHLSTLEVLALVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVVLNYNGTSQELVAVSGRKLNWPLGYPPPDIPKCGFDNEDPACNQDHLSTLEVLALVGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LSLLGILIVSFFIYRKMQLEKELASELWRVRWEDVEPSSLERHLRSAGSRLTLSGRGSNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSLLGILIVSFFIYRKMQLEKELASELWRVRWEDVEPSSLERHLRSAGSRLTLSGRGSNY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 GSLLTTEGQFQVFAKTAYYKGNLVAVKRVNRKRIELTRKVLFELKHMRDVQNEHLTRFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSLLTTEGQFQVFAKTAYYKGNLVAVKRVNRKRIELTRKVLFELKHMRDVQNEHLTRFVG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ACTDPPNICILTEYCPRGSLQDILENESITLDWMFRYSLTNDIVKGMLFLHNGAICSHGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ACTDPPNICILTEYCPRGSLQDILENESITLDWMFRYSLTNDIVKGMLFLHNGAICSHGN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LKSSNCVVDGRFVLKITDYGLESFRDLDPEQGHTVYAKKLWTAPELLRMASPPVRGSQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKSSNCVVDGRFVLKITDYGLESFRDLDPEQGHTVYAKKLWTAPELLRMASPPVRGSQAG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 DVYSFGIILQEIALRSGVFHVEGLDLSPKEIIERVTRGEQPPFRPSLALQSHLEELGLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DVYSFGIILQEIALRSGVFHVEGLDLSPKEIIERVTRGEQPPFRPSLALQSHLEELGLLM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 QRCWAEDPQERPPFQQIRLTLRKFNRENSSNILDNLLSRMEQYANNLEELVEERTQAYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRCWAEDPQERPPFQQIRLTLRKFNRENSSNILDNLLSRMEQYANNLEELVEERTQAYLE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 EKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 LNDLYTCFDAVIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPVRNGRLHACEVARMALALLDAVRSFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNDLYTCFDAVIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPVRNGRLHACEVARMALALLDAVRSFR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 IRHRPQEQLRLRIGIHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEALKIHLSSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IRHRPQEQLRLRIGIHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEALKIHLSSET
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KE3 KAVLEEFGGFELELRGDVEMKGKGKVRTYWLLGERGSSTRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KAVLEEFGGFELELRGDVEMKGKGKVRTYWLLGERGSSTRG
1030 1040 1050 1060
>>CCDS6590.1 NPR2 gene_id:4882|Hs108|chr9 (1047 aa)
initn: 3605 init1: 1950 opt: 4181 Z-score: 2902.1 bits: 548.7 E(32554): 2.5e-155
Smith-Waterman score: 4181; 62.0% identity (81.6% similar) in 1048 aa overlap (16-1055:6-1040)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPGPRRPAGSRLRLLLLLLLPPLLLLLRGSHAGNLTVAVVLPLANTSYPWSWARVGPAVE
::::. : .: : :::.::::: : :: :.: ::::::
CCDS65 MALPSLLLLVAALAGGVRPPGARNLTLAVVLPEHNLSYAWAWPRVGPAVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LALAQVKARPDLLPGWTVRTVLGSSENALGVCSDTAAPLAAVDLKWEHNPAVFLGPGCVY
:: :.: :: .: : ::: :.::. :::.::::: :.: ..:::::::
CCDS65 LA---VEALGRALP-VDLRFV--SSELE-GACSEYLAPLSAVDLKLYHDPDLLLGPGCVY
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE3 AAAPVGRFTAHWRVPLLTAGAPALGFGVK-DEYALTTRAGPSYAKLGDFVAALHRRLGWE
:: :.::..:::.::::::: : ::..: :.: .:.::: :::.::..:: ...:
CCDS65 PAASVARFASHWRLPLLTAGAVASGFSAKNDHYRTLVRTGPSAPKLGEFVVTLHGHFNWT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RQALMLYA-YRPGDEEHCFFLVEGLFMRVRDRLNITVDHLEFAEDDLS--HYTRLLRTMP
.: .:: : :. : .: .::.: .. :..:.: .:.. . . :...:.
CCDS65 ARAALLYLDARTDDRPH-YFTIEGVFEALQGS-NLSVQHQVYAREPGGPEQATHFIRA--
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RKGRVIYICSSPDAFRTLMLLALEAGLCGEDYVFFHLDIFGQSLQGGQGPAPRRPWE--R
.::..:::. . .. ..: : . .: . :::::.::.::.::..: : :::. :
CCDS65 -NGRIVYICGPLEMLHEILLQAQRENLTNGDYVFFYLDVFGESLRAGPTRATGRPWQDNR
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GDGQDVSARQAFQAAKIITYKDPDNPEYLEFLKQLKHLAYEQFNFTMEDGLVNTIPASFH
: . :.:::.. .:::..: :::: :: ..: : :.:. . .:.: : . :.
CCDS65 TREQAQALREAFQTVLVITYREPPNPEYQEFQNRLLIRAREDFGVELGPSLMNLIAGCFY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 DGLLLYIQAVTETLAHGGTVTDGENITQRMWNRSFQGVTGYLKIDSSGDRETDFSLWDM-
::.::: ....::. .::: :: :...: .: ..:::: . .:...:::::: :: :
CCDS65 DGILLYAEVLNETIQEGGTREDGLRIVEKMQGRRYHGVTGLVVMDKNNDRETDFVLWAMG
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 DPENGAFRVVLNYNGTSQELVAVSGRKLNWPLGYPPPDIPKCGFDNEDPACNQDHLSTLE
: ..: :. . .:.:. .. . .:: . : : :: : : :.:: .::.:.. ::::
CCDS65 DLDSGDFQPAAHYSGAEKQ-IWWTGRPIPWVKGAPPSDNPPCAFDLDDPSCDKTPLSTLA
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 VLALVGSLSLLGILIVSFFIYRKMQLEKELASELWRVRWEDVEPSSLERHLRSAGSRLTL
..:: ..... . . ::.:.::..::::::: :::.:::... .. ::. ..:::::::
CCDS65 IVALGTGITFIMFGVSSFLIFRKLMLEKELASMLWRIRWEELQFGNSERYHKGAGSRLTL
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 SGRGSNYGSLLTTEGQFQVFAKTAYYKGNLVAVKRVNRKRIELTRKVLFELKHMRDVQNE
: :::.::::.:..:..:.::.:...:::.::.:.::.:::::::.:::::::::::: .
CCDS65 SLRGSSYGSLMTAHGKYQIFANTGHFKGNVVAIKHVNKKRIELTRQVLFELKHMRDVQFN
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 HLTRFVGACTDPPNICILTEYCPRGSLQDILENESITLDWMFRYSLTNDIVKGMLFLHNG
:::::.::: :::::::.:::::::::::::::.::.::::::::: ::.:::: ::::.
CCDS65 HLTRFIGACIDPPNICIVTEYCPRGSLQDILENDSINLDWMFRYSLINDLVKGMAFLHNS
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 AICSHGNLKSSNCVVDGRFVLKITDYGLESFRDL-DPEQGHTVYAKKLWTAPELLRMASP
: :::.:::::::::.::::::::::: :::. .:...:..::::::::::::
CCDS65 IISSHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPL
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 PVRGSQAGDVYSFGIILQEIALRSGVFHVEGLDLSPKEIIERVTRGEQPPFRPSLALQSH
:. : : .::::::::::::::::: :..::::::::::...: :..: ::::. .
CCDS65 PTTGMQKADVYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPYFRPSIDRTQL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 LEELGLLMQRCWAEDPQERPPFQQIRLTLRKFNRENSSNILDNLLSRMEQYANNLEELVE
::: :::.::::.:: ::: : ::. .:.::.:....:::::: ::::::::::.:::
CCDS65 NEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVE
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 ERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAES
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 TPMQVVTLLNDLYTCFDAVIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPVRNGRLHACEVARMALAL
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::. :: :.:::::::
CCDS65 TPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALAL
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 LDAVRSFRIRHRPQEQLRLRIGIHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEAL
:::: ::::::::..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS65 LDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQAL
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE3 KIHLSSETKAVLEEFGGFELELRGDVEMKGKGKVRTYWLLGERGSSTRG
:::.:: :: .:.:.: :.::::::::::::::.:::::::::
CCDS65 KIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGDVEMKGKGKMRTYWLLGERKGPPGLL
1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS11127.1 GUCY2D gene_id:3000|Hs108|chr17 (1103 aa)
initn: 1401 init1: 962 opt: 1656 Z-score: 1159.1 bits: 226.2 E(32554): 3e-58
Smith-Waterman score: 1798; 35.4% identity (62.2% similar) in 1088 aa overlap (4-1056:27-1061)
10 20 30
pF1KE3 MPGPRRP-AGSRLRLLLLLLL--PPLLLLLRGSHAGN
:: : : :: ::::::: :: : ..
CCDS11 MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPAL-------SAV
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 LTVAVVLPLANTSYPWSWARVGPAVELALAQVKARPDLLPGWTVRTVLGSSENALGVCSD
.::.:. : : .: :: :..:: :... : : : ...: :
CCDS11 FTVGVLGPWACDPI-FSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEP-----CR-
60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 TAAPLAAVDLKWEHNPAVFLGPGCVYAAAPVGRFTAHWRVPLLTAGAPALGFGVKDEYAL
: . :.::. . .. .:: : :. .. . . :. : : :
CCDS11 TPGSLGAVSSALARVSGL-VGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPW-------TQAE
110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TTRAGPSYAKLGDFVAALHRRLGWERQALMLYAYRPGDEEHCFFLVEGLFMRVRDRLNIT
: : :. . .: . :: : .:: : ::. : : . .:.: .
CCDS11 GTTA-PAVTPAADALYALLRAFGWARVALVTA---PQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVAS
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KE3 VDHLEFAEDDLSHYTRLLRTM---PRKGRVIYICSS----PDAFRTLMLLALEAGLCGED
: .: ::: . :: . :: ::.. : . : :. : : :: .
CCDS11 VTSME--PLDLSGAREALRKVRDGPRVTAVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGS
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 YVFFHLDIFGQSLQGGQGPAPRRPWERGDGQDVSARQAFQAAKIITYKDPDNPEYLEFLK
::. .: . .:. :.:. ...... :.: .:. .: . :.. :. :.
CCDS11 LVFLPFDTIHYALS----PGPEALAALANSSQL--RRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLR
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 QLKHLAYEQFNFTMEDGLVNTIPASFHDGLLLYIQAVTET-LAHGGTVTDGENITQRMWN
. .. ...... :. . ....:...: ..:.:. : :: ..: ..... .
CCDS11 RAQERRELPSDLNLQQ--VSPLFGTIYDAVFLLARGVAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRD
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 RSFQGVTGYLKIDSSGDRETDFSLWDMDPENGAFRVVLNYNGTSQELVAVSGRKLNWPLG
. : : : .::.: : : : : . . .. . . ... .: ....: :
CCDS11 AQVPGFCG----DLGGDEEPPFVLLDTDAAGDRLFATYMLDPARGSFLS-AGTRMHFPRG
390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 --YPPPDIPKCGFDNEDPACN---QDHLSTLEVLALVGSLSLLGILIVSFFIYRKMQLEK
: :: :.: :: .. :. . : : : .:: ..: : ... . .: ....
CCDS11 GSAPGPD-PSCWFDPNN-ICGGGLEPGLVFLGFLLVVG-MGLAGAFLAHYVRHRLLHMQM
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550
pF1KE3 ELASELWRVRWEDV---EPSSLERHLRSAGSRLTLSGRGSNYGSLLTTEGQFQVFAKTAY
. . . .:. .: . . . ::: .:..: ..... . .: . .
CCDS11 VSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGAR--SMSDIRSGPSQHLDSPNIGV
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600
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:.:. : .:. . ..: . . .........:... ..: .. : :
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. ...:.: ::::::.: .. : :::::. :: :..::. .::. .. .:: ::: ::.
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:::::::::::.: ::. . : :: .. .::::::::: . ::. ::::.
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:..::.::.. ::. . . :.:.:.:...:: :. : :: ..... : :::..:
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:::.:. :: ... ....:. ..::.:..: .:::..:::.:..:::. ::.
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:.. :: :.:: :::: :: : :. : :..::.:::::::::..:: : :..:: ::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]